• 제목/요약/키워드: C Library

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Selection and identification of single-domain antibody against Peste des Petits Ruminants virus

  • Liu, Dan;Li, Lingxia;Cao, Xiaoan;Wu, Jinyan;Du, Guoyu;Shang, Youjun
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제22권4호
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    • pp.45.1-45.13
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    • 2021
  • Background: Peste des petits ruminants (PPR) is an infectious disease caused by the peste des petits ruminants virus (PPRV) that mainly produces respiratory symptoms in affected animals, resulting in great losses in the world's agriculture industry every year. Single-domain variable heavy chain (VHH) antibody fragments, also referred to as nanobodies, have high expression yields and other advantages including ease of purification and high solubility. Objectives: The purpose of this study is to obtain a single-domain antibody with good reactivity and high specificity against PPRV. Methods: A VHH cDNA library was established by immunizing camels with PPRV vaccine, and the capacity and diversity of the library were examined. Four PPRV VHHs were selected, and the biological activity and antigen-binding capacity of the four VHHs were identified by western blot, indirect immunofluorescence, and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) analyses. ELISA was used to identify whether the four VHHs were specific for PPRV, and VHH neutralization tests were carried out. ELISA and western blot analyses were used to identify which PPRV protein was targeted by VHH2. Results: The PPRV cDNA library was constructed successfully. The library capacity was greater than 2.0 × 106 cfu/mL, and the inserted fragment size was approximately 400 bp to 2000 bp. The average length of the cDNA library fragment was about 1000 bp, and the recombination rate was approximately 100%. Four single-domain antibody sequences were selected, and proteins expressed in the supernatant were obtained. The four VHHs were shown to have biological activity, close affinity to PPRV, and no cross-reaction with common sheep diseases. All four VHHs had neutralization activity, and VHH2 was specific to the PPRV M protein. Conclusions: The results of this preliminary research of PPRV VHHs showed that four screened VHH antibodies could be useful in future applications. This study provided new materials for inclusion in PPRV research.

Optimized Serological Isolation of Lung-Cancer-associated Antigens from a Yeast Surface-expressed cDNA Library

  • Kim, Min-Soo;Choi, Hye-Young;Choi, Yong-Soo;Kim, Jhin-Gook;Kim, Yong-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권6호
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    • pp.993-1001
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    • 2007
  • The technique of serological analysis of antigens by recombinant cDNA expression library (SEREX) uses autologous patient sera as a screening probe to isolate tumor-associated antigens for various tumor types. Isolation of tumor-associated antigens that are specifically reactive with patient sera, but not with normal sera, is important to avoid false-positive and autoimmunogenic antigens for the cancer immunotherapy. Here, we describe a selection methodology to isolate patient sera-specific antigens from a yeast surface-expressed cDNA library constructed from 15 patient lung tissues with non-small cell lung cancer (NSCLC). Several rounds of positive selection using patient sera alone as a screening probe isolated clones exhibiting comparable reactivity with both patient and normal sera. However, the combination of negative selection with allogeneic normal sera to remove antigens reactive with normal sera and subsequent positive selection with patient sera efficiently enriched patient sera-specific antigens. Using the selection methodology described here, we isolated 3 known and 5 unknown proteins, which have not been isolated previously, but and potentially associated with NSCLC.

대학도서관 리모델링 전.후의 공간구성에 관한 이용자 만족도 조사 연구 - C대학교 중앙도서관을 중심으로 - (A Study on User Satisfaction Research about Spacial Composition before and after Remodeling University Library Focused on C University Library)

  • 남영준;문정현;이현정
    • 한국비블리아학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.205-222
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    • 2009
  • 대학도서관은 대학교육과 상호 관련되어 있다. 지식 정보사회에는 대학의 경쟁력을 키우고 나아가 국가경쟁력을 강화하기 위해 대학도서관이 발전적으로 운영되어야 한다. 교수와 학생들의 연구 및 학습활동을 지원할 수 있는 적절한 시설과 시스템을 갖추어야만 대학도서관 본연의 기능과 역할을 성취할 수 있을 것이다. 본 연구에서는 C대학교 중앙도서관 중심으로 공간구성의 변화를 분석하고, 그에 따라 리모델링 전 후의 이용자 만족도를 조사하여 이용자들의 공간구성에 대한 만족도와 그 결과를 분석하였다. 이 연구의 결과로는 이용자가 원하는 도서관 공간 활용 가운데 열람공간과 휴게공간에 대한 중요도를 파악할 수 있었다. 이러한 결과는 향후 도서관 서비스의 질을 높이거나, 도서관 이용자 만족도를 조사 연구하는 연구자들에게 좋은 참고자료가 될 것이다.

의학도서관 정보이용교육 프로그램 연구: C대학교 의학도서관을 중심으로 (A Study on Information Literacy Education Program of Medical Library: Focused on C University Medical Library)

  • 이용재;우상희
    • 정보관리연구
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    • 제39권3호
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    • pp.49-71
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    • 2008
  • 이 연구는 국내 의학도서관 정보이용교육의 활성화를 도모하고, 아울러 정보환경의 변화에 부응하고 이용자 지향적인 정보이용교육 프로그램을 제시하기 위하여 수행되었다. 이를 위해 국내외 선진 사례들을 벤치마킹한 뒤, 국내 평균에 가까운 한 대학도서관을 주요 사례로 하여 정보이용교육의 실태와 이용자들의 정보요구를 조사하였다. 이를 바탕으로 국내 의학도서관 정보이용교육의 프로그램 구성을 위한 방안을 제시하였다. 특히 프로그램을 구성할 때의 고려사항, 내용, 흐름을 제시하였다. 이 연구의 결과는 국내 의학도서관들이 정보이용교육 프로그램을 시작하거나 보완하고자 할 때 유용한 참조원이 될 것이다. 각 의학도서관은 자관의 상황에 따라 이 연구의 결과를 적절히 가감하여 활용할 수 있을 것이다.

Apoptosis Suppressor에 관련된 유전자 스크린 방법과 동정된 유전자 특성 규명

  • 황규찬;옥도원;권득남;신혜경;김진회
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2001년도 춘계학술발표대회
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    • pp.16-16
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    • 2001
  • Apoptosis로 일컬어지는 예정된 세포사멸(programmed cell death)은 개별 세포의 입장에서는 곧바로 사멸을 의미하지만, 정상적인 고등 생물의 입장에서는 개체의 발생과 분화하는데 프로그램된 과정이다. 자발적 세포사멸은 다른 조직에 비해 생식 조직인 난소나 정소에서 복잡한 apoptosis 기작들을 가지리라 사료된다. 본 연구는 Bcl-2 family중 apoptotic protein인 Bax에 대해 suppression하는 유전자를 yeast system을 활용하여 돼지 정소와 난소로부터 각각 cDNA library를 구축한 후 탐색하였다. 탐색에 활용된 cDNA library는 돼지의 정소와 난소로부터 mRNA를 분리하여 yeast vector인 pAD-GAL4-2.1에 구축하였고, 마우스 bax 유전자는 gal 1 promoter의 조절 하에 glucose 배지에서는 유도되지 않고, galactose 배지에서만 선택적으로 Bax를 발현할 수 있는 효모 vector(pL19-bax)를 구축하였다. Bax에 의한 apoptosis suppressor를 탐색하기 위해 우선 효모 W303에 pL19-bax를 transform하여 glucose 배지에서 Bax의 발현을 억제하였다. pL19-bax를 가진 효모에 정소와 난소로부터 구축된 cDNA library를 transform 시키고, transform된 효모는 각각 Bax에 의한 toxicity를 저해하는 유전자를 찾기 위해 스크린되었다. 이러한 방법으로 정소 cDNA library 탐색에서는 5 $\times$ $10^{6}$ transformant중 39개, 난소cDNA library 탐색에서는 2 $\times$ $10^{6}$ transformant중 26개의 콜로니가 생존하였다. 이들 콜로니로부터 유전자를 분리하여 분석해 본 결과 여러 그룹으로 분류할 수 있었다. 각 그룹의 관련 유전자는 protein synthesis/degradation 12종, oxidation/reductation 5종, detoxin/ cell cycle promoter 3종, signal transduction/growth factor 5종, 그리고 알려지지 않은 유전자 9종이었다. 그 중, bax-toxicity inhibition에 강력한 survival phenotype을 가지는 유전자(pSEDL)를 동정하였다. 이것은 T3-4-1 콜로니로부터 분리하였는데 140개 아미노산으로 이루어진 인간 SEDL(GenBank, XM_013096) 유전자와 매우 유사한 homology를 가지며, bax와 관련된 기능은 밝혀져 있지 않다. 이외에도 분리된 유전자에는 NADH, thioreduction, 그리고 cytochrome oxidase와 같은 positive 유전자 군이 크로닝되어, Bax를 이용한 효모에서 apoptosis suppressor에 관련된 유전자를 손쉽게 스크린하는 것이 가능하고, 분리된 유전자의 기능을 예측할 수 있어 지금까지 보고된 유전자 크로닝법 보다는 강력한 수단으로 활용될 수 있다는 사실을 시사하였다. 그러나, ORF에 관계없이 Bax 발현에 저항하는 유전자군이 선발된다든지 하는 문제점은 금후 검토가 필요하리라 사료된다.

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공공도서관의 공간구성과 복합화 유형에 관한 연구 (A Study on the Typology of Mixing Activities and Space Organization in Public Library Buildings)

  • 김정희;이상호
    • 한국실내디자인학회논문집
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    • 제41호
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    • pp.146-154
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    • 2003
  • The purpose of this study is, According to society changing fast, human life is changing in the direction of complexity and variety, the middle class and multiple structure have been generated in relation between architecture and function. Accordingly, considering the analyzed elements of the main floor space planning and relation of the factors in space planning of Seoul s public libraries. The Public Library is variety of function is abstracted to the plan for Space Composition Form from future public library, analysis of “This point of user, how to composition is the space of different function” and “How to is the connection between the educational function and the other function, complexity of space.” With above distinctive themes and the research, the typology of public library in seoul city, At the first, the research shows that the public library is 8 type, and high in typology of “TYPE 7 (A3-B2-Cl)”. Secondary, There appears public library, such as in the satisfaction of the One-Function-User is high in “TYPE 3 (A1-B2-C3)”, in the satisfaction over the Two-Function-User is high in “TYPE 6 (A3-B1-C1)”

Renin-Angiotensin계의 분자생물학적 연구 : Renin유전자의 발현과 Genomic Library작성 (A Study on the Molecular Biology of Renin-Angiotensin System : Renin Gene Expression and Construction of Genomic Library)

  • 박영순;한동민;김종호;문영희;이호섭;고건일;김성준
    • 한국동물학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.35-44
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    • 1990
  • 생쥐 악하선으로부터 분리한 전 RNA를 poly(U)-sepharose chromatography와 sucrose linear density gradient centrifugation 방법으로 레닌 mRNA를 분리하여 in vitro translation과 immunoprecipitation에 의하여 레닌 mRNA를 확인하였다. 레닌 mRNA로부터 레닌 cDNA를 합성하여 EcoRI inker를 이용하여 pUC19에 삽입시켰고, Taq, polymerase를 이용한 PCR방법으로 합성한 레닌 cDNA는 pUC19의 Hinalll 부의에 삽입하여 재조합 plamid를 각각 작성하였다. 이것을 JM103에 형질전환시켜 레닌 유전자 발현을 유도하여 45,000의 분자량을 갖는 레닌을 얻었으며 이 레닌 단백은 토끼으 혈압을 850115mmHg에서 115-140mmHg로 증가시키는 생리 활성을 나타냈다. 토끼의 신장 DNA를 EMBL3 phage에 삽입시켜 genomic library를 작성한 후, 레닌 cDNA로부터 합성한 probe로 plaque hybridization시켜 genomic 유전자를 갖는 재조합 phage를 분리하였다.

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Unusual Orientation of cDNAs Found in a cDNA Library

  • Lee Jeongyeo;Song Hayoung;Lim Yong-Pyo;Hur Yoonkang
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제7권1호
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    • pp.51-55
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    • 2005
  • Many cloning vectors in which cDNAs can be inserted to the sense orientation have been developed. Uni-ZAP XR vector (Stratagene) should contain clones that are oriented to sense direction with respect to T3 RNA polymerase primer. Unexpectedly, large portions of cDNAs in Chinese cabbage cDNA library showed unusual insertions, antisense orientation and a hybrid of two different clones. Using two clones, 4H03 and 53-B10, derived from different cDNA libraries, we proposed and demonstrated the possibility of unusual-construct formation by in vitro translation and northern blot analysis. The 4H03 clone was inserted with inverse direction, and its transcript and translation product could be produced by T7 RNA polymerase, indicating that this clone is definitely inserted into inverse orientation. The 53-B10 that contains two independent genes was turned out to be a hybrid in which two genes are inserted to opposite direction each other. All unusual constructs might be due to the presence of small fragments of DNA, like adapter. However, the mechanism underlined the formation of unusual constructs is still remain to be solved.

고려인삼(Panax ginseng C.A, Meyer)의 잎 ESTs database에서 Energy 대사 관련 유전자 분석 (Gene Analysis Related Energy Metabolism of Leaf Expressed Sequence Tags Database of Korean Ginseng (Panax ginseng C.A. Meyer))

  • 이종일;윤재호;송원섭;이범수;인준교;김은정;양덕춘
    • 한국자원식물학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.174-179
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    • 2006
  • 본 연구에서는 인삼 잎으로부터 정제한 mRNA를 이용하여 cDNA library를 제작하였다. 이 cDNA library로 부터 349개의 에너지 대사 관련 유전자를 선발 하였다. 에너지 대사 관련 유전자의 평균 사이즈는 0.49 kb이며, 에너지 관련 유전자들의 세부 기능별 발현을 분석한 결과 aerobic respiration(48.4%), accessory proteins of electron transport and membrane associated energy conservation(17.2%), glycolysis and gluconeogenesis(3.4%), electron transport and membrane associated energy conservation(2.9%), respiration(2.0%), glycolysis methylglyoxal byp-ass(1.7%), metabolism of energy reserves(0.6%)와 alcohol fermentation(0.3%)의 분포를 보였다. 인삼 잎에서 발현되는 유전자중 가장 많이 발현된 Chlorophyll a/b binding protein of IhcII type I(36.6%), Photosystem II oxygen-evolving complex protein(6.6%) 등이 발현되었다.