• 제목/요약/키워드: DAP kinase

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원발성 폐암 환자의 혈청에서 DAP kinase 유전자의 Methylation 양상 (Aberrant Promoter Methylation of Death-Associated Protein Kinase in Serum DNA from Lung Cancer Patients)

  • 이준희;이정욱;정경식;김기욱;이태근;이경우;나민아;전두수;최영민;김윤성;이민기;박순규
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제55권4호
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    • pp.378-387
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    • 2003
  • 목 적 : 폐암의 발생 기전에서 종양 억제 유전자의 메틸화가 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 폐암의 전이에 관여한다고 알려진 DAP kinase 유전자의 메틸화 양상을 폐암 환자의 말초 혈액 내 종양 DNA를 이용하여 알아보고자 하였다. 방 법 : 조직학적으로 윈발성 폐암으로 진단 받은 총 65명을 대상으로 말초 혈액 내에서 DNA를 추출하였다. 추출한 DNA를 Sodium bisulfite로 처리한 후 methylation specific PCR (MSP) 방법을 사용하여 DAP kinase 유전자의 비정상적인 메틸화 양상을 조사하였으며, 조직학적 양상, TNM병기, 임상 양상에 따른 비정상적인 메틸화 빈도의 차이성을 보았다. 결 과 : 전체 대상군은 남자 43명(65.2%), 여자 22명(33.8%)이었고 평균 연령은 6 1.0세, 평균 흡연력은 22.1갑/년이었다. 전체 65명 중 DAP kinase 유전자의 비정상적인 메틸화는 29명(44.6%)였다. 비소 세포암은 57명중 25명(43.9%), 소세포암은 8명중 4명(50.0%)에서 비정상적인 메틸화가 관찰되었으며, 조직형에 따른 통계학적 차이는 없었다. 비소세포암과 소세포암 모두에서 TNM 병기에 따른 비정상적인 메틸화 빈도의 차이는 없었다. 결 론 : 원발성 폐암 환자의 혈청에서 비교적 높은 빈도로 DAP kinase 유전자의 메틸화를 관찰할 수 있어 비침습적인 종양 표지자 검사로 이용될 수 있는 가능성을 보여 준다.

비소세포폐암 조직에서 p16 종양억제유전자와 Death-Associated Protein Kinase의 Aberrant Methylation의 양상 (Aberrant Methylation of p16 Tumor Suppressor Gene and Death-Associated Protein Kinase in Non-Small Cell Lung Carcinoma)

  • 김윤성;이민기;정경식;김기욱;김영대;이형렬;이창훈;석주원;김용기;전은숙;최영민;나서희;박순규
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제51권2호
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    • pp.108-121
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    • 2001
  • 배 경 : p16 종양 억제 유전자 promoter의 aberrant methylation에 의한 불활성화가 비소세포 폐암이 발병하는 초기단계에 영향을 미치는 것으로 추측되며, DAP kinase 유전자 promoter의 hypermethylation은 유전자의 발현을 억제하여 폐암의 전이에 중요한 역할을 한다고 알려져 있다. 방 법 : 본 연구는 비소세포 폐암으로 근치적 절제술을 받은 환자 중에서 총 35 예를 대상으로 MSP률 이용하여 p16 유전자와 DAP kinase의 비정상적인 methylation의 양상을 조사하여, 폐암에서 두 유전자의 메틸화 빈도, 진단적 응용의 가능성 빛 임상적 유용성을 알고자 하였다. 결 과 : 전체 대상 35예중 p16 유전자의 aberrant methylation은 33예중 13예(39.4%)에서, DAP kinase 유전자 hypermethylation은 35예중 21예(60%)에서 확인할 수 있었다. 55 세 이상에서 p16의 aberrant methylation은 유의하게 증가되어 있었으며, DAP kinase는 병기의 진행도에 따라 발현 빈도가 증가하였으나, 통계학적 의미는 없었다. 또한 p16 유전자와 DAP kinase 유전자간의 메틸화 양상에서도 연관성은 관찰할 수 없었다. 결 론 : p16과 DAP kinase 유전자중 하나라도 비정상적인 메틸화가 발견된 경우는 전체 대상의 74.3% 로 비교적 높은 빈도로 관찰되어 폐암의 조기 진단을 위한 분자 생물학적 방법으로 이용될 수 있을 것으로 사료된다.

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Cloning and Characterization of DAP10 homologue gene from Olive Flounder, Paralichthys olivaceus

  • 박찬일;김무찬;황지윤;김기혁;김주원
    • 한국어병학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.227-233
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    • 2006
  • Olive flounder immunoreceptor DAP10 homologue cDNA was cloned from a peripheral blood lymphocytes (PBLs) cDNA library. The length of the olive flounder DAP10 cDNA is 473bp and it contains an open reading frame of 234bp. The predicted polypeptide sequence is 78 amino acids, consisting of a 22-amino acid leader, an 11-amino acid extracellular domain, a 21-amino acid transmembrane segment, and a 24-amino acid cytoplasmic domain. The amino acid sequence of olive flounder DAP10 has 56%, 50%, 32%, 31%, and 31% sequence identity with zebrafish DAP10, catfish DAP10, cattle DAP10, rat DAP10 and Monkey DAP10, respectively. Olive flounder DAP10 has a conserved aspartic acid in the transmembrane domain and a phophatidylinositol-3 kinase-binding site (YxxM/V) in the cytoplasmic region. Genomic organization reveals that olive flounder DAP10 comprises five exons and four introns. A phylogenetic analysis based on the deduced amino acid sequence grouped the olive flounder DAP10 with other species DAP10. In RT-PCR analysis, DAP10 transcripts were detected predominantly in PBLs, kidney, spleen and intestine.

Escherichia coli와 Corynebacterium glutamicum간의 shuttle vectors의 C. glutamicum에서의 안정성에 대한 클론된 유전자의 영향 (Effects of Cloned Genes on the Stability of Shuttle Vectors between Escherichia coli and Corynebacterium glutamicum)

  • 노갑수;김성준;오종원;이현환;현형환;이재흥
    • 미생물학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.149-154
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    • 1991
  • Escherichia coli/Corynebacterium glutamicum shuttle vectors, pECCG1 and pECCG2 were constructed by joining a 3.00 kb cryptic plasmid pCB 1 from C. glutamicum and a 3.94 kb plasmid pACYC 177 from E. coli. By trimming unessential parts and introducing mulitiple cloning site into the plasmid pECCG 1, a plasmid pECCG122(5.1kb) was constructed. All the shuttle vectors were stably maintained in C. glutamicum up to about 40 generations irrespective of kanamycin addition in the medium. Threonine operon (homoserine dehydrogenase/homoserine kinase) and dapA gene (dihydrodipicolinate synthetase) of C. glutamicum were cloned into the plasmid pECCG122, and the resultant plasmids were designated pTN31 and pDHDP19, respectively. They were used to study the effect of cloned foreign gene on the stability of the plasmid pECCG122. Plasmids pTN31 and pDHDP19 were segregated rapidly from C. glutamicum when cultured in the medium without kanamycin. In medium with $50\mu${\g/ml} of kanamycin, their segregation rates were much slower than those in medium without kanamycin, but the danamycin addition didn't guarantee the complete maintenance of the plasmids in C. glutamicum.

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