• Toxicological Research
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• 제31권1호
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• pp.11-16
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• 2015

Our body's immune system has defense mechanisms against pathogens such as viruses and bacteria. Immune responses are primarily initiated by the activation of toll-like receptors (TLRs). In particular, TLR4 is well-characterized and is known to be activated by gram-negative bacteria and tissue damage signals. TLR4 requires myeloid differentiation factor 2 (MD2) as a co-receptor to recognize its ligand, lipopolysaccharides (LPS), which is an extracellular membrane component of gram-negative bacteria. Gambogic acid is a xanthonoid isolated from brownish or orange resin extracted from Garcinia hanburyi. Its primary effect is tumor suppression. Since inflammatory responses are related to the development of cancer, we hypothesized that gambogic acid may regulate TLR4 activation. Our results demonstrated that gambogic acid decreased the expression of pro-inflammatory cytokines ($TNF-{\alpha}$, IL-6, IL-12, and $IL-1{\beta}$) in both mRNA and protein levels in bone marrow-derived primary macrophages after stimulation with LPS. Gambogic acid did not inhibit the activation of Interferon regulatory factor 3 (IRF3) induced by TBK1 overexpression in a luciferase reporter gene assay using IFN-${\beta}$-PRD III-I-luc. An in vitro kinase assay using recombinant TBK1 revealed that gambogic acid did not directly inhibit TBK1 kinase activity, and instead suppressed the binding of LPS to MD2, as determined by an in vitro binding assay and confocal microscopy analysis. Together, our results demonstrate that gambogic acid disrupts LPS interaction with the TLR4/MD2 complex, the novel mechanism by which it suppresses TLR4 activation.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제29권2호
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• pp.381-388
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• 2008

An X-linked skeletal disorder, SEDT (spondyloepiphyseal dysplasia tarda) is a genetic disease characterized by a disproportionately short trunk and short stature caused by mutations in the SEDL gene. This gene is evolutionarily conserved from yeast to human. The yeast SEDL protein ortholog, Trs20p, has been isolated as a member of a large multi-protein complex called the transport protein particle (TRAPP), which is involved in endoplasmic reticulum (ER)-to-Golgi transport. The interaction between SEDL and partner proteins is important in order to understand the molecular mechanism of SEDL functions. We isolated several SEDL-binding proteins derived from rat cells by an immobilized GST-fusion method. Furthermore, the SEDL-homologue proteins were identified using motif based methods. Common motifs between SEDL-binding proteins and SEDL-homologue proteins were classified into seven types and 78 common motifs were revealed. Sequence similarities were contracted to seven types using phylogenetic trees. In general, types I-III and VI were classified as having the function of acetyl-CoA carboxylase, glycogen phosphorylase, isocitrate dehydrogenase, and enolase, respectively, and type IV was found to be functionally related to the GST protein. Types V and VII were found to contribute to TRAPP vesicle trafficking.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권12호
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• pp.1653-1658
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• 2012

We have reported previously that a recombinant Escherichia coli co-expresses aminolevulinic acid (ALA) synthase, an NADP-dependent malic enzyme, and a dicarboxylate transporter-produced heme, an iron-chelated porphyrin, in a succinate-containing complex medium. To develop an industrially plausible process, a chemically defined medium was formulated based on M9 minimal medium. Heme synthesis was enhanced by adding sodium bicarbonate, which strengthened the C4 metabolism required for the precursor metabolite, although a pH change discouraged cell growth. Increasing the medium pH buffering capacity (100mM phosphate buffer) and adding sodium bicarbonate enabled the recombinant E. coli to produce heme at rates 60% greater than those in M9 minimal medium. Adding growth factors (1 mg/l thiamin, 0.01 mg/l biotin, 5 mg/l nicotinic acid, 1 mg/l pantothenic acid, and 1.4 mg/l cobalamin) also induced positive heme production effects at levels twice of heme production in M9-based medium. Porphyrin derivatives and heme were found in the chemically defined medium, and their presence was confirmed by liquid chromatography/mass spectroscopy (LC/MS). The formulated medium allowed for the production of $0.6{\mu}M$ heme, $29{\mu}M$ ALA, $0.07{\mu}M$ coproporphyrin I, $0.21{\mu}M$ coproporphyrin III, and $0.23{\mu}M$ uroporphyrin in a 3 L pH-controlled culture.

• 암석학회지
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• 제13권1호
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• pp.34-45
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• 2004

본 연구는 제주도에 분포하는 현무암에 포획된 맨틀포획암과 맨틀포획암에 포획된 유체포유물에 대한 암석 및 조직에 대한 기재와 하부지각물질이 초고온의 변성작용을 받아 형성된 부카이트라는 산성질포획암에 관한 예비연구이다. 제주도에 분포하는 알칼리현무암에는 초염기성포획암, 산성질포획암, 큐뮬레이트포획암이 풍부하게 포획되어 있다. 초염기성포획암은 첨정석(스피넬)-레졸라이트가 대부분이며, 첨정석-레졸라이트는 감람석, 사방휘석, 단사휘석과 첨정석로 이루어져 있다. 부카이트는 석영, 사장석과 검은 세맥으로 이루어져 있으며, 큐뮬레이트포획암은 단사휘석 혹은 단사휘석과 사장석으로 이루어진 거정의 결정들로 구성되어 있다. 이들 포획암들의 구성입자들은 조립질이며, 하부지각/상부맨틀에서의 복잡한 진화사를 보여주는 변성암의 특징을 나타낸다. 초염기성포획암에는 프로토그라뉼라, 반상쇄성, 등립질의 조직이 관찰되며, 이러한 조직의 존재는 제주도의 상부맨틀에 전단체계가 형성되어 있음을 나타낸다. 프로토그라뉼라 조직에서는 거정의 사방휘석 결정들 중간에 첨정석, 세립의 감람석이 시공간적인 연관성을 지니고 항상 같이 산출되어지는데 이는 첨정석과 감람석이 사방휘석에서 용리되어진 것으로 여겨진다. 이러한 첨정석과 감람석이 사방휘석에서 용리되어진 조직은 프로토그라뉼라조직이 형성되기 이전에 고온에서 알루미나 함량을 많이 지닌 암석이 평형상태를 유지했음을 의미하며, 원래의 암석은 알루미나가 풍부한 사방휘석을 지닌 페리도타이트인 것을 암시한다. 이러한 하부지각/상부맨틀에서 유래하는 포획암에는 세 종류의 유체포유물이 포획되어 있다. I형은 이산화탄소를 풍부하게 가지고 있는 포유물이고, II형은 다상의 규산염용융포유물로서 유리$\pm$탈유리화된 결정들$\pm$딸결정들 ＋수축기포로 구성되어 있다. III형은 황화용융포유물이다. 제주도의 맨틀포획암에는 I형이 가장 풍부하게 포획되어 있으며, 이산화탄소가 맨틀에 존재하는 가장 풍부한 휘발성성분이며, 맨틀과 같은 고온고압에서 하나의 독립된 상으로 존재한다는 것을 반영하고 있다. 또한 맨틀과 같은 환경에서 규산염멜트(melt), 황화멜트, 이산화탄소가스 사이에 서로 불용융(immscibility) 상태도 형성되고 있음을 나타내고 있다. 대부분의 다상의 규산염용융포유물 (II형)은 상당한 양의 규산질 유리를 지니고 있으며, 이는 하부지각/상부맨틀에서 SiO$_2$ 함량이 높은 규산질마그마가 형성되고 있음을 지시한다. 암석학적, 지화학적 정보와 함께 맨틀 혹은 하부지각 암석에 포획된 유체포유물과 용융포유물 데이터는 한반도의 맨틀에 대한 유체체계, 유체-마그마-광물 사이의 강호작용, 모암인 포획암에 대한 압력-온도 진화사를 파악하는데 크게 이용될 것이다.

• 지능정보연구
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• 제17권1호
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• pp.127-138
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• 2011

대부분의 연구포털 사이트는 관심 분야의 논문을 획득하고자 하는 연구자를 대상으로 한 서비스를 주로 제공하고 있다. 하지만 이러한 서비스는 정확한 서지사항을 알고 있는 일부 사용자의 경우 손쉽게 이용할 수 있지만, 대부분의 이용자는 원하는 자료를 획득하기 위해 키워드 검색을 통한 반복적 시행착오를 겪게 된다. 특히 사용자가 익숙하지 않은 분야의 논문을 검색하는 경우에는, 찾고자 하는 논문의 적절한 키워드 자체를 알지 못하여 검색에 큰 어려움을 겪게 된다. 이러한 한계를 극복하기 위해 일부 연구포털 사이트에서는 온라인 쇼핑몰의 상품 추천에 주로 사용되어온 연관관계 분석 기반 키워드 추천 서비스를 채택하고 있다. 하지만 연관관계 분석에만 기반한 키워드 추천 방식은 두 키워드간의 단편적인 관계만을 알려줄 뿐, 해당 학술 분야와 관련된 전체 키워드 간의 복합적 연결 관계를 보여주기에는 한계가 있다. 따라서 본 논문에서는 연관관계 분석을 통해 빈발 출현 키워드 쌍을 추출하고 이를 근거로 전체 키워드 간 네트워크를 구축함으로써, 학술 분야별 중심 키워드 및 분야 간 융합을 위한 연계 키워드를 추천하기 위한 방법을 제시하고자 한다.

• 한국재료학회지
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• 제22권9호
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• pp.445-449
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• 2012

We investigate the effects of redox reaction on preparation of high purity ${\alpha}$-alumina from selectively ground aluminum dross. Preparation procedure of the ${\alpha}$-alumina from the aluminum dross has four steps: i) selective crushing and grinding, ii) leaching process, iii) redox reaction, and iv) precipitation reaction under controlled pH. Aluminum dross supplied from a smelter was ground to separate metallic aluminum. After the separation, the recovered particles were treated with hydrochloric acid(HCl) to leach aluminum as aluminum chloride solution. Then, the aluminum chloride solution was applied to a redox reaction with hydrogen peroxide($H_2O_2$). The pH value of the solution was controlled by addition of ammonia to obtain aluminum hydroxide and to remove other impurities. Then, the obtained aluminum hydroxide was dried at $60^{\circ}C$ and heat-treated at $1300^{\circ}C$ to form ${\alpha}$-alumina. Aluminum dross was found to contain a complex mixture of aluminum metal, aluminum oxide, aluminum nitride, and spinel compounds. Regardless of introduction of the redox reaction, both of the sintered products are composed mainly of ${\alpha}$-alumina. There were fewer impurities in the solution subject to the redox reaction than there were in the solution that was not subject to the redox reaction. The impurities were precipitated by pH control with ammonia solution, and then removed. We can obtain aluminum hydroxide with high purity through control of pH after the redox reaction. Thus, pH control brings a synthesis of ${\alpha}$-alumina with fewer impurities after the redox reaction. Consequently, high purity ${\alpha}$-alumina from aluminum dross can be fabricated through the process by redox reaction.