• 제목/요약/키워드: DIMBOA

검색결과 1건 처리시간 0.016초

수박계통간 염색체수준의 유전적변이 분석 (Genome-wide analysis of sequence variations in eight inbred watermelon lines)

  • 김윤성;고찬섭;양희범;강순철
    • Journal of Plant Biotechnology
    • /
    • 제43권2호
    • /
    • pp.164-173
    • /
    • 2016
  • 수박의 형태적 변이의 유전적 원인을 분석해 보기 위해 8개 계통에서 re-sequencing을 수행하였다. 유전적 변이의 수는 염색체에 따라 다르게 나왔으며 발견된 SNP의 약 12.9%만이 유전자내에서 발견되었고 나머지는 프로모터나 유전자 사이의 지역에서 발견되었다. SNP 밀도에 대한 분석 결과 염색체 6번의 말단지역에 변이가 집중되어 있는 것을 알 수 있었다. 또한 염색체 10과 11번에 잘 보존된 지역을 발견하였다. Pathway 분석을 통해 DIMBOA(일종의 항생제)-glucoside 분해 대사가 계통간 가장 차이나는 것으로 확인되었으며 이는 각 계통의 병저항성에서 차이가날 가능성을 시사하는 것이다. 당대사 관련 유전자 변이를 분석한 결과 alpha-galactosidase 유전자에 가장 변이가 많은 것으로 밝혀졌다. 이러한 연구 결과는 육종을 분자수준에서 이해하는 데 도움을 줄 것으로 생각한다.