• 제목/요약/키워드: Colony formation

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Induction of colony formation in planktonic algae by substances released from grazer zooplankton

  • Kyong, Ha;Jang, Min-Ho;Joo, Gea-Jae;Bahk, Jae-Rim;Takamura, Noriko
    • 한국환경과학회:학술대회논문집
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    • 한국환경과학회 2001년도 가을 학술발표회 발표논문집
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    • pp.198-200
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    • 2001
  • Grager-Induced colony formation was examined using strains of green alga Scenedemus dimorphus (Turpin) Kutzing. Alga was cultured in a medium with or without filtered water in which Daphnia magna or Moina macrocopa had been reared. Colony formation was obviously promoted in S. dimorphus by exposure to zooplankton filtered water (ZFW), showing in proportion to the volume of zooplankton filtered water in cultured media. The particle volume as well as the number of cells per one colony of S. dimorphus increased between 24 and 48 hours after exposure to ZFW, which were caused by an infochemical released from from Daphnia or Moina probably as a part of defense mechanism against zooplankton grazing.

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인간 배아줄기세포의 생식세포로의 분화 및 효소에 의해 분리된 단일줄기세포 배양조건 (Differentiation of Human Embryonic Stem Cells into Germ Cell and Culture Condition for Single Embryonic Stem Cells Dissociated by Enzyme)

  • 지희준;최순영;정다연
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제37권1호
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    • pp.13-23
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    • 2010
  • 목 적: 본 연구는 인간 배아줄기세포를 생식세포로의 분화를 유도하고 효소에 의해 분리된 단일 배아줄기세포의 배양조건을 확립하기 위해 수행하였다. 연구방법: Embryonic body (EB)는 배아줄기세포 (hESCs) colony를 떼어내어 3일간 hanging drop culture 방법으로 작성하였고, 이러한 EB를 retionic acid (RA)와 bone morphogenetic protein-4 (BMP4)를 단독 또는 함께 배양액에 첨가하여 14일간 배양함으로써 생식세포로의 분화를 유도하였다. 분화를 유도한 EB는 생식세포 발현유전자인 c-kit과 VASA의 표지인자를 이용한 면역조직형광법으로 분화여부를 조사하였다. 줄기세포는 Collagenase, Tryple 그리고 Accutase 등의 효소로 각각 분리하였고 분리된 단일세포들의 colony formation rate를 조사하였다. 한편 Rho-associated kinase inhibitor (Y-27632)를 단일세포 배양액에 첨가하여 단일세포 분리과정 중에 발생하는 apoptotic damage를 감소시키고자 하였다. 결 과: Tryple 또는 Accutase를 이용하여 분리한 단일세포가 Collagenase에 의해 분리된 세포에 비해 높은 colony formation rate를 나타내었다. 단일세포를 $5{\times}10^3$ cells/well (4 well dish) 농도로 지지세포 위에 seeding하였을 때 다른 농도의 세포를 seeding한 것에 비해 높은 colony formation rate를 확보하는데 효과적이었다. Y27632의 첨가는 단일세포의 colony formation rate를 유의하게 향상시켰으며 특히 Tryple로 분리한 단일세포에 보다 효과적이었다. EB의 분화유도후 c-kit과 VASA의 표지인자를 이용한 면역조직형광염색은 대조군인 정소조직에 비해 약한 형광염색을 나타내었다. 결 론: Tryple을 이용한 단일세포 분리가 건강한 단일세포를 얻는데 가장 효율적이었으며 Y27632 의 첨가는 단일 세포의 생존 및 colony formation에 유익하다는 것을 확인하였다. 다른 연구와는 달리 본 연구에서는 단지 생식세포 표지인자의 희미한 형광염색만을 관찰하였는데 이러한 결과는 본 연구의 분화유도기간이 상대적으로 짧았던 것이 원인이었을 것으로 생각된다.

Characterization of the Maize Stalk Rot Pathogens Fusarium subglutinans and F. temperatum and the Effect of Fungicides on Their Mycelial Growth and Colony Formation

  • Shin, Jong-Hwan;Han, Joon-Hee;Lee, Ju Kyong;Kim, Kyoung Su
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제30권4호
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    • pp.397-406
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    • 2014
  • Maize is a socioeconomically important crop in many countries. Recently, a high incidence of stalk rot disease has been reported in several maize fields in Gangwon province. In this report, we show that maize stalk rot is associated with the fungal pathogens Fusarium subglutinans and F. temperatum. Since no fungicides are available to control these pathogens on maize plants, we selected six fungicides (tebuconazole, difenoconazole, fluquinconazole, azoxystrobin, prochloraz and kresoxim-methyl) and examined their effectiveness against the two pathogens. The in vitro antifungal effects of the six fungicides on mycelial growth and colony formation were investigated. Based on the inhibition of mycelial growth, the most toxic fungicide was tebuconazole with 50% effective concentrations ($EC_{50}$) of < $0.1{\mu}g/ml$ and $EC_{90}$ values of $0.9{\mu}g/ml$ for both pathogens, while the least toxic fungicide was azoxystrobin with $EC_{50}$ values of 0.7 and $0.5{\mu}g/ml$ for F. subglutinans and F. temperatum, respectively, and $EC_{90}$ values of > $3,000{\mu}g/ml$ for both pathogens. Based on the inhibition of colony formation by the two pathogens, kresoxim-methyl was the most toxic fungicide with complete inhibition of colony formation at concentrations of 0.1 and $0.01{\mu}g/ml$ for F. subglutinans and F. temperatum, respectively, whereas azoxystrobin was the least toxic fungicide with complete inhibition of colony formation at concentrations > $3,000{\mu}g/ml$ for both pathogens.

Cultural Characteristics and Fruiting Body Production in Cordyceps bassiana

  • Lee, Je-O;Shrestha, Bhushan;Sung, Gi-Ho;Han, Sang-Kuk;Kim, Tae-Wong;Sung, Jae-Mo
    • Mycobiology
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    • 제38권2호
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    • pp.118-121
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    • 2010
  • Single ascospore isolates of Cordyceps bassiana were observed for their colony pigmentation on Sabouraud Dextrose agar plus Yeast Extract (SDAY) plates and were inoculated in a brown rice medium for production of fruiting bodies. Colony pigmentation did not show any relationship with perithecial stromata formation. The isolates were also grown on opposite sides of SDAY agar plates and were observed for vegetative compatibility. Neither vegetative compatibility nor perithecial stromata could be found to be related to each other. It was concluded that fertile fruiting body production was independent of colony pigmentation and vegetative compatibility. Synnemata formation was found to be more common than perithecial stromata formation. This might be due to its highly conidiogenous anamorphic stage, i.e., Beauveria bassiana.

방사선 피폭 마우스에서 홍삼, 백삼 및 diethyldithoicarbamate의 효과 (Effect of Red Ginseng, White Ginseng and Diethyldithoicarbamate in Irradiated Mice)

  • 김성호;이해준;김세라;이종환;조성기;나승렬;손창호;신동호
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제25권2호
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    • pp.68-73
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    • 2001
  • Studies were performed to determine the effect of red ginseng and white ginseng on jejunal crypt survival, endogenous spleen colony formation, and apoptosis of jejunal crypt cells in irradiated mice. The radioprotective effect of ginseng was compared with the effect of diethyldithocarbamate(D). Jejunal crypts were protected from irradiation by pretreatment of red ginseng (50 mg/kg B.W., I.P. at 36 and 12 hours before irradiation) and white ginseng (50 mg/kg B.W., I.P. at 36 and 12 hours before irradiation). Red ginseng administration before irradiation and both pretreatment and posttreatment (50 mg/kg B.W., I.P. at 30 minutes after irradiation) of white ginseng resulted in an increase of the formation of endogenous spleen colony. the frequency of radiation-induced apoptosis in intestinal crypt cells was also reduced by both pretreatment and posttreatment of red ginseng, and pretreatment of white ginseng. The radioprotective effect of DDC (1000 mg/kg B.W., I.P. at 30 minutes before irradiation) on jejunal crypt survival and apoptosis was similar to those of ginseng treatment. Treatment with DDC showed no significant modifying effects on formation of endogenous spleen colony. These results indicated that ginseng might be a useful radioprotector. Further studies are needed to characterize effective radioprotective components and mechanism of ginseng.

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생쥐 내세포괴의 분리방법과 지지세포의 종류와 Mitomycin C 처리 시간이 내세포괴 Colony 형성률에 미치는 영향 (Effect of the Isolation Method of Mouse Inner Cell Mass, Types of Feeder Cells and Treatment Time of Mitomycin C on the Formation Rate of ICM Colony)

  • 장호진;고경래;김미경;나용진;이규섭
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제33권4호
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    • pp.265-272
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    • 2006
  • 목 적: 본 연구는 생쥐 포배기 배아로부터 내세포괴를 분리하는 방법과 지지세포의 종류와 mitomycin C 처리 시간이 내세포괴 colony 형성률에 미치는 영향을 관찰하기 위해 시행되었다. 연구방법: 일반적인 면역절제술, 주사바늘을 이용한 부분 영양막세포 절개법, 포배기 배아 공배양법으로 내세포괴를 분리한 후, 상업적으로 구입이 가능한 STO 또는 직접 제조한 생쥐 배아섬유아세포 (pMEF)를 지지세포로 이용하여 배양하였다. 또한, mitomycin C를 1, 2, 3시간 동안 처리한 각각의 지지세포에서 7일 동안 배양한 후, 내세포괴 colony 형성률을 살펴보았다. 결 과: STO 지지세포에서는 부분 영양막세포 절개법을 사용한 경우 (52%)가 면역절제술 (12%)이나 포배기 배아 공배양법 (16%)을 사용한 경우보다 내세포괴 colony 형성률이 유의하게 높았다 (p<0.05). pMEF 지지세포에서의 형성률은 부분 영양막세포 절개법을 사용한 경우 (88%)와 포배기 배아 공배양법 (82%)을 사용한 경우가 면역절제술 (16%)을 사용한 경우보다 높았다 (p<0.05). STO와 pMEF 모두에서, 2시간 mitomycin C 처리군 (52%, 88%)이 1시간 처리군 (9%, 42%)과 3시간 처리군 (18%, 76%)보다 높은 내세포괴 colony 형성률을 보여주었다 (p<0.05). 결 론: 이상의 결과는 부분 영양막세포 절개법이 생쥐 포배기 배아로부터 내세포괴를 분리하는 가장 효과적인 방법이며, 가장 적절한 mitomycin C 처리 시간은 2시간이라는 것을 보여준다. 그러나 이와 같은 부분 영양막세포 절개법의 효용성을 보다 명확하게 확인하기 위해서는 분리한 내세포괴를 계대배양하여 줄기세포주로서의 특성을 확인하는 실험이 추가적으로 필요할 것으로 생각된다.

Advanced tube formation assay using human endothelial colony forming cells for in vitro evaluation of angiogenesis

  • Lee, Hyunsook;Kang, Kyu-Tae
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제22권6호
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    • pp.705-712
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    • 2018
  • The tube formation assay is a widely used in vitro experiment model to evaluate angiogenic properties by measuring the formation of tubular structures from vascular endothelial cells (ECs). In vitro experimental results are crucial when considered the advisability of moving forward to in vivo studies. Thus, the additional attentions to the in vitro assay is necessary to improve the quality of the pre-clinical data, leading to better decision-making for successful drug discovery. In this study, we improved the tube formation assay system in three aspects. First, we used human endothelial colony forming cells (ECFCs), which are endothelial precursors that have a robust proliferative capacity and more defined angiogenic characteristics compared to mature ECs. Second, we utilized a real-time cell recorder to track the progression of tube formation for 48 hours. Third, to minimize analysis error due to the limited observation area, we used image-stitching software to increase the microscope field of view to a $2{\times}2$ stitched area from the $4{\times}$ object lens. Our advanced tube formation assay system successfully demonstrated the time-dependent dynamic progression of tube formation in the presence and absence of VEGF and FGF-2. Vatalanib, VEGF inhibitor, was tested by our assay system. Of note, $IC_{50}$ values of vatalanib was different at each observation time point. Collectively, these results indicate that our advanced tube formation assay system replicates the dynamic progression of tube formation in response to angiogenic modulators. Therefore, this new system provides a sensitive and versatile assay model for evaluating pro- or anti-angiogenic drugs.

루우핀 콩의 발효에 관한 연구 (제 1 보)콩배지에서 Aspergillus oryzae 성장속도의 측정 (Studies on the Fermentation of Lupinseed (Part 1) Determination of the Growth Rate of Aspergillus oryzae on Beans.)

  • Lee, Cherl-Ho;Oh, Sung-Hoon;Kim, Chan-Shick
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.227-232
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    • 1982
  • 삶은 콩을 이용한 고체 배지상에서 Aspergillus oryzae의 성장 속도를 측정하는 방법에 대하여 연구하고 이들 방법을 대두와 루우핀콩 배지에서의 균 성장 특성을 비교하는데 적용하였다. 여러가지 배지 조건에서 배양 기간에 따른 균체 colony의 형성시간 크기변화, $\alpha$-아미노 질소함량의 변화, 포자형성 시간 및 균사길이의 변화등을 측정 비교하였다. 배지의 종류에 따라 Aspergillus oryzae는 특정한 균체 colony 형성시간을 나타내었으며 colony 형성후 부터는 colony 직경의 크기는 배양시간에 따라 직선적으로 증가하였다. 균체colony 직경은 배지중의 $\alpha$-아미노 질소함량과 높은 직접적인 상관관계를 나타내었으나 배지의 수분함량이 변하면 이러한 상관관계가 성립되지 않았다. 오히려 배지의 수분함량이 증가하면(60%-85%) $\alpha$-아미노 질소함량은 증가하나 colony 직경은 감소하는 역 관계를 나타내었다. 일반적으로 Aspergillus oryzae는 삶은 루우핀콩 페이스트에서 최초 성장 속도가 대두보다 발랐으며. 루우핀콩 배지에서의 colony 형성시간이 24시간인데 반해 대두에서는 44.4 시간이 걸렸다. 그러나 colony 형성이후의 성장 속도는 대두에서 더 빠르게 나타나 대두의 경우 8.83mm/day 인데 반하여 루우핀 콩에서는 7.05mm/day이었다. spore 형성 시간은 colony 형성 시간과 깊은 상관관계를 나타내었으며 일반적으로 루우핀콩에서 spore 형성 시간이 짧았다. 콩의 표면에서 균사길이를 측정하는 방법은 간단하고 빨리 균체의 성장 속도를 비교할수 있 었으며 특히 콩의 구조와 형태가 균체 성장에 미치는 영향을 조사하는데 편리하였다. 본 실 험에서는 이 방법으로 루우핀콩의 두꺼운 외피가 균체 성장을 저해하고 있음을 발견하였다.

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박테리아와 어류가 유해조류 Microcystis aeruginosa의 성장 및 형태변화에 미치는 영향 (Effects of Fish and Bacterium on the Morphological and Growth of Cyanobacterium Microcystis aeruginosa)

  • 김보라;한명수;김백호
    • 생태와환경
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    • 제38권3호통권113호
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    • pp.420-428
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    • 2005
  • 유해조류의 대발생을 제어하기 위하여 개발되었던 박테리아, 백운몰개, 송사리 등의 직접 및 배양여액이 배양중인 단독형 (solitary) 남조 M. aeruginosa의 성장 및 형태에 어떠한 영향을 주는지 파악하기 위하여 대수기 조류세포에 생물제재를 농도별로 처리하였다. 실험에 사용된 3가지 생물제재의 적접처리시 남조 M. aeruginosa를 효과적으로 감소시켰으며, 특히 2종의 어류는 모두 처리 5일째 조류세포를 완전히 제어하였다. 생물제재의 직접 또는 여액에 의한 조류세포의 군체형성은 생물제재의 종류, 처리유형, 처리농도 등에 따라 차이를 보였는데, 어류의 경우, 여액 처리농도가 높을수록 높은 군체 및 군체당 높은 세포수를 나타냈으나, 살조세균은 농도에 따른 유의한 차이를 보이지 않았다. 결국, 유해조류의 제어를 위한 생물제재의 현장 적용은 남조 M. aeruginosa의 군체형성을 유도함으로서 새로운 조류대발생의 원인이 될 수 있기 때문에 새로운 생물제재나 적용기법 등의 개발이 필요하다고 판단되었다.

Protoplast Culture by Electrofusion of Protoplasts from Solanum sisymbriifolium and Other Solanum Species

  • Kim Hag-Hyun;Jung Hye-Jin;Shin Un-Dong
    • 한국자원식물학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.422-426
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    • 2006
  • This research was conducted to get the basic materials necessary to obtain the somatic hybrid plant between Solanum sisymbriifolium and other Solanum species (S. integrifolium and S. toxicarium). Regarding the formation of colony from the protoplast in S. sisymbriifolium, S. integrifolium and the fused protoplast mixture; for the S. sisymbriifolium, a colony was observed in F medium(Kao medium containing $5.0mg{\cdot}L^{-1}\;NAA,\;1.0mg{\cdot}L^{-1}$ 2,4-D and $1.0mg{\cdot}L^{-1}$ BA); and for the S. integrifolium, in G medium (a half strength MS medium containing 0.03 M sucrose, 0.4 M mannitol, $1.0mg{\cdot}L^{-1}\;NAA,\;1.0mg{\cdot}L^{-1}$ kinetin) respectively. In mixed cultured protoplast after electriofusion treatment, the cell division and colony formation were observed in both media F and G. For the shoot and root formation rate, there was no difference between the parent of each breed and mixed protoplast regardless of the medium. In the fused protoplast mixture of S. sisymbriifolium and S. toxicarium, a colony formation was also observed in both media F and H(a half strength MS medium containing 0.03 M sucrose, 0.4 M mannitol, $1.0mg{\cdot}L^{-1}\;NAA,\;1.0mg{\cdot}L^{-1}$ kinetin); and there was no difference in the shoot and root formation rate between the parent and the mixed protoplast.