Crystal structure of $Ba_5-5X$Y$_10/3$Nb$_10$O$_30$ was tried to determine by Rietveld analysis using powder X-ray diffraction data. This compound has tetragonal tungsten bronze (TTB) structure with general formula, (Al)$_2$(A2)$_4$(B1)$_2$(B2)$_8$(O1)$_8$(O2)$_8$(O3)$_4$(O4)$_2$(O5)$_4$(O6)$_4$. However, it was difficult to determine the distribution of Ba and Y in Al and A2 sites by the analysis only. Combination of Rietveld analysis and site potentials calculation as well as lattice energy calculations helped to determine the distribution. As the result, it was clarified that $Ba^2+$ cations occupy A2 (pentagonal tunnel site) and $Y^3+$ cations occupy Al (cubic site). The distribution of cations at each site coincides with the distribution estimated by the difference of ionic radii. This supports the formation condition of TTB which was proposed in our previous report. $Ba_5-5X$Y$_10X/3$Nb$_10$O$_30$ shows ferroelectric characteristics. In this compound, remanent polarization decreases slightly with the composition X. On the other hand, the result of crystal structure determination reveals that atomic positions along c-axis for A1, A2, B1 and B2 cations are also decreased with the composition X. This would suggest that the dependence of remanent polarization on composition X is derived by the dependence of atomic coordinates on composition X.
Journal of the Korean Applied Science and Technology
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v.22
no.3
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pp.204-211
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2005
The structure of nitrogen adsorption complex of fully dehydrated $Cd^{2+}$ ion exchanged zeolite-X, $|Cd_{46}(N)_{18}|[Si_{100}Al_{92}O_{384}]$, was determined in the cubic space group $Fd\overline{3}$ at 21(1) $^{\circ}C$ [a = 24.863(4) ] by single crystal X-ray diffraction analysis. The crystal was prepared by ion exchange in a flowing steam of 0.05 M aqueous solution $Cd(NO_3)_2$ : $Cd(O_2CCH_3)_2$ = 1:1 for five days, followed by dehydration at $500^{\circ}C$ and $2{\times}10^{-6}$ Tor. for two days, and exposured to 100 Tor. zeolitically dry nitrogen gas at 21(1) $^{\circ}C$. The structure was determined in atmosphere, and was refined within $F_0$ > $4{\sigma}(F_0)$ using reflection for which the final error can appear in indices $R_1$ = 0.097 and $wR_2$ = 0.150. In this structure, $Cd^{2+}$ ions occupied four crystallographic sites. Nine $Cd^{2+}$ ions filled the octahedral site I at the centers of hexagonal prisms (Cd-O = 2.452(16) ${\AA}$). Eight $Cd^{2+}$ ions filled site I' (Cd-O = 2.324(19) ${\AA}$). The remaining 29 $Cd^{2+}$ ions are found at two nonequivalent sites II (in the supercages) with occupancy of 11 and 18 ions. Each of these $Cd^{2+}$ ions coordinated to three framework oxygens, either at 2.159(15) or 2.147(14) ${\AA}$, respectively. Eighteen nitrogen molecules were adsorbed per unit cell and three per supercage.
Two new Zn(II) complexes, $[Zn_2(dpa)_2(phen)_2(H_2O)_2]{\cdot}H_2O$ (1) (dpa = dephenate, phen = 1,10-phenanthroline) and [$Zn_2(dpa)_2(bpy)_2(H_2O)_2$] (2) (bpy = 2,2'-bipyridine) have been synthesized and characterized by elemental analysis, infrared spectroscopy, thermogravimetric analysis, and single crystal X-ray diffraction. The X-ray analysis reveals that the structures of 1 and 2 are dinuclear zinc(II) complexes bridged by dpa dianions, respectively. The zinc ions in 1 exhibit a distorted square pyramidal environments, while the zinc ions in 2 exhibit a trigonal bipyramid geometry. In each complex, the dpa ligand is coordinated to zinc ions as a bis-monodentate.
The thermal decomposition process of ammonium paratungstate $5(NH_4)_2O{\cdot}12WO_3{\cdot}5H_2O$ was analysed by the methods of thermogravimetric analysis, differential thermal analysis, quantitative analysis of the ammonia which is released during heating and X-ray powder diffraction in air and in vacuo. There are several endothermic peaks which indicate release of ammonia and exothermic peaks which indicate crystal growth and oxidation of decomposed prodects in air. After water is driven off the ammonia is released at intervals corresponding to the endothermic peaks. The highest temperature at which ammonia is released is about $420^{\circ}C$ in air and $480^{\circ}C$ in vacuo. In air the crystal structure of paratungstate is conserved up to a temperature of $300^{\circ}C$ at which the remaining ammonia is about 4 mols. At $320^{\circ}C$ the remaining ammonia becomes less than 2 mols and the paratungstate structure changes into the amorphous state. After that ${\gamma}$ oxide is produced and is oxidized to ${\alpha}$ oxide in the temperature range of 400-$500^{\circ}C$ in air. In vacuo however the endothermic peaks and structural changes occur at lower temperatures and the structure of ${\gamma}$ oxide is conserved up to temperatures higher than $500^{\circ}C$.
It has been studied the crystal and block structures of the hexagonal ferrites with M, W, Y and Z types prepared by various coprecipitation-oxidation method. The structures have been refined with a Rietveld analysis of the powder X-ray diffraction pattern with high precision ($R_{WP}$ <0.09, $R_I$ <0.03). The density difference between the S-blocks was proportioned to the cobalt contents in hexagonal ferrites, but that between the R or T-blocks was relatively small. Compared with the blocks and cation-oxygen polyhedra in BaM ($BaFe_{12}O_{19}$), those were bulky to the normal direction for the c-axis in $Co_2W$ ($BaCo_2Fe_{16}O_{27}$) and to the parallel direction for the c-axis in $Co_2Y$ ($Ba_2Co_2Fe_{12}O_{22}$) and $Co_2Z$ ($Ba_3Co_2Fe_{24}O_{41}$). The S-blocks of $Co_2W$, $Co_2Y$, and $Co_2Z$ were unstable and distorted. Because the T-block of $Co_2Z$ was unstable, the T-block was decomposed into the Ba-rich phase and $Co_2W$ at high temperatures above $1200^{\circ}C$. A standard powder X-ray diffraction pattern for $Co_2Z$ was proposed as well.
Mardani, Zahra;Golsanamlou, Vali;Jabbarzadeh, Zahra;Moeini, Keyvan;Carpenter-Warren, Cameron;Slawin, Alexandra M.Z.;Woollins, J. Derek
Journal of the Korean Chemical Society
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v.62
no.5
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pp.372-376
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2018
A 1D-coordination polymer of $1D-\{Cu({\mu}-picolinato)_2\}$$\{Hakimi,\;2012\;\sharp73\}_n$ (1), was prepared by the reactions between 2-(2-(pyridin-2-yl)oxazolidin-3-yl)ethanol (AEPC) ligand and $CuCl_2$ or $CuBr_2$. The product was characterized by elemental analysis, UV-Vis, FT-IR spectroscopy and single-crystal X-ray diffraction. The X-ray analysis results revealed that the AEPC ligand, after reactions with the copper(II) chloride or bromide, gives the same product - $1D-\{Cu({\mu}-picolinato)_2\}_n$ (1). The coordination modes for various picolinate-based ligands were extracted from the Cambridge Structural Database (CSD). In the crystal structure of 1, the copper atom has a $CuN_2O_4$ environment and octahedral geometry, which is distorted by elongation of the axial bond lengths due to the Jahn-Teller effect.
Guo, Huan-Mei;Wang, Xian;Jian, Fang Fang;Xiao, Hai Lian;Zhao, Pu Su
Bulletin of the Korean Chemical Society
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v.30
no.5
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pp.1061-1066
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2009
Two fluoro-substituted 2-pyrazoline derivatives, 1-phenyl-3-(4-methoxyphenyl)-5-(4-fluorophenyl)-2-pyrazoline (1) and 1-phenyl-3-(4-methoxyphenyl)-5-(2-fluoro-phenyl)-2-pyrazoline (2) have been synthesized and characterized by elemental analysis, IR, UV-Vis and fluorescence spectra. The crystal structure of 1 has been determined by X-ray single crystal diffraction. For the two compounds, density functional theory (DFT) calculations of the structures and natural population atomic charge analysis (NPA) have been performed at B3LYP/6-311G** level of theory. By using TD-DFT method, electron spectra of 1 and 2 have been predicted, which are very approximate with the experimental ones. Comparative studies on 1 and 2 indicate that the location change of fluorine atom in 5-position phenyl ring of 2-pyrazoline does not make significant change of geometries and electronic transition bands, but it leads to evident change of atomic charge distributions and peak intensities of UV and fluorescence spectra.
Two cobalt(II) compounds $[Co(2,2{^\prime}-bipy)(H_2O)_2(SO_4)]_n$ (1) and $[Co_2(2,2^{\prime}-bipy)_2(btec)(H_2O)_6]{\cdot}2H_2O$ (2) (2,2'-bipy = 2,2'-bipyridine, $H_4btec$ = 1,2,4,5-benzenetetracarboxylic acid), have been simultaneously synthesized by a one-pot slow solvent evaporation reaction. Their structures were determined by single-crystal X-ray diffraction and further characterized by X-ray powder diffraction (XRPD), IR, elemental and thermogravimetric analysis (TGA). The structural analysis reveals that compound 1 exhibits an infinite 1D chain structure with the octahedral Co(II) centers bridging by the tetrahedral ${\mu}_2-SO{_4}^{2-}$ ligands, while compound 2 possesses a dinuclear $Co_2(2,2^{\prime}-bipy)_2(btec)(H_2O)_6$ unit and the two adjacent octahedral Co(II) ions are linked by the bismonodentately coordinated btec ligand. Additionally, compound 2 exhibits blue fluorescent emission in the solid state at room temperature.
A new hydrazone derivative compound has been synthesized and characterized by IR, $^1H$-NMR, $^{13}C$-NMR and UV-vis. spectroscopy techniques, elemental analysis and single-crystal X-ray diffraction (XRD). The new compound crystallizes in monoclinic space group C2/c. In addition to the crystal structure from X-ray experiment, the molecular geometry, vibrational frequencies and frontier molecular orbitals analysis of the title compound in the ground state have been calculated by using the HF/6-31G(d, p), B3LYP/6-311G(d, p) and B3LYP/6-31G(d, p) methods. The computed vibrational frequencies are used to determine the types of molecular motions associated with each of the observed experimental bands. To determine conformational flexibility, molecular energy profile of (1) was obtained by semi-empirical (AM1) calculation with respect to a selected degree of torsional freedom, which was varied from $-180^{\circ}$ to $+180^{\circ}$ in steps of $10^{\circ}$. Molecular electrostatic potential of the compound was also performed by the theoretical method.
Hormone sensitive lipase (HSL) plays a major role in energy homeostasis and lipid metabolism. Several crystal structures of HSL-homolog proteins have been identified, which has led to a better understanding of its molecular function. HSL-homolog proteins exit as both monomer and dimer, but the biochemical and structural basis for such oligomeric states has not been successfully elucidated. Therefore, we determined the crystal structure of HSL-homolog protein EstE7 from a metagenome library at $2.2\;{\AA}$ resolution and characterized the oligomeric states of EstE7 both structurally and biochemically. EstE7 protein prefers the dimeric state in solution, which is supported by its higher enzymatic activity in the dimeric state. In the crystal form, EstE7 protein shows two-types of dimeric interface. Specifically, dimerization via the external ${beta}8$-strand occurred through tight association between two pseudosymmetric folds via salt bridges, hydrogen bonds and van der Waals interactions. This dimer formation was similar to that of other HSL-homolog protein structures such as AFEST, BEFA, and EstE1. We anticipate that our results will provide insight into the oligomeric state of HSL-homolog proteins.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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