Background: Previous published data on the association between CYP1A2 rs762551, rs2069514, rs2069526, and rs2470890 polymorphisms and lung cancer risk have not allowed a definite conclusion. The present meta-analysis of the literature was performed to derive a more precise estimation of the relationship. Materials and Methods: 8 publications covering 23 studies were selected for this meta-analysis, including 1,665 cases and 2,383 controls for CYP1A2 rs762551 (from 8 studies), 1,456 cases and 1,792 controls for CYP1A2 rs2069514 (from 7 studies), 657 cases and 984 controls for CYP1A2 rs2069526 (from 5 studies) and 691 cases and 968 controls for CYP1A2 rs2470890 (from 3 studies). Results: When all the eligible studies were pooled into the meta-analysis for the CYP1A2 rs762551 polymorphism, significantly increased lung cancer risk was observed in the dominant model (OR=1.21, 95 % CI=1.00-1.46). In the subgroup analysis by ethnicity, significantly increased risk of lung cancer was observed in Caucasians (dominant model: OR=1.29, 95%CI=1.11-1.51; recessive model: OR=1.33, 95%CI=1.01-1.75; additive model: OR=1.49, 95%CI=1.12-1.98). There was no evidence of significant association between lung cancer risk and CYP1A2 rs2069514, s2470890, and rs2069526 polymorphisms. Conclusions: In summary, this meta-analysis indicates that the CYP1A2 rs762551 polymorphism is linked to an increased lung cancer risk in Caucasians. Moreover, our work also points out the importance of new studies for rs2069514 associations in lung cancer, where at least some of the covariates responsible for heterogeneity could be controlled, to obtain a more conclusive understanding about the function of the rs2069514 polymorphism in lung cancer development.
Kim, Dal-Sik;Kim, Yunjeong;Jeon, Ji-Young;Kim, Min-Gul
Journal of Ginseng Research
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제40권4호
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pp.375-381
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2016
Background: We evaluated the drug interaction profile of Red Ginseng (RG) with respect to the activities of major cytochrome P450 (CYP) enzymes and the drug transporter P-glycoprotein (P-gp) in healthy Korean volunteers. Methods: This article describes an open-label, crossover study. CYP probe cocktail drugs, caffeine, losartan, dextromethorphan, omeprazole, midazolam, and fexofenadine were administered before and after RG supplementation for 2 wk. Plasma samples were collected, and tolerability was assessed. Pharmacokinetic parameters were calculated, and 90% confidence intervals (CIs) of the geometric mean ratios of the parameters were determined from logarithmically transformed data using analysis of variance after RG administration versus before RG administration. Results: Fourteen healthy male participants were evaluated, none of whom were genetically defined as poor CYP2C9, 2C19, and CYP2D6 metabolizers based on genotyping. Before and after RG administration, the geometric least-square mean metabolic ratio (90% CI) was 0.870 (0.805-0.940) for caffeine to paraxanthine (CYP1A2), 0.871 (0.800-0.947) for losartan (CYP2C9) to EXP3174, 1.027 (0.938-1.123) for omeprazole (CYP2C19) to 5-hydroxyomeprazole, 1.373 (0.864-2.180) for dextromethorphan to dextrorphan (CYP2D6), and 0.824 (0.658-1.032) for midazolam (CYP3A4) to 1-hydroxymidazolam. The geometric mean ratio of the area under the curve of the last sampling time ($AUC_{last}$) for fexofenadine (P-gp) was 0.963 (0.845-1.098). Administration of concentrated RG for 2 wk weakly inhibited CYP2C9 and CYP3A4 and weakly induced CYP2D6. However, no clinically significant drug interactions were observed between RG and CYP and P-gp probe substrates. Conclusion: RG has no relevant potential to cause CYP enzyme- or P-gp-related interactions.
The $11{\alpha}$-hydroxylation of $16{\alpha}$, 17-epoxyprogesterone (EP) catalyzed by Rhizopus nigricans is crucial for the steroid industry. However, lower conversion rate of the biohydroxylation restricts its potential industrial application. The $11{\alpha}$-steroid hydroxylase CYP509C12 from R. oryzae were reported to play a crucial role in the $11{\alpha}$-hydroxylation in recombinant fission yeast. In the present study, the CYP509C12 of R. oryzae (RoCYP) was introduced into R. nigricans using the liposome-mediated mycelial transformation. Heterologous expression of RoCYP resulted in increased fungal growth and improved intracellular reactive oxygen species content in R. nigricans. The $H_2O_2$ levels in RoCYP transformants were approximately 2-folder that of the R. nigricans wild type (RnWT) strain, with the superoxide dismutase activities increased approximately 45% and catalase activities decreased approximately 68%. Furthermore, the $11{\alpha}$-hydroxylation rates of EP in RoCYP transformants (C4, C6 and C9) were 39.7%, 38.3% and 38.7%, which were 12.1%, 8.2% and 9.4% higher than the rate of the RnWT strain, respectively. This paper investigated the effect of heterologous expression of RoCYP in R. nigricans, providing an effective genetic method to construct the engineered strains for steroid industry.
목 적 : 신생아 황달은 백인에 비해 중국, 일본, 한국 등 동아시아인에서 2배 이상 많이 발생하는 것으로 보아 유전적 연관성이 있을 것으로 생각되어 왔고, 최근 일본인, 타이완 중국인, 한국인에서 UGT1A1 유전자의 Gly71Arg 다형성이 신생아 황달과 연관성이 있다고 보고되었다. 선천적으로 UDP-glucuronosyltransferase(UDPGT)에 결함이 있는 경우에는 부경로(alternative pathway)로 CYP1A2 효소를 자극하여 빌리루빈 대사가 이루어진다. 출생 후 6-14주가 되어야 성인 UDPGT 정상치에 도달하기 때문에 신생아 황달에서 빌리루빈 대사에 CYP1A2 부경로가 중요한 역할을 할 것으로 생각된다. 이에 저자들은 UGT1A1과 CYP1A2 유전자의 다형성이 한국인 신생아 황달의 발생과 어떤 연관성이 있는지 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 혈중 빌리루빈 수치가 12 mg/dL 이상의 건강하고, 황달의 다른 위험인자가 없는 만삭아 79명과 대조군 68명으로부터 혈액 0.5 cc를 채취하여 DNA을 분리하였다. UGT1A1 유전자는 Polymerase chain reaction(PCR) 후에 염기서열 분석을 통해서 Gly71Arg 유전자 다형성을 확인하였으며, CYP1A2는 제한효소인 MboII를 이용하여 PCR-restriction fragment length polymorphism 방법과 염기서열 분석을 통해서 T2698G 유전자 다형성을 확인하였다. 결 과 : UGT1A1 유전자의 Gly71Arg 다형성은 변이형 대립 유전자 분포가 환자군에서 32%로 대조군 11%보다 높았다(P<0.0001). CYP1A2 유전자의 다형성은 변이형 유전형 분포가 환자군에서는 41.8%, 대조군에서 32.3%로 환자군이 높았으며 통계학적으로 유의하였다(P=0.015). 변이형 대립유전자의 빈도는 환자군에서 21%로 대조군 19%보다 높았으나 통계학적 유의성은 없었다(P=0.706). Gly71Arg와 T2698G의 변이형 발생의 연관성은 없었다(P=0.635). 결 론 : 한국인의 신생아 황달에서 체내의 빌리루빈 대사의 주경로와 부경로에 작용하는 효소의 유전자인 UGT1A1과 CYP1A2의 다형성이 확인되었고, UGT1A1 유전자의 Gly71Arg 다형성은 신생아 황달과 연관이 있었으나 CYP1A2 유전자의 T2698G 다형성은 신생아의 황달과 연관이 없었다.
Rimal, Hemraj;Subedi, Pradeep;Kim, Ki -Hwa;Park, Hyun;Lee, Jun Hyuck;Oh, Tae-Jin
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제30권11호
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pp.1750-1759
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2020
The characterization of cytochrome P450 CYP125A13 from Streptomyces peucetius was conducted using cholesterol as the sole substrate. The in vitro enzymatic assay utilizing putidaredoxin and putidaredoxin reductase from Pseudomonas putida revealed that CYP125A13 bound cholesterol and hydroxylated it. The calculated KD value, catalytic conversion rates, and Km value were 56.92 ± 11.28 μM, 1.95 nmol min-1 nmol-1, and 11.3 ± 2.8 μM, respectively. Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) analysis showed that carbon 27 of the cholesterol side-chain was hydroxylated, characterizing CYP125A13 as steroid C27-hydroxylase. The homology modeling and docking results also revealed the binding of cholesterol to the active site, facilitated by the hydrophobic amino acids and position of the C27-methyl group near heme. This orientation was favorable for the hydroxylation of the C27-methyl group, supporting the in vitro analysis. This was the first reported case of the hydroxylation of cholesterol at the C-27 position by Streptomyces P450. This study also established the catalytic function of CYP125A13 and provides a solid basis for further studies related to the catabolic potential of Streptomyces species.
In order to understand the mechanism of the regulation of drug metabolizing enzyme gene expression, we have studied the induction of CYP1A1 and $GST\alpha,$$\mu,$$\pi$ enzymes in Japanese monkey and rhesus monkey after the treatment with 3-methylcholanthrene (3MC) and di-n-butyl phthalate (DBP) and bisphenol A (BPA). The levels of mRNA were measured by RT-PCR in brain, intestine and liver. In the case of adult monkey, treatment with 3MC induced CYP1A1 mRNA in intestine by 11-fold. The treatment with DBP induced CYP1A1 mRNA. Effects of 3MC and DBP on GST mRNA expression was not clear. But $GST\mu$ was slightly inhibited by the treatment with 3MC and DBP. $GST\alpha$ was induced in intestine by 1.5-fold. $GST\pi$ was slightly induced by the treatment with 3MC and DBP in intestine. In the case of fetus monkey, the basal levels of fetus CYP1A1 mRNA and GSTs mRNA were relatively low compared to adult monkey. As the age of monkey increased, the basal levels of CYP1A1 mRNA were also increased. 3MC induced the expression of CYP1A1 mRNA didn't significantly induce CYP1A1 mRNA in intestine. The levels of $GST\mu$ and $GST\pi$ were not changed by the treatment with 3MC and DBP. $GST\pi$ was slightly induced by the treatment with 3MC and DBP.
Kim, In-Hye;Kim, Si-Kwan;Kim, Eun-Hye;Kim, Sung-Won;Sohn, Sang-Hyun;Lee, Soo-Cheol;Choi, Sang-Dun;Pyo, Suhk-Neung;Rhee, Dong-Kwon
Journal of Ginseng Research
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제35권3호
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pp.272-282
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2011
Ginseng (Panax ginseng Meyer) has been shown to have anti-aging effects in animal and clinical studies. However, the molecular mechanisms by which ginseng exerts these effects remain unknown. Here, the anti-aging effect of Korean red ginseng (KRG) in rat testes was examined by system biology analysis. KRG water extract prepared in feed pellets was administered orally into 12 month old rats for 4 months, and gene expression in testes was determined by microarray analysis. Microarray analysis identified 33 genes that significantly changed. Compared to the 2 month old young rats, 13 genes (Rps9, Cyp11a1, RT1-A2, LOC365778, Sv2b, RGD1565959, RGD1304748, etc.) were up-regulated and 20 genes (RT1-Db1, Cldn5, Svs5, Degs1, Vdac3, Hbb, LOC684355, Svs5, Tmem97, Orai1, Insl3, LOC497959, etc.) were down-regulated by KRG in the older rats. Ingenuity Pathway Analysis of untreated aged rats versus aged rats treated with KRG showed that the affected most was Cyp11a1, responsible for C21-steroid hormone metabolism, and the top molecular and cellular functions are organ morphology and reproductive system development and function. When genes in young rat were compared with those in the aged rat, sperm capacitation related genes were down-regulated in the old rat. However, when genes in the old rat were compared with those in the old rat treated with KRG, KRG treatment up-regulated C21-steroid hormone metabolism. Taken together, Cyp11a1 expression is decreased in the aged rat, however, it is up-regulated by KRG suggesting that KRG seems enhance testes function via Cyp11a1.
본 연구는 시토크롬 P450 단백질을 암호화하는 애기장대 유래의 AtCYP78A7을 과발현하는 형질전환 식물체로부터 AtCYP78A7 단백질을 특이적으로 인식하는 단일큰론 항체의 제조와 그 항체를 AtCYP78A7 단백질과 접촉시켜 항원-항체 복합체 형성을 검출함으로써 AtCYP78A7 단백질을 효소면역학적(ELISA) 방법으로 검출하는 진단 키트를 개발하기 위하여 수행하였다. 재조합한 GST-AtCYP78A7 단백질을 항원으로 사용하여 단일클론 항체를 분비하는 융합세포주를 제조한 후 비오틴화 및 페어링 테스트를 통해 포획항체와 검출항체를 선정하였으며, GST-AtCYP78A7 정제 단백질을 기준으로 일품벼, 화영벼, AtCYP78A7 과발현 벼(10B-5, 18A-4)의 용해물을 검출항원으로 사용하여 product test를 진행하였다. 그 결과 AtCYP78A7 단백질에 특이적으로 결합하는 4개의 단클론 항체(mAb 6A7, mAb 4C2, mAb 11H6, mAb 7E8)를 생산하였고, 포획항체 mAb 4C2와 검출항체 mAb 7E8-biotin의 조합으로 ELISA 키트를 개발하였다. 개발된 ELISA 키트를 이용한 벼 시료의 분석 결과 AtCYP78A7 과발현 벼는 전체 단백질 대비 AtCYP78A7 단백질의 비율이 0.1% 이상인 양성으로, 일품벼와 화영벼는 0.1% 미만인 음성으로 나타나 키트를 이용한 AtCYP78A7 단백질의 검출이 가능하였으며, 따라서 본 키트는 향후 AtCYP78A7를 과발현하는 형질전환 작물을 대상으로 하는 환경 모니터링 또는 인체 위해성 평가에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 사료된다.
Nephrocalcinosis often occurs in infants and is caused by excessive calcium or vitamin D supplementation, neonatal primary hyperparathyroidism, and genetic disorders. Idiopathic infantile hypercalcemia (IIH), a rare cause of nephrocalcinosis, results from genetic defects in CYP24A1 or SLC34A1. Mutations in CYP24A1, which encodes 25-hydroxyvitamin D 24-hydroxylase, disrupt active vitamin D degradation. IIH clinically manifests as failure to thrive and hypercalcemia within the first year of life and usually remits spontaneously. Herein, we present a case of IIH wih CYP24A1 mutations. An 11-month-old girl visited our hospital with incidental hypercalcemia. She showed failure to thrive, and her oral intake had decreased over time since the age of 6 months. Her initial serum parathyroid hormone level was low, 25-OH vitamin D and 1,25(OH)2 vitamin D levels were normal, and renal ultrasonography showed bilateral nephrocalcinosis. Whole-exome sequencing revealed compound heterozygous variants in CYP24A1 (NM_000782.4:c.376C>T [p.Pro126Ser] and c.1310C>A [p.Pro437His]). Although her hypercalcemia and poor oral intake spontaneously resolved in approximately 8 months, we suggested that her nephrocalcinosis and renal function be regularly checked in consideration of potential asymptomatic renal damage. Hypercalcemia caused by IIH should be suspected in infants with severe nephrocalcinosis, especially when presenting with failure to thrive.
Clopidogrel is used to reduce the risk of cardiovascular events in patients with atherosclerosis documented by recent ischemic stroke, recent myocardial infarction (MI), or established peripheral arterial disease (secondary prevention). Clopidogrel is metabolized by CYP3A4, and the active metabolites inhibit platelet aggregation. The purpose of this study was to assess clopidogrel only versus clopidogrel + others (aspirin, CYP3A4 inhibitor, and CYPBA4 inducer) in terms of cardiovasculalr events and bleeding complications. We reviewed the charts of patients who visited between August 1, 2002 and August 31, 2003, retrospectively. Total 72 patients were included and they consisted of 5 groups; clopidogrel group (n=36), clopidogrel + aspirin group (n=11), clopidogrel + CYP3A4 inhibitor group (n=15), clopidogrel + aspirin + CYP3A4 inhibitor group (n=6), clopidorel + CYP3A4 inducer group (n=4). The primary endpoints at 6 months, 12 months were the composite of cardiovascular (CV) events. The secondary end-point was the incidence of bleeding events at 6months, and 12months. At 12months, the primary endpoint was not significantly different among the five groups (p=0.056). In comparison of two groups as clopidogrel only versus clopidogrel + others (aspirin, CYP3A4 inhibitor and CYP3A4 inducer), the primary endpoint was significantly different (p=0.02). The CV events were increased in the clopidogrel + others group. The secondary end point was not significantly different among the five groups (p=0.52). However, time to bleeding events was 230.8 in the clopidogrel group and 74.7 in the clopidogrel + others group (p = 0.046). In conclusion, clopidogrel interaction with aspirin, CYP3A4 inhibitor, and CYP3A4 inducer affected cardiovascular events and bleeding events. Drug interaction of clopidogrel with concurrent medications should be considered cautiously.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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