• Molecules and Cells
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• 제20권3호
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• pp.348-353
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• 2005

Using in silico approaches and RACE we cloned a full length trinucleotide (CAG) repeat-containing cDNA (cag-3). The cDNA is 2478 bp long and the deduced polypeptide consists of 140 amino acids of which 73 are glutamines. The genomic sequence spans approximately 79 kb on mouse chromosome 7 and the gene is composed of four exons. Standard and real-time PCR analyses of several mouse tissues showed that the gene is exclusively expressed in the brain and is not detected in embryonic stages. Within the brain, it is expressed throughout the forebrain region with predominant expression in the hypothalamus and olfactory bulb and very low levels in the mid- and hindbrain.

• Annals of Clinical Neurophysiology
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• 제3권2호
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• pp.151-155
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• 2001

SCA 1 is an autosomal dominant disorder. The phenotypic manifestations of SCA 1 are not specific, and thus, the diagnosis of SCA 1 rests on molecular genetic testing. The number of CAG repeats ranges from 6-44 in normal alleles and from 39-81 repeats in disease-causing alleles(chromosomal locus 6p22-23). The main clinical features of SCA 1 are ataxia, dysarthria, ophthalmoparesis, extrapyramidal signs without retinal degeneration. A 24-year-old woman with suspected family history presented with progressive cerebellar ataxia, dysarthria, ptosis, titubation and general weakness. Brain MRI revealed a moderate cerebellar atrophy. A genomic polymerase chain reaction(PCR) analysis showed 66 repeats at the SCA 1 locus.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제6권1호
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• pp.1-9
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• 2003

목 적: Helicobacter pylori (H. pylori)에 의한 질병 발생의 병독 인자로 cagA, picB 및 iceA 등의 유전형이 연구되고 있으며, 최근에는 위 상피세포의 증식(proliferation)과 세포사(apoptosis)의 불균형이 중요시되고 있다. 이에 H. pylori 감염 소아에서 위 상피세포 증식과 세포사 및 cagA, picB 및 iceA 유전형의 관련성을 알아보고자 하였다. 방 법: 1999년 8월부터 2001년 6월까지 이화여자 대학교 목동병원 소아과에서 소화기 증상으로 내시경을 시행하여 H. pylori 감염으로 진단된 20예와 감염 음성 20예를 대상으로 하였다. H. pylori 감염 양성은 조직학적으로 H. pylori 균이 관찰되고, CLO 검사와 ureC PCR이 전부 양성인 경우로 하였다. 위생검 조직에서 개정된 시드니 체계를 이용하여 조직 소견을 분석하고, proliferating cell nuclear antigen (PCNA) 발현으로 위 상피세포 증식의 정도를 in situ terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick-end labeling (TUNEL) 방법으로 세포사의 정도를 조사하였다. cagA, picB 및 iceA 유전자에 대해 중합효소연쇄반응을 시행하였다. 결 과: 1) 세포 증식 지표는 H. pylori 감염 양성에서 $77.4{\pm}13.12$로 음성 $52.3{\pm}12.20$에 비하여 유의하게 높았다(p=0.000). 세포 증식 지표는 H. pylori 밀도가 증가할수록(r=0.624, p=0.000, 다핵형 중성구의 활동성이 증가할수록(r=0.460, p=0.005), 만성 염증이 증가할수록(r=0.433, p=0.009) 증가하였다. 2) 세포사 지표는 H. pylori 감염 양성에서 $0.70{\pm}0.411$, 음성에서 $0.14{\pm}0.201$로 감염 양성에서 음성보다 유의하게 높았다(p=0.000). 세포사 지표는 H.pylori 밀도가 증가할수록(r=0.691, p=0.000), 다핵형 중성구의 활동성이 증가할수록(r=0.585, p=0.000), 만성 염증이 증가할수록(r=0.535, p=0.001) 증가하였다. 3) 세포 증식 지표가 증가할수록 세포사 지표는 유의하게 증가하였다(r=0.527, p=0.001). 4) H. pylori 감염 양성에서 유전형의 양성률은 cagA 90%, picB 75%, iceA1 60% 및 iceA2 15%였으며, cagA, picB, 및 iceA 유전형에 따른 세포 증식지표, 세포사 지표, 내시경 소견 및 조직 소견에는 유의한 차이가 없었다. 결 론: H. pylori 감염 소아에서 위 상피세포 증식 지표와 세포사 지표가 균형을 이루면서 증가하였으며, cagA, pic B 및 iceA 유전형에 따른 유의한 차이는 없었다. 이는 위 상피세포 증식과 세포사가 H. pylori의 병인에 중요함을 시사하며, 앞으로 세포 증식과 세포사의 기전과 유발 요인, 여러 유전형과의 관계, 성인과의 비교 연구 등이 필요하리라 생각된다.

• Journal of Microbiology
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• 제44권6호
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• pp.660-664
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• 2006

The relationship between H. pylori clarithromycin resistance and genetic pattern distribution has been differently explained from different geographic areas. Therefore, we aimed to assess the clarithromycin resistance rate, to evaluate the bacterial genetic pattern, and to search for a possible association between clarithromycin resistance and cagA or vacA genes. This prospective study enrolled 62 consecutive H. pylori infected patients. The infection was established by histology and rapid urease test. Clarithromycin resistance, cagA and vacA status, including s/m subtypes, were assessed on paraffin-embedded antral biopsy specimens by TaqMan real time polymerase chain reaction (PCR). Primary clarithromycin resistance was detected in 24.1 % of cases. The prevalence of cagA was 69.3%, and a single vacA mosaicism was observed in 95.1 % cases. In detail, the s1m1 was observed in 23 (38.9%) patients, the s1m2 in 22 (37.2%), and the s2m2 in 14 (23.7%), whereas the s2m1 combination was never found. The prevalence of cagA and the vacA alleles distribution did not significantly differ between susceptible and resistant strains. Primary clarithromycin resistance is high in our area. The s1m1 and s1m2 are the most frequent vacA mosaicisms. There is no a relationship between clarithromycin resistance and bacterial genotypic pattern and/or cagA positivity.

• 미생물학회지
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• 제41권3호
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• pp.177-182
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• 2005

본 연구를 수행하기 전에 H. pylori에 대한 어떠한 치료도 받지 않은 114명의 소화기 궤양 환자들을 내시경 검사를 하는 동안, 114개의 H. pylori 균주를 위 전정부로부터 분리하였다. H. pylori를 검출하기 위하여 rapid urease test, SSA와 cagA 유전자의 PCR증폭을 수행하였고, CagA 발현 검출을 위하여 Western blot을 수행하였다. H. pylori에 감염된 환자들은 omeprazole. clarithromycin (a macrolide), amoxicillin을 모두 사용하는데 3제 요법(triple therapy)으로 치료하였다. 치료가 중단되고 6주 후에 내시경 검사에서 세균 박멸률을 측정하였다. 내성률은 각각 clarithromycin이 $20.2\%$. amoxicillin이 $0.0\%$였다. Clarithromycin 내성은 H. pylori의 23S rRNA 유전자에 있는 A2142G돌연변이에 의한 것이 $87\%$이었다. A2142G돌연변이의 clarithromycin의 MIC값($32\~>256\;{\mu}g\ml$)은 A2143G돌연변이의 MIC값($4\~128\;{\mu}g/ml$)보다 더 높았다. Clarithromycin에 감수성을 가진 H. pylori는 박멸되었으나 clarithromycin내성을 가진 H. pylori는 박멸되지 않았다(P = 0.0001). 이러한 결과들은 CagA 발현에는 어떠한 영향도 받지 않았으며 H. pylori의 clarithromycin 내성은 치료 실패의 가장 중요한 이유임을 제시하였다. 우선적으로 실시되는 생검 배양에 대한 H. pylori의 항생제 감수성 시험은 감염된 환자들에 대한 3제 요법을 선택하기 이전에 필히 실시되어야 하며 국내에서 clarithromycin에 대한 1차 내성의 높은 빈도는 H. pylori의 감염증 치료에 심각한 문제점을 야기시켰다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제46권3호
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• pp.261-268
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• 2018

Differences in host ethnicities and geographical distributions may influence the genetic variation and pathogenesis of Helicobacter pylori strains, particularly with respect to those with a high risk of gastric cancer and in Asian Enigma regions. We simultaneously identified H. pylori virulence-associated genes involved in inflammation and cell damage in Thai and Korean dyspeptic patients. The virulence-associated gene cagA, cagA genotypes (East Asian and Western type cagA), vacA genotypes (s- and m-), oipA, and sabA were detected in Thai and Korean dyspeptic patients by polymerase chain reaction (PCR), real-time PCR, and DNA sequence analysis. Comparisons between the two regions showed that cagA, East Asian type cagA, and vacA s1/m1 in Korean dyspeptic patients occurred at rates of 100%, 86.67%, and 88.89%, respectively (p < 0.05). The oipA- and sabA-positive samples were significantly more predominant in the Korean population (95.56%, 91.11%) than in the Thai population (32%, 34%). DNA sequence analysis revealed differences in the patterns of cytosine-thymine dinucleotide repeats of oipA and sabA among the two populations of dyspeptic patients. Our results indicate that the H. pylori strains detected in the two regions were divergent, and strains colonizing the Korean dyspeptic patients may be more virulent than those in the Thai population. Our data may help explain H. pylori pathogenesis in Asian Enigma areas with a low gastric cancer incidence. However, other factors involving H. pylori infection in these two regions should be further analyzed.

• Korean Journal of Radiology
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• 제20권5호
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• pp.719-728
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• 2019

Objective: To investigate the diagnostic validity of coronary computed tomography angiography (cCTA) in vasospastic angina (VA) and factors associated with discrepant results between invasive coronary angiography with the ergonovine provocation test (iCAG-EPT) and cCTA. Materials and Methods: Of the 1397 patients diagnosed with VA from 2006 to 2016, 33 patients (75 lesions) with available cCTA data from within 6 months before iCAG-EPT were included. The severity of spasm (% diameter stenosis [%DS]) on iCAGEPT and cCTA was assessed, and the difference in %DS (Δ%DS) was calculated. Δ%DS was compared after classifying the lesions according to pre-cCTA-administered sublingual nitroglycerin (SL-NG) or beta-blockers. The lesions were further categorized with %DS ≥ 50% on iCAG-EPT or cCTA defined as a significant spasm, and the diagnostic performance of cCTA on identifying significant spasm relative to iCAG-EPT was assessed. Results: Compared to lesions without SL-NG treatment, those with SL-NG treatment showed a higher Δ%DS (39.2% vs. 22.1%, p = 0.002). However, there was no difference in Δ%DS with or without beta-blocker treatment (35.1% vs. 32.6%, p = 0.643). The significant difference in Δ%DS associated with SL-NG was more prominent in patients who were aged < 60 years, were male, had body mass index < 25 kg/m², and had no history of hypertension, diabetes, or dyslipidemia. Based on iCAG-EPT as the reference, the per-lesion-based sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, and accuracy of cCTA for VA diagnosis were 7.5%, 94.0%, 60.0%, 47.1%, and 48.0%, respectively. Conclusion: For patients with clinically suspected VA, confirmation with iCAG-EPT needs to be considered without completely excluding the diagnosis of VA simply based on cCTA results, although further prospective studies are required for confirmation.

• 대한핵의학회지
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• 제34권3호
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• pp.207-221
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• 2000

목적: 우리 나라에서 관동맥질 환자에게 시행되는 치료방법의 빈도와 현행수가와 개정 발표될 수가를 바탕으로 검사 전 유병률에 따라 비용효과 분석을 하였다. 대상 및 방법: 심근관류 SPECT를 한 후 관동맥조영술을 하는 경우, 운동부하심전도 후에 관동맥조영술을 한 경우, 바로 관동맥조영술을 한 경우, 그리고 운동부하심전도 후에 심근 SPECT 후에 관동맥조영술을 한 각각의 경우에 따라 비용을 계산하고 삶의 질을 고려한 여명(Quality Adjusted Life Year: QALY)가 각 치료하거나 치료하지 않았을 때 획득되는 여명의 차이(${\Delta}QALY$)를 산출하여 비용/${\Delta}QALY$가 검사 전 유병률에 따라 달라지는 양상을 제시하였다. 결과: 검사 전 유병률이 0.6이상일 때는 관동맥조영술을 바로 실시하는 것이 가장 비용대비효과가 높았다. 검사 전 유병률이 $0.2{\sim}0.6$이었을 때는 운동부하심전도 후에 심근 SPECT 후에 관동맥조영술을 하는 것이 비용대비 효과가 높았다. 심근 SPECT 후에 관동맥조영술을 하는 것이 차선책이었다. 운동부하심전도의 개정수가와 개정희망수가를 근거로 산출하였을 때에도 비용효과의 순서는 비슷하였다. 운동부하심전도 후 바로 관동맥조영술을 시행하는 것은 언제나 비용대비효과가 가장 낮았다. 결론: 심근관류 SPECT는 우리나라의 현행수가체계에서나 변동된 수가체계에서나 검사 전 유병률에 상관없이 비용효과면에서 우수하고 꼭 필요한 검사로 나타났다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제38권6호
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• pp.544-550
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• 2023

치주질환의 원인균인 Porphyromonas gingivlais (P. gingivalis)의 병인인자중 하나인 gingipain 효소에 대한 억제활성을 갖는 유산균을 개발하고자 본 연구실에 보관중인 30여종의 유산균 배양상등액의 활성을 검색하였다. 그 결과 발효식품에서 분리, 동정한 Weisiella cibaria SPM402와 Lactobacillus paracasei SMP412가 P. gingivalis에 대한 항균효과, gingipain 유전자 발현억제 및 gingipain 효소활성 억제능이 확인되었다. W. cibaria SPM402 의 배양 상등액 WC402는 10 mg/mL에서 kgp 유전자는 0.71±0.02배 발현되었고, rgpB 유전자는 0.71±0.14배 발현되 약간의 발현억제 효과가 확인되었다. 반면 L. paracasei SMP412의 배양상등액 LP412는 10 mg/mL 농도에서 kgp 유전자는 0.19±0.08배, rgpA 유전자는 0.09±0.02배, rgpB 유전자는 0.24±0.03배 발현되어 LP412의 뛰어난 gingipain 유전자 발현억제 효과를 확인하였다. 10 mg/mL농도에서, Kgp 효소 활성은 WC 402에 의해 78.65±3.58% (CAG), 82.45±1.22% (CFG), LP412에 의해 80.71±2.11% (CAG), 85.81±0.05% (CFG) 억제되었다. 동일한 농도에서 Rgp 활성은 WC402에 의해 78.6±1.01% (CAG), 86.78±0.47% (CFG), LP412에 의해 82.93 ±1.26% (CAG), 88.81±0.36% (CFG) 억제되었다. 이상의 결과들을 통해 WC402와 LP412는 P. gingivalis에 대한 항균효과 뿐 아니라 병인인자 gingipain을 효과적으로 억제하는 기능성 유산균임을 확인하였다.

• 대한의생명과학회지
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• 제21권4호
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• pp.233-240
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• 2015

Some virulence proteins of Helicobacter pylori, such as vacuolating cytotoxic protein A (VacA) and cytotoxin-associated gene protein A (CagA) have been reported to be causative agents of various gastric diseases including chronic gastritis, gastric ulcer or gastric adenocarcinoma. The expression level of these virulence proteins can be regulated when H. pylori is exposed to the antibacterial agent, cyanidin 3-O-glucoside (C3G) as previously reported. In this study, we analyzed the quantitative change of various virulence proteins including CagA and VacA by C3G treatment. We used 2-dimensional electrophoresis (2-DE) to analyze the quantitative change of representative ten proteome components of H. pylori 60190 ($VacA^+/CagA^+$; standard strain of Eastern type). After 2-DE analysis, spot intensities were analyzed using ImageMaster$^{TM}$ 2-DE Platinum software then each spot was identified using matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) or peptide sequencing using Finnigan LCQ ion trap mass spectrometer (LC-MS/MS). Next, we selected major virulence proteins of H. pylori among quantitatively meaningful ten spots and confirmed the 2-DE results by Western blot analysis. These results suggest that cyanidin 3-O-glucoside can modulate a variety of H. pylori pathogenic determinants.