Interplay between Cymbidium mosaic virus (CymMV)/Odontoglossum ringspot virus (ORSV) and its host plant Phalaenopsis equestris remain largely unknown, which led to deficiency of effective measures to control disease of P. equestris caused by infecting viruses. In this study, for the first time, we characterized viral small interfering RNAs (vsiRNAs) profiles in P. equestris co-infected with CymMV and ORSV through small RNA sequencing technology. CymMV and ORSV small interfering RNAs (siRNAs) demonstrated several general and specific/new characteristics. vsiRNAs, with A/U bias at the first nucleotide, were predominantly 21-nt long and they were derived predominantly (90%) from viral positive-strand RNA. 21-nt siRNA duplexes with 0-nt overhangs were the most abundant 21-nt duplexes, followed by 2-nt overhangs and then 1-nt overhangs 21-nt duplexes in infected P. equestris. Continuous but heterogeneous distribution and secondary structures prediction implied that vsiRNAs originate predominantly by direct Dicer-like enzymes cleavage of imperfect duplexes in the most folded regions of the positive strand of both viruses RNA molecular. Furthermore, we totally predicted 54 target genes by vsiRNAs with psRNATarget server, including disease/stress response-related genes, RNA interference core components, cytoskeleton-related genes, photosynthesis or energy supply related genes. Gene Ontology classification showed that a majority of the predicted targets were related to cellular components and cellular processes and performed a certain function. All target genes were down-regulated with different degree by vsiRNAs as shown by real-time reverse transcription polymerase chain reaction. Taken together, CymMV and ORSV siRNAs played important roles in interplay with P. equestris by down modulating the expression levels of endogenous genes in host plant.
Moon, Jae Won;Kang, Jang Hee;Kim, Hyun Ji;Byun, Soon Ok
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.52
no.7
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pp.785-790
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2009
Purpose : Febrile convulsions are a common pediatric neurological disease, and it is important to prevent such a disease by controlling the risk factors that may recur. A recent report states that influenza virus infections have a high probability of a relationship with febrile convulsions; therefore, it is necessary to identify the clinical properties of febrile convulsions in relation to domestic influenza virus infections. Methods : Between November 2005 and February 2008, children hospitalized because of febrile convulsions and subsequently confirmed to have influenza infections were enrolled as subjects (patient group, n=11). The control subjects were those admitted with influenza virus infections but no febrile convulsions (control group 1, n=46) and those who developed febrile convulsions without influenza virus infection (control group 2, n=53). Results : The patient group showed a higher maximum body temperature ($39.3{\pm}0.5^{\circ}C$), more histories of past febrile convulsions (72.7%), and a shorter total duration of fever ($2.9{\pm}1.2$ days) than control group 1. When multivariate analysis was performed, the probability of febrile convulsions was found to be as high as 225.9 times in patients who had influenza virus infections with a past history of febrile convulsions (OR=225.9, 95% CI: 1.7-4780.0, P<0.05). When patients with febrile convulsions were compared based on the symptoms of influenza virus infections, the patient group showed a shorter duration of fever ($0.9{\pm}0.7$ days) before convulsion than control group 2; these convulsions were mostly a recurrence of febrile convulsions. When multivariate analysis was performed, the cases with a past history of febrile convulsions showed 5.5 times (OR=5.5, 95% CI: 1.2-25.1, P=0.03) the probability of convulsions when infected with the influenza virus, and this probability decreased by 0.3 times over one-day increments of the febrile period until febrile convulsions (95% CI: 0.1-0.9, P=0.02). Maximum body temperature, total duration of fever, family history of febrile convulsions, and complex febrile convulsions did not show a statistical significance. Conclusion : In cases of pediatric influenza virus infection, the past history of febrile convulsions could be identified within the risk factor of recurrent febrile convulsions. Therefore, influenza vaccination of children having a past history of febrile convulsions will be helpful to avoid the recurrence of these convulsions.
Low pathogenic avian influenza (LPAI; H9N2) and Newcastle disease (ND) are economically important poultry diseases in Korea. In this study, we investigated pathological features and virus distribution in the lymphoid tissues of chicks experimentally infected with H9N2 and/or ND virus. Six-weeks-old SPF chickens were divided into 4 groups, Control (C), H9N2 (E1), NDV (E2), and H9N2+NDV (E3). E1 group was challenged with 0.1 ml A/Kr/Ck/01310/01 (H9N2) $10^{5.6}$$EID_{50}$ intranasally, E2 group was challenged with 0.5 ml KJW (NDV) $10^{5.0}{\sim}10^{6.0}$$ELD_{50}$ intramuscularly, and E3 group was challenged with H9N2, followed 7 days later by NDV. In histopathological examination, E1 group showed depletion and necrosis in bursa of Fabricius, thymus, cecal tonsil, and spleen, whereas E2 and E3 groups were noted severe lymphocyte depletion and necrosis with destruction of lymphoid organs structures. In TUNEL assay, apoptotic bodies were detected in lymphoid organs of all experimental groups, which was most severe in E3 group. H9N2 and ND viruses were predominantly detected in cecal tonsil of E1, E2, and E3 groups by PCR and immunohistochemistry (ICH). In conclusion, co-infection of H9N2 with NDV caused severe pathologic lesions and apoptosis in lymphoid tissues compared to single infections.
This study was conducted to determine whether the vaccination programs for the control of Newcastle disease(ND) would affect the immune status of Ogol chicken in Yeonsan, Chungnam province. The results obstained are summerized as followes ; 1. Maternal antibody titers level of Ogol chickes was 2 $log_2$. 2. The efficacy of the Newcastle spray and drinking water vaccine was evaluated by the antibody responses and the protection rates(over 90% ) after challenge with a virulent Newcastle disease vims at 14 days. 3. Spray vaccine caused on visible side reaction like respiratory symptoms, but it is declined of the 4~5 days.
Yoo, Dongwan;Kim, Hyunil;Lee, Joo Young;Yoo, Han Sang
Journal of Veterinary Science
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v.21
no.2
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pp.38.1-38.24
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2020
African swine fever (ASF), caused by the ASF virus, a member of the Asfarviridae family, is one of the most important diseases in the swine industry due to its clinical and economic impacts. Since the first report of ASF a century ago, ample information has become available, but prevention and treatment measures are still inadequate. Two waves of epizootic outbreaks have occurred worldwide. While the first wave of the epizootic outbreak was controlled in most of the infected areas, the second wave is currently active in the European and Asian continents, causing severe economic losses to the pig industry. There are different patterns of spreading in the outbreaks between those in European and Asian countries. Prevention and control of ASF are very difficult due to the lack of available vaccines and effective therapeutic measures. However, recent outbreaks in South Korea have been successfully controlled on swine farms, although feral pigs are periodically being found to be positive for the ASF virus. Therefore, we would like to share our story regarding the preparation and application of control measures. The success in controlling ASF on farms in South Korea is largely due to the awareness and education of swine farmers and practitioners, the early detection of infected animals, the implementation of strict control policies by the government, and widespread sharing of information among stakeholders. Based on the experience gained from the outbreaks in South Korea, this review describes the current understanding of the ASF virus and its pathogenic mechanisms, epidemiology, and control.
Pathogens on the cultured 579 rockfish, Sebastes schlegeli in the marine cage farms from Geoje and Tongyeong of the Southern sea were investigated from 2006 to 2008. The pathogens were detected throughout the year at 46.0~90.0% for 3 years and the detection rate was low with an average 58.1% in May and high with an average 81.5% in October. Bacteria only, bacteria-parasite mix and virus only were found in October and November as well as parasite only, whereas infection of parasite only was dominant in May when the temperature increased and in August when the temperature peaked. Of rockfish, Microcotyle sp. and Caligus sp. were dominant for parasitic disease, and Vibrio sp. and Streptococcus sp. were dominant bacteria. For virus, RSIV and VNNV were detected as dominant organisms. While no virus was detected in 2006, VNNV, VHSV and RSIV were detected in 2007 due to $1.5\sim2.0^{\circ}C$ higher temperature than 2006 in the summer season. For total prevalence by rockfish sizes, the highest was found at 50.0~87.1% in 11~15cm sizes and 50% was found in 30 cm size. Parasite showed a similar trend of 50.0~79.6% as the total prevalence. Prevalence for bacteria varied from 1.6% (for 10 cm group) to 23.8% (for 26 cm group) and higher virus prevalence of 21.5% was found from below 25 cm group.
Jong-Woo Han;Young-Uk Park;Cheol-Ku Youn;Seok-Ho Lee;Taek-Goo Jeong;Hong-Soo Choi;Mi-Kyeong Kim
Research in Plant Disease
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v.29
no.1
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pp.88-93
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2023
To investigate the incidence status of viruses in major cultivated areas of watermelon and melon in Chungbuk Province, samples were collected from 2020 to 2021 in vinyl greenhouse of Jincheon and Eumseong and examined for virus infection using reverse transcription polymerase chain reaction. Of the six viruses on watermelon that was analyzed in this study, watermelons were infected with cucumber mosaic virus (CMV), watermelon mosaic virus (WMV), cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), and cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV). The incidence rate of CMV was 20.9-35.0%, WMV 0.4-15.8%, CGMMV 1.6-38.5%, and CABYV was 3.5-3.7% from 2020 to 2021. But strangely, there were no incidence of zucchini yellow mosaic virus and cucurbit chlorotic yellows virus (CCYV) during investigation. From this result, we knew the major virus was CGMMV on watermelon in Chungbuk Province. Molecular diagnosis assays of the two melon viruses, showed that melons were infected with CABYV and CCYV from 2020 to 2021. The incidence rate of CABYV was 53.9-92.2% and CCYV was 2.7-20.8%. The incidence of CABYV was high in melon cultivation of Jincheon and Eumseong, Chungbuk. Afterwards, it is necessary to establish a control management strategy for reduce the incidence of CABYV. Furthermore, we must pay attention that of CCYV even if the incidence was low.
We here document discovery of expression profile of myeloid derived suppressor cells (MDSCs) in chronic hepatitis B (CHB) patients and changes in the course of disease. The study population was composed of 75 outpatient HBV cases and 15 healthy control cases. Peripheral blood samples were collected for separation of mononuclear cells. Levels of MDSCs labeled with Lin-DR-CD11b+CD33+ obtained from peripheral blood mononuclear cells (PBMC), were revealed to have significant differences between the CHB and other groups. They were 0.414% for health control cases and 0.226% for CHB cases (Z=-2.356, p=0.0189). It also observed that the group of HBeAg positive cases had significant difference in MDSCs/PBMC median ($X^2=11.877$, p=0.003), compared with group of HBeAg negative cases and the healthy control group. It suggested considerable MDSCs might be involved in HBeAg immune tolerance. In addition, negative correlations between MDSCs/PBMC and parameters of ALT, AST and TBil, while positive correlation between MDSCs/PBMC and ALB parameter were found. Multiple comparisons between the four phases and health control phase again, there was a statistically sifnificant difference ($X^2=17.198$, p=0.002). Taken together, these findings may provide a new immunotherapy strategy for reduced the expression levels of MDSCs in CHB patients, through induction of an autoimmune response to virus removal.
To examine whether HSV, VZV, H. pylori and Candida that are known to be microorganisms causing ulcerative disease in oral cavity and have the relatively high contigiousness are detected in saliva of patients with RAU and related to the development with RAU, PCR and culture were performed on the saliva of 29 patients with RAU and 29 control subjects who visited the Department of Oral Medicine, Dental Hospital, Chosun University. The results were obtained as follows; 1. HSV DNA was detected in 41.4% patients with RAU, and 55.2% control subjects, however, a significant difference between the two groups was not detected, (P>0.05), and VZV DNA was not detected in both groups. 2. H. pylori DNA was detected in 27.6% patients with RAU, and 48.3% control subjects, however, a significant difference between the two groups was not detected (P>0.05). 3. Candida was cultured in 13.8% patients with RAU, and 6.9% control subjects, however, a significant difference between the two groups was not detected (P>0.05). This results suggest that HSV, VZV, H. pylori and Candida can not be regarded to play a direct role in the development of RAU. Thus it is considered that in future, on a larger sample, also, it has to be examined whether other microorganisms acts as a trigger factor of the development of RAU.
Hemagglutination-inhibition titers (log2) to Newcastle disease (ND) vims were chronologically observed in chicks, which were orally inoculated with 5 × 105 oocysts of Cwptospori,drum bcileyi at 2 days of age and subsequently vaccinated with inactivated ND virus at 4 and 21 days postinoculation. In general, the titers were considerably lower in the infected chicks than those in the uninfected control throughout the experimental period (p < 0.01), and rapid negative seroronversions were observed in the infected chicks. The titers reached a peak on weeks 2 and 4 post-booster-vaccination in the control and infected chicks, respectively. Thus, C. bciLeWi infection was shown to have an immunosuppressive effect on ND vaccination when the agent was given to 2-day-old chicks. It is suggested that C. bniLeWi infection in chicks may increase the host susceptibility to ND virus.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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