홍화 수집종의 RAPD 분석을 통한 유전적 다양성 및 유연관계를 밝히고 품종군을 분류하여 품종육성의 기초자료로 활용코자 시험한 결과는 아래와 같다. RAPD 분석에 적용한 37개의 Primer 중 25개의 적정 primer를 선발하였고, 증폭원 PCR산물은 $0.1{\sim}4.0kb$에서 재현성있는 band를 보였으며 각 primer에 의해 증폭된 band의 수는 $1{\sim}9$개로 다양하였고 평균 4.8개였다. PCR 반응에 사용된 25개의 primer에서 120개의 band가 관찰되었으며 다형성을 보이는 band될 수는 23개(19.2%)였다. RAPD-PCR에 의해 얻어진 dendrogram에서 유연계수 0.042를 기준으로 합을 했을 때 6개 군으로 분류되었고 II군과 III군은 각각 12종(38%)씩 속하였다.
수확 후 3주와 8주에 맥주보리 49개 품종의 발아세, 발아율 및 수감수성의 품종간 차이를 검토하고자 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 수확 후 3주에 발아상의 물량 증가에 따른 발아세, 발아율, PI치와 수감수성의 차이는 컸으나 8주에는 그 차이가 적어서 휴비성이 발아세와 발아율을 저하시켰다. 2. 발아세는 휴비성이 소거된 8주에는 전 공시 품종이 극히 양호하였으며, CI 12062와 CI 15631등의 수감수성이 다소 커서 광범위한 육종재료를 교배에 이용할 경우 수감수성의 검정이 필요할 것으로 본다. 3. 수감수성은 저장기간에 관계없이 물 8ml 발아세, 발아율, PI치와 상관이 매우 높았으나 물 4ml에서는 상관관계가 없었다. 4. 저장기간, 품종 및 곡립의 풍만도에 따라서 발아세와 수감수성의 차이가 있으므로 등숙이 양호한 품종의 육성과 등숙향상을 위한 재배법이 연구되어야 할 것으로 생각된다.
뽕나무 오디는 기능성 식품소재 및 농가의 소득을 증진시킬 수 있는 과실로서 뽕나무 묘목에 대한 일반인의 수요가 증가하고 있으나, 현재 오디생산을 위한 뽕 품종은 '대성뽕'외에 등록되어 있지 않다. 따라서 본 연구는 우리나라에 유전자원으로 보존 중인 뽕나무의 결실 오디를 계통별로 채취하여 과실적 특성을 조사하고 우수한 계통을 선발함으로써, 오디 생산용 뽕 품종의 육종 효율을 높이고 품종의 조기 농가보급을 위한 기초 자료를 제공코자 하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 그루당 10kg이상 수확 가능한 계통으로서 '수성뽕', '청노상', '수원노상', '절곡조생(충북)' 4계통을 다수성 계통으로 선발하였다. 또한 단과중이 3.5g 이상인 대과형 계통과 17 Brix $\%$ 이상인 고당도 계통을 각각 5계통, 4계통 선발하였다. 공시계통 중 '절곡조생(충북)'은 단과중이 4.5g으로서 가장 높았으며, '강선'은 19.6 Brix $\%$으로 당도 함량이 가장 높았다. 2. 수량, 단과중 및 당도 값을 동시에 만족시키는 오디 생산용 우량 계통으로서 '절곡조생(충북)', '팔청시평', '강선', '수원노상', '죽천조생', '수성뽕', '당상7호', '장소상' 8계통을 선발하였다.
한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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pp.162-162
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2017
Atractylodes japonica and Atractylodes macrocephala belongs to Atractylodes genus and theirs roots are used as 'Baek-chul'(White atractylodes rhizome) in Korea Pharmacopoeia. 'Baek-chul' widely used in traditional herbal remedies in Asia. Concurrently, the 'Baek-chul' demand enormously increased in the market due to the growing interest in favoring health benefits but it is depend on import from China. Thus we conducted breeding research to solve the problems associated with domestically cultivated 'Baek-chul' such as low productivity and low disease tolence. We crossed A. japonica (female parent) and A. macrocephala (male parent) in the greenhouse in September 2000. the next season 119 crossed line seeds were collected and germinated in the green house. Among them we selected the good lines in the same season. then conducted replicated yield trials (RYT) in 2014 to local adaptability test (LAT) in 2015-2016. The results showed that the 'AJM16' line has beneficial charactersitcs like, increased plant height, large rhizome diameter, narrow leaf width compared with a 'Sang-chul' (check cultivar) and varied flower color from A. japonica (female parent). The line 'AJM16' was also exhibited decreased anthracnose symptoms(Colletotrichum gloeosporides Penz.). Simultaneously the root yield of AJM16 was 2,409 kg per are, which was increased 130% higher yield compared to 'Sang-chul' (check cultivar) at three various regions from 2015 to 2016. Therefore, we named AJM16 as new cultivar 'Man-chul'. According the results, we have developed a new Atractylodes spp. hybrid cultivar 'Macn-chul' with high yielding and disease tolerance by National Institute of Horticulture and Herbal Science, RDA, in 2016.
Park, Sumin;Kim, Kyung Hye;Go, Hong Min;Lee, Ju Seok;Jung, Jin Kyo;Bilyeu, Kristin D.;Lee, Jeong-Dong;Kan, Sungtaeg
한국작물학회:학술대회논문집
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한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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pp.145-145
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2017
Foxglove aphid, Aulacorthum solani (Kaltenbach), is a Hemipteran insect that infected a wide variety of plants worldwide and caused serious yield losses in crops. The objective of this study was to identify the putative genes to foxglove aphid resistance in wild soybean, PI 366121 (Glycine soja Sieb. and Zucc.). One hundred and forty-one F4:8 recombinant inbred lines developed from a cross between susceptible variety, Williams 82 and foxglove aphid resistance wild soybean, PI 366121 were used. The two type of resistance response, antibiosis and antixenosis resistance were evaluated through choice and no-choice test, graded by the degree of total plant damage and primary infestation leaf damage; a genome-wide molecular linkage map was constructed with 29,898 single-nucleotide polymorphism markers utilizing a Axiom(R) 180K soyaSNP array. Using inclusive composite interval mapping analysis for foxglove aphid resistance, one major candidate QTL on chromosome 7 was identified. The major QTL on chromosome 7 showed both antixenosis and antibiosis resistance responses. The newly identified major QTL was consistent with previously reported QTL, Raso2, which showed around 5 times narrow down interval range with 8 candidate genes. Furthermore, total 1,115 soybean varieties including Glycine soja and Glycine max were exposed to germplasm screening, and 31 varieties, which showed significant antibiosis type foxglove aphid resistance were identified. This result could be useful in breeding for new foxglove aphid resistant soybean cultivars and developing novel insecticides.
한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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pp.82-82
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2017
The production of spring wheat, the major crop in Mongolia, is accounting for 98% of the cultivated area. Collection, conservation and utilization of wheat germplasm resources play an important role in wheat breeding and production in Mongolia. Understanding genetic variability in the existing genebank accessions is important for collection and conservation of wheat germplasms. To determine the genetic diversity and population structure among a representative collection of Mongolian local wheat cultivars and lines, 200 wheat accessions were analyzed with 15 SSR markers distributed throughout the wheat genome. A total of 85 alleles were detected, with 3 to 5 alleles per locus and a mean genetic diversity value of 5.66. The average genetic diversity index was 0.68, with values ranging from 0.37 to 0.80. The 200 Mongolian wheat accessions were divided into two subgroups based on STRUCTURE, un-rooted NJ cluster and principal coordinate analyses. The results from this study will provide important information for future wheat germplasm conservation and improvement programs with Mongolian genebank.
Kim, Serim;Jeong, Ji Hee;Chung, Hee;Kim, Ji Hyeon;Gil, Jinsu;Yoo, Jemin;Um, Yurry;Kim, Ok Tae;Kim, Tae Dong;Kim, Yong-Yul;Lee, Dong Hoon;Kim, Ho Bang;Lee, Yi
Journal of Plant Biotechnology
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제43권2호
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pp.181-188
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2016
In this study, we developed 15 novel polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers by SSR-enriched genomic library construction from Codonopsis lanceolata. We obtained a total of 226 non-redundant contig sequences from the assembly process and designed primer sets. These markers were applied to 53 accessions representing the cultivated C. lanceolata in South Korea. Fifteen markers were sufficiently polymorphic, and were used to analyze the genetic relationships between the cultivated C. lanceolata. One hundred three alleles of the 15 SSR markers ranged from 3 to 19 alleles at each locus, with an average of 6.87. By cluster analysis, we detected clear genetic differences in most of the accessions, with genetic distance varying from 0.73 to 0.93. Phylogenic analysis indicated that the accessions that were collected from the same area were distributed evenly in the phylogenetic tree. These results indicate that there is no correlative genetic relationship between geographic areas. These markers will be useful in differentiating C. lanceolata genetic resources and in selecting suitable lines for a systemic breeding program.
We previously identified quantitative trait loci (QTL) for body weight and average daily gain in a common region between ADL0198 (chr 1: 171.7 Mb) and ABR0287 (chr 1: 173.4 Mb) on chicken chromosome 1 in an $F_2$ resource population produced by crossing low- and high-growth lines of the Hinai-dori breed. Motilin receptor (MLNR) is a candidate gene affecting growth traits in the region. In this study, we genotyped polymorphisms of the MLNR gene and investigated its association with growth traits in a Hinai-dori $F_2$ intercross population. All the exons of the MLNR gene in the parental population were subjected to PCR amplification, nucleotide sequenced and haplotypes identified. To distinguish resultant diplotype individuals in the $F_2$ population, a mismatch amplification mutation assay was performed. Three haplotypes (Haplotypes 1-3) were accordingly identified. Six genotypes produced by the combination of three haplotypes (Haplotype 1, 2, and 3) were examined in order to identify associations between MLNR haplotypes and growth traits. The data showed that Haplotype 1 was superior to Haplotype 2 and 3 in body weight at 10 and 14 weeks of age, average daily gain between 4 and 10 weeks, 10 and 14 weeks, and 0 and 14 weeks of age in female in $F_2$ females. It was concluded that MLNR is a useful marker of growth traits and could be used to develop strategies for improving growth traits in the Hinai-dori breed.
Kim Hong-Sik;Park Kwang-Geun;Baek Seong-Bum;Kim Jung-Gon;Nam Jung-Hyun
한국작물학회지
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제50권2호
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pp.131-141
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2005
Molecular-based genetic diversity for a set of 141 accessions of Korean barley cultivars and 24 accessions of foreign exotic cultivars were analyzed using random amplified polymorphic DNAs (RAPDs). Different level of genetic variability was observed with 30 random decamer primers in the Korean barley varieties and breeding lines which were preliminarily classified by morphological (hulled & hulless barley) and end-use (malting barley) and/or by the released periods. A total of 74 RAPD bands were scored, and the number of bands per primer varied from 1 to 7 with an average of 2.74. The hulled barley pool had one more marker genotype per primer than the hulless barley pool. The polymorphic information content (PIC) values based on the band pattern frequencies among genotypes varied depending on genetic pools where mean PICs of hulled, hulless and malting barleys were 0.62, 0.57, and 0.43, respectively. Certain genomic loci amplified by opR04, opF01, opB05, and opC13 were highly polymorphic with PIC>0.8. Patterns and temporal trends of genetic diversity assessed over the period from 1970s to 1990s had a tendency to increase, and in particular, this upward slant was quite clear and significant for the hulless barley pool. In the cluster analysis using genetic similarity matrix calculated from RAPD profiles, two major groups and several small subgroups were classified. Major grouping of materials was not affected by the presence of the husk but by their genetic background and the spike-row type. The validity of information on the genetic diversity and relationships between genotypes will have been reviewed to predict their yield potential.
The applicability of non-destructive near infrared reflectance spectroscopic (NIRS) method was tested to determine the protein and oil contents of intact soybean [Glycine max (L.) Merr.] seeds. A total of 198 soybean calibration samples and 101 validation samples were used for NIRS equation development and validation, respectively. In the developed non-destructive NIRS equation for analysis of protein and oil contents, the most accurate equation was obtained at 2, 8, 6, 1(2nd derivative, 8 nm gap, 6 points smoothing, and 1 point second smoothing) and 2, 1, 20, 10 math treatment conditions with Standard Normal Variate and Detrend (SNVD) scatter correction method and entire spectrum (400-2500 nm) by using Modified Partial Least Squares (MPLS) regression, respectively. Validation of these non-destructive NIRS equations showed very low bias (protein: 0.060%, oil: -0.017%) and standard error of prediction (SEP, protein: 0.568 %, oil : 0.451 %) as well as high coefficient of determination ($R^2$, protein: 0.927, oil: 0.906). Therefore, these non-destructive NIRS equations can be applicable and reliable for determination of protein and oil content of intact soybean seeds, and non-destructive NIRS method could be used as a mass screening technique for selection of high protein and oil soybean in breeding programs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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