• 제목/요약/키워드: Cell Sorting

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Micro-imaging techniques for evaluation of plastic microfluidic chip

  • Kim, Jung-Kyung;Hyunwoo Bang;Lee, Yongku;Chanil Chung;Yoo, Jung-Yul;Yang, Sang-Sik;Kim, Jin-Seung;Park, Sekwang;Chang, Jun-Keun
    • JSTS:Journal of Semiconductor Technology and Science
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    • 제1권4호
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    • pp.239-247
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    • 2001
  • The Fluorescence-Activated Cell Sorter (FACS) is a well-established instrument used for identifying, enumerating, classifying and sorting cells by their physical and optical characteristics. For a miniaturized FACS device, a disposable plastic microchip has been developed which has a hydrodynamic focusing chamber using soft lithography. As the characteristics of the spatially confined sample stream have an effect on sample throughput, detection efficiency, and the accuracy of cell sorting, systematic fluid dynamic studies are required. Flow visualization is conducted with a laser scanning confocal microscopy (LSCM), and three-dimensional flow structure of the focused sample stream is reconstructed from 2D slices acquired at $1\mutextrm{m}$ intervals in depth. It was observed that the flow structure in the focusing chamber is skewed by unsymmetrical velocity profile arising from trapezoidal cross section of the microchannel. For a quantitative analysis of a microscopic flow structure, Confocal Micro-PIV system has been developed to evaluate the accelerated flow field in the focusing chamber. This study proposes a method which defines the depth of the measurement volume using a detection pinhole. The trajectories of red blood cells (RBCs) and their interactions with surrounding flow field in the squeezed sample stream are evaluated to find optimal shape of the focusing chamber and fluid manipulation scheme for stable cell transporting, efficient detection, and sorting

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다채널전극으로 기록한 토끼 망막신경절세포의 활동전위 파형 구분 (Waveform Sorting of Rabbit Retinal Ganglion Cell Activity Recorded with Multielectrode Array)

  • 진계환;이태수;구용숙
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제16권3호
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    • pp.148-154
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    • 2005
  • 망막에서 나오는 활동전위와 같이 복잡한 신경망을 거쳐 처리되는 전기신호를 분석하기 위해서는 기존의 단일 전극 기록법으로는 어렵다. 단일 전극을 통한 활동전위의 기록은 개개의 신경세포 특성을 알아내는 데에는 유용한 방법이나 신경세포 간의 시간적, 공간적인 관계는 알아낼 수 없다는 한계를 가지고 있으므로 이같은 한계를 극복하기 위하여 다채널 전극을 이용한 신경신호 기록방법이 최근에 개발되어 널리 이용되고 있다. 다채널전극 기록 방식인 MEA60 시스템은 세포 밖에 위치한 60개의 전극이 생체신호를 동시에 기록한다. 세포 fi에 위치한 각각의 전극이 포착한 신경 신호는 하나의 망막신경절세포 반응이라기보다는 여러 세포의 반응이 동시에 기록될 가능성이 높다. 그러므로 여러 세포의 반응이 함께 기록된 신호로부터 각각의 세포로부터 나오는 파형을 구분하는 작업이 반드시 필요하다. 본 연구에서는 다채널 전극으로 기록한 망막 신경절세포 신호로부터 MATLAB을 이용하여 활동전위 파형을 검출하고 분류하는 과정을 구현하여 보았다. 이러한 분류과정은 추후 진행되는 신호분석방법인 자극 후 시간 히스토그램(poststimulus time histogram, PSTH), 자기상관관계(autocorrelogram), 상호상관관계(cross-correlogram)를 보기 위하여 반드시 거쳐야 하는 전처리(preprocess) 과정이다. 본 연구에서는 MATLAB을 이용한 파형 구분 프로토콜을 확립하였을 뿐만 아니라 이러한 프로토콜이 신경절 세포의 활동전위 파형을 검출하는 데 유용한 방법임을 입증하였다

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라만 분광법을 활용한 세균 검측 기술 (Rapid bacterial identification using Raman spectroscopy)

  • 노지현;이태권
    • 미생물학회지
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    • 제53권2호
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    • pp.71-78
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    • 2017
  • 라만 분광법은 레이저가 분자의 공명에 의해 산란되는 특성을 이용하여 세포 내 지질, 핵산, 단백질 등의 구성물질을 신속하게 측정할 수 있어 단세포 수준의 세균 검측에 적합한 기술로 알려져 있다. 세포 구성물질에 대한 높은 특이성과 민감성 때문에 라만 스펙트라(spectra)만으로 일부 종 수준의 세균 계통분석이 가능하다. 또한 탄소-13, 수소-2 등의 동위원소를 동시에 사용하였을 경우 단세포의 생리적 활성 변화에 대한 정량평가에 활용 할 수 있다. 라만 분광법을 이용한 세균 검측 이후에도 광학핀셋과 미세유체칩과 연계하여 관심 있는 난배 양성 세균을 선택적으로 분리하거나 단세포 유전체 연구에 이용할 수 있을 정도로 응용 범위가 넓다. 본 총설에서는 라만 분광법을 활용한 미생물 분석 연구의 정확한 이해를 돕고자 기존의 연구를 중심으로 라만 분광법의 특성과 응용분야에 대해서 검토, 정리하였다.

Purification of Pig Muscle Stem Cells Using Magnetic-Activated Cell Sorting (MACS) Based on the Expression of Cluster of Differentiation 29 (CD29)

  • Choi, Kwang-Hwan;Kim, Minsu;Yoon, Ji Won;Jeong, Jinsol;Ryu, Minkyung;Jo, Cheorun;Lee, Chang-Kyu
    • 한국축산식품학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.852-859
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    • 2020
  • The muscle stem cells of domestic animals are of interest to researchers in the food and biotechnology industries for the production of cultured meat. For producing cultured meat, it is crucial for muscle stem cells to be efficiently isolated and stably maintained in vitro on a large scale. In the present study, we aimed to optimize the method for the enrichment of pig muscle stem cells using a magnetic-activated cell sorting (MACS) system. Pig muscle stem cells were collected from the biceps femoris muscles of 14 d-old pigs of three breeds [Landrace×Yorkshire×Duroc (LYD), Berkshire, and Korean native pigs] and cultured in skeletal muscle growth medium-2 (SkGM-2) supplemented with epidermal growth factor (EGF), dexamethasone, and a p38 inhibitor (SB203580). Approximately 30% of total cultured cells were nonmyogenic cells in the absence of purification in our system, as determined by immunostaining for cluster of differentiation 56 (CD56) and CD29, which are known markers of muscle stem cells. Interestingly, following MACS isolation using the CD29 antibody, the proportion of CD56+/CD29+ muscle stem cells was significantly increased (91.5±2.40%), and the proportion of CD56 single-positive nonmyogenic cells was dramatically decreased. Furthermore, we verified that this method worked well for purifying muscle stem cells in the three pig breeds. Accordingly, we found that CD29 is a valuable candidate among the various marker genes for the isolation of pig muscle stem cells and developed a simple sorting method based on a single antibody to this protein.

순서통계에 근거한 개선된 CFAR 검파기의 하드웨어 구조 제안 (Advanced OS-CFAR Processor Design with Low Computational Effort)

  • 현유진;이종훈
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제16권1호
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    • pp.65-71
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    • 2012
  • 순서통계에 근거한 CFAR(Constant False Alarm) 검파기(이하 OS-CFAR)는 다중 타깃(Target) 환경의 차량용 레이더에 아주 유용 사용되는 알고리즘이다. 그러나 정렬 알고리즘을 사용하기 때문에 일반적인 셀-평균 CFAR 검파기(이하 CA-CFAR)에 비해 계산량이 많아 실시간 구현에 어려운 점이 있다. 본 논문에서는 보다 낮은 계산량을 가지는 OS-CFAR 구조를 제안하였다. 제안된 방법에서는 정렬 알고리즘이 단 한번 만 수행되기 때문에 이를 통해 많은 계산량을 줄일 수 있다. 특히 고속 정렬 알고리즘을 사용하는 경우 통상적인 OS-CFAR 구조와 비교하여 데이터양에 상관없이 항상 계산속도가 빠름을 확인 할 수 있다. 또한 본 논문에서는 실제 레이더 수신 데이터를 이용하여 제안된 방법에 적용한 결과도 제시하였다.

B-1 세포 유래 다중반응성 단클론 항체의 형성과 항원 자극에 대한 B 세포의 동시자극자 발현 (Establishment of B-1 cell-derived polyreactive monoclonal antibodies and expression of costimulators by B-cell to antigenic stimulation)

  • 이주연;최점일;서조영
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제37권sup2호
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    • pp.371-384
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    • 2007
  • 연구 목적 : 면역 반응에서 B-1 세포의 정확한 역할은 아직 명확히 규명되지 않았으나 최근 B-1 세포가 면역의 내성을 야기하고 유지하는데 필요한 특성들을 가지고 있음이 밝혀지고 있다. 이에 본 연구에서는 B-1 세포 유래 단클론 항체의 특성과 항원 자극에 대한 B 세포의 동시자극자 (MHC Class, B7-2, 7-2) 발현을 평가하여 B 세포의 면역조절 기능을 알아보고자 한다. 연구 대상 및 방법 : B-1 세포 유래 단클론 항체를 형성하는 잡종세포주를 이용하여 다양한 내, 외인성 항원에 대한 단클론 항체의 반응 양상을 평가하였다. 여러 내, 외인성 항원으로 면역한 쥐의 복강과 비장 B 세포의 동시자극자의 발현을 Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS)을 이용하여 평가하였다. 결과 : 최종적으로 단클론을 형성하는 2개의 클론을 형성하였고, 이 B-1 세포 유래 단클론 항체는 dose-saturable pattern을 띄는 다중 반응성을 나타내었다. FACS를 이용한 동시자극자의 발현 검사에서는 MHC 발현은 복강과 비장의 B 세포가 유사하였으나, B7-1과 7-2는 복강의 B 세포에서 더 뚜렷한 발현을 보여주었다. 결론 : B-1 세포 유래 단클론 항체는 다양한 내, 외인성 항원 자극에 대해 dose-saturable한 다중반응성을 나타낸다. 복강과 비장의 B세포는 내, 외인성 항원의 면역에 있어서 동시자극자 발현이 명확히 다른 양상을 나타냄을 확인할 수 있었다.

항원 특이적 단일 기억 B 세포 분리를 이용한 신종 바이러스 대응 신속 항체 플랫폼 개발 (Development of Rapid Antibody-based Therapeutic Platform Correspondence for New Viruses Using Antigen-specific Single Cell Memory B Cell Sorting Technology)

  • 석지윤;정수한;한예지;박아름;김정은;송영조;유치호;윤형석;구세훈;이승호;이용한;허경행;최웅
    • 한국군사과학기술학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.116-125
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    • 2024
  • The COVID-19 pandemic is not over despite the emergency use authorization as can see recent COVID-19 daily confirmed cases. The viruses are not only difficult to diagnose and treat due to random mutations, but also pose threat human being because they have the potential to be exploited as biochemical weapons by genetic manipulation. Therefore, it is inevitable to the rapid antibody-based therapeutic platform to quickly respond to future pandemics by new/re-emerging viruses. Although numerous researches have been conducted for the fast development of antibody-based therapeutics, it is sometimes hard to respond rapidly to new viruses because of complicated expression or purification processes for antibody production. In this study, a novel rapid antibody-based therapeutic platform using single B cell sorting method and mRNA-antibody. High immunogenicity was caused to produce antibodies in vivo through mRNA-antigen inoculation. Subsequently, antigen-specific antibody candidates were selected and obtained using isolation of B cells containing antibody at the single cell level. Using the antibody-based therapeutic platform system in this study, it was confirmed that novel antigen-specific antibodies could be obtained in about 40 days, and suggested that the possibility of rapid response to new variant viruses.

ATM 망에 적용 가능한 출력단 버퍼형 Batcher-Banyan 스위치의 성능분석 (Performance Analysis of Output Queued Batcher-Banyan Switch for ATM Network)

  • Keol-Woo Yu;Kyou Ho Lee
    • 한국시뮬레이션학회논문지
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    • 제8권4호
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    • pp.1-8
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    • 1999
  • This paper proposes an ATM switch architecture called Output Queued Batcher-Banyan switch (OQBBS). It consists of a Sorting Module, Expanding Module, and Output Queueing Modules. The principles of channel grouping and output queueing are used to increase the maximum throughput of an ATM switch. One distinctive feature of the OQBBS is that multiple cells can be simultaneously delivered to their desired output. The switch architecture is shown to be modular and easily expandable. The performance of the OQBBS in terms of throughput, cell delays, and cell loss rate under uniform random traffic condition is evaluated by computer simulation. The throughput and the average cell delay are close to the ideal performance behavior of a fully connected output queued crossbar switch. It is also shown that the OQBBS meets the cell loss probability requirement of $10^{-6}$.

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Optimization of Yeast Surface-Displayed cDNA Library Screening for Low Abundance Targets

  • Kim, Juhyung;Kim, Hyung Kyu;Jang, Hye Jeong;Kim, Eunkyung;Kim, Moon Kyu
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권4호
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    • pp.547-553
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    • 2015
  • The yeast surface-displayed cDNA library has been used to identify unknown antigens. However, when unknown target antigens show moderate-to-low abundance, some modifications are needed in the screening process. In this study, a directional random-primed cDNA library was used to increase the number of candidates for the unknown antigen. To avoid the loss of target yeast clones that express proteins at a low frequency in the cDNA library, a comprehensive monitoring system based on magnetic-activated cell sorting, fluorescence-activated cell sorting, and immunofluorescence was established, and a small number of target yeast cells was successfully enriched. These results showed that our optimized method has potential application for identifying rare unknown antigens of the human monoclonal antibody.

순환적 순위 알고리즘을 이용한 단일형 버퍼형태의 ATM스위치 (Single Buffer types of ATM Switches based on Circulated Priority Algorithm)

  • 박병수;조태경
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제5권5호
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    • pp.429-432
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    • 2004
  • 본 논문은 단일형태의 버퍼 구조로 물리적인 단일 큐의 시퀀서 갖고 논리적으로 다중 큐의 형태로 구성된 ATM스위치를 제안한다. 제안된 스위치는 순환적 순위 알고리즘이 적용되도록 하드웨어로 구현된 ATM 셀의 출력 포트에 따라 ATM 셀이 정렬되도록 프로시져를 수행시킨다. 이 구조는 물리적으로 단일 버퍼를 갖지만 논리적으로는 순환적으로 순위를 결정하여 출력포트에서의 상충을 최대한 억제하도록 설계된 다중 큐의 기능을 하고 있다. 향후 이러한 형태의 구조는 다양한 구조의 라우팅을 위한 스위치로 응용되고, 시스템 구성의 확장성에 있어서도 큰 장점을 지니고 있어, 전송 효율적인 면에서도 훌륭한 구조로 평가된다.

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