• 제목/요약/키워드: Clearing samples

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Three Different Viruses Isolated from Typical Weed Plants that Grown Adjacent to Common Crop Fields

  • Kwon, Sun-Jung;Choi, Hong-Soo;Han, Jung-Heon;La, Yong-Joon;Kim, Kook-Hyung
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제16권6호
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    • pp.297-305
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    • 2000
  • Weeds are widely grown in the field and are infected by many viruses. A survey was conducted to identify viruses infecting weeds in Korea. Virus-infected weed samples including Rorippa indica (L.) Hiern, R. islandica (Oed.) Bord, Crepidiastrum denticulatum (Houtt.) Pak & Kawanno, Achyranthes japonica (Miq.) Nakai, and Chrysanthemum boreale (Makino) Makino were collected in Kyonggi Province. These weeds were grown in the greenhouse and were isolated on 10 test plants. Several virus isolates were isolated fron infected tissues and were further studied by host range assay, serological test, electron microscopy (EM), reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequencing. Each isolated virus strain was mechanically transmitted to weeds and various hosts including Nicotiana spp., Brassica spp., Vigna unguiculata, Capsicum annuum, and Cucumis sativus and showed systemic mosaic, vein clearing, necrosis, mottle, malformation, chlorosis, and/or death of host plants in some cases. Each virus was then purified using infected leaves and observed by EM. From these results three viruses were isolated and identified as Turnip mosaic virus (TuMV), Broad bean wilt virus (BBWV), and Cucumber mosaic virus (CMV). RT-PCR using virus-specific oligonucleotide primers and the cloning were conducted to determine the nucleotide sequences of coat proteins of the three viruses their amino acid sequence were deduced. The amino acid sequence homologies were about 92.7 to 99.7%, 96.2 to 97.7%, and 93.9 to 98.6% to other reported TuMV, BBWV, and CMV strains, respectively. These results suggest that many weeds may serve as primary inoculum source of diseases caused by TuMV, BBWV, CMV and that the management of these viral diseases can be achieved through weed control.

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Comparison of micro-computerized tomography and cone-beam computerized tomography in the detection of accessory canals in primary molars

  • Acar, Buket;Kamburoglu, Kivanc;Tatar, Ilkan;Arikan, Volkan;Celik, Hakan Hamdi;Yuksel, Selcen;Ozen, Tuncer
    • Imaging Science in Dentistry
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    • 제45권4호
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    • pp.205-211
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    • 2015
  • Purpose: This study was performed to compare the accuracy of micro-computed tomography (CT) and cone-beam computed tomography (CBCT) in detecting accessory canals in primary molars. Materials and Methods: Forty-one extracted human primary first and second molars were embedded in wax blocks and scanned using micro-CT and CBCT. After the images were taken, the samples were processed using a clearing technique and examined under a stereomicroscope in order to establish the gold standard for this study. The specimens were classified into three groups: maxillary molars, mandibular molars with three canals, and mandibular molars with four canals. Differences between the gold standard and the observations made using the imaging methods were calculated using Spearman's rho correlation coefficient test. Results: The presence of accessory canals in micro-CT images of maxillary and mandibular root canals showed a statistically significant correlation with the stereomicroscopic images used as a gold standard. No statistically significant correlation was found between the CBCT findings and the stereomicroscopic images. Conclusion: Although micro-CT is not suitable for clinical use, it provides more detailed information about minor anatomical structures. However, CBCT is convenient for clinical use but may not be capable of adequately analyzing the internal anatomy of primary teeth.

Morphology of Arbuscular Mycorrhizal Roots and Effects of Root Age and Soil Texture on the Mycorrhizal Infection in Panax ginseng C.A. Meyer

  • Lee, Kyung-Joon;Park, Hoon;Lee, In-Sik
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제28권3호
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    • pp.149-156
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    • 2004
  • The objectives of this study were to investigate the morphology of mycorrhizal roots, and the effects of root age and soil texture on the mycorrhizal infection in ginseng (Panax ginseng C. A. Meyer) growing in Korea. Ginseng roots at ages of two to six years were collected from fields in late June. Their infection by arbuscular mycorrhizal fungi(AMF) was studied by clearing the roots and staining fungal hyphae with trypan blue. Root infection varied greatly depending on the developmental stages of young roots. Young tertiary roots, in diameter of smaller than 0.8 mrn, formed during the current growing season had root hairs and were frequently and in some cases heavily infected by AMF. Hyphal coils and arbuscules were abundant, while vesicles were rarely observed. Older secondary or tertiary roots in diameter of bigger than 1.0 mm with fully differentiated primary xylem formed during the previous growing season had no root hairs, and were not infected at all. The rates of mycorrhizal infection in the young tertiary roots were not affected by the age of the ginseng plants, suggesting that fungal populations might have not much changed during the aging of the cultivated fields up to six years. The differences in the infection rates among the different ages of ginseng were caused by differences in the amount of young tertiary roots in the samples. Soil texture, either sandy loam or clay loam, did not affect the rate of root infection. There were large variations in the infection rates among the different farms and locations within a farm. It strongly suggested that infection rates of the ginseng roots by AMF would be influenced by the practice of the farmers, possibly by avoiding consecutive planting, introduction of new topsoil, and the ways of handling the soil before transplanting the ginseng, such as fumigation or sterilization that might have affected indigenous inoculum sources of the AMF.

활성탄을 이용한 불순물제거에 의한 효과적인 인삼 조직 단백질체 분석 방법 개선 연구 (Development of a Simple and Reproducible Method for Removal of Contaminants from Ginseng Protein Samples Prior to Proteomics Analysis)

  • 굽타 라비;김소운;민철우;성기호;아그라왈 가네시 쿠마르;락왈 랜딥;조익현;방경환;김영창;김기홍;김선태
    • 생명과학회지
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    • 제25권7호
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    • pp.826-832
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    • 2015
  • 본 연구는 인삼의 잎과 뿌리 단백질 추출물에서 활성탄을 이용하여 염, 계면활성제, 색소를 제거하여 단백질체 분석 연구에 미치는 잠재적인 효과에 대한 평가를 기술하고 있다. 5%(w/v) 활성탄(100-400 mesh)과 함께 단백질 추출물을 30분간 4℃에서 반응시켜 염과 계면활성제를 제거한 후 SDS-PAGE를 분석하여 단백질의 양상을 관찰하였다. 엽록소 함량의 분석은 활성탄 처리 후 엽록소의 상당한 양(~33%)이 제거되는 것을 보여주었고, 이 분석은염, 계면활성제 제거만이 아닌 색소의 제거에서도 활성탄의 잠재적 효과가 있음을 보여 주고 있다. 활성탄을 처리한 단백질 시료를 이용하여 이차원 전기영동과 PCA 통계분석을 시행한 결과 단백질은 gel에서 더 나은 해상도를 보여주었으며 단백질 시료의 정제에서도 활성탄의 효과가 있음을 확인하였다. 종합적으로, 이 결과들은 활성탄을 이용한 간단한 방법으로 다양한 식물 조직의 단백질 추출물에서 염, 계면활성제, 색소를 제거함으로써 고해상도의 단백질체 분석에 적용될 수 있을 것으로 기대된다.

Neovascularization in Outer Membrane of Chronic Subdural Hematoma : A Rationale for Middle Meningeal Artery Embolization

  • Hyun Kim;Yoori Choi;Youngsun Lee;Jae-Kyung Won;Sung Ho Lee;Minseok Suh;Dong Soo Lee;Hyun-Seung Kang;Won-Sang Cho;Gi Jeong Cheon
    • Journal of Korean Neurosurgical Society
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    • 제67권2호
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    • pp.146-157
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    • 2024
  • Objective : Chronic subdural hematomas (cSDHs) are generally known to result from traumatic tears of bridging veins. However, the causes of repeat spontaneous cSDHs are still unclear. We investigated the changes in vasculature in the human dura mater and outer membrane (OM) of cSDHs to elucidate the cause of their spontaneous repetition. Methods : The dura mater was obtained from a normal control participant and a patient with repeat spontaneous cSDHs. The pathological samples from the patient included the dura mater and OM tightly adhered to the inner dura. The samples were analyzed with a particular focus on blood and lymphatic vessels by immunohistochemistry, 3-dimensional imaging using a transparent tissue clearing technique, and electron microscopy. Results : The dural border cell (DBC) layer of the dura mater and OM were histologically indistinguishable. There were 5.9 times more blood vessels per unit volume of tissue in the DBC layer and OM in the patient than in the normal control. The DBC layer and OM contained pathological sinusoidal capillaries not observed in the normal tissue; these capillaries were connected to the middle meningeal arteries via penetrating arteries. In addition, marked lymphangiogenesis in the periosteal and meningeal layers was observed in the patient with cSDHs. Conclusion : Neovascularization in the OM seemed to originate from the DBC layer; this is a potential cause of repeat spontaneous cSDHs. Embolization of the meningeal arteries to interrupt the blood supply to pathological capillaries via penetrating arteries may be an effective treatment option.

RT-PCR법을 이용한 백합 바이러스 LSV, LMoV, CMV의 검출 (Detection of Lily symptomless virus, Lily mottle virus, and Cucumber mosaic virus from Lilium Grown in Korea by RT-PCR)

  • 임지현;배은혜;이용진;박성한;이규준;김새로미;정용태
    • 미생물학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.251-256
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    • 2009
  • 2008~2009년에 강원, 충남, 제주 지역의 백합 재배 농가에서 바이러스 감염 증상을 보이는 백합의 잎과 구근을 채취하였으며 RT-PCR 방법으로 Lily mottle virus (LMoV), Lily symptomless virus (LSV), Cucumber mosaic virus (CMV) 등 3 종류의 바이러스를 검출 하였다. LSV 12주, LMoV 20주, CMV 1주가 검출 되었으며 LSV에 감염된 12개의 식물체 중 7개에서는 LMoV도 검출되어 복합 감염된 것을 확인하였다. LMoV와 LSV에 의한 복합 감염은 엽맥투명화, 잎말림, 반점, 모자이크, 황화 줄무늬 등 단독 감염보다 심각한 병징을 나타내었으며 좋지 않은 환경에서 저장된 구근에서도 복합 감염이 관찰되었다. 채집된 식물체는 LMoV 감염이 가장 많았으며 Lily virus X(LVX)에 의한 감염은 검출되지 않았다. 7개 분리주의(LMoV 4주, LSV 2주, CMV 1주) 외피 단백질 유전자를 증폭한 후 염기서열을 분석하여 국내에서 발표된 백합 바이러스 염기서열(LSV:AJ516059, CMV: AJ296154)과 비교 하였으며 LMoV는 국내에서 처음으로 염기서열을 결정하여 기존에 보고된 염기서열(AJ564636)과 비교하였다. 분리주는 기존에 보고된 바이러스와 95~99%의 뉴클레오티드 염기서열 유사성을 보였으며, 이들 분리주의 분자 생물학적 특성을 밝히고 신속하고 정확한 바이러스 진단을 위해서는 전체 염기 서열 분석이 필요한 것으로 판단되었다.

치과병원 내원환자의 만족도 조사분석 (A study on the gratification of the patient in the Dental Hospital)

  • 김민영;이근우;문홍석;정문규
    • 대한치과보철학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.65-82
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    • 2008
  • 오늘날의 시장 경제는 소비자 중심으로 빠르게 변모하고 있다. 이는 점점 가속화 되어가는 소비자의 생활수준과 교육수준의 향상, 다양한 대중매체를 통한 구매자의 상품에 대한 접근의 용이성에 기인한다. 다양한 선택의 대안 속에서 자신의 가치를 만족시킬 수 있는 상품을 선택할 수 있는 소비자 중심의 시장 경제체제는 소비자의 소득수준의 증가와 전 국민 의료보험의 실시로 인한 의료 수요확대를 통해 의료분야에서도 그 두각을 나타내고 있다. 최근 우리나라의 의료계는 의료기관의 수 및 의료 인력의 증가로 인해 경쟁이 강화되고 있는 실정이고, 이러한 경쟁 강화를 통해 소비자의 시장 선택의 폭은 넓어지게 되었다. 이런 시점에 소비자의 입장에서 본 의료서비스에 있어서의 고객만족도에 영향을 미치는 요인, 서비스의 문제점, 개선점에 대한 조사와 연구는 필요 불가결하다고 하겠다. 이 연구는 2006년 1월 23일부터 4월 15일 까지 서울시에 소재한 연세대학교 치과병원에 내원한 환자 784명을 대상으로 진행되었으며 구조화된 설문지를 이용하여 자기기입식 방법으로 자료를 수집하여 이를 분석하였다. 본 연구의 결과를 살펴보면 다음과 같다. 1. 응답자의 사회인구학적인 특성은 성별이나 결혼여부는 적절하게 표본이 추출 된 것으로 보이나 직업에서는 학생 및 대학(원)생, 내원이 유와 현재 받고 있는 치료에 있어서는 교정치료가 높은 비율로 나타났다. 2. 치과병원에 대한 전반적인 만족도는 전체의 74%가 높은 만족을 나타내었다. 3. 독립변수들 중 구체적 서비스 항목에 대해서는 '서비스시스템', '친절도', '설명', '대기시간설명', '예약시스템', '응급상황에의 대처', '치과진료경험의 풍부', '치과적 지식의 유무', '병원의 규모', '소독', '내부시설', '주차' 에 대한 만족도는 높게, '치료비', '치료 준비시간', '대기시간', '치료시간', '예약기간' 에 대한 만족도는 낮게 나타났다. 4. 독립변수들 간의 상관관계 분석을 실시하였고 이들 사이에는 높은 선형관계가 없었다. 5. 독립변수들과 종속변수 사이의 상호관련성을 평가하기 위한 프로빗 회귀분석 결과 총 34개의 독립변수 중에서 불편감 해소, 서비스 시스템, 친절도, 설명, 한 번 내원 시 치료시간, 예약시스템, 지식의 유무, 내부시설에 대한 만족도의 8개 독립변수가 유의수준 1%하에서 서로 높은 상호관련성을 보였다. 고객의 만족은 전적으로 고객의 주관적인 평가에 의존한다. 환자들의 욕구가 다양화되고 고급화되면서 의료서비스에 대한 기대수준이 높아지고 있기 때문에 이에 부합하는 서비스를 제공하는 것이 의료서비스의 고객인 환자를 만족시키는 필수 요건이 된다. 많은 의료기관이 환자를 중심으로 하여 고객만족을 위한 병원, 고객감동을 위한 병원이 되기 위하여 노력을 하고 있으며, 이는 치과의료 분야에 있어서도 적용되고 있는 현실이다. 내원환자들의 만족도를 향상시키기 위해서는 이 연구의 결과를 기초로 한 새로운 병원 경영 전략의 수립과 그로 인한 의료 서비스의 질 향상으로 고객이 만족하는 양질의 의료서비스를 제공하는 노력이 필요하리라 여겨진다.