본 연구는 한국재래돼지 염색체의 핵형 제시를 위하여 G-banding, C-banding 및 AgNORs를 분석하였다. 시험에 공시된 공시축은 축산기술연구소에서 선발 육종중인 재래돼지 종모돈 50두를 대상으로 각 개체별 혈액채취로서 혈액배양을 이용한 핵형 분석을 수행하였다. 한국재래돼지의 핵형은 38, XX 또는 XY로서 5쌍의 submetacentric chromosomes(Group I), 짧은 단완을 가진 2쌍의 acrocentric chromosomes(Group II), 5쌍의 metacentric chromosomes(Group III) 및 동원체가 말단부에 있는 6쌍의 acrocentric chromosomes(Group IV)로 구성된 36개의 상 염색체와 metacentric인 XX 또는 XY 성 염색체로 구성되어 있다. 재래돼지의 G-banding은 각 상동 염색체별 고유한 특징적 밴드 양상을 나타내고 있으며, 전체 염색체의 형태적 특징이나 대표적 landmarks는 국제표준핵형과 큰 차이가 없는 양상이다. 그러나 재래돼지의 경우 국제표준핵형에 비하여 보다 많은 band가 출현하였고 특히 1번, 3번, 5번, 6번, 7번, 8번, 13번, 14번, 15번, 16번, 17번, 18번 및 X 염색체에서 sub-bands의 분리를 나타내었다. 재래돼지의 C-banding은 비록 각 염색체들 간 heterochromatin의 양적 다형성이 존재하지만 거의 모든 상염색체의 동원체 부위에 C-bands가 나타나고, Y 염색체는 염색체의 전장에 걸친 heterochromatin의 분포를 보였다. AgNOR 염색에 의한 재래돼지의 NORs는 8번 및 10번 염색체의 동원체 부위에 확인되었고, 세포 당 NORs의 수는 2개에서 4개까지 관찰되었으며, 평균 2.13개로 분석되었다. 10번 염색체의 경우 모든 상동염색체에서 NORs가 나타나나 8번 염색체에서는 수적 다형성뿐만 아니라 양적 다형성을 나타내었다. 품종 간 NORs의 비교 분석에서 재래돼지의 NORs 수가 Yorkshire에 비해 유의적으로 높게 나타나 돼지의 NORs 분포 양상은 특히 8번 염색체에 있어 품종 간, 개체 간 및 세포 간에 다형적 변이 양상이 존재하는 것으로 사료된다.
본 연구는 몇 몇 포유류로부터 얻은 공여세포핵의 proliferation을 돕기 위한 수핵난자로 소 난자의 세포질을 사용하였으며, 공통 세포질로써의 능력을 시험하였다. 소 난자와 소, 사람, 돼지, 생쥐의 체세포와의 결합에서 유래한 각 종별 핵이식란의 융합율, 분할율, 배발달률 그리고 염색체 수를 조사하였다. 1. 소, 돼지, 생쥐, 사람 각각의 체세포를 이용한 핵이식란의 융합율은 70.2% 70.2% 72.4%와 63.0 %로 유의차를 보이지 않았다. 2. 소, 돼지, 생쥐, 사람 각각의 체세포를 이용한 핵이식란의 체외분할 ($\geq$2cell cleavage)율 또한 60.6%, 63.7%, 54.1%와 62.7%로 유의차가 없었다. 3. 각 종별로 체외분할이 일어난 시기를 조사한 결과 종에 관계없이 대체로 활성화 처리 후 24시간째에 대부분 일어나는 것을 볼 수 있었다. 그러나 점차적으로 분할이 계속 이루어지면서 발달시기가 종 특이적인 특성을 나타내는 것을 볼 수 있었다. 4. 이종간 핵이식의 후기 배발달 (상실배와 배반포) 률을 살펴보면 소와 사람의 체세포를 사용했을 경우 17.5%, 4.3%의 결과를 나타내었으며, 돼지와 생쥐의 체세포를 사용한 경우 16세 포기 이후 단계에 발달중지 현상을 볼 수 있었다. 5. 4~8 세포기 정도의 각 종별 핵이식란 할구를 분석에 사용하였을 때, 공여핵으로 사용된 종의 염색체 수와 일치하는 결과를 볼 수 있었다. 이상의 결과를 종합해 볼 때 성숙한 소 난자의 세포질은 소뿐만 아니라 돼지, 생쥐, 사람과 같은 다양한 포유류의 핵을 사용하여 핵이식을 하였을 때에도 발달이 가능하다는 것을 보여주고 있다.
목 적 : 염색체의 구조 및 유전을 연구하는 학문인 세포유전학은 임상 진단, 생식 문제, 산전 진단, 종양, 유전자의 다형성 및 유전 상담에 있어 중요한 역할을 하고 있다. 이 연구는 단일 기관에서 시행된 말초혈액을 이용한 세포유전학 검사 결과를 검토하여 주요 염색체 이상의 양상과 빈도를 분석하였다. 방 법 : 1981년 5월부터 2005년 10월까지 25년간 경북대학교병원 소아과 염색체 검사실로 각 임상 진료과에서 염색체 이상이 의심되어 의뢰한 말초혈액 검체 4,856례를 대상으로 하여 염색체 핵형을 분석하였다. 결 과 : 총 4,856례 가운데 4,567례를 분석하였다. 이 중 소아는 3,014례(66.0%), 성인은 1,553례(34.0%)였으며, 검사를 의뢰한 가장 흔한 이유는 소아에서는 성장과 발달 장애, 성인에서는 생식 문제였다. 4,567례 중 염색체 이상은 770례(16.9%)에서 발견되었다. 염색체 이상 중 수적 이상은 558례(12.2%), 구조적 이상은 187례(4.1%)였으며, 취약부위나 염색체 파손과 같은 이상이 25례(0.5%)였다. 수적 이상 중 상염색체 이상은 Down 증후군이 294례(6.4%)로 가장 많았으며, Edwards 증후군 7례(0.2 %), Patau 증후군 4례(0.1%) 순이었다. 성염색체의 이상은 Klinefelter 증후군이 131례(2.9%)로 가장 많았고, Turner 증후군 99례(2.2%), XXX 증후군 8례(0.2%), XYY 증후군 3례(0.1%) 순이었다. 구조적 이상은 전위가 84례(1.8%)로 가장 많았다. 결 론 : 본 연구에서 염색체 이상 핵형의 유형과 그 양상을 파악하였으며, 적극적 세포유전학적 연구로 진료와 유전상담에 적용하여야 할 것이다.
본 연구는 배추(Brassica campestris L. ssp. pekinensis)의 자엽 및 하배축 조직으로부터 효율적인 식물체 재분화 체계를 확립하기 위하여 실시하였다. 다양한 조합의 식물생장조절제 NAA와 BA를 조사한 바 자엽은 NAA 2.0mg/L, BA 1.0mg/L와 $AgNO_3$ 16.7mg/L를 첨가한 배지에서 절편당 2.67개의 가장 좋은 신초발생을 보였다. 하배축 절편체로부터는 NAA 1.0mg/L, BA 5.0mg/L와 $AgNO_3$ 16.7mg/L를 첨가하였을 때 절편당 1.87개의 가장 좋은 신초발생을 보였다. 재분화된 신초는 발근배지에서 뿌리를 유기하였으며 식물체는 습도가 유지된 생장상에서 순화를 거처 온실에서 재배하였다. 재분화 개체는 표현형과 염색체수에서는 이상이 없는 것으로 나타났다.
미나리아재비속(Ranunculus)의 털개구리미나리(R. cantonienesis)의 분자계통학적 유연관계를 조사하고 잡종화 가설을 추정하기 위하여, 군외군을 포함한 8분류군의 25개 DNA재료를 대상으로 핵 DNA와 엽록체 DNA의 염기서열을 분석하였다. 털개구리미나리와 근연종에 대하여 maximum parsimony와 maximum likelihood방법으로 분석한 핵 DNA의 ITS 계통수와 psbA-trnH, rps16, trnL 유전자 구간의 염기서열을 조합한 엽록체 DNA 계통수에서, 털개구리미나리는 젓가락나물과 가장 가깝고, 개구리미나리, 왜젓가락나물 순으로 유연관계를 나타내었다. 이러한 분자계통학적 유연관계는 털개구리미나리가 왜젓가락나물과 가장 가깝다는 기존의 외부형태학적 보고와 일치하지 않았다. 염기서열 분석에서 털개구리미나라는 조사된 분류군 중 유일하게 다형성을 나타냄으로서, 염색체수와 핵형에 의하여 보고된 털개구리미나라의 다형성을 지지하였다. 털개구리미나리는 ITS 에서 젓가락나물과 왜젓가락나물의 표지 유전자를 공유하고, 엽록체 DNA에서 왜젓가락나물의 표지 유전자를 공유하였다. 이 결과는 염색체수와 핵형에 의하여 제시되었던 털개구리미나리가 젓가락나물과 왜젓가락나물의 잡종화에 의하여 종분화되었다는 가설을 지지하였으며, 왜젓가락나물이 모계이며, 젓가락나물이 부계로 추정된다.
Serum liver enzyme levels are widely used in the clinical diagnosis of liver diseases and the assessment of liver status. They also have epidemiological significance to be prospective risk factors for type 2 diabetes, cardiovascular disease. In the previous study, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in several genes have been reported to be associated with serum liver enzyme levels in American population. We aimed to confirm whether the genetic variation of C16orf47 (chromosome 16 open reading frame 47) gene also influence the serum liver enzyme levels in Korean population. We genotyped variants in or near C16orf47 in a population-based sample including 994 unrelated Korean adult. Here, we performed association analysis to elucidate the possible relations of genetic polymorphisms in C16orf47 gene with serum liver enzyme levels. By examining genotype data of a total of 944 subjects in 5 hospital health promotion center, we discovered the C16orf47 gene polymorphisms are associated with serum liver enzyme levels. The common and highest significant polymorphism was rs7203412 (${\beta}$=3.68, P=3.66E-06) with glutamic oxaloacetic transferase (GOT) and rs7203412 (${\beta}$=6.2, P=7.06E-05) with glutamic pyruvate transaminase (GPT) in all group. Furthermore, the SNP rs7203412 was consistently associated with GOT (${\beta}$=6.41, P=6.78E-08) and GPT (${\beta}$=11.53, P=2.81E-06) in men group. Consequently, we found statistically significant SNP in C16orf47 gene that are associated with serum levels of GOT and GPT. In addition, these results suggest that the individuals with the minor alleles of the SNP in the C16orf47 gene may be more elevated serum liver enzyme levels in the Korean population.
서울대공원에서 사육중인 Miniature horse 10두의 혈통정립을 목적으로 PCR에 의한 성별 판정 및 16개 microsatellite marker를 사용하여 친자감정을 실시하였다. 성별 판정에서 430 bp의 SRY band가 관찰된 7두는 숫말로 판정되었고, 친자감정에서는 멘델의 유전양식에 부합된 3두가 친자관계가 확인되었다. 향후 Miniature horse의 혈통보존 및 관리에 유용한 자료가 될 것으로 사료된다.
Park, Hee Sue;Kim, Aryun;Shin, Kyeong Seob;Son, Bo Ra
Journal of Genetic Medicine
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제18권1호
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pp.31-37
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2021
Purpose: To summarize the results of chromosomal microarray analysis (CMA) for copy number variants (CNVs) detection and clinical utility in a single tertiary hospital. Materials and Methods: We performed CMA in 46 patients over the course of two years. Detected CNVs were classified into five categories according to the American College of Medical Genetics and Genomics guidelines and correlated with clinical manifestations. Results: A total of 31 CNVs were detected in 19 patients, with a median CNV number per patient of two CNVs. Among these, 16 CNVs were classified as pathogenic (n=3) or likely pathogenic (LP) (n=11) or variant of uncertain significance (n=4). The 16p11.2 deletion and 16p13.11 deletion classified as LP were most often detected in 6.5% (3/46), retrospectively. CMA diagnostic yield was 24.3% (9/37 patients) for symptomatic patients. The CNVs results of the commercial newborn screening test using next generation sequencing platforms showed high concordance with CMA results. Conclusion: CMA seems useful as a first-tier test for developmental delay with or without congenital anomalies. However, the classification and interpretation of CMA still remained a challenge. Further research is needed for evidence-based interpretation.
한국산 누치속(genus Hemibarbus) 어류 3종에 대한 세포유전학적 특성을 구령하기 일해 적혈구 세포 크기, 세포당 DNA 함량 및 염색체 핵형을 분석하였다. 누치 H. labeo, 참마자 H. longirostris 및 어름치 H. mylodon의 적혈구 크기를 비교한 결과, 적혈구 세포 장경, 세포 표면적 및 세포 체적에서 어름치가 다른 2종보다 크게 나타났다(P<0.05). 그러나 DNA 함량은 적혈구 세포 크기와 다른 경향을 보여 2.33-2.51 범위로 3종간에 유의적인 차이를 보이지는 않았다(P>0.05). 누치속 어류 3종의 염색체 수는 모두 2n=50개로 나타났으나 핵형에 있어서는 종별로 서로 달라 누치 16M+16SM+18T,A (Fundamental number: NF, 82), 참마자 18M+16SM+16T,A (NF, 84) 그리고 어름치가 18M+24SM+8T,A (NF, 92)로 나타나 3종은 핵형에서 뚜렷한 차이를 보였다.
Bacteria have been regarded as one of the most important factors in pulpal and periapical diseases. Streptococci are frequently isolated facultative anaerobes in infected root canals. Recently molecular biological techniques have been rapidly progressed. This study was designed to apply the molecular biological tools to the identification and classification of streptococci in the endodontic microbiology. Streptococci isolated from infected root canals were identified with both Vitek Systems and API 20 STREP. Identification results were somewhat different in several strains of streptococci. Eighteen streptococci and enterococcal was difficult so to digest plasmid DNA using Hind III and EcoRI to differentiate strains by restriction enzyme analysis of plasmid DNA. 16S rDNA of chromosome was amplified by polymerase chain reaction(PCR) and then restricition fragment length polymorphism(RFLP) using several restriction enzymes was observed. The molecular mass of 16S rDNA of chromosomal DNA was approximately 1.4kb. There were three to five RFLP patterns using eight restriction enzymes. RFLP patterns digested with CfoI which recognizes four base sequences were identical in all stains. Hind III which recognizes six base sequences could not digest the 16S rDNA. Restriction enzymes which recognize five base sequences were suitable for RFLP pattern analysis. At least three different restriction enzymes were needed to compare each strains. 16S rDNA PCR-RFLP was simple and rapid to differentiate and classify strains and could be used in the epidemiological study of root canal infections.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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