• Title/Summary/Keyword: Cassette

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Efficient and Precise Construction of Markerless Manipulations in the Bacillus subtilis Genome

  • Yu, Haojie;Yan, Xin;Shen, Weiliang;Shen, Yujia;Zhang, Ji;Li, Shunpeng
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권1호
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    • pp.45-53
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    • 2010
  • We have developed an efficient and precise method for genome manipulations in Bacillus subtilis that allows rapid alteration of a gene sequence or multiple gene sequences without altering the chromosome in any other way. In our approach, the Escherichia coli toxin gene mazF, which was used as a counter-selectable marker, was placed under the control of a xylose-inducible expression system and associated with an antibiotic resistance gene to create a "mazF-cassette". A polymerase chain reaction (PCR)-generated fragment, consisting of two homology regions joined to the mazF-cassette, was integrated into the chromosome at the target locus by homologous recombination, using positive selection for antibiotic resistance. Then, the excision of the mazF-cassette from the chromosome by a single-crossover event between two short directly repeated (DR) sequences, included in the design of the PCR products, was achieved by counter-selection of mazF. We used this method efficiently and precisely to deliver a point mutation, to inactivate a specific gene, to delete a large genomic region, and to generate the in-frame deletion with minimal polar effects in the same background.

${\alpha}1$,3-Galactosyltransferase 유전자 좌위에서 Membrane Cofactor Protein을 효과적으로 발현하는 자성 돼지 섬유아세포의 생산 (Generation of Female Porcine Fibroblasts Expressing Efficiently Membrane Cofactor Protein at ${\alpha}1$,3-Galactosyltransferase locus)

  • 오건봉;김벨라;황성수;옥선아;임석기;박진기
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.289-295
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    • 2013
  • Xenotransplantation of pig organs into primates results in fatal damage, referred as hyperacute rejection (HAR), and acute humoral xenograft rejection (AHXR), to the organ graft mediated by antibodies pre-existing and newly-producing in primates against their cognate pig antigens. Functional ablation of ${\alpha}1$,3-galactosyltransferase (Gal-T KO) of pig which is an enzyme involved in synthesis of Gala1-3Galb1-4GlcNAc-R antigen is essentially required to prevent HAR. Moreover, additional genetic modification under Gal-T KO background for enforced expression of human complement regulatory proteins which can inhibits complement activation is known to effectively imped HAR and AHXR. In this study, we constructed a membrane cofactor protein (MCP) expression cassette under control of human $EF1{\alpha}$ promoter. This cassette was inserted between homologous recombination regions corresponding to Gal-T locus. Subsequently this vector was introduced into ear skin fibroblasts of female pig by nucleofection. We were able to obtained 40 clones by neomycin selection and 4 clones among them were identified as clones targeted into Gal-T locus of MCP expression cassette by long-range PCR. Real time RT-PCR was shown to down-regulation of Gal-T expression. From these results, we demonstrated human $EF1{\alpha}$ promoter could induce efficient expression of MCP on cell surface of fibroblasts of female pig.

Structural Insights into Porphyrin Recognition by the Human ATP-Binding Cassette Transporter ABCB6

  • Kim, Songwon;Lee, Sang Soo;Park, Jun Gyou;Kim, Ji Won;Ju, Seulgi;Choi, Seung Hun;Kim, Subin;Kim, Na Jin;Hong, Semi;Kang, Jin Young;Jin, Mi Sun
    • Molecules and Cells
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    • 제45권8호
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    • pp.575-587
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    • 2022
  • Human ABCB6 is an ATP-binding cassette transporter that regulates heme biosynthesis by translocating various porphyrins from the cytoplasm into the mitochondria. Here we report the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of human ABCB6 with its substrates, coproporphyrin III (CPIII) and hemin, at 3.5 and 3.7 Å resolution, respectively. Metal-free porphyrin CPIII binds to ABCB6 within the central cavity, where its propionic acids form hydrogen bonds with the highly conserved Y550. The resulting structure has an overall fold similar to the inward-facing apo structure, but the two nucleotide-binding domains (NBDs) are slightly closer to each other. In contrast, when ABCB6 binds a metal-centered porphyrin hemin in complex with two glutathione molecules (1 hemin: 2 glutathione), the two NBDs end up much closer together, aligning them to bind and hydrolyze ATP more efficiently. In our structures, a glycine-rich and highly flexible "bulge" loop on TM helix 7 undergoes significant conformational changes associated with substrate binding. Our findings suggest that ABCB6 utilizes at least two distinct mechanisms to fine-tune substrate specificity and transport efficiency.

충청지역의 닭으로부터 분리된 Proteus mirabilis 균주에 존재하는 Class 1 Integron의 유전형 분석 (Characterizations of Class 1 Integrons in Proteus mirabilis Isolated from Chickens at Chungcheong Province)

  • 성지연;변용관
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제47권2호
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    • pp.65-70
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    • 2015
  • 최근까지도 세균 감염증 치료 또는 성장촉진을 목적으로 가축에게 광범위하게 항균제를 사용해 왔으며, 이는 사람에게 보편적으로 사용되는 항균제들에 대한 내성세균의 출현 및 확산을 유도했다. 이렇게 출현한 다제 내성세균은 사람에게 음식을 통해 전달되고 내성유전자를 확산시킬 수 있어 더 큰 문제가 되고 있다. 본 연구에서는 충청지역에서 사육된 닭으로부터 분리된 Proteus mirabilis 균주를 대상으로 integron의 빈도 및 integron의 존재에 따른 항균제 내성 비율의 변화를 조사하였다. 총 26 균주의 Proteus mirabilis가 분리되었으며 이 균주를 대상으로 항균제 감수성 검사와 PCR 및 DNA 염기서열분석을 통한 integron의 유전자 카세트 분석이 이루어졌다. 또한 extragenic palindromic sequence-based PCR (REP-PCR) 방법을 이용하여 P. mirabilis 균주들의 clonality를 확인하였다. P. mirabilis 26균주 중 14 균주(53.8%)가 class 1 integrons을 가지고 있음이 확인되었다. Class 1 integron 내에는 aminoglycoside (aacC, aadA), trimethoprim (dfrA), lincosamide (linF), 및 erythromycin (ereA) 등의 내성을 유도하는 유전자 카세트가 위치해 있었다. 이들 class 1 integron을 포함하는 균주는 integron을 포함하지 않는 균주보다 aminoglycoside 및 trimethoprim 계열 항균제에 대해 높은 내성율을 보였다. 본 연구에서 class 1 integron은 P. mirabilis 균주들 사이에 광범위하게 확산되어 있으며 다양한 항균제에 내성을 나타내는데 중요한 역할을 하고 있음이 확인되었다. 따라서 축사환경에 다제 내성세균의 출현 및 증가에 중요한 역할을 하는 integron의 확산에 대한 지속적인 감시가 필요할 것으로 사료된다.

일반촬영 실습 장비의 오염 및 소독에 관한 융합적 연구 (A Convergence Study on the Contamination and Disinfection of General X-ray generator Practical Equipment)

  • 박규태;김동흔;박상희;정원희;김소연;홍희진;손나라;남설희;한만석
    • 한국융합학회논문지
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    • 제11권1호
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    • pp.51-56
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    • 2020
  • 본 연구는 강원도 지역 K 대학교내 방사선촬영 실습실의 진단용 엑스선 발생장치 1대를 선택하여 table, IP cassette, 의료방사선 차폐용 납 가운의 표면 오염도의 세균을 검출하여 적절한 소독관리와 학생들의 손 위생의 필요성을 알리고자 한다. 그 후 휴지, tissue cleaner, 70% alchol로 소독을 실시하고 즉시 멸균면봉으로 채취하여 표면의 오염 분포상태 및 소독효과를 평가하였다. 표면의 오염 분포도를 측정한 결과는 Apron에서 가장 많은 균이 검출되었고 표면 오염도에 따른 소독효과 평가는 IP cassette에서는 70% Alcohol에서 두드러진 효과가 나타나고 Apron와 Table의 경우는 Tissue cleaner, 70% Alcohol에서는 소독효과가 동일함을 확인하였다. 따라서 학생들 사이에서 세균 감염을 방지하기 위하여 실습 전에 기본적인 손 씻기, 주기적인 소독을 하여 감염을 방지하여야 한다.

Integration of a target gene into chromosomal genome of BF-2 cells using UV-inactivated snakehead retrovirus (SnRV)

  • Kwon, Se-Ryun;Nishizawa, Toyohiko;Yoshimizu, Mamoru
    • 한국어병학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.375-382
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    • 2009
  • 목적 유전자를 숙주 세포의 게놈에 삽입하거나 발현하는데 있어서, retrovirus 매개의 유전자 전달 시스템을 사용하게 되면, 복잡하고 힘든 절차를 거치게 된다. 본 연구에서는 목적 유전자의 BF-2 세포 게놈 내 삽입을 하기 위해, UV로 불활화한 어류 레트로바이러스인 SnRV를 사용한 간단한 방법에 대해 조사하였다. 우선, BF-2 세포를 사용한 transfection을 위해 Lipofectamine 2000과 Transome을 사용하여 최적 조건을 결정하였다. 0.5 $\mu\ell$ Lipofectamine 2000을 사용한 경우 0.5, 1 그리고 2 $\mu{g}$ DNA 사용에 대해 33.8, 40.6 그리고 40.2%의 transfection 효율을 보인 동시에 최소 80 % 이상의 높은 세포 생존율을 나타낸 반면, Transome을 사용한 transfection 효율은 모두 5% 이하였다. UV 처리 시간에 있어서는 5분간의 UV 처리로 SnRV의 감염성이 불활성화되는 것을 확인하였다. 다음으로 GFP 유전자의 양측에 SnRV에서 유래된 LTR 서열을 접하고 있는 cassette를 구축한 뒤 BF-2 세포에 transfection 하고, cassette 유전자의 삽입과 발현을 위해 UV로 불활화한 SnRV를 처리하였다. 그 결과 UV로 불활화한 SnRV를 1회 처리 또는 SnRV 무처리 BF-2 세포에서는 형광이 관찰되지 않았던 반면, 3회와 5회 처리한 BF-2 세포에서 형광발현이 확인되었다. 이러한 결과로, GFP 유전자가 불활화한 SnRV를 이용하여 BF-2 세포 게놈에 삽입되는 것을 확인하였다.

회원사 탐방-팜파스(주)

  • 한국광산업진흥회
    • 광산업정보
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    • 통권35호
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    • pp.20-23
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    • 2006
  • 1980년 3월, 국내 최초로 Aldio용 Cassette Mono Head를 생산(LG이노텍)하였던 기술력을 바탕으로 2003년 6월, Head 사업부에서 분사하여 설립된 팜파스는 초정밀 가공기술 LED 제어 및 모듈기술, 박막/열처리/측정 등의 응용기술을 확보하여 새로운 시장을 개척해 나가고 있는 전문기업이다.

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OHT System for 300mm wafer cassette transfer

  • Lee, Sunghyun;Kim, Jinki;Hakkyung Sung
    • 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
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    • 제어로봇시스템학회 2002년도 ICCAS
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    • pp.104.6-104
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    • 2002
  • $\textbullet$ Contents 1 Introduction $\textbullet$ Contents 2 300mm OHT System $\textbullet$ Contents 3 function of OHT System $\textbullet$ Contents 4 Control Method $\textbullet$ Contents 5 Conclusion

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디지탈 신호처리에 의한 실시간 태아 심전도 감시 시스템에 관한 연구 I (Real Time FECG Monitoring System Using Digital Signal Process)

  • 김남현;유선국;이건기;윤대희;김원기;박상희
    • 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
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    • 제어로봇시스템학회 1988년도 한국자동제어학술회의논문집(국내학술편); 한국전력공사연수원, 서울; 21-22 Oct. 1988
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    • pp.722-724
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    • 1988
  • In this study, 8 ch. FECG signal storage system with general cassette recorder and amplifier is developed, and simulated LMS algorithm. In future we construct real time FECG monitor system that is used digital signal processor.

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