• 제목/요약/키워드: Carboxyl terminal

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ZNF552, a novel human KRAB/C2H2 zinc finger protein, inhibits AP-1- and SRE-mediated transcriptional activity

  • Deng, Yun;Liu, Bisheng;Fan, Xiongwei;Wang, Yuequn;Tang, Ming;Mo, Xiaoyang;Li, Yongqing;Ying, Zaochu;Wan, Yongqi;Luo, Na;Zhou, Junmei;Wu, Xiushan;Yuan, Wuzhou
    • BMB Reports
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    • 제43권3호
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    • pp.193-198
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    • 2010
  • In this study, we report the identification and characterization of a novel C2H2 zinc finger protein, ZNF552, from a human embryonic heart cDNA library. ZNF552 is composed of three exons and two introns and maps to chromosome 19q13.43. The cDNA of ZNF552 is 2.3 kb, encoding 407 amino acids with an amino-terminal KRAB domain and seven carboxyl-terminal C2H2 zinc finger motifs in the nucleus and cytoplasm. Northern blotting analysis indicated that a 2.3 kb transcript specific for ZNF552 was expressed in liver, lung, spleen, testis and kidney, especially with a higher level in the lung and testis in human adult tissues. Reporter gene assays showed that ZNF552 was a transcriptional repressor, and overexpression of ZNF552 in the COS-7 cells inhibited the transcriptional activities of AP-1 and SRE, which could be relieved through RNAi analysis. Deletion studies showed that the KRAB domain of ZNF552 may be involved in this inhibition.

Kinesin superfamily-associated protein 3 (KAP3)를 통한 HS-1-associated protein X-1 (HAX-1)과 Kinesin-II의 결합 (Kinesin Superfamily-associated Protein 3 (KAP3) Mediates the Interaction between Kinesin-II Motor Subunits and HS-1-associated Protein X-1 (HAX-1) through Direct Binding)

  • 장원희;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제23권8호
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    • pp.978-983
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    • 2013
  • Kinesin-II는 다양한 운반체들을 미세소관을 따라 운반하는 motor 단백질의 하나이다. Kinesin-II는 두 개의 motor 단백질 KIF3A와 KIF3B, 그리고 motor 단백질의 말단에 결합하는 kinesin superfamily-associated protein 3 (KAP3)로 구성되어 있다. KAP3는 Kinesin-II의 기능에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있으나 명확한 기능은 아직 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KAP3와 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid system을 사용하여 탐색한 결과 HS-1-associated protein X-1 (HAX-1)을 분리하였다. KAP3은 HAX-1의 C-말단 부위와 결합하며, HAX-1은 KAP3의 C-말단부위와 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 그러나, HAX-1는 KIF3A, KIF3B, KIF5B, 그리고 kinesin light chain (KLC)과는 결합하지 않았다. KAP3와 HAX-1의 단백질 결합은 glutathione S-transferase (GST) pull-down assay와 공동면역침강으로 추가 확인하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액을 HAX-1 항체와 KIF3A 항체로 면역침강을 행한 결과 Kinesin-II의 구성단백질인 KIF3B와 KAP3가 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 KAP3가 Kinesin-II와 HAX-1의 결합을 매개한다는 것을 시사한다.

Kinesin-I과 직접 결합하는 STAR RNA 결합 단백질인 SAM68, SLM-1과 SLM-2의 규명 (The STAR RNA Binding Proteins SAM68, SLM-1 and SLM-2 Interact with Kinesin-I)

  • 석대현
    • 생명과학회지
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    • 제21권9호
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    • pp.1226-1233
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    • 2011
  • 키네신은 신경세포에서 미세소관 위를 따라 소포들을 운반하는 분자 motor 단백질로 4개의 단백질로 구성되어있다. 신경세포내에서 발현하는 KIF5C가 세포 내에서 어떤 특정소포를 이동시키는가는 신경세포성장에서 중요문제이다. 이에 본연구는 KIF5C와 결합하는 단백질을 동정하기 위하여 효모 two-hybrid 방법을 사용하여 KIF5C와 특이적으로 결합하는 $\underline{S}$am68-$\underline{l}$ike $\underline{m}$ammalian protein 2 (SLM-2)을 확인하였다. $\underline{S}$ignal $\underline{T}$ransducers and $\underline{A}$ctivators of $\underline{R}$NA (STAR) family의 한 종류이며 RNA processing에 관여하는 RNA 결합단백질인 SLM-2는 KIF5s의 C-말단과 결합하며, 또한 SLM-2의 C-말단은 KIF5s와 결합하는데 필수영역이였다. 이러한 단백질간의 결합은 Glutathione S-transferase (GST) pull-down assay를 통하여 SAM68, SLM-1, SLM-2은 특이적으로 Kinesin-I과 결합함을 확인하였으며, SAM68의 항체로 면역침강한 결과 KIF5s와 mRNA는 같이 침강하였다. 신경 세포의 말단에는 돌기형성에 필요한 단백질들의 주형인 mRNA가 다수 존재하며, 이러한 mRNA는 세포의 중앙에서 세포의 말단쪽으로 이동하여야 하는데, 이번 연구 결과는 Kinesin-I이 특이적으로 mRNA을 운반할 것으로 예상된다.

Muskelin과 multi-PDZ domain protein 1 (MUPP1) 단백질의 PDZ 도메인을 통한 결합 (Muskelin Interacts with Multi-PDZ Domain Protein 1 (MUPP1) through the PDZ Domain)

  • 장원희;정영주;최선희;이원희;김무성;김상진;엄상화;문일수;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.594-600
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    • 2015
  • 단백질-단백질 결합은 다양한 세포내 반응 조절에서 중요한 역할을 한다. Postsynaptic density-95/disks large/ zonula occludens-1 (PDZ) 도메인은 널리 알려진 단백질-단백질 결합 매개 도메인 중 하나이다. PDZ 도메인은 결합 단백질의 카르복실(C)-말단의 특정 motif와 결합한다. Multi-PDZ domain protein 1 (MUPP1)은 13개 PDZ 도메인을 가지는 단백질로서 다양한 구조단백질 및 신호단백질에 대한 scaffold로 작용한다고 알려져 있지만 MUPP1의 세포 내 기능은 아직 명확히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 MUPP1의 PDZ 도메인과 결합하는 단백질을 규명하기 위하여 효모 two-hybrid 방법을 이용하였고 muskelin이 MUPP1과 결합하는 것을 확인하였다. Muskelin은 GABAA 수용체(GABAAR)의 α1 subunit와 결합하며 수용체의 endocytosis와 분해에 관여하는 것으로 알려져 있다. Muskelin은 MUPP1의 3번째 PDZ 도메인과 결합하지만, 다른 PDZ 도메인과는 결합하지 않았다. 또한 MUPP1과의 결합에 muskelin의 C-말단부위가 필수적임을 효모 two-hybrid 방법으로 확인하였다. HEK-293T 세포에 MUPP1과 muskelin을 동시에 발현하여 면역 침강한 결과 두 단백질은 같이 면역 침강하였다. 반면에 C-말단 결손 muskelin은 MUPP1과 같이 면역 침강하지 않았다. 또한 muskelin과 MUPP1은 세포내의 같은 위치에서 발현하였다. 이러한 결과들은, muskelin과의 결합을 통해, MUPP1 혹은 MUPP1과 결합하는 단백질이 GABAAR의 세포내이동과 회전(turnover)을 조절할 가능성을 시사한다.

Ras-GTPase-activating protein SH3 domain-binding proteins 2, G3BP2와 KIF5A C-말단 꼬리 영역과의 결합 (Interaction of Ras-GTPase-activating Protein SH3 Domain-binding Proteins 2, G3BP2, With the C-terminal Tail Region of KIF5A)

  • 정영주;장원희;이원희;김무성;김상진;엄상화;문일수;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제27권10호
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    • pp.1191-1198
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    • 2017
  • 세포 내 소기관들과 소포들은 세포 내에서 미세소관을 따라 적절한 구획으로 수송된다. 이러한 세포 내 수송과정은 분자 모터단백질인 kinesin과 dynein에 의하여 이루어진다. Kinesin 1은 오징어 축삭돌기 세포질로부터 처음 분리되었으며 2개의 중쇄단위체(KHCs, 또는 KIF5s) 및 이와 결합하는 경쇄단위체(KLCs)의 복합체를 형성한다. KIF5s는C-말단 고리 영역을 통해 많은 다양한 단백질과 결합하는데, 아직 그 결합단백질들은 충분히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서는 KIF5A 결합단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid 탐색을 수행하여 스트레스 과립형성과 mRNP 위치결정에 관여하는 Ras-GTPase-activating protein (GAP) Src homology3 (SH3)-domain-binding protein 2 (G3BP2)를 분리하였다. G3BP2는 KIF5A의 C-말단 고리 영역에 존재하는 73개 아미노산을 포함하는 영역과 결합하였다. 그러나 G3BP2는 KIF5B, KIF5C, KLC1, KIF3A와는 결합하지 않았다. KIF5A는 G3BP2의 arginine-glycine-glycine(RGG)/Gly-rich 도메인과 결합하지만 G3BP1과는 결합하지 않았다. HEK-293T세포에 G3BP2와 KIF5A를 발현하여 면역침강한 결과 G3BP2와 KIF5A는 같이 침강하였다. 또한 HEK-293T 세포 내의 전체에서 두 단백질은 같은 부위에 존재하였다. 이러한 결과들은 세포 내에서 G3BP2는 KIF5A와 결합하는 결합단백질로 확인 되었다.

분열효모 핵공단백질인 Nup184의 기능에 필요한 부위 분석 및 SUMO 변성 (Analysis of a Region Required for the Functions of Fission Yeast Nucleoporin Nup184 and Its SUMO Modification)

  • 채애리;장수연;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.66-72
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    • 2012
  • Nup188 단백질은 진화적으로 보존된 가장 큰 핵공단백질 중의 하나로 핵공복합체의 inner ring을 구성하는 인자이다. Nup188의 이종상동체인 분열효모 S. pombe의 Nup184 단백질은 영양분이 풍부한 완전배지(YES 배지)에서 정상적인 생장과 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 필요하다. 본 연구에서는 ${\Delta}nup184$ 결실돌연변이를 YES 배지에서 배양할 때 보이는 생장지체와 mRNA export 결함을 상보하기 위해서 Nup184의 카르복시 부위(아미노산 잔기482에서 1628까지)가 필요함을 알아내었다. 또한 이 부위는 GFP-Nup184 융합단백질이 핵막에 위치하기 위해서도 필요하였다. 이 과정에서 S. pombe GeneDB (Sanger 연구소, 영국)에 등록되어 있는 Nup184의 열린읽기틀 (1564개의 아미노산 잔기로 된 단백질로 예측)이 우리가 얻은 염기서열 데이터에 비해 66개의 아미노산 잔기가 짧다는 것을 발견하였다. 이 카르복시-말단 부위는 Nup184의 기능에 반드시 필요하였다. 이외에도 Nup184 단백질이 세포 안에서 SUMO 변형되어 있음을 보였다.

Impact of RGD Peptide Tethering to IL24/mda-7 (Melanoma Differentiation Associated Gene-7) on Apoptosis Induction in Hepatocellular Carcinoma Cells

  • Bina, Samaneh;Shenavar, Fatemeh;Khodadad, Mahboobeh;Haghshenas, Mohammad Reza;Mortazavi, Mojtaba;Fattahi, Mohammad-Reza;Erfani, Nasrollah;Hosseini, Seyed Younes
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권14호
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    • pp.6073-6080
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    • 2015
  • Background: Melanoma differentiation-associated gene-7 (MDA-7)/interleukin-24 (IL-24), a unique tumor suppressor gene, has killing activity in a broad spectrum of cancer cells. Herein, plasmids producing mda-7 proteins fused to different RGD peptides (full RGD4C and shortened RGD, tRGD) were evaluated for apoptosis induction with a hepatocellular carcinoma cell line, Hep-G2. The study aim was to improve the apoptosis potency of mda-7 by tethering to RGD peptides. Materials and Methods: Three plasmids including mda-7, mda-7-RGD and mda-7-tRGD genes beside a control vector were transfected into Hep-G2 cells. After 72 hours incubation, cell viability was evaluated by MTT assay. In addition, the rate of apoptosis was analyzed by flow cytometry using PI/annexin staining. To detect early events in apoptosis, 18 hours after transfection, expression of the BAX gene was quantified by real time PCR. Modeling of proteins was also performed to extrapolate possible consequences of RGD modification on their structures and subsequent attachment to receptors. Results and Conclusions: In MTT assays, while all mda-7 forms showed measurable inhibition of proliferation, unmodified mda-7 protein exhibited most significant effect compared to control plasmid (P<0.001). Again, flow cytometry analysis showed a significant apoptosis induction by simple mda-7 gene but not for those RGD-fused mda-7 proteins. These findings were also supported by expression analysis of BAX gene (P<0.001). Protein modelling analysis revealed that tethering RGD at the end of IL-24/Mda7 disrupt attachment to cognate receptor, IL-20R1/IL-20R2. In conclusion, fusion of RGD4C and shortened RGD peptides to carboxyl terminal of mda7, not only reduce apoptosis property in vitro but also disrupt receptor attachment as demonstrated by protein modelling.

Cloning and Characterization of an Endoglucanase Gene from Actinomyces sp. Korean Native Goat 40

  • Kim, Sung Chan;Kang, Seung Ha;Choi, Eun Young;Hong, Yeon Hee;Bok, Jin Duck;Kim, Jae Yeong;Lee, Sang Suk;Choi, Yun Jaie;Choi, In Soon;Cho, Kwang Keun
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권1호
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    • pp.126-133
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    • 2016
  • A gene from Actinomyces sp. Korean native goat (KNG) 40 that encodes an endo-${\beta}$-1,4-glucanase, EG1, was cloned and expressed in Escherichia coli (E. coli) $DH5{\alpha}$. Recombinant plasmid DNA from a positive clone with a 3.2 kb insert hydrolyzing carboxyl methyl-cellulose (CMC) was designated as pDS3. The entire nucleotide sequence was determined, and an open-reading frame (ORF) was deduced. The ORF encodes a polypeptide of 684 amino acids. The recombinant EG1 produced in E. coli $DH5{\alpha}$ harboring pDS3 was purified in one step using affinity chromatography on crystalline cellulose and characterized. Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis/zymogram analysis of the purified enzyme revealed two protein bands of 57.1 and 54.1 kDa. The amino terminal sequences of these two bands matched those of the deduced ones, starting from residue 166 and 208, respectively. Putative signal sequences, a Shine.Dalgarno-type ribosomal binding site, and promoter sequences related to the consensus sequences were deduced. EG1 has a typical tripartite structure of cellulase, a catalytic domain, a serine-rich linker region, and a cellulose-binding domain. The optimal temperature for the activity of the purified enzyme was $55^{\circ}C$, but it retained over 90% of maximum activity in a broad temperature range ($40^{\circ}C$ to $60^{\circ}C$). The optimal pH for the enzyme activity was 6.0. Kinetic parameters, $K_m$ and $V_{max}$ of rEG1 were 0.39% CMC and 143 U/mg, respectively.

누에에서 생산된 뱀장어 재조합 생식소자극호르몬이 암컷 뱀장어(Anguilla japonica)의 성성숙 유도에 미치는 영향 (Induction of Sexual Maturation in Female Eels Anguilla japonica by Recombinant Eel Gonadotropin Produced in Silkworm)

  • 김대근;김효원;김정현;이배익;홍선미;민관식;명정인;김대중
    • 한국수산과학회지
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    • 제50권6호
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    • pp.770-776
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    • 2017
  • This study investigated the effects of recombinant eel gonadotropin hormone (rJeGTH) produced in silkworms, with and without a carboxyl-terminal peptide from equine chorionic gonadotropin (eCG), on the induction of sexual maturation in female eels Anguilla japonica. Experiments were conducted both in vivo and in vitro. In in vitro trials, germinal vesicle breakdown (GVBD) induction did not significantly differ between rJeFSH and $rJeFSH{\cdot}eCG$ treatments and the control group. However, previous studies did find that rJeLH and $rJeLH{\cdot}eCG$ treatments induced GVBD in female eels. Our in vitro exploration of $estradiol-17{\beta}$ ($E_2$) levels in immature ovarian tissues revealed significantly higher $E_2$ levels in the group treated with $rJeFSH{\cdot}eCG$ $1{\mu}g/mL$ than in the control group. In contrast, the in vivo experiments showed no effect of recombinant hormones on the sexual maturation of feminized eels. Previous studies and our own in vitro results have clearly shown that rJeGTH and $rJeGTH{\cdot}eCG$ have a positive effect on the sexual maturation of feminized eels. To develop the activity of rJeGTH in vivo, further studies should confirm circulation time and activity of these hormones in eels' bloodstream, modify the structure of the recombinant gene, and implement additional glycosylation.

반하가 CT105에 의한 신경세포 상해 및 백서의 기억에 미치는 영향 (Neuroprotective and Memory Enhancing Effects of Pinelliae rhizoma Extract)

  • 강상렬;이소연;윤현덕;신오철;박창국;박치상
    • 대한한의학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.27-42
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    • 2005
  • Objectives : Alzheimer's disease (AD) is a progressive and fatal neurodegenerative disease characterized by amyloid plaques and neurofibrillary tangles. These plaques are associated with degenerating neuronal processes and consist primarily of fibrillary aggregates of beta-amyloid$ protein, generated from amyloid precursor protein (APP). Another amyloidogenic fragment, the carboxyl terminus (CT) of APP, which is composed of 99-105 amino acid residues containing the complete $A{\beta}$ sequence, also appears to be toxic to neurones. Recent evidence suggest that CT105, carboxy terminal 105 amino acids peptide fragment of APP, may be an important factor causing neurotoxicity in AD. Methods : Although a variety of oriental prescriptions including Pinelliae rhizoma have traditionally been utilized for the treatment of AD, their pharmacological effects and action mechanisms have not yet been fully elucidated. In the present study, we investigated effects of the dichloromethane extract of Pinelliae rhizoma (PINR) on neurotoxicity and the formation of reactive oxygen species (ROS) and nitric oxide (NO) in SK-N-SH cells overexpressed with CT105. In addition, we evaluated its radical scavenging activity and effects on acetylcholinesterase (AChE) activity. Furthermore, effects on cognitive deficits induced by scopolamine treatment in rats were evaluated. Results ; We found in this study that PINR significantly inhibited apoptotic neuronal death induced by CT105 overexpression in SK-N-SH cells. Based on morphological examinations by phase-contrast microscopy, PINR reversed apoptotic changes of CT105-expressed cells. It was also found that PINR significantly promoted neurite outgrowth and inhibited formation of ROS nd NO. PINR was shown to scavenge DPPH radicals and noncompetitively inhibit AChE activity. Furthermore, it reduced scopolamine-induced memory impairment in rata, assessed by passive avoidance test. Conclusions : Taken together, these results demonstrate that PINR exhibits neuroprotective, antioxidant, and memory enhancing effects, and therefore may bs beneficial for the treatment of AD.

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