Oo, May Moe;Yoon, Ha-Yeon;Jang, Hyun A;Oh, Sang-Keun
The Plant Pathology Journal
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제34권6호
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pp.480-489
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2018
Bitter rot caused by Colletotrichum species is a common fruit rotting disease of apple and one of the economically important disease in worldwide. In 2015 and 2016, distinct symptoms of bitter rot disease were observed in apple orchards in five regions of South Korea. In the present study, infected apples from these regions were utilized to obtain eighteen isolates of Colletotrichum spp. These isolates were identified and characterized according to their morphological characteristics and nucleotide sequence data of internal transcribed spacer regions and glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase. Molecular analyses suggested that the isolates of Colletotrichum causing the bitter rot disease in South Korea belong to 4 species: C. siamense; C. fructicola; C. fioriniae and C. nymphaeae. C. siamense and C. fructicola belonged to Musae Clade of C. gloeosporioides complex species while C. fioriniae and C. nymphaeae belonged to the Clade 3 and Clade 2 of C. acutatum complex species, respectively. Additionally, we also found that the isolates of C. gloeosporioides species-complex were more aggressive than those in the C. acutatum species complex via pathogenicity tests. Taken together, our results suggest that accurate identification of Colletotrichum spp. within each species complex is required for management of bitter rot disease on apple fruit in South Korea.
This study was carried out to assess the antifungal potential of R. oligosporus and its ethyl acetate (EtOAc) extract against the fungal pathogens causing anthracnose disease in apple fruits using disc diffusion, antagonistic effect and morphological abnormalities in fungal mycelia. The percentage of inhibition of antifungal effect of the ethyl acetate extract (5 ${\mu}l$$disc^{-1}$) of the R. oligosporus against C. acutatum KACC 40848, C. gloeosporioides KACC 40897, C. higginsianum KACC 40806, C. orbiculare KACC 40808, C. coccodes KACC 40008, C. musae KACC 40947, C. boninense KACC 40893, C. liliacearum KACC 40981, C. caudatum KACC 41028 and Colletotrichum sp. KACC 40811 was found to be 44.4, 35.5, 40, 31.1, 33.3, 37.7, 40, 51.1, 28.8 and 28.8%, respectively. Also the fungus R. oligosporus showed potential antagonistic effect of antifungal activity against the tested pathogens of Colletotrichum spp. Further, R. oligosporus had a potential detrimental effect on the morphology of the tested fungi of Colletotrichum spp. such as wrinkle abnormalities, abnormal cell formation, lysis of mycelium, empty cell formation, distorted cell formation and breakage of the mycelium. These findings strongly support the role of R. oligosporus to serve as a potential antifungal agent to control plant pathogenic fungi causing anthracnose disease in apple fruits.
콩 탄저병의 효과적인 관리를 위하여 병원균의 병원성을 비교하고, 포자발아, 부착기 형성, 균사생장 및 병 진전에 미치는 온도와 수분존재시간의 영향, 그리고 살균제에 대한 반응을 조사하였다. C. gloeosporioides의 종자병원성은 C.truncatum과 비슷하게 높았으나 경엽에서의 병원성은 현저히 낮았다. C. gloeosporioides의 포자발아, 부착기 형성, 균사생장 적온은 $25^{\circ}C$였고, C. truncatum의 적온은 $30^{\circ}C$였으며, $15^{\circ}C$에서는 매우 낮았다. 살균제에 대한 반응은 C. truncatum은 fluazinam과 benomyl에 대해, C. gloeosporioides는 fluazinam과 triflumizole에 대해 높은 감수성을 보였다. C. truncatum에 의한 병의 진전율은 수분존재시간이 8시간이면 $30^{\circ}C$에서, 32시간 이상이면 $25^{\circ}C$에서 가장 높았으며, $20^{\circ}C$에서는 매우 낮았다. 살균제에 대한 감수성은 병원균에 따라 차이가 있으므로 Colletotrichum spp. 의 중복감염에 의한 콩 탄저병의 방제를 위해서는 살균제의 정확한 선택이 중요할 것으로 보인다.
This study was carried out to research microorganisms having the antifungal activity against ginseng Alternaria blight pathogen Alternaria panax and ginseng anthracnose pathogen Colletotrichum gloeosporioides. Eleven Bacillus strains. were isolated from Korean traditional soybean paste and Kimchi. Among the 11 isolates, DJ5, KC1, KC2 and KC4 showing antagonistic activity on the mycelial growth of A. panax and C. gloeosporioides in pairing culture were finally selected as the antagonistic microorganisms. Based on 16s rRNA sequence and phylogenetic tree analysis, they were identified as Bacillus spp.. The selected microorganisms were investigated antagonistic activity by measured leaf-segment colonization in pot test. When Bacillus sp. were injected after A. panax treatment, KC1, KC2 and KC4 showed similar effect to chemical pesticides treated control. To measure preventive effect of Bacillus sp, antagonistic microorganisms were injected and C. gloeosporioides was treated in pot. When measuring the effectiveness for the prevention of Anthracnose, All Bacillus spp. showed approximately 83~90 % degree of superior preventive effect. In general, The four Bacillus spp. isolated from Korean traditional fermented foods showed therapeutic effect of Alternaria blight and preventive effect of Anthracnose.
Dieback disease in mango trees has been observed in Indonesia, particularly in Java Island, with the causal agent remaining unidentified. One of the important pathogens that are responsible for causing mango dieback is Colletotrichum. Field surveys were conducted in various mango cultivating areas in Java Island, Indonesia to assess prevalence of Colletotrichum as dieback disease pathogen. Eleven Colletotrichum isolates were recovered from symptomatic dieback twigs and morphologically characterized. Genetic diversity fingerprint analysis was carried out using rep-PCR. Phylogenetic analysis identified isolates as belonging to Colletotrichum asianum and Colletotrichum cairnsense using partial sequences of four gene regions, including ITS, ACT, GAPDH, and TUB2. Pathogenicity tests on mango seedlings cv. Arumanis showed that all fungal isolates were responsible for causing dieback symptoms. Subsequently, symptomatic tissue was reisolated to fulfill Koch's Postulate. This study represented new funding for two species of Colletotrichum causing mango dieback in Indonesia.
Colletotrichum spp.에 의해 감염되는 고추 탄저병은 고추 생산량에 경제적인 감소를 초래한다. 분자 진단은 병원균의 신속한 동정과 살균제 저항성을 결정하는 데 중요한 역할을 하는데, 이를 위한 병원균의 분리, 게놈 DNA 추출 및 유전자 염기서열 분석은 시간이 소요된다. 이 연구에서는 게놈 DNA 추출이나 특별한 처리 과정 없이 Colletotrichum 종의 포자를 사용하는 방법을 적용하였다. 방법의 명확성을 위해 ITS 기반의 primer 쌍을 이용하여 PCR 및 qPCR 검정으로 민감도를 분석하였다. PCR과 qPCR 실험 모두 탄저병균 1개의 포자에서도 검출되었다. 이 결과 1,000개 포자가 1 pg의 게놈 DNA와 동일하였다. QoI 계열 살균제 감수성 검정을 위한 cytb 유전자 증폭은 단일포자에서도 검출이 가능하지만, cycle 수를 35 cycle로 늘릴 경우 염기서열 정보를 안정적으로 확보할 수 있을 만큼의 PCR 산물이 확보되었다. 또한, V8-Juice 한천 배지에 10% 간 고추를 첨가할경우 일반적으로 사용되는 감자 한천 배지에 비해 3.2-6.0배 더 많은 포자가 형성되어 포자 기반 연구를 위해 적용 가능할 것이다. 본 연구를 종합하면, 이 연구는 PCR 및 qPCR 분석을 통해 고추 탄저병의 분자 동정을 위한 최소 포자량 및 바코드 유전자를 포함한 표적 유전자 증폭에 포자를 활용할 수 있는 유용한 기술을 제공한다.
Kim, Joon-Tae;Park, Soo-Kyoung;Park, Woobong;Lee, Yong-Hwan;Kim, Heung-Tae
한국식물병리학회:학술대회논문집
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한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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pp.125.1-125
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2003
Pepper anthracnose is one of the major limiting factors in pepper production. Boring last over 10 years, Colletotrichum gloeosporioides has been known as the most prevalent species among five Colletotrichum spp. involved as anthracnose causing agents. Recently, however, the change of major species with pepper anthracnose has been proposed. Identification study was peformed on 12 test isolates collected from anthracnose disease symptoms on pepper during 2001-2002 and 25 reference isolates obtained from several other host plants. The identification of the isolates with morphological observation and IfS region sequence comparison resulted that 11 ones from 12 test isolates colleted from pepper anthracnose during 2001-2002 were identified as C. acutatum. PCR using species-specific primers designed from ITS region sequence suggested a rapid diagnosis method in identifying C. acutatum from C. gloeosporioides.
1. 충남(忠南) 각지(各地)에서 수집(收集)한 28개(個) 콩종자(種子) sample을 blotter법(法)으로 조사(調査)하였던 바 21종(種)의 균류(菌類)가 검출(檢出)되었고, 특히 부생균(腐生菌)인 Alternaria alternata, Aspergillus spp., Penicillium spp. 등(等)과, 자주빛무늬병균(病菌) (Cercospora kikuchii) 및 Fusarium spp. 이 많이 검출(檢出)되었다. 2. 자주빛무늬가 있는 종자(種子)에서는 무늬가 없는 종자(種子)에 비(比)하여 C. kikuchii가 많이 검출(檢出)되었고 반면(反面)에 Aspergillus spp.나 Penicillium spp.와 같은 부생균(腐生菌)의 오염율(汚染率)과 Phomopsis sp. 및 Fusarium 균(菌)의 이병율(罹病率)이 낮았다. 3. 병원성실험(病原性實驗) 결과(結果) Cercospora kikuchii, Colletotrichum dematium, Fusarium moniliforme, F. oxysporum, F. semitectum, Phomopsls sp.는 병원성(病原性)을 나타내었으나, F. equiseti와 F. solani는 병원성(病原性)이 없었다.
옻나무 주성분인 조추출액의 고추 탄저병균에 대한 항진균활성을 조사한 결과 1.0 mg urushiol/mL PDA 농도에서 18.3-39.5%의 억제효과가 있었으며, 푸른 고추에 병원성이 강한 것으로 조사된 GC계열의 균주보다는 DC계열의 균주에 대한 효과가 높았다. Urushiol의 농도가 1.0 mg/mL 일 경우 약 70% 정도의 포자가 발아한 PDB 용액에서보다 공시 모든 균주의 포자발아는 50% 이상 억제되었다. 동일한 농도에서 균사생장억제 효과 보다는 포자발아에 대한 억제 효과가 다소 높은 경향을 보였다. 푸른 고추와 붉은 고추에 옻 추출액을 처리하고 공시 탄저병균을 접종한 후 병 발생 억제효과를 in vitro에서 검정한 결과 붉은 고추에 DC 균주를 접종하였을 경우 1.0 mg/mL 농도 처리에서는 75.0%, 0.1 mg/mL 농도 처리에서는 58.0% 로 나타났으며, 푸른고추에 병원성이 강한 GC 균주를 접종하였을 경우에는 각각 68.1% 및 28.3% 탄저병 발생이 억제되었다. 비닐하우스에서 관행재배방법에 의해 고추를 재배하면서 고추 탄저병이 자연발생하기 시작한 8월 21부터 옻 추출액을 1주일 간격으로 3회 살포하고 최종 살포일 7일 후에 전체 고추 열매 중 이병 열매를 조사하여 옻 추출액의 병 발생 억제정도를 구한 결과 1차 조사한 9월 11일에는 무처리 대조구에 비해 옻 조 추출액을 1.0 mg/mL 처리한 시험구에서는 85.0% 탄저병 발생 억제효과를 보였으나, 0.01 mg/mL 처리구에서는 9.8%의 낮은 억제효과를 보였다. 9월 11일 조사 후 이병 열매를 모두 제거한 다음 동일한 방법으로 옻 추출액을 계속처리하고 10월 2일에 조사한 결과 1차 조사 시기보다 대조구의 이병과율이 훨씬 낮은 7.0% 였으며, 옻 추출액 처리효과는 공시 처리 농도별로 각각 60.0, 54.3 및 10.0%로 조사되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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