Fusarium oxysporum은 하나의 종내에 많은 formae speciales(분화종)과 races 등이 분화되어 있다. 그 중에서 10균주에 대하여 균사 내에서의 영양핵의 분열상을 찾아 Giemsa staining 용액으로 염색하여 그들의 염색체 수를 비교 관찰하였다. 균주에 따라 염색체 수에 차이가 있었으며 2균주(F. oxysporum f. sp. lycoperici, F. oxysporum Kangnung D2)는 n=4, 2균주(F. oxysporum S Sachun 3, F. oxysporum S Kohung 2)는 n=5, 5균주(F. oxysporum S Kohung 3, F. oxysporum CS Hongchun D16, F. oxysporum S Bosung 5, F. oxysporum S Sunchun 4, F. oxysporum S Haenam 4)는 n= 7개를 관찰할 수 있었고 Australia의 Sydney 대학에서 분양받은 F. oxysporum 14-39는 n=8개로 전체로 보아 4-8개의 염색체를 관찰할 수 있었다. 본인의 앞서 본문의 결과와 종합하여 고찰할 때 F. oxysporum의 기본염색체 수는 반수체가 4개로 추론되며 여기에서부터 여러가지 요인으로 인하여 diploidy, aneuploidy가 되어 다양한 염색체 수를 가진 것으로 사료된다.
Fusarium 속의 20균주를 PDA 배지에서 배양하고. HCI-Giemsa 염색법을 이용하여 균사 내에서의 영양핵의 핵분열을 관찰하였고, 염색체 수를 세었다. 관찰한 모든 Fusarium 속의 균주들익 염색체 수는 4-8개 사이에 있었다. 그 중에서 3균주인 F. solari S Hongchun D4. F. moniiforme(from banana), F. raphani (from radish)는 n=8개이고, F, solani 7468(from Sydney), F, solani 7475 (from Sydney), F, oxyporum (from tomato), F, oxyporum(from tomato). F F. roseum(from rice), F, sporotrichioides C. Jungsun 1, F. avenaceum C Kosung 6. F, avenaceum46039 등의 7균주에서는 n=7개였다 F. monilzfonne (from rice), F. graminellrum, F. probiferatum 6787(from Sydney), F. anguioides ATCC20351의 5균주는 n=6개 F. moniliforme NRRL2284. F. poae NRRL3287. F. tricintum NRRL 3299의 3균주는 n=5개였고 가장 적은 수의 n=4개인 균주로는 F. sporotrichioides NRRL3510과 F. equiscli KFCC 11843 IFO 030198의 3균주였다. 이상의 균주들의 염색체 수를 비교 고찰할 때 Fusarium 속의 기본 염색체 수는 반수체가 4개이며 종 분화과정에서 이수체와 배수체가 되었을 것으로 추론된다.
Park, Ki-Ryong;Kurosawa, Takahide;Seo, Min-Gyeong;Lee, Bo-Eun;Ahn, Soo-Kyeong
식물분류학회지
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제47권4호
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pp.304-307
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2017
We report somatic chromosome numbers for three species belonging to the Euphorbia pekinensis complex distributed in Far East Asia. In E. pekinensis populations distributed in Korea, 2n = 28 and 56 were found, while the Japanese native E. lasiocaula was also found at 2n = 28 and 56 and the Japanese endemic E. sinanensis was found at 2n = 20. Based on the number of chromosomes, E. lasiocaula distributed in Japan supports treatment as a variety of E. pekinensis rather than as a different species, while E. sinanensis should be recognized as a distinct species rather than as a variety of E. pekinensis. In the same populations of E. pekinensis and E. lasiocaula, diploid and tetraploid individuals were found, and the diversity of these chromosome numbers was consistent with the morphological diversity of these populations, suggesting the future evolutionary potential of this species.
The karyotype of Lilium cernum has been analysed by means of C-banding technique. Most of clones observed were 2n=24 chromosomes which consist of two pairs of submetacentric and ten pairs of subtelocentric chromosomes, among which two pairs of chromosomes(B and E) showed secondary constriction in the short arm. In addition to these chromosomes a small supernumerary telocentric chromosome was seen in the eight clones. Sixtyeight bands were observed in the twentytwo chromosomes of complement and one band in the supernumerary chromosome. A pair of chromosome (L) did not show any band. The bnads on the chromosome. A pair of chromosome (L) did not show any band. The bands on the chromosomes were distributed in the centromere, secondary constriction and intercalary regions of arms. Of the twelve pairs of chromosomes ten pairs showed symmetric banding patterns in each, but two pairs (I and K) showed asymmetric banding patterns.
Objective: The present study was undertaken to synthesize a human Y chromosome specific probe and to confirm the usefulness of the probe for fluorescence in situ hybridization (FISH) in various types of human cells. Methods: An approximately 400 bp DNA fragment of the DYZ1 sequences was synthesized by PCR using digoxigenin labeled dUTP (dig-PCR). The fidelity of probe was tested by FISH for cultured and uncultured human lymphocytes, amniocytes, chorionic villus cells, embryos, sperms, and germ cells of seminiferous tubule. Results: The human Y chromosome specific probe hybridized specifically to Y chromosome of the cells that had been tested. This probe assigned to the Yq12 region where the DYZ1 repetitive sequence is concentrated. Conclusion: We have identified a human Y chromosome specific probe that hybridized specifically to the Y chromosome by FISH for various types of uncultured as well as cultured cells. Therefore FISH technique using human Y chromosome specific probe should be useful for clinical application as a diagnostic tool for the detection of human Y chromosome.
본 연구에서는 염색체의 영상패턴을 인식하고 분류하는 방법을 개선하기 위해 패턴인식의 특징정보로 사용되는 비선형적인 염색체 영상을 선형적으로 재구성하는 영상 재구성 알고리즘을 사용하여 선형화된 특징정보를 추출하여 패턴분류기인 신경회로망의 입력정보로 사용한다. 중앙축 변환방법과, 영상 재구성방법을 사용하여 임상적으로 정상인으로 판명된 20명의 염색체 영상의 특징정보를 추출하였다. 중앙축 변환방법에 의하여 추출된 특징정보의 패턴조합과 영상 재구성방법에 의하여 추출된 특징정보의 패턴조합을 구성하였으며, 10명에 대하여 추출한 특징정보를 계층적인 신경회로망(Hierarchical Multilayer Neural Network : HMNN)의 학습입력으로 사용하여 염색체를 분류하기 위한 패턴인식기를 구현하였다. 그리고 나머지 10명에 대하여 학습입력과 동일하게 조합된 패턴조합을 HMNN의 분류입력으로 사용하여 수행한 결과 약 98.26%의 우수한 인식률을 나타내는 최적화된 패턴인식기를 구현할 수 있었다.
Haryono, Samuel J;Datasena, I Gusti Bagus;Santosa, Wahyu Budi;Mulyarahardja, Raymond;Sari, Kartika
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제16권6호
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pp.2231-2235
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2015
Genome-wide association studies (GWASs) of the entire genome provide a systematic approach for revealing novel genetic susceptibility loci for breast cancer. However, genetic association studies have hitherto been primarily conducted in women of European ancestry. Therefofre we here performed a pilot GWAS with a single nucleotide polymorphism (SNP) array 5.0 platform from $Affymetrix^{(R)}$ that contains 443,813 SNPs to search for new genetic risk factors in 89 breast cancer cases and 46 healthy women of Indonesian ancestry. The case-control association of the GWAS finding set was evaluated using PLINK. The strengths of allelic and genotypic associations were assessed using logistic regression analysis and reported as odds ratios (ORs) and P values; P values less than $1.00{\times}10^{-8}$ and $5.00{\times}10^{-5}$ were required for significant association and suggestive association, respectively. After analyzing 292,887 SNPs, we recognized 11 chromosome loci that possessed suggestive associations with breast cancer risk. Of these, however, there were only four chromosome loci with identified genes: chromosome 2p.12 with the CTNNA2 gene [Odds ratio (OR)=1.20, 95% confidence interval (CI)=1.13-1.33, $P=1.08{\times}10^{-7}$]; chromosome 18p11.2 with the SOGA2 gene (OR=1.32, 95%CI=1.17-1.44, $P=6.88{\times}10^{-6}$); chromosome 5q14.1 with the SSBP2 gene (OR=1.22, 95%CI=1.11-1.34, $P=4.00{\times}10^{-5}$); and chromosome 9q31.1 with the TEX10 gene (OR=1.24, 95%CI=1.12-1.35, $P=4.68{\times}10^{-5}$). This study identified 11 chromosome loci which exhibited suggestive associations with the risk of breast cancer among Indonesian women.
한국산 청서(Sciunis vulgaris corea)와 다람쥐(Tamias sibiricus asiaticu)의 핵형을 일반 Giemsa- stain과 C-banding stain방법으로 분석하였다. 청서의 염색체 수는 2n=40이였으며 이 중 6쌍은 중부, 8쌍은 차중부, 3쌍은 차단부 그리고 2쌍은 단부 염색체이었고 X 염색체는 차중부,Y염색체는 acro또는 차단부 염색체로서 NF(arm number)=72(성염색체 제외)를 나타내었다. 다람쥐의 염색체 수는 2n=38이었으며 이 중 3쌍은 중부, 4쌍은 차중부, 5쌍은 차단부, 그리고 6쌍은 단부 염색체이었고 X염색체는 차중부, Y염색체는 중부염색체로서 NF=60을 나타내었다. C-banding분석결과, 청서의 염색체에서는 각 경우 대부분 동원체 (centromere)부위와 말단부(telomere)에 주로 구조적이질염색질이 분포하였고 다람쥐에서는 몇몇 염색체상(제2,3,9번)을 제외하고는 주로 동원체 부위에 구조적이직염색질이 분포하였다. 이러한 결과들로 보아 핵형상의 분화에 non-Robensonian 재배열과 구조적 이질염색질의 분포가 중요한 작용을 한 것으로 생각된다.
During the years 1984 to 1989, in order to determine of chromosome abnormalities are associated with recurrent spontaneous abortions, cytogenetic studies were performed 384 couples. Abnormal karyotypes were found in 51(13.3%) couples. There was no apparent relation with the number of abortions. The abnormalities were as follows: 17(4.4%) balanced translocation; 15(3.9%) mosaicisms; 17(4.4%) pericentric inversion; 2(0.5%) addition or isochromosome. Chromosome abnormalities were observed in 34(67%) of the wives and 17(33%) of the husbands. In addition, we detected polymorphic variants of chromosomes in 89(23.2%) subjects. Reciprocal translocations(13/17) were more common than the robertsonian type(4/17). All of the mosaicisms were associated with the sex chromosomes in 10 females and 5 males subjects. Pericentric inversions were most common in chromosome 9. Compared to previously studied general populations, significantly higher frequencies of translocations, mosaicisms and inversions were found in couples with repetitive spontaneous abortion. This suggests that couples should have chromosome studies after two or more abortions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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