Three-dimensionally ordered macro-porous Sn-C composites were prepared by using polystyrene microsphere as a template. The Sn-C composites were composed of well-interconnected pore with circular shape and wall structure with wall thickness of a few tens of nano-meters. This porous three-dimensional structure is readily and uniformly accessible to the electrolyte, which facilitates lithium ion diffusion during charge-discharge reactions. The wall thickness of the composites was increased as the increase of Sn content of the composite. From EDS analysis, it is confirmed that the Sn was dispersed uniformly in Sn-C composites. The capacity was increased as the Sn content increased, which is due to Sn anode with high capacity. The Sn-C composites with high Sn content showed superior cyclic performances. Such enhancement is ascribed to the thick wall thickness and small pore size of the sample with high Sn content. The Sn-C composite with Sn 30 wt% showed relatively high capacity and stable cycle life, however, the stability of the 3-dimensional structure should be enhanced by further work.
Porcine circovirus (PCV) is a small, nonenveloped virus that contains a single-stranded circular DNA genome of about 1.76 kb and belongs to the family circoviridae. The PCV-2 has been incriminated as the cause of post-weaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) , an emerging disease in pigs. In the present study, a PCR assay was applied to detect PCV-2 in tissue samples. The presence of PCV-2 antigen in the porcine tissues was confirmed by indirect immunofluorescence (IIF) with PCV-2 specific monoclonal antibodies. And then DNA extracted from PCV-2 positive tissues was used as a template. One oligonucleotide primer suitable for PCR was selected from a published PCV-2 sequence (Genbank). Amplified PCR product was detected the same fragment lengths of 416 bp as a control. Based on these results, it was suggested that the PCR is a simple and sensitive method for support diagnostic purposes.
Prabu, R.;Vijayaraj, A.;Suresh, R.;Jagadish, L.;Kaviyarasan, V.;Narayanan, V.
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제32권5호
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pp.1669-1678
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2011
Six new binuclear copper(II) complexes have been prepared by template condensation of the dialdehydes 1,8-[bis(3-formyl-2-hydroxy-5-methyl)benzyl]-l,4,8,11-tetraazacyclotetradecane (PC-a) and 1,8-[bis(3-formyl-2-hydroxy-5-bromo)benzyl]-l,4,8,11-tetraazacyclotetradecane (PC-b) with appropriate aliphatic diamines, and copper(II) perchlorate. The structural features of the complexes have been confirmed by elemental analysis, IR, UV-vis and mass spectra etc. The electrochemical behavior of all the copper(II) complexes show two irreversible one electron reduction process. The room temperature magnetic moment studies depict the presence of an antiferromagnetic interaction in the binuclear complexes. The catechol oxidation and hydrolysis of 4-nitrophenylphosphate were carried out by using the complexes as catalyst. The antimicrobial screening data show good results. The binding of the complexes to calf thymus DNA (CT DNA) has been investigated with absorption and emission spectroscopy. The complex [$Cu_2L^{1a}$] displays significant cleavage property of circular plasmid pBR322 DNA in to linear form. Spectral, electrochemical, magnetic and catalytic studies support the distortion of the copper ion geometry that arises as the macrocyclic ring size increases.
Cold shock proteins (CSPs) are a family of proteins induced at low temperatures. CSPs bind to single-stranded nucleic acids through the ribonucleoprotein 1 and 2 (RNP 1 and 2) binding motifs. CSPs play an essential role in cold adaptation by regulating transcription and translation via molecular chaperones. The solution nuclear magnetic resonance (NMR) or X-ray crystal structures of several CSPs from various microorganisms have been determined, but structural characteristics of psychrophilic CSPs have not been studied. Therefore, we optimized the purification process to obtain highly pure Lm-Csp and determined the three-dimensional structure model of Lm-Csp by comparative homology modeling using MODELLER on the basis of the solution NMR structure of Bs-CspB. Lm-Csp consists of a ${\beta}$-barrel structure, which includes antiparallel ${\beta}$ strands (G4-N10, F15-I18, V26-H29, A46-D50, and P58-Q64). The template protein, Bs-CspB, shares a similar ${\beta}$ sheet structure and an identical chain fold to Lm-Csp. However, the sheets in Lm-Csp were much shorter than those of Bs-CspB. The Lm-Csp side chains, E2 and R20 form a salt bridge, thus, stabilizing the Lm-Csp structure. To evaluate the contribution of this ionic interaction as well as that of the hydrophobic patch on protein stability, we investigated the secondary structures of wild type and mutant protein (W8, F15, and R20) of Lm-Csp using circular dichroism (CD) spectroscopy. The results showed that solvent-exposed aromatic side chains as well as residues participating in ionic interactions are very important for structural stability. Further studies on the three-dimensional structure and dynamics of Lm-Csp using NMR spectroscopy are required.
Kim, Dong-Min;Zhang, Shichen;Kim, Minhee;Kim, Dong-Eun
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제30권5호
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pp.662-667
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2020
Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations are not only genetic markers for diagnosis but also biomarkers of clinical-response against tyrosine kinase inhibitors (TKIs) in non-small cell lung cancer (NSCLC). Among the EGFR mutations, the in-frame deletion mutation in EGFR exon 19 kinase domain (EGFR exon 19-del) is the most frequent mutation, accounting for about 45% of EGFR mutations in NSCLCs. Development of sensitive method for detecting the EGFR mutation is highly required to make a better screening for drug-response in the treatment of NSCLC patients. Here, we developed a fluorometric tandem gene amplification assay for sensitive detection of low-abundance EGFR exon 19-del mutant genomic DNA. The method consists of pre-amplification with PCR, thermal cycling of ligation by Taq ligase, and subsequent rolling circle amplification (RCA). PCR-amplified DNA from genomic DNA samples was used as splint DNA to conjugate both ends of linear padlock DNA, generating circular padlock DNA template for RCA. Long stretches of ssDNA harboring multiple copies of G-quadruplex structure was generated in RCA and detected by thioflavin T (ThT) fluorescence, which is specifically intercalated into the G-quadruplex, emitting strong fluorescence. Sensitivity of tandem gene amplification assay for detection of the EGFR exon 19-del from gDNA was as low as 3.6 pg, and mutant gDNA present in the pooled normal plasma was readily detected as low as 1% fraction. Hence, fluorometric detection of low-abundance EGFR exon 19 deletion mutation using tandem gene amplification may be applicable to clinical diagnosis of NSCLC patients with appropriate TKI treatment.
Jena, Jayashree;Pradhan, Nilotpala;Nayak, Rati Ranjan;Dash, Bishnu P.;Sukla, Lala Behari;Panda, Prasanna K.;Mishra, Barada K.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제24권4호
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pp.522-533
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2014
Bionanotechnology has revolutionized nanomaterial synthesis by providing a green synthetic platform using biological systems. Among such biological systems, microalgae have tremendous potential to take up metal ions and produce nanoparticles by a detoxification process. The present study explores the intracellular and extracellular biogenic syntheses of silver nanoparticles (SNPs) using the unicellular green microalga Scenedesmus sp. Biosynthesized SNPs were characterized by AAS, UV-Vis spectroscopy, TEM, XRD, FTIR, DLS, and TGA studies and finally checked for antibacterial activity. Intracellular nanoparticle biosynthesis was initiated by a high rate of $Ag^+$ ion accumulation in the microalgal biomass and subsequent formation of spherical crystalline SNPs (average size, 15-20 nm) due to the biochemical reduction of $Ag^+$ ions. The synthesized nanoparticles were intracellular, as confirmed by the UV-Vis spectra of the outside medium. Furthermore, extracellular synthesis using boiled extract showed the formation of well scattered, highly stable, spherical SNPs with an average size of 5-10 nm. The size and morphology of the nanoparticles were confirmed by TEM. The crystalline nature of the SNPs was evident from the diffraction peaks of XRD and bright circular ring pattern of SAED. FTIR and UV-Vis spectra showed that biomolecules, proteins and peptides, are mainly responsible for the formation and stabilization of SNPs. Furthermore, the synthesized nanoparticles exhibited high antimicrobial activity against pathogenic gram-negative and gram-positive bacteria. Use of such a microalgal system provides a simple, cost-effective alternative template for the biosynthesis of nanomaterials in a large-scale system that could be of great use in biomedical applications.
Lithium ion batteries (LIBs) is a kind of rechargeable secondary battery, developed from lithium battery, lithium ions move between the positive and negative electrodes to realize the charging and discharging of external circuits. Zeolitic imidazolate frameworks (ZIFs) are porous crystalline materials in which organic imidazole esters are cross-linked to transition metals to form a framework structure. In this article, ZIF-67 is used as a sacrificial template to prepare nano porous carbon (NPC) coated cobalt nanoparticles. The final product Co/NPC composites with complete structure, regular morphology and uniform size were obtained by this method. The conductive network of cobalt and nitrogen doped carbon can shorten the lithium ion transport path and present high conductivity. In addition, amorphous carbon has more pores that can be fully in contact with the electrolyte during charging and discharging. At the same time, it also reduces the volume expansion during the cycle and slows down the rate of capacity attenuation caused by structure collapse. Co/NPC composites first discharge specific capacity up to 3115 mA h/g, under the current density of 200 mA/g, circular 200 reversible capacity as high as 751.1 mA h/g, and the excellent rate and resistance performance. The experimental results show that the Co/NPC composite material improves the electrical conductivity and electrochemical properties of the electrode. The cobalt based ZIF-67 as the precursor has opened the way for the design of highly performance electrodes for energy storage and electrochemical catalysis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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