• 제목/요약/키워드: Chromosome 16

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한우 체외 수정란의 체외 배양 조건에 따른 염색체 분석 (Chromosomal Analysis of Hanwoo Embryos by In Vitro Culture Condition)

  • 최선호;조상래;한만희;김현종;최창용;손동수;정연길;김상근;손시환
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.137-141
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    • 2007
  • 항산화제는 산소의 저장고로서 무혈청 배양액에서 주요한 작용을 하며, 복합배지에서 유용한 첨가제로 알려져 있다. 따라서 본 연구는 한우 체외 수정란의 배양에 있어서 항산화제인 L-cysteine의 작용과 수정란의 발달 단계별 염색체의 분석을 통하여 체외 수정란의 배양 체계를 수립하고자 실시하였다. 한우 난포란의 체외 성숙은 0.1% PVA, 0.1 mM L-cysteine 첨가 시 체외 성숙율은 73.4%, 94.6%으로 각각 나타냈으며, 처리간에 유의적인 차이를 보였다(p<0.05). 체외 발달율은 20.3%, 10.0%로 5% FBS+TCM199, 0.1 mM L-cysteine+1% BSA 첨가구에서 각각 나타났으며, 처리간에 유의적인 차이는 보이지 않았다. 배양액의 종류에 따른 염색체 분석 결과는 중기상의 수정란은 18.3%, 12.0%를 보였으며, 분석 가능 수정란 수는 6.1%, 4.0%로 5% FBS+TCM199, 0.1mM L-cysteine 첨가구에서 각각 나타났고, 60, XX 2개, 60XY 1개가 5% FBS+TCM199 처리구에서, 60, XX 2개가 0.1 mM L-cysteine 처리구에서 확인되었고, 처리간에 유의적인 차이가 없었다. 수정란의 발달 단계별 염색체 분석 결과는 $4{\sim}16$세포기는 5% FBS-TCM199 배양액과 0.1 mM L-cysteine을 첨가한 배양액에서 18.3, 12.0%의 염색체 중기상을 확인할 수 있었고, 상실기에서는 43.1, 13.0%의 염색체 중기상을 보였으며, 배반포기의 경우는 94.8, 100.0%의 염색체 중기상을 보여 발달 단계가 진행될수록 염색체 중기 상이 많이 나타났다. 이상의 결과로 항산화제인 L-cysteine은 한우 난포란의 체외 성숙 및 발달에 중요한 인자임을 확인하였다.

초자화동결된 생쥐 미성숙란의 세포골격과 염색체성상 (The Cytoskeletal and Chromosomal Constitution of Vitrified Immature Mouse Oocytes)

  • 박세필;이봉경;김은영;남화경;이금실;윤산현;정길생;임진호
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제26권3호
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    • pp.363-368
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    • 1999
  • 연구목적: 본 연구는 동해방지제인 EFS40을 이용한 초자화동결이 생쥐 미성숙란의 cytoskeleton과 염색체의 성상에 미치는 영향을 indirect immunocytochemistry방법과 염색체 분석법으로 알아보고자 실시하였다. 연구재료 및 방법: 본 실험은 생쥐 미성숙란을 EFS40 (40% ethylene glycol, 18% ficou과 0.5 M sucrose가 들어있는 M2배양액)으로 초자화 동결하여 융해한 후 16시간동안 체외 성숙을 유도하여, 제 1극체가 나타난 성숙된 난자를 기준으로 동해제노출군 또는 대조군과 비교 조사하였다. 결과: 초자화동결된 미성숙란의 응해 후 생존율과 체외성숙율은 90.3%과 64.7%로써, 동해제노출군 (86.7%, 69.2%)과 대조군 (100%, 58.3%)에 유사하였다. 초자화동결이 미성숙란의 microtubule과 microfilament에 미치는 영향을 조사하였던 바, 동결군의 microtubule과 micro-filament의 정상적인 형성율 (93.9%, 100.0%)은 동해 제노출군 (94.4%, 100.0%)과 대조군 (100.0%, 100.0%)의 성적과 유사하게 나타났다. 또한, 초자화동결군에서 정상적인 염색체수를 가진 난자의 비율도 65.8%로써, 대조군(79.6%)과 노출군 (69.0%)의 결과와 유의한 차이가 없었다. 결론: 생쥐 미성숙란을 EFS40에 노출하고 동결하는 것이 미성숙란의 cytoskeleton과 염색체성상에 영향을 미치지 않으며, 본 연구에서 사용된 EFS40을 이용한 초자화동결법은 생쥐 미성숙란 동결에 적합하다는 것을 알 수 있었다.

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해양 해면체로부터 분리한 세균으로 항알러지성물질을 생산하는 Bacillus safensis KCTC 12796BP의 유전체 해독 (The complete genome sequence of a marine sponge-associated bacteria, Bacillus safensis KCTC 12796BP, which produces the anti-allergic compounds)

  • 한 응엔 판 기우;김수희;김금진;최혁재;남두현
    • 미생물학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.448-452
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    • 2018
  • 제주도 성산리 앞 바다 속 해면체로부터 분리한 Bacillus safensis KCTC 12796BP의 유전체를 분석하였다. 그 결과 3,935,874 bp의 환형 염색체와 36,690 bp의 plasmid 염기 서열을 확인하였다. 염색체는 G + C 함량이 41.4%로 75개의 위유 전자를 포함한 3,980개의 코딩 서열을, plasmid는 G + C 함량이 37.3%로 36개의 코딩 서열을 포함하고 있었다. 염색체 코딩 서열 중에는 81개의 tRNA 유전자, 24개 rRNA 유전자와 1개의 tmRNA 유전자가 있었다. 또한 포자 생성에 필요한 30개의 유전자, 포자피를 지령하는 16개의 유전자, 그리고 발아에 필요한 20개의 유전자도 발견되었다. 이외에 협막 다당체 생합성에 필요한 유전자와 편모 생합성 및 주화성에 필요한 유전자, 그리고 염 내성에 필요한 glycine-choline betaine 수송체에 관한 유전자도 존재하였다. 무엇보다도 항알러지활성을 보이는 이차대사산물 seongsanamide의 생합성을 지령하는 비리보좀성 펩타이드 합성효소 유전자를 확인할 수 있었다.

살균제 carbendazim이 DNA, 유전자 및 염색체에 미치는 영향 (Effects of carbendazim on DNA, gene and chromosome)

  • 이제봉;성필남;정미혜;신진섭;강규영
    • 농약과학회지
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    • 제8권4호
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    • pp.288-298
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    • 2004
  • 광범위 보호 살균제인 carbendazim이 DNA, 유전자 및 염색체에 미치는 영향을 평가하기 위하여 Ames가 개발한 미생물복귀돌연변원성시험, CHL (chinese hamster lung fibroblast cell) 세포를 이용한 염색체 이상시험, DNA 손상시험 및 마우스 골수세포를 이용한 소핵시험을 수행하였다. Carbendazim $156\sim2,500{\mu}g/plate$ 농도로 직접법 및 대사활성화법으로 TA 1535, TA 1537, TA 98 및 TA 100에서 수행한 Ames test결과 음성 대조군(DMSO)과 유사한 colony수를 보여 유전자의 염기절단에 의한 결손이나 염기 치환을 일으키지 않았다. 염색체에 미치는 영향을 검색하기 위하여 CHL세포에 $2.0\sim32.0{\mu}g/mL$의 농도로 carbendazim을 처리하여 염색체이상시험을 수행한 결과 염색분체 절단과 같은 구조이상은 없었으나 염색체의 수에 변화가 관찰되어 수적 이상은 인정되었다. Carbendazim 25, 50 및 $100{\mu}g/mL$을 마우스에 처리하여 30분, 60분 및 120분에 DNA에 직접 노출시켜 DNA손상 시험을 수행한 결과 60분까지는 영향이 없었으나, 120분 노출 군에서 대조군에 비해 $22\sim27%$정도의 DNA이동거리가 증가하여 약간의 손상이 관찰되었으며, 세포에 노출시켰을 때도 중 농도와 저 농도에서 16%의 이동거리 증가와 120분 노출시켰을 때 $10%\sim26%$의 이동거리 증가가 있어 DNA에 직접 노출한 경우와 비슷하였다. Carbendazim 375, 750 및 1,500 mg/kg 농도로 투여한 소핵시험결과 음성으로 판단되었으며, 골수세포에 대한 세포독성도 관찰되지 않았다. 이상의 결과에선 benzimidazole계 살균제 carbendazim이 DNA손상 및 염색체의 수적이상을 일으킨다는 것을 알 수 있었다. 이와 같은 결과는 계속적으로 논란이 되고 있는 benzimidazole계 농약인 benomyl이나 carbendazim에 장기적으로 인체에 노출되었을 경우 유전물질에 영향을 미칠 수 있을 것으로 생각되나 만성독성성적과 노출량 등 구체적인 자료를 이용한 위해성평가를 수행하여야 보다 정확한 판단을 할 수 있을 것으로 사료되었다.

Linkage Mapping and QTL on Chromosome 6 in Hanwoo (Korean Cattle)

  • Kim, J.W.;Park, S.I.;Yeo, J.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제16권10호
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    • pp.1402-1405
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    • 2003
  • The QTL(quantitative traits loci) linkage mapping of Hanwoo (Korean Cattle) chromosome 6 for daily gain and marbling score was performed using 378 individuals from 18 paternal half-sib families in Hanwoo. Hanwoo chromosome 6 were mapped to total length of 394.2 cM between 28 microsatellite loci using 36 microsatellite primers of BTA 6 linkage group. The QTL analysis for daily gain in Hanwoo showed 8 microsatellite loci (BM3026-5.66, EL03-5.58, BM4311-5.29, ILSTS035-4.50, BMS1242-4.37, BM1329-3.67, BM415-3.11, BMS2460-3.03) in larger than LOD score 3.0. Based on the QTL analysis for marbling score, LOD scores of 12 microsatellite loci (BM415-8.88, BM3026-7.15, ILSTS093-5.45, ILSTS035-4.91, EL03-4.69, BMS690-4.52, BM1329-4.43, BMS511-3.74, BMS1242-3.66, BMS518-3.65, BM4311-3.41, BMC4203-3.36) were found larger than 3.0.

Expression and cDNA Cloning of klp-12 Gene Encoding an Ortholog of the Chicken Chromokinesin, Mediating Chromosome Segregation in Caenorhabditis elegans

  • Ali, M. Yusuf;Khan, M.L.A.;Shakir, M.A.;Kobayashi, K. Fukami;Nishikawa, Ken;Siddiqui, Shahid S.
    • BMB Reports
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    • 제33권2호
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    • pp.138-146
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    • 2000
  • In eukaryotes, chromosomes undergo a series of complex and coordinated movements during cell division. The kinesin motor proteins, such as the chicken Chromokinesin, are known to bind DNA and transport chromosomes on spindle microtubles. We previously cloned a family of retrograde C-terminus kinesins in Caenorhabditis elegans that mediate chromosomal movement during embryonic development. Here we report the cloning of a C. elegans klp-12 cDNA, encoding an ortholog of chicken Chromokinesin and mouse KIF4. The KLP-12 protein contains 1609 amino acid and harbors two leucine zipper motifs. The insitu RNA hybridization in embryonic stages shows that the klp-12 gene is expressed during the entire embryonic development. The RNA interference assay reveals that, similar to the role of Chromokinesin, klp-12 functions in chromosome segregation. These results support the notion that during mitosis both types, the anterograde N-terminus kinesins such as KLP-12 and the retrograde C-terminus kinesins, such as KLP-3, KLP-15, KLP-16, and KLP-17, may coordinate chromosome assembly at the metaphase plate and chromosomal segregation towards the spindle poles in C. elegans.

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PCR 기법에 의한 소 수정란의 웅성 특이적 DNA Band 출현과 성 판별에 관한 연구 (Study on Sex Determination and Detection of Male Specific DNA Band in Bovine IVF Embryos Using Polymerase Chain Reaction)

  • 김현종;오성종;김성우;최화식;윤종택;정구민;임경순
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제11권3호
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    • pp.283-289
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    • 1996
  • This study was carried out to determine the sex of genomic and embryonic DNA using polymerase chain reaction(PCR). Bovine specific(216bp) and Y chromosome speicific DNA primers(l4lbp) were synthesized and tested for sexing. Bovine embryos used in this study were produced by in vitro fertilization. Few blastomeres for PCR were bisected by nicromanipulator and demi -embryos were cultured in TCM 199 medium containing 0.1% of solcoseryl. The results obtained were as follows; 1. Average optical density of genomic DNA extracted from blood of Hanwoo was 1.79$\pm$ 0.14. 2. 2. The ratio of the demi-embryos developed to blastocyst was 62.1 and 81.9% in morula and blastocyst, respectively. 3. When DNA of 2~4, 5~10 and more than 11 blastomeres was amplified with Y chromosome specific DNA primer by PCR, appreance rate of Y specific DNA band was 16.7, 46.2 and 40.0%, respectively. At least 5 to 10 blastomeres were required to determine the sex of embryos. 4. The rate of demi-embryos developed to blastocyst was 73.3% in TCM 199 medium supplemented with 0.1% solcoceryl. but 55.6% in control.

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Prenatal diagnosis of the Wolf-Hirschhorn syndrome

  • Lee, Moon-Hee;Park, So-Yeon;Ryu, Hyun-Mee;Hong, Sung-Ran;Lee, Young-Ho;Choi, Soo-Kyung
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제2권2호
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    • pp.49-51
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    • 1998
  • Wolf-Hirschhorn syndrome (WHS) is caused by a deletion of the short arm on chromosome 4 and is characterized by multiple congenital abnormalities, growth and mental retardation. In this case report, we performed amniocentesis for the chromosome analysis on a 25-year-old pregnant woman at 16 weeks of gestation whom we suspected of Edward's syndrome by the triple test of maternal serum and ultrasonography. The result of analysis revealed a karyotype of the fetus with 46,XY,del(4)(p15) by trypsin Giemsa's banding technique. With the result, we were able to diagnose the fetus as having WHS. As such, after therapeutic termination of the pregnancy, we confirmed WHS through the sampling of tissue by both trypsin Giemsa's banding and fluorescence in situ hybridization (FISH) method. To determine the origin of the WHS, we further tested the karyotypes of the parents. As parental karyotypes were found to be normal, we determined the case of the fetal WHS to be de novo.

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Characterization of Quantitative Trait Loci (QTL) for Growth using Genome Scanning in Korean Native Pig

  • Lee, H.K.;Choi, I.S.;Choi, B.H.;Kim, T.H.;Jung, I.J.
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제28권2호
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    • pp.107-112
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    • 2004
  • Molecular genetic markers were genotyped used to detect chromosomal regions which contain economically important traits such as growth traits in pigs. Three generation resource population was constructed from a cross between the Korean native boars and Landrace sows. A total of 193 F2 animals from intercross of F1 were produced. Phenotypic data on 7 traits, birth weight, body weight at 3, 5, 12, 30 weeks of age, live empty weight were collected for F2 animals. Animals including grandparents (F0), parents (F1), offspring (F2) were genotyped for 194 microsatellite markers covering from chromosome 1 to 18. Quantitative trait locus analyses were performed using interval mapping by regression under line-cross model. To characterize presence of imprinting, genetic full model in which dominance, additive and imprinting effect were included was fitted in this analysis. Significance thresholds were determined by permutation test. Using imprinting full model, four QTL with expression of imprinted effect were detected at 5% chromosome-wide significance level for growth traits on chromosome 1, 5, 7, 13, 14, and 16.

Identification of Potocki-Lupski syndrome in patients with developmental delay and growth failure

  • Jun, Sujin;Lee, Yena;Oh, Arum;Kim, Gu-Hwan;Seo, Eulju;Lee, Beom Hee;Choi, Jin-Ho;Yoo, Han-Wook
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제16권2호
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    • pp.49-54
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    • 2019
  • Purpose: Potocki-Lupski syndrome (PTLS), is a recently identified, rare genomic disorder. The patients are affected by infantile hypotonia, poor growth and developmental delay. Facial dysmorphism may not be obvious in some patients. PTLS is associated with microduplication at chromosome 17p11.2. In the current study, three Korean patients are reported with their clinical and genetic features. Materials and Methods: The clinical findings of each patient were reviewed. Karyotyping and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) analyses were done for genetic diagnoses. Results: All the patients did not have the characteristic dysmorphic features, such as broad forehead, triangular face, asymmetric smile and palpebral fissures. On the other hand, all three patients were affected by variable degree of developmental delay, poor oral intake, failure to thrive, and language development disorders. Chromosome 17p11.2 duplication was identified by conventional karyotyping analysis only in one patient, whereas the other confirmed by MLPA analyses. Conclusion: Delayed development was mostly commonly observed in our patients without distinct dysmorphic facial features. In this respect, genomic screening in patients with developmental delay would identify more cases with PTLS to understand their long-term clinical courses with the development of adequate psychological and rehabilitation education program.