• Title/Summary/Keyword: C5 Protein

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박테리오파아지 T7 의 기능에 관한 연구;복제단백질간의 단백질 상호작용 (Funcyional Studies on Gene 2.5 Protein of Bacteriophage T7 : Protein Interactions of Replicative Proteins)

  • 김학준;김영태
    • 생명과학회지
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    • 제6권3호
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    • pp.185-192
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    • 1996
  • 박테리오파지 T7 gene 2.5 단백질은 single-stranded DNA 결합 단백질로 박태리오파지 T7의 DNA복제, 재조합, 및 수선에 필수적으로 요구된다. Gene 2.5 protein은 T7의 DNA 합성과 성장에 필수적인 단백질이다. Gene 2.5 Protein이 중요시 되는 이유는 이 단백질이 T7의 다른 복제 필수단백질인 T7의 다른 복제 필수단백질인 T7 DNA polymerase 와 gene 4 protein(helicase/primase)와 서로 상호작용할 것으로 제안되었기 때문이다. (Kim and Richardson, J. Biol. Chem., 1992;1994). 이 단백질의 단백질 상호작용을 가능하게 하는 domain은 carboxyl-terminal domain일 것으로 여러 실험에서 대두되었기에, 이 domain의 특성을 파악하기 위해 야생형과 변이체 gene 2.5 단백질들을 각각 GST에 융합한후 fusion 단백질을 정제하였다. 정제된 이 융합 단백질들의 carboxyl-terminal domain이 T7 복제 단백질들과 상호작용을 조사하는지를 조사하기 위해 affinity chromatography로 이용하였다. 실험 결과, 아생형 GST-gene 2.5 융합단잭질(GST-2.5 (WT))는 T7 DNA polymerase 와 상호작용을 하였지만. 변이형 융합단백질(GST-2.5$\Delta$21C)는 interaction을 하지 못했다. 이 결과는 carbohyl-terminal domain이 단백질-단백질 상호작용을 하는데 직접적으로 관여하는 것을 증명하였다. 또한,GST2.5(WT)는 gene 4 protein(helicase/primase)와 직접 상호작용을 하나. GST2.5$\Delta$21C는 상호작용을 하지 못하는 것으로 나타났다. 따라서 gene 4 proteins와의 상호작용에도 gene 2.5 protein의 carboxyl-terminal domain이 직접 관여 한다는 것이 증명되었다. 이상의 결과에서 gene 2.5 protein은 박테리오파지 T7 의 유전자 목제 시 단백질-단백질 상호작용에 관혀아며, 특히 gene 2.5 protein의 carboxyl-terminal domain이 이러한 상호작용에 직접적으로 관여하는 domain이라는 것을 알 수가 있었다.

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Effects of Overexpression of C5 Protein on rnpB Gene Expression in Escherichia coli

  • Kim, Yool;Lee, Young-Hoon
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권4호
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    • pp.791-793
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    • 2009
  • Escherichia coli RNase P is composed of a large RNA subunit (M1 RNA) and a small protein subunit (C5 protein). Since both subunits are assembled in a 1:1 ratio, expression of M1 RNA and C5 protein should be coordinately regulated for RNase P to be efficiently synthesized in the cell. However, it is not known yet how the coordination occurs. In this study, we investigated how overexpression of C5 protein affects expression of the rnpB gene encoding M1 RNA, using a lysogenic strain, which carries an rnpB-lacZ transcription fusion. Primer extension analysis of rnpB-lacZ fusion transcripts showed that the overexpression of C5 protein increased the amount of the fusion transcripts, suggesting that rnpB expression increases with the increase of intracellular level of C5 protein.

C5a에 의해 자극된 호중구에서 세포내 칼슘동원에 대한 Protein Tyrosine Kinase의 조절작용 (Regulatory Action of Protein Tyrosine Kinase in Intracellular Calcium Mobilization in C5a-stimulated Neutrophils)

  • 최원태;한은숙;이정수
    • 대한약리학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.417-424
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    • 1996
  • 본 연구는 C5a에 의해 자극된 호중구에서 세포내 칼슘유리와 세포외부로부터 칼슘유입에 있어 protein kinase C와 protein tyrosine kinase의 관여 여부를 조사하였다. Protein kinase C 억제제인 staurosporine과 H-7은 C5a에 의해 자극된 호중구에서 세포내 칼슘유리를 억제하였으나, 세포막을 교차한 칼슘유입이나 세포내 칼슘농도 증가에 영향을 나타내지 않았다. C5a에 의한 세포내 칼슘유리와 칼슘유입은 protein tyrosine kinase 억제제인 genistein과 methyl-2,5-dihydroxycinnamate에 의해서 억제 되었다. ADP에 의해 야기된 세포내 칼슘농도의 증가는 genistein과 methyl-2,5-dihydroxycinnamate에 의해서 억제되었으나 staurosporine과 H-7의 영향은 받지 않았다. Genistein과 methyl-2,5-dihydroxy-cinnamate는 thapsigargin을 처리한 호중구에서 칼슘유입을 감소시켰으나 이에 대한 staurosporine 과 H-7의 효과는 나타나지 않았다. 호중구를 phorbol 12-myristate 13-acetate로 전처치하였을때 세포내 칼슘증가에 미치는 C5a의 자극 효과는 감소하였다. 이상의 결과로 부터 protein tyrosine kinase는 C5a에 의해 활성화된 호중구에서 세포내 칼슘유리와 세포막을 교차한 칼슘유입의 조절에 관여할 것으로 추정된다.

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Selection and Analysis of Genomic Sequence-Derived RNA Motifs Binding to C5 Protein

  • Kim, Kwang-sun;Ryoo, Hye-jin;Lee, June-Hyung;Kim, Mee-hyun;Kim, Tae-yeon;Kim, Yool;Han, Kook;Lee, Seol-Hoon;Lee, Young-hoon
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제27권5호
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    • pp.699-704
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    • 2006
  • Escherichia coli RNase P is a ribonucleoprotein composed of M1 RNA and C5 protein. Previously, analysis of RNA aptamers selected for C5 protein from a synthetic RNA library showed that C5 protein could bind various RNA molecules as an RNA binding protein. In this study, we searched cellular RNA motifs that could be recognized by C5 protein by a genomic SELEX approach. We found various C5 protein-binding RNA motifs derived from E. coli genomic sequences. Our results suggest that C5 protein interacts with various cellular RNA species in addition to M1 RNA.

Bacteriophage T7의 유전자 복제기작에 관한 생화학적, 분자생물학적 특성 연구 (Biochemical and Molecular Biological Studies on the DNA Replication of Bacteriophage T7)

  • KIM Young Tae
    • 한국수산과학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.209-218
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    • 1995
  • 본 연구에서는 유전자 복제기작을 생화학적, 분자생물학적 방법을 사용하여 bacteriphage T7을 대상으로 연구하였다. Bacteriophage T7의 유전자 복제, 재조합, 수선시 필수 단백질로 작용하는 gene 2.5 단백질의 생체내 기능에 대한 유전학적 연구와 단백질을 분리 정제하여 복제 단백질들과의 상호작용에 대한 연구를 수행하였다. 연구결과 gene 2.5 단백질은 DNA복제시 필수 구성단백질로 작용하며, 복제과정에서 유전자 복제에 관여하는 핵심 단백질들인 DNA polymerase, helicase/primase와 직접 단백질-단백질 상호 협동 작용을 하는 r것을 증명하였다. 특히 gene 2.5 단백질의 C-terminal domain이 절편된 변이체의 경우 복제 단백질들과 상호작용이 결여되었다. 따라서 C-terminal domain이 gene 2.5 단백질의 기능에 필수적으로 관여함을 입증하였다.

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Identification of a Cellular Protein Interacting with RNA Polymerase of Hepatitis C Virus

  • Park, Kyu-Jin;Choi, Soo-Ho;Koh, Moon-Soo;Kim, Sung-Wan;Hwang, Soon-Bong
    • BMB Reports
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    • 제33권1호
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    • pp.59-62
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    • 2000
  • Hepatitis C virus (HCV) nonstructural 5B (NS5B) protein is an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). To determine whether it can contribute to viral replication by interaction with cellular proteins, the yeast two-hybrid screening system was employed to screen a human liver cDNA library. Using the HCV NS5B as a bait, we have isolated positive clones encoding a cellular protein. The NS5B interacting protein, 5BIP, is a novel cellular protein of 170 amino acids. Interaction of the HCV NS5B protein with 5BIP was confirmed by a protein-protein blotting assay. Recently, we have demonstrated that NS5B possesses an RdRp activity and thus it is possible that 5BIP, in association with NS5B, plays a role in HCV replication.

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Virginiamycin 생합성 유도인자 Virginiae butanolide C에 의한 2차 대사산물 생산의 유도 (Induction of Secondary Metabolites by Virginiamycin Inducing Factor, Virginiae Butanolide C)

  • 김현수;강선영
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제22권5호
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    • pp.459-466
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    • 1994
  • Virginiae butanolide C(VB-C) is one of the butyrolactone autoregulators, which triggers the production of virginiamycin in Streptomyces virginiae. Streptomyces longwoodensis was selected as a test strain to investigate new VB-C functions. When 100 ng/ml of the synthetic VB-C was added into the culture at 5 hour and 0 hour, the initial production time of antibiotics and a dark blue pigment were shortened by 4~6 hours and 2~4 hours, respectively. HPLC analysis revealed the production of several new antibiotics by VB-C addition. In the SDS-PAGE analysis of the total protein from mycelium several new protein bands showed up and the amounts of certain protein bands increased in the presense of VB-C. The existence of specific VB-C binding protein was confirmed from S. longwoodensis in relation to VB-C signal transduction. These results suggest that the VB-C might have an ability to induce the production of secondary metabolites in Streptomy- ces longwoodensis.

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대두 유식물에서 Protein Kinase C의 부분 정제 (Partial Purification of Protein Kinase C in Glycine max)

  • 최윤희
    • Journal of Plant Biology
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    • 제36권2호
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    • pp.171-176
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    • 1993
  • Protein kinase C, a protein related in PI cascade, was partially purified from the cytosol protein of etiolated plants of Glycine max by DEAE-52 cellulose chromatography and phenylsepharose chromatography. When the DEAE column was eluted with 0-0.8 M linear gradient KCl, tow fractions were found that increased the phosphorylation of histon H1 about five and nine-fold in the presence of 5 $\mu\textrm{g}$/mL phosphatidylserine and 0.5 $\mu\textrm{g}$/mL diolein, respectively. These fractions were used as DEAE pool. The reaction eluted with relatively high concentration of KCl was loaded on phyenylsepharose column with 5 mM CaCl2 and eluted with 1 mM EGTA. A fraction contained the protein kinase C, which increased the phosphorylation of the histon H1 was fractionated. To determine the molecular weight of PKC, the fraction eluted from phenylsepharose column was analyzed by 5~15% polyacrylamide gel electrophoresis after concentrated with the Amicon membrane (YM10). That revealed two bands corresponding to 60 and 65 kGy by silver staining of the gel, respectively.

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Application of Gel-based Proteome Analysis Techniques to Studying Post-mortem Proteolysis in Meat

  • Hwang, I.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권9호
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    • pp.1296-1302
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    • 2004
  • This study was conducted to evaluate the possible application of 2 D-SDS-PAGE (2 DE)-based proteome analysis techniques to the assessment of extreme proteolysis in postmortem skeletal muscle. Eight Hanwoo longissimus muscles were incubated immediately after slaughter for 24 h at 5$^{\circ}C$, 15$^{\circ}C$ or 36$^{\circ}C$. Warner Bratzler (WB)-shear force and ultrastructural configuration were determined at 24 h, and rate of proteolysis to 24 h was determined by 1 D-SDS-PAGE (1 DE) and 2 DE. In addition, tentative protein identification was performed from peptide mass fingerprints of MALDI-ToF analysis of major protein groups on 2 DE profiles. The result showed that although ultrastructural configuration was similar between the 5$^{\circ}C$ and 36$^{\circ}C$ treatments, meat at 5$^{\circ}C$ had higher WBshear force (approximately 5 kg greater). A higher rate of protein degradation at 36$^{\circ}C$ was observed based on Troponin-T degradation, 1 DE, and 2 DE analysis. This indicates that proteolysis during the early postmortem period was a significant determinant of shear force at 24 h. Little difference in proteolysis between 5$^{\circ}C$ and 15$^{\circ}C$ treatments was found based on classic 1 DE profile assessment. Meanwhile, considerable differences in the 2 DE profiles between the two treatments were revealed, with substantially higher rate of proteolysis at 15$^{\circ}C$ compared to 5$^{\circ}C$. Nuclease treatment improved 2 DE profile resolution. 400 ${\mu}$g and 600 ${\mu}$g of sample loading appeared to be appropriate for 24 cm pH 3-10 and pH 5-7 IPG strips, respectively. Protein detection and quantification of the 5$^{\circ}C$, 15$^{\circ}C$ and 36$^{\circ}C$ 2 DE profiles revealed 78, 163 and 232 protein spots respectively that were differentially modified in terms of their electrophoretic properties between approximately pI 5.3-7.7 with the molecular weight range of approximately 71-12 kDa. The current results demonstrated that 2 DE was a superior tool to 1 DE for characterising proteolysis in postmortem skeletal muscle.

Staurosporine과 Genistein이 C5a 또는 PMA에 의하여 활성화된 호중구에서의 Superoxide와 HOCl 생성에 나타내는 영향 (Effects of Staurosporine and Genistein on Superoxide and HOCl Production in C5a- or PMA-activated Neutrophils)

  • 윤영철;강희정;신용규;이정수
    • 대한약리학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.115-122
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    • 1995
  • C5a 또는 PMA에 의하여 활성화된 호중구에서의 superoxide와 HOCl 생성에 나타내는 staurosporine, genistein과 pertussis toxin의 효과를 관찰하였다. C5a에 의한 superoxide과 $H_2O_2$의 생성은 staurosporine, genistein과 pertussis toxin에 의하여 억제되었다. PMA의 자극효과는 staurosporine에 의하여 억제되었으나 pertussis toxin에 의하여 영향을 받지 않았으며, 한편 이는 genistein에 의하여 더 촉진되었다. Staurosporine, genistein은 sodium fluoride에 의한 superoxide 생성을 억제 하였으나 pertussis toxin은 영향을 나타내지 않았다. PMA에 의한 $H_2O_2$의 생성은 staurosporine에 의하여 억제되었으나 pertussis toxin은 영향을 나타내지 않았다. Genistein은 PMA에 의한 $H_2O_2$의 생성에 자극효과를 나타내지 않았다. Staurosporine과 pertussis toxin은 C5a 또는 PMA에 의한 HOCl 생성을 억제하였으나, 이에 반하여 genistein은 자극하였다. C5a와 PMA에 의한 myeloperoxidase 유리는 genistein에 의하여 억제되었나, pertussis toxin의 효과는 나타나지 않았다. Staurosporine은 유리에 대한 PMA의 자극효과에 영향을 주지 않았다. Myeloperoxidase 활성은 genistein에 의하여 현저하게 증가되었으나 staurosporine과 pertussis toxin의 영향은 받지 않았다. 이상의 결과는 호중구의 respiratory burst가 protein kinase C와 protein tyrosine kinase에 의하여 조절된다고 제시한다. Protein kinase C의 직접적인 자극에 따른 superoxide 생성은 protein tyrosine kinase의 영향을 역으로 받을 것으로 추정된다. Genistein은 아마도 myeloperoxidase를 활성화하여 HOCl 생성을 촉진할 것으로 시사된다.

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