• 생태와환경
• /
• 제54권3호
• /
• pp.229-239
• /
• 2021

말쥐치는 북서태평양 해역에 분포하는 군집성 어류로 수산식품으로 이용되는 경제적 가치가 높은 어종이다. 본 연구에서는 서남해에 서식하는 국내산 말쥐치(Thamnaconus modestus)와 기존에 보고된 유사종(Thamnaconus septentrionalis)과의 형태적-유전적 특징을 비교-분석하였다. 이를 위해 서남해에서 채집한 말쥐치의 외부 형태와 골격을 관찰하고, 미토콘드리아 DNA의 cytochrome c oxidase subunit I (COI) 유전자 염기서열을 비교하여 유사종 (T. septentrionalis)과의 계통진화적 연관관계를 분석하였다. 서남해안 말쥐치의 외부 형태는 회갈색 바탕에 몸 전체에 흑갈색 무늬가 불규칙하게 산재된 패턴을 가지며 청록빛의 지느러미가 관찰되었다. 채집한 말쥐치에서 추출한 미토콘드리아DNA의 COI 유전자 분석결과 7종류의 염기서열 변이가 나타났으나 상동성이 전체적으로 98.8% 이상으로 유사성이 높게 나타났다. 또한 형태적으로 말쥐치 유사종인 T. septentrionalis COI 염기서열 비교와 계통유전학적 분석 결과, 보고된 시퀀스 중 상동성이 99%로 유전적으로 말쥐치로 보여지는 두 종(JN813099, MW485059)과 상동성 95%로 유사종으로 보이는 두 종(EF607583, KP267619)이 확인되었다. 말쥐치와 유사종은 계통유전적 분석결과 말쥐치와 유사종의 차이를 확인하였으나 형태적 특징으로 종 분류는 어려운 상태이다. 따라서 본 연구는 말쥐치의 외부 형태와 내부 골격 및 계통유전학적 정보를 제공함으로 말쥐치와 유사종(T. septentrionalis)의 분류학적 재검토를 진행하는 데 주요한 정보가 될 것이다.

• 생태와환경
• /
• 제52권3호
• /
• pp.221-230
• /
• 2019

섬진강 수계에 서식하는 누치(Hemibarbus labeo)의 미토콘드리아 DNA에서 cytochrome c oxidase subunit I(COI) 유전자를 발굴하고 누치속 Hemibarbus 및 잉어과(Cyprinidae) 내 계통유전학적인 위치를 확인하는 연구를 수행하였다. 발굴된 577 bp COI 시컨스의 다중배열 결과 섬진강산 누치들의 높은 염기서열 상동성을 보였다(99~100%). 우리나라에서 발견되는 누치속 3종에서 누치(H. labeo: HD1)와 어름치(H. mylodon)의 염기서열 유사성은 88.91%, 참마자 (H. longirostis)와는 88.81%이었다. 또한, H. maculatus, H. meditus, H. umbrifer, H. barbus는 각각 누치와의 염기서열 유사성이 98.97%, 97.20%, 96.87%, 98.85% 등으로 나타났다. 누치속 7종의 계통유전학적 분석결과 섬진강산 누치(H. labeo)들은 두개의 단계통 (clade)을 형성하는데 하나는 하동, 임실, 강진, 순창의 섬진강 누치들로만 이루어진 단계통, 다른 하나는 하동의 HD2, HD8, HD9와 국내 부산, 아산, 서울 등에서 채집 보고된 누치들과 단계통을 형성하였다. 잉어과 내 섬진강산누치(HD1)의 계통진화적 위치는 피라미(Zacco platypus)와는 진화적 거리가 0.143, 누치속 H. maculatus와는 0.006으로 나타났다. 또한 잉어과 28종 내 계통유전학적 위치는 모래무지아과(Gobioninae) 어류들이 포함된 그룹 I에 섬진강산 누치가 위치함을 확인하였다. 본 연구의 결과는 누치를 포함하는 잉어과 내 어류의 계통유전학적 비교와 환경오염에 따른 담수환경 모니터링을 위한 모델어류의 발굴연구에 주요한 유전적 정보를 제공할 것이다.

• 한국어류학회지
• /
• 제21권4호
• /
• pp.287-290
• /
• 2009

줄종개(Cobitis tetralineata)와 왕종개(Iksookimia longicorpa)간 자연잡종으로 추정되는 개체를 유전적으로 동정하기 위하여 핵 recombination activating gene 1 (RAG1)과 미토콘드리아 cytochrome c oxidase I (COI) 유전자들의 염기서열을 분석하였다. RAG1 염기서열을 분석한 결과 850 bp 중에서 두 친어종들 간에 총 23개의 치환이 관찰되었고, 자연잡종 개체의 electropherogram에서는 이들 치환이 관찰된 모든 위치들에서 double peak들이 관찰되어, 멘델의 유전법칙을 따랐다. 그리고 모계를 통해 자손에게 유전되는 특징을 가지는 미토콘드리아 유전자들 중에서 COI 염기서열을 비교한 결과 잡종 개체는 줄종개와 염기서열이 100% 일치하여 그 모계는 줄종개임이 명확히 밝혀졌다.

• 한국가금학회지
• /
• 제36권1호
• /
• pp.85-88
• /
• 2009

조류에서 미토콘드리아내 유전자인 cytochrome c oxidase I(COI)는 종 구분을 위한 바이오마커로 많이 이용이 되고 있다. 본 연구는 이 유전자의 변이를 이용하여 닭의 품종 구분이 가능한지를 실험하기 위하여 실시하였다. 그 결과 한국 재래닭은 공시축으로 사용한 산란계인 White Leghorn과 육계인 Cornish가 가지고 있는 단일염기다형을 모두 가지고 있는 것으로 판명되어 품종구분을 위한 마커로 사용하기에는 적합하지 않은 것으로 확인되었다. 그러나 본 연구 결과를 통하여 한국재래계가 육계와 산란계의 특성을 모두 가지고 있다는 기존의 학설을 뒷받침하였으며, 품종 구분을 위하여 미토콘드리아와 genomic DNA 유래 단일염기다형 선발의 중요성을 확인할 수 있었다.

• 환경생물
• /
• 제33권2호
• /
• pp.177-181
• /
• 2015

Two marine isopods, Pentias hayi Richardson, 1904 and P. thompsoni Collinge, 1916 were verified as unrecorded species in South Korea. The genus Pentias is reported for the first time in South Korea. These two isopods were collected from Heuksan-do Island and Ulleung-do Island from South Korea, respectively. We provide descriptions of the diagnostic characteristics, illustrations of two species and their partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) for molecular characteristics.

• 환경생물
• /
• 제33권2호
• /
• pp.182-188
• /
• 2015

Three marine isopods, Symmius yamaguchiensis Shimomura, 2008, Colanthura pigmentata Kensley, 1980 and Synidotea nipponensis Nunomura, 1985 are reported for the first time in South Korea. The family Chaetiliidae, and genera Symmius and Colanthura are new to South Korea. We provide descriptions of the diagnostic characteristics, illustrations of three species and their partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) for molecular characteristics.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제23권1호
• /
• pp.75-85
• /
• 2007

A taxonomic study was carried out on the Perinereis nuntia species group of Korea by using morphological and molecular data (mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I: mtCOI). Two species, P. mictodonta (Marenzeller, 1879) and P. wilsoni (Glasby and Hsieh, 2006), are recognized and redescribed. In this study, mtCOI gene showed a good resolution as molecular marker for species identification of the P. nuntia species group of Korea.

• 한국양식학회:학술대회논문집
• /
• 한국양식학회 2004년도 수산관련학회 공동학술대회 발표요지집
• /
• pp.280-281
• /
• 2004

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제28권4호
• /
• pp.297-303
• /
• 2012

New Korean lumbricids are described: Eisenia gaga Blakemore sp. nov. from remote Gageodo Island and E. sindo Blakemore, sp. nov. from an island at Incheon. Both are comparable to Eisenia koreana (Zicsi, 1972) from near Pyongyang, North Korea. A remarkable yet previously unrecognized similarity to American earthworm Eisenoides carolinensis (Michaelsen, 1910) is discussed, but synonymy is rejected on tenuous morphological grounds (form of nephridial vesicle bladders) with taxonomy supported by objective molecular data (mtDNA cytochrome c oxidase subunit 1 barcodes).

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제31권2호
• /
• pp.135-138
• /
• 2015

An asteroid specimen was collected in adjacent water of Gisamun, Gangwon-do in the East Sea, Korea at a depth of 170 m by fishing net at May 2013. It was identified as Nearchaster (Nearchaster) pedicellaris (Fisher, 1910) belonging to family Benthopectinidae of order Notomyotida, which was new to the Korean fauna. The genus, family, and order of this species were also new to Korean waters. The partial sequence of mitochodrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) was determined for the first time and registered at GenBank.