• Title/Summary/Keyword: Chenopodium amaranticolor

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Characterization of Tomato spotted wilt virus from Paprika in Korea

  • Choi, Gug-Seoun;Kim, Jeong-Soo;Choi, Jang-Kyung;Kim, Jae-Hyun
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제20권4호
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    • pp.297-301
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    • 2004
  • A Tomato spotted wilt virus (TSWV-KP) was isolated from Paprika (Capsicum annuum var. grossum) showing necrosis spot on the leaves and malformation of the fruit in Yesan, Korea. The virus infected Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Petunia hybrida, Nicotiana glutunosa, Gomphrena globosa, and Physalis floridana. Ten plants including tomato were observed to have systemic TWSV-KP infection. The virus produced necrosis or necrotic ring spots on the inoculated leaves and mosaic, vein necrosis or death on the upper leaves of Datura stramonium, N. clevarandii, N. rustica, and N.tabacum cvs. Thin sections of the infected leaf tissue contained spherical to oval particles, a characteristic of a Tospovirus. The virion contained three molecules of genomic RNAs, which were approximately 9.0, 4.9 and 3.0 kb. The nucleocapsid (N) protein of the purified virion migrated as a single band with molecular weight of about 29 kDa in SDS-PAGE. The N gene of TSWV-KP showed 96.5-97.2% and 97.7-98.5% identities to the three different TSWV isolates of Genbank Database at the nucleotide and amino acid, respectively.

잠두 위조 바이러스와 세포 미세구조 (Broad Bean Wilt Fabaviruses and Their Specific Ultrastructures)

  • 최홍수;조점덕;이금희;김정수
    • Applied Microscopy
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    • 제31권3호
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    • pp.215-222
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    • 2001
  • 잠두위조바이러스(broad bean wilt virus) 5종의 분리주에 대하여 명아주 등 29종의 지표식물반응에 의한 병원성을 분류하였다. 이들 분리주에 감염된 세포에서 3종류의 서로 다른 특이한 미세구조가 관찰되었다. 첫번째 구조는 바이러스입자로 된 $1\sim2$층의 원형관(tube)이고, 둘째는 6각형의 벌집구조(comb)로서 이것은 외부모양이 원형 또는 각으로 된 구조로 구분되었으며, 셋째는 세포원형질 내에 존재하는 다량의 막구조(membrane proliferation)이었다.

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Biological and Molecular Variability of Alfalfa mosaic virus Affecting Alfalfa Crop in Riyadh Region

  • AL-Saleh, Mohammed A.;Amer, Mahmoud A.
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제29권4호
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    • pp.410-417
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    • 2013
  • In 2011-2012, sixty nine samples were collected from alfalfa plants showing viral infection symptoms in Riyadh region. Mechanical inoculation with sap prepared from two collected samples out of twenty five possitive for Alfalfa mosaic virus (AMV) by ELISA were produced systemic mosaic on Vigna unguiculata and Nicotiana tabacum, local lesion on Chenopodium amaranticolor and C. quinoa. Vicia faba indicator plants that induce mosaic and mottle with AMV-Sagir isolate and no infection with AMV-Wadi aldawasser isolate. Approximately 700-bp was formed by RT-PCR using AMV coat protein specific primer. Samples from infected alfalfa gave positive results, while healthy plant gave negative result using dot blot hybridization assay. The nucleotide sequences of the Saudi isolates were compared with corresponding viral nucleotide sequences reported in GenBank. The obtained results showed that the AMV from Australia, Brazil, Puglia and China had the highest similarity with AMV-Sajer isolate. While, the AMV from Spain and New Zealaland had the lowest similarity with AMV-Sajer and Wadi aldawasser isolates. The data obtained in this study has been deposited in the GenBank under the accession numbers KC434083 and KC434084 for AMV-Sajer and AMV-Wadialdawasser respectively. This is the first report regarding the gnetic make up of AMV in Saudi Arabia.

시금치 바이러스병에 관한 연구 I. 시금치에 발생하는 순무모자익바이러스 (TuMV)의 분류동정 (Investigations on the Virus Diseases in Spinach. (Spinacia orleraea L.) I. Identification of Turnip Mosaic Virus Occuring Spinach)

  • 이순형;이기운;정봉조
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.33-35
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    • 1978
  • 모자익병징을 나타내는 이병시금치를 채집하여 순무모자익 바이러스를 분류 동정하였다. 분리된 순무모자익바이러스를 지표식물에 접종한 결과 담배(B.Y)와 명아주에는 국부병반이 형성되었고 쑥갓, 시금치, 무우에는 모자익 병징이 나타났다. 이병시금치 잎을 착즙하여 순무모자익바이러스의 항혈청과의 혈청반응 시험 결과 양성 반응이 나타났다. 이병엽을 Dip법으로 시료를 제작하여 전자현미경에서 검경한 결과 대부분이 750nm의 사상 입자가 관찰되었다. 시금치에서 순무모자익바이러스의 발생분포는 수원, 안양, 대구, 진주 등 거의 전국적으로 발생하였다

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토끼풀에서 분리한 Peanut stunt virus의 성질 (Some Properties of an Isolate of Peanut stunt virus Isolated from White Clover (Trifolium repens L.))

  • 정구호;전용운;최장경;홍진성;류기현;이상용
    • 식물병연구
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    • 제14권1호
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    • pp.71-75
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    • 2008
  • 전형적인 모자이크 증상을 나타낸 토끼풀로부터 Peanut stunt virus(PSV)를 분리하여 Tr-PSV로 명명하였다. 이 연구에서는 Tr-PSV의 특성을 기주반응, 혈청학적 성질, dsRNA분석, RT-PCR 및 RFLP 분석 등을 통하여 지금까지 잘 알려진 ER-PSV Fny-CMV 및 LS-CMV와 비교하였다. Tr-PSV는 접종한 Nicotiana속 식물에서는 모두 전신감염되었으며, C. amaranticolor에서는 접종엽에 국부병반을 형성하였다. 그러나 동부에서는 대조로 이용한 ER-PSV와 마찬가지로 전신감염되어, 접종엽에 국부병반을 형성하는 대조의 CMV계통과는 구분되었다. Tr-PSV에 감염된 N. benthamiana 잎으로부터 추출한 dsRNA는 대조의 PSV나 CMV와 유사한 분자 크기의 4종의 dsRNA가 확인되었고, satellite RNA의 존재는 인정되지 않았다. Cucumovirus 특이적 프라이머를 이용하여 증폭시킨 PCR산물은 약 950 bp의 cDNA가 얻어졌고, 이를 이용하여 조사한 RFLP패턴은 ER-PSV와 같았다. 이와 같은 RFLP분석과 Er-PSV의 항혈청을 이용한 혈청학적 성질의 결과로부터 Tr-PSV는 ER-PSV와 같은 서브그룹 I에 속하는 PSV의 한 계통으로 판단되었다. 국내에서 토끼풀로부터 PSV가 분리 동정된 것은 이 논문이 처음이다.

Characteristics of Cucumber mosaic virus isolated from Zea mays in Korea

  • Kim, Mi-Kyeong;Kwak, Hae-Ryun;Lee, Su-Heon;Kim, Jeong-Soo;Kim, Kook-Hyung;Cha, Byeong-Jin;Choi, Hong-Soo
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제27권4호
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    • pp.372-377
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    • 2011
  • A virus causing mottle and stunt symptom on Zea mays was observed around Ulleng-do, Korea and identified as Cucumber mosaic virus (CMV-ZM) based upon biological, serological, and molecular characteristics. In host range studies, the CMV-ZM isolate produced local lesions on Datura stramonium, Vigna unguiculata, Cucurbita moschata, Chenopodium amaranticolor, Ch. quinoa, whereas this isolate produced systemic mosaic on Nicotiana tabacum cv. 'Xanthi-nc', Capsicum annuum, Solanum lycopersicum, Solanum melongena, Cucurbita pepo, and Z. mays. In addition, chlorotic local rings on inoculated leaves along with severe mosaic, malformation, and fern leaf symptoms on upper systemic leaves were shown in N. glutinosa plants. Complete nucleotide sequences of each genomic RNA segment was determined and compared to those of the other CMV strains. Comparison of the nucleotide sequence of 1a open reading frame (ORF) revealed approximately 89.2-92.4% sequence identity with each CMV subgroup IA and IB strain, while showing only 78% sequence identity with CMV subgroup II. Nucleotide sequence analysis of RNA2 ORFs revealed 85.3-97.6% sequence identity with subgroup I. In ORFs of RNA3, levels of nucleotide sequence identities were higher than 92-99.2% with CMV subgroup I and lower than 82% with CMV isolates of subgroup II. These results suggest that CMV-ZM isolate is more closely related to subgroup I than subgroup II and therefore, CMV-ZM isolate might be classified into as CMV subgroup I based on biological and molecular analysis.

Survey of the Incidence of Viral Infections in Calanthe spp. and Characterization of a GW Isolate of Cymbidium mosaic virus in Korea

  • Park, Chung Youl;Baek, Da Some;Oh, Jonghee;Choi, Jong-Yoon;Bae, Dae Hyeon;Kim, Jeong-Seon;Jang, Gil-Hun;Lee, Su-Heon
    • 식물병연구
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    • 제22권2호
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    • pp.65-71
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    • 2016
  • Cymbidium mosaic virus (CymMV) is a major virus infecting orchid plants and causing economic loss. In this study, the incidence of viral infection in Calanthe spp. at the Korean Institute of Calanthe was investigated using reverse transcription polymerase chain reaction. The CymMV infection rate was 42%, and the two viruses Odontoglossum ringspot virus and Cucumber mosaic virus had frequencies of 8% and 2%, respectively. Additionally, we characterized an isolate of CymMV, CymMV-GW, using biological tests and examined the nucleotide sequence properties of its complete genome. CymMV-GW induced chlorotic ringspots and chlorotic spot symptoms in inoculated leaves of Chenopodium amaranticolor and Nicotiana benthamiana, respectively. In this study, we have for the first complete genome sequence of CymMV-GW in Korea. The CymMV-GW genome was 6,225 nucleotides in length, excluding the poly-(A) tail, and showed whole-genome nucleotide and amino acid sequence identities of 97.7% and 100%, respectively, with the NJ-1 isolate of CymMV. Here, we report the complete genome sequence of the CymMV-GW isolate and viral infection rates for Calanthe spp. in Korea.

Identification of a Genetic Locus Related to Antivirus Production in Pseudomonas fluorescence strain Gpf01 Against Cucumber mosaic virus

  • Cho, Sae-Youll;Lee, Seon-Hwa;Park, Su-Jin;Choi, Kyu-Up;Cho, Jun-Mo;Hur, Jang-Hyun;Shrestha, Anupama;Lim, Chun-Keun
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제25권1호
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    • pp.77-85
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    • 2009
  • Pseudomonas fluorescens strain Gpf01, isolated from ginseng rhizosphere showed antiviral activity against Cucumber mosaic virus, when tested in a local host of CMV, Chenopodium amaranticolor. Transposon mutant library of Gpf01 was prepared using pGS9::Tn5 and the mutant Gpf01-RS19 was found to loose antiviral production. We developed primers from the flanking region of Tn5 and found a cosmid clone pAV1123, harboring 1.2 kb antiviral compound producing (avcf01) locus. When a sub-clone pPH9, which carried 9.3 kb region of pAV1123, was introduced into antivirus deficient P. fluorescens wild type strain B16, it exhibited antiviral activity. Using Tn3-gus mutagenesis and complementation analysis, it was found that the genes related to antiviral activity production resided in a 9.3 kb HindIII-HindIII fragment of pAV1123, indicating that the plasmid carries an essential genes promoting antiviral activity.

채소(가지, 알타리무, 슈가로프)에 발생한 토마토반점위조바이러스 (Tomato spotted wilt virus) 발생과 병징 특성 (Occurrence and Symptoms of Tomato spotted wilt virus on Egg Plant, Whole Radish and Sugar Loaf in Korea)

  • 조점덕;김진영;김정수;최홍수;최국선
    • 식물병연구
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    • 제16권3호
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    • pp.232-237
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    • 2010
  • Tomato spotted wilt virus(TSWV)의 상습 발생지인 안양지역에서 가지, 알타리무, 슈가로프에서 TSWV가 발생하였다. 알타리무에서는 잎에 괴저반점과 뿌리에 괴저 병징이 나타났다. 가지에서는 잎에 전형적인 다중 원형반점을 나타냈으며 열매에 심한 괴저를 나타냈다. 슈가로프에서는 잎에 전형적인 원형반점과 심한 위축 병징이 나타났다. 가지, 알타리 무, 슈가로프에서 분리한 TSWV의 생물적 특성은 흰 명아주, 붉은 명아주, 담배(N. devney)에서는 국부 감염이었으며, 담배(N. glutinosa, N. benthamiana)와 독말풀(D. stramonium)에서는 전심감염이었다. 가지와 슈가로프에서 분리한 TSWV는 병원성이 유사하였으나, 알타리 무에서 분리한 TSWV는 N. tabacum 'Xanthi NC' 등 5종의 담배에서 국부 감염되어 병원성이 매우 상이하였다.

명월초에서 분리한 오이모자이크바이러스의 감염 첫 보고 (First Report of Cucumber mosaic virus Isolated from Sambungai (Gynura procumbens))

  • 권준;홍진성
    • 식물병연구
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    • 제23권4호
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    • pp.379-382
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    • 2017
  • 2016년 3월, 모자이크와 황화 병징을 보이는 명월초 잎에서 CMV를 분리하여 CMV-Gyp로 명명하였다. 기주식물의 생물적 반응과 RT-PCR, PCR-RFLP, 이동단백질 및 외피단백질 유전자의 염기서열 분석을 통해 CMV를 동정하였다. 가지과(담배, 고추, 꽈리)와 비름과(흰명아주, 붉은명아주)에서는 전형적인 CMV의 병징이 나타났으나 박과(쥬키니호박, 오이)에서는 병징이 발현되지 않는 특성을 보였다. 3a 및 CP 유전자의 계통학적 분석 결과, CMV-Gyp가 CMV Subgroup II에 속하는 것으로 나타냈다. CMV-Gyp의 이동단백질과 외피단백질유전자의 서열은 아미노산 수준에서 CMV-Hnt와 99.3% 및 100% 일치하였다. 이 논문은 명월초에서 CMV 감염에 대한 첫 보고이다.