• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제2권3호
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• pp.112-114
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• 1981

The photocycloaddition reaction of 8-methoxypsoralen with purine and/or pyrimidine bases is studied as a model for the charge transfer interactions of psoralens with DNA bases by the FMO method. The results indicate that, in the case of the molecular complex formation between psoralens and purine and/or pyrimidine bases, the most probable photocycloaddition should occur in the following order: Thy (5,6)<>(3,4) 8-MOP, Cyt(5,6)<>(3,4)8-MOP, Ade (7,8)<>(3,4)8-MOP, Gua(7,8)<>(3,4)8-MOP. The theoretical results for the photocycloaddition reaction are also correlated with the experimental results. The photoadducts between 8-methoxypsoralen and adenine are likely to be C4-cycloadducts through the cycloaddition of 3,4-pyrone double bond of 8-methoxypsoralen to 7,8-double bond of adenine.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제27권3호
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• pp.317-324
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• 2012

본 연구는 식품원료의 진위여부를 판별하기 위한 시험법으로 일반 프라이머를 이용한 DNA barcode 기법을 도입하였다. 동물성식품원료의 경우 미토콘드리아 DNA 중 cytochrome oxidase subunit I(COI) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2)와 cytochrome b(cyt b) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(L14724/H15915)를 사용하였다. 상기 3 종류의 프라이머를 사용하여 가축류 6종(소, 돼지, 염소, 양, 말 및 사슴), 가금류 4종(닭, 오리, 칠면조 및 타조), 어류 7종(명태, 대구, 청대구, 청어, 송어, 다랑어 및 우럭)을 대상으로 PCR 후 전기영동하여 예상되는 PCR 산물의 생성 유무를 확인하였다. 가축류 6종에 대하여는 LCO1490/HCO2198, VF2/FISH R2 및 L14724/H15915 프라이머를 사용한 경우 COI 및 cyt b가 모두 검출되었으며, 가금류 4종은 LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우만 COI이 검출되었다. 또한 어류 7종은 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우에만 COI 부위가 검출됨을 확인하였다. 식물의 경우 엽록체 DNA 부위를 이용하여 디자인된 3 종류의 프라이머(trnH/psbA, rpoB 1F/4R 및 rbcL 1F/724R)를 사용하였다. 각각의 프라이머를 이용하여 식물 5종(마늘, 양파, 무, 녹차 및 시금치)에 대하여 실험한 결과 3종류의 프라이머에서 PCR의 산물을 모두 확인하였으며 trnH/psbA 프라이머의 경우 식물 종마다 PCR 산물의 크기는 다르게 검출되었다. 본 연구에서는 17종의 식품원료별 일반 프라이머 및 PCR 조건을 확립하였으며, 생산된 PCR 산물을 대상으로 염기서열을 결정하고 유전자은행에 있는 염기서열과 DB 비교 분석을 통하여 식품에 사용된 원료의 진위여부 판별에 적용이 가능할 것으로 기대된다.

• 환경생물
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• 제36권3호
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• pp.352-358
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• 2018

본 연구는 PCR 기반 RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism; 제한절편 길이 다형성) 분자기법을 활용하여 난 및 치어 대상 납자루아과 어류 3종의 동정을 좀 더 빠르고 정확하게 파악하고 납자루아과 어류의 종별 산란양상 및 번식생태 이해에 대한 기여가 목적이다. 본 연구를 위해 기존 선행된 문헌자료를 확인하고 납자루아과 어류가 2종 이상 동서하고 있는 지역을 확인하여 현지조사를 수행하였다. 현지조사 결과 확인된 납자루아과 어류는 묵납자루(Acheilognathus signifer), 줄납자루(A. yamatsutae) 및 각시붕어(Rhodeus uyekii)로 총 3종이 확인되었으며, 확인된 납자루아과 어류와 동서하고 있는 숙주조개(작은말조개; Unio douglasiae sinuolatus)를 채집하여 숙주조개 속 납자루아과 어류의 난 및 치어를 확보하였다. 현지조사 결과 확인된 납자루아과 어류 3종을 대상으로 미토콘드리아 DNA COI과 cyt b 유전자 염기서열을 비교하여 각각 종별로 특이성을 지닌 부위(단일염기변이; Single Nucleotide Variation: SNV)에 맞는 제한효소를 선정하였고, 숙주조개 속 난 및 치어를 대상으로 genomic DNA를 추출하여 PCR-RFLP 실험을 수행한 결과 현지조사 시 확인된 납자루아과 어류 3종의 독특한 제한절편 길이 양상을 전기영동을 통하여 확인하였다. 본 연구를 통해 묵납자루, 줄납자루 및 각시붕어의 종을 판별할 수 있는 RFLP 마커를 개발하였으며, 숙주조개 난 및 치어를 대상으로 정확한 종의 동정을 보다 빠르고 효과적으로 수행하여 각각 납자루아과 종별 산란양상을 보다 정확히 규명하고 향후 이들 자연개체군의 효과적인 유지, 관리 및 보전 방법 개발에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국환경생태학회지
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• 제34권3호
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• pp.198-206
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• 2020

본 연구는 지리산국립공원 세석평전 일대 설치류에 의한 수목피해실태를 조사하고, 피해목 주변에서 확인된 설치류 배설물 분석을 통하여 가해 의심종을 확인하고자 하였다. 피해목 조사는 대상지 내 탐방로를 중심으로 접근과 육안관찰이 가능한 지역에 한해 수종에 관계없이 실시하였으며, 가해 의심종 확인을 위해 피해목 주변 설치류 배설물에 대한 미토콘드리아 DNA Cyt-b의 염기서열 분석을 수행하였다. 설치류에 의한 피해목은 총 52개체로 모두 구상나무로 확인되었으며, 구상나무가 높은 밀도로 군락을 형성하고 있는 곳에서 집중되어 있었다. 수고 1.5m 이상 구상나무가 40개체가 조사되었으며, 이중 39개체는 피해 입은 가지부만 고사한 것으로 나타나 수목 전체에 영향을 미치지 않았다. 수고 1.5m 미만 구상나무는 12개체가 조사되었으며, 이중 7개체는 완전히 고사한 것으로 나타나, 상대적으로 어린 구상나무가 피해를 입을 경우 고사 가능성이 높은 것으로 나타났다. 배설물의 유전자 염기서열 분석결과 구상나무를 가해한 종은 대륙밭쥐로 확인되었다.

• 한국어류학회지
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• 제32권4호
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• pp.199-209
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• 2020

본 연구는 예전부터 혼란스러웠던 한국산 대주둥치속, Macroramphosus 어류의 분류학적 위치를 명확히 하기 위해, 한국산 18개체를 일본/대만산 35개체 및 지중해산 M. scolopax와 형태 및 분자 변이를 비교 분석하였다. 한국, 일본 및 대만산 대주둥치속 어류는 제1등지느러미 극조 길이(A-type은 22.8~32.1%, B-type은 15.6~21.4%), 제1등지느러미와 제2등지느러미 사이 길이(A-type은 6.4~9.7%, B-type은 8.6~13.3%), 체고(A-type은 20.0~28.0%, B-type은 17.3~22.6%)에서 두 type으로 명확히 구분되었으나, 유전적으로는 구분되지 않았다(CR에서 0.0~3.3%, cyt b에서 0.0~1.3%, COI에서 0.0~0.5%). 한편, 한국산 대주둥치는 지중해산 M. scolopax와 유전적으로 명확히 구분되어(CR에서 9.9~11.5%, cyt b에서 3.8~4.6%, COI에서 1.2~3.6%), 최근 사용하고 있는 학명 M. scolopax를 M. japonicus (및/또는 M. sagifue)로 변경해야 할 것이다. 그러나, 본 연구에서 두 type 간 형태변이와 분자변이 간 일치성을 찾지 못했으며, 이는 아마도 그들간에 분화가 상당히 최근에 일어났음을 시사한다. 두 type 간 유전자 교류 정도를 파악하려면 향후 microsatellite와 같은 보다 민감한 마커를 이용한 후속 연구가 필요할 것이다.

• 한국어류학회지
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• 제27권4호
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• pp.284-292
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• 2015

이 연구는 제주도 주변 4개의 정점에서 채집된 어란의 월별 종조성 및 출현량을 알아보기 위해 실시하였다. 현장조사는 2006년 8월부터 2007년 7월까지 봉고네트를 이용하여 월별로 표층채집을 하였으며, 종동정은 채집된 어란의 미토콘드리아 cytochrome b 유전자 (cyt b) 염기서열을 성어 염기서열과 상호 비교함으로써 이루어졌다. 채집된 어란은 총 43개의 분류군으로 분류되었고, 이중 34종 (6목 24과 33속)은 종 (species)까지 동정이 이루어졌다. 나머지 9종 가운데 4종은 과 (family)까지 동정할 수 있었고, 5종은 미동정되었다. 지역별로 제주항 근해에서는 23개의 분류군으로 가장 많은 분류군이 나타났고, 성상포 근해에서 21개, 서귀포항 근해에서 19개, 차귀도 근해에서는 18개의 분류군이 출현하였다. 시기별로는 2006년 9월에 15개의 분류군으로 가장 많이 나타났고, 12월과 7월에 3개의 분류군으로 가장 적게 나타났다. 동정이 이루어진 34종 중 멸치 (E. japonicus)와 노랑벤자리 (C. japonicus)가 가장 높은 출현 빈도를 보였으며, 멸치는 표층수온 $14.0{\sim}28.6^{\circ}C$에서, 노랑벤자리는 $14.9{\sim}20.5^{\circ}C$에서 출현하였다. 이번 연구에서 사용된 cyt b 유전자의 PCR 증폭 성공률은 68.3%였으며, 종동정률은 79.1%였다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제39권3호
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• pp.266-272
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• 2024

본 연구는 어린이집 급식설비 손잡이의 식중독 세균 오염도를 측정하고, 분리 균주의 독소 유전자와 항생제 내성을 분석하여 급식설비 손잡이에 의한 집단식중독을 예방을 위한 과학적 기반을 마련하고자 하였다. 실험 대상은 전라남도 일부 지역 어린이집 101곳의 냉장고, 냉동고, 자외선 살균기 손잡이, 총 303개를 대상으로 하였다. 어린이집 냉장고, 냉동고 손잡이에서 B. cereus 4 균주(1.3%)가 검출되었고 어린이집 냉장고 손잡이에서 S. aureus 2균주(0.7%)가 검출되었다. B. cereus와 S. aureus의 독소유전자를 분석한 결과 B. cereus 4개 균주 모두에서 nheA, nheB, nheC, entFM, cytK가 검출되었으나, S. aureus의 2개 균주의 경우 모두 sea, seb, sec, sed, see, seg, seh, sei, sej 독소유전자가 불검출되었다. B. cereus에서 설사를 유발하는 장독소가 검출되어 B. cereus에 의한 식중독 발생가능성이 상존하는 것으로 판단되었다. B. cereus와 S. aureus의 항생제 감수성을 실험한 결과 B. cereus 4 균주에서 AM, FEP 등 β-lactam계 항생제에 내성을 나타내었고 S. aureus 균주 모두 AM, P 항생제에 내성을 나타내었다. S. aureus 균주는 OX 항생제에 각각 중간 내성 1 균주와 감수성 1 균주를 나타내었으나 MRSA는 검출되지 않았다. 이러한 결과를 종합하여 볼 때 어린이집 급식설비 손잡이의 교차오염으로 인한 식중독 발생을 예방하기 위해 급식설비 손잡이에 대한 주기적인 살균 등 위생관리 방안을 강화해야할 것으로 판단되었다.

• BMB Reports
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• 제42권4호
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• pp.223-226
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• 2009

We measured the pH-induced spectral changes of yeast iso-1-cytochrome c on silver nanoparticle surfaces using surface-enhanced resonance Raman scattering (SERRS) at 457.9 nm. At a pH of ~3, the Met80 ligand in yeast iso-1-cytochrome c is assumed to dissociate, leading to a marked conformational change as evidenced by the vibrational spectral shifts. The Soret band at ~410 nm in the UV-Vis spectrum shifted to ~396 nm at pH~3, indicating a transition from a low spin state to a high spin state from a weak interaction with a water molecule. Thus, SERRS spectroscopy can measure the pH-induced denaturalization of cyt c adsorbed on metal nanoparticle surfaces at a lower concentration with a better sensitivity than ordinary resonance Raman spectroscopy.

• 대한세포병리학회지
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• 제17권1호
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• pp.18-26
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• 2006

Transitional cell carcinoma of the urinary bladder is common in the genitourinary tract. The gold standard for the diagnosis of bladder cancer has been cystoscopy, along with urine cytology. Cystoscopy is an invasive and relatively expensive technique. By comparison, urine cytology is easy to perform and specific for a diagnosis of bladder cancer, although less sensitive, especially in low-grade tumors. For this reason, there has been a need for superior noninvasive technology to increase our confidence in being able to detect bladder cancer. There are many reports of the various urinary tests that are available to facilitate the diagnosis. In this article, I reviewed the literature on urinary markers and tests that may be clinically useful, including fluorescence in situ hybridization, uCyt+/Immunocyte, the $BTA^{(R)}$ test, the NMP 22TM, the $FDP^{(R)}$ test, the telomerase activity test, the HA and HAse tests, and flow cytometry. Most of these tests have a higher sensitivity and specificity than cytology. However, urine cytology has the highest specificity, especially in individuals with a high-grade tumor. We conclude that no urinary markers or tests can replace the role of cystoscopy along with cytology in the diagnosis of transitional cell carcinoma of the bladder. However, some markers could be used adjunctively to increase the diagnostic accuracy during screening or during the postoperative follow-up examination of patients with bladder cancer.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제25권3호
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• pp.189-195
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• 2021

Fluoxetine (FLX), a selective serotonin reuptake inhibitor antidepressant, exhibits various other mechanisms of action in numerous cell types and has been shown to induce cell death in cancer cells, paving the way for its potential use in cancer therapy. The aim of this study was to determine the off-target effects of the anti-depressant drug FLX, on the human ovarian granulosa tumor COV434 cells stimulated by forskolin (FSK), by measuring the real-time kinetics of intracellular cyclic AMP (cAMP), ATP level, cytoplasmic calcium ([Ca2+]cyt) and survival of COV434 cells. We show that incubating COV434 cells with FLX (between 0.6 and 10 μM) induces a decrease in intracellular cAMP response to FSK, a drop in ATP content and stimulates cytoplasmic Ca2+ accumulation in COV434 cells. Only the highest concentrations of FLX (5-10 μM) diminished cell viability. The present report is the first to identify an action mechanism of FLX in human tumor ovarian cells COV434 cells and thus opening the way to potential use of fluoxetine as a complementary tool, in granulosa tumor treatments.