• 생명과학회지
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• 제14권2호
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• pp.229-234
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• 2004

케라틴으로 구성되어 있는 우모는 도계 공장에서 부산물로 대량 배출되는 단백질 폐기물이다. 현재, 물리화학적 처리를 통하여 우모를 가축의 사료로 재활용하기 위한 방법이 시행되고 있으나 이러한 방법은 많은 단점을 가지고 있으며, 결과적으로 keratinolytic protease의 이용은 우모의 생물 공학적 처리를 위해 반드시 필요한 과정임을 알 수 있다. 본 연구에서는 우모의 생물학적 처리를 위하여 keratinolytic protease를 생성함으로서 우모를 분해할 수 있는 세균을 자연계로부터 분리한 후, 그 분류학적 위치를 검토하였다. 퇴비화중인 볏짚, 닭 가공공장 주변의 토양 및 붕괴중인 우모로부터 keratinolytic protease생성능이 우수한 5균주를 최종 선정하였다. 그중 효소 생성능과 우모 분해능이 가장 우수한 F7-1을 실험 균주로 선정하여 형태학적, 배양적 및 생화학적 특성을 조사한 결과, Bacillus sp.로 동정되었으며, Biolog system을 이용한 동정에서도 Bacillus sp.로 조사되었다. 보다 정확한 균주 동정을 위하여 16S rDNA 염기서열 분석을 수행하였으며, 그 결과 F7-1 균주는 B. megaterium과 계통진화학적으로 가장 유연 관계가 높았다.

• 대한환경공학회지
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• 제31권12호
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• pp.1069-1074
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• 2009

본 연구에서는 CuO와 ZnO의 입자 크기가 옥수수의 성장과 토양 미생물 군집에 미치는 독성을 microcosm 실험을 통하여 살펴보았다. 나노 입자는 micro 입자에 비해 옥수수의 biomass를 약 30% 감소시켜 나노 입자가 옥수수의 성장을 저해하는 것으로 나타났다. 토양 미생물 활성 지표인 Dehydrogenase activity는 CuO 나노 입자에서는 낮게 나타났으나 ZnO 나노 입자에서는 높게 나타났다. Biolog test 결과, CuO 나노 입자와 ZnO micro 입자에서 토양 미생물 다양성이 감소하는 것으로 나타났다. 그러므로, metal oxide의 나노 입자가 micro 입자보다 항상 토양 미생물의 활성 및 다양성에 더 유해한 영향을 나타내는 것은 아니라고 판단된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제34권2호
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• pp.94-100
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• 2006

식물생장 촉진 호르몬인 auxin을 생산하는 균주를 선발하기 위해 경산지역 경작지 토양에서 29종의 세균을 분리하였으며 Salkowsky test를 통해 auxin을 생산하는 14종을 선발하였다. 이 중 CAS(chrome azurol S) blue agar에서 siderophore의 생산을 확인 후 auxin과 siderohroe를 동시에 생산하는 AH18을 최종 선발하였다. AH18의 mung-bean adventitious root induction test를 통해 식물생장 촉진 능이 대조구에 비해 1.5배나 뛰어남을 알 수 있었고, 토마토 pot test에서 토마토 시들음병의 윈인균인 F. oxysporum에 대해서 길항력도 나타내었다. 선발된 AHl8 균주는 16S rDNA와 Biolog system을 통해 Bacillus subtilis 동정되었다. B. subtilis AH18은 Sucrose-asparagine-MgsO$_4$(SAM) medium (pH 6.0)에 접종하여 30$^{\circ}C$에서 3일간 배양 시 siderophore를 가장 많이 생산하는 것을 알 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제46권4호
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• pp.346-351
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• 2010

본 연구의 목적은 원유에 오염된 지역의 토양시료로부터 분리한 생물계면활성제 생산균주의 특성을 조사하기 위하여 실시하였다. 1% 원유를 포함하는 배지에서 균주 HK-3의 배양기간 동안, 생장, 생물계면활성제의 생산, pH의 변화 등을 조사하였다. 생물계면활성제의 생산능력이 뛰어난 균주인 HK-3를 선별하여, 이 균주의 배양기간에 따른 생장 변화와 생물계면활성제의 생산량, 그리고 pH에 대하여 관찰하였다. HK-3는 배양 36시간이 경과하였을 때, 가장 많은 양의 생물계면활성제를 생산하였다. 생물계면활성제 생산에 대한 부가탄소원의 효과를 알아보기 위하여 HK-3를 다른 부가탄소원(예, glucose, dextrose, mannitol, citrate, acetate)과 함께 배지에서 배양하였다. 그 결과, 생물계면활성제의 최대생산량은 mannitol을 포함하는 BH 고체평판배지에서 관찰되었으며, 투명대의 면적은 직경은 약 7.64 cm2로 측정되었다. 분리균주의 생리학적 및 생화학적 특성을 조사하였으며, 주사전자현미경을 통하여 불규칙한 막대형의 세균으로 관찰되었다. BIOLOG 시스템과 16S rRNA 염기서열을 이용한 계통유전학적 분석을 통하여 동정하여 Pseudoalteromons 종으로 확인되어 Pseudoalteromons sp. HK-3로 명명하였으며, GenBank에 [FJ477041]로 등록하였다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제40권4호
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• pp.453-461
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• 2016

Background: This study aims to describe the characterization of Paenibacillus polymyxa GBR-1 (GBR-1) with respect to its positive and negative effects on plants. Methods: The morphological characteristics of GBR-1 were identified with microscopy, and subjected to Biolog analysis for identification. Bacterial population and media optimization were determined by a growth curve. The potential for GBR-1 as a growth promoting agent, to have antagonistic activity, and to have hydrolytic activity at different temperatures was assessed. The coinoculation of GBR-1 with other microorganisms and its pathogenicity on various stored plants, including ginseng, were assessed. Results: Colony morphology, endospore-bearing cells, and cell division of GBR-1 were identified by microscopy; identification was performed by utilizing the Biolog system, gas chromatography of fatty acid methyl esters (GC-FAME). GBR-1 showed the strongest antagonistic activity against fungal and bacterial pathogens. GBR-1 cell numbers were relatively higher when the cells were cultured in brain heart infusion (BHI) medium when compared with other media. Furthermore, the starch-hydrolytic activity was influenced by GBR-1 at higher temperature compared to low temperatures. GBR-1 was pathogenic to some of the storage plants. Coinoculation of GBR-1 with other pathogens causes differences in rotting on ginseng roots. A significant growth promotion was observed in tobacco seedlings treated with GBR-1 suspensions under in vitro conditions, suggesting that its volatile organic compounds (VOCs) might play a role in growth promotion. Conclusion: The results of this study indicate that GBR-1 has both positive and negative effects on ginseng root and other stored plants as a potential biocontrol agent and eliciting in vitro growth promotion.

• 한국임상수의학회지
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• 제24권1호
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• pp.19-25
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• 2007

This study carried out to investigate the genital tract bacterial flora of Thoroughbred mare in Jeju province during March and July, 2006. The specimens were collected from vaginal ucosa and clitorial fossa using a culture swab (BBL, USA) from 100 Thoroughbred mares. Colonies were selected blood and MacConkey agar plate, and identified as standard biochemical properties using Biolog system (Thermo, USA). In this study, 470 gram-negative strains were isolated more frequently than 249 gram-positive strains. We were Isolated Escherichia coli (19.8%), Proteus mirabillis (14.9%), Enterobacter nimipressuralis (7.4%), Enterobacter mobilis (4.7%), Aeromonas encheleia (4.3%), Pseudomonas aeroginosa (3.0%), Staphylococcus aureus (14.9%), Staphylococcus epidermidis (11.2%), Coagulasenegative Staphylococcus spp. (10.0%), Enterococcus faecalis (9.2%), Enterococcus faecium (8.0%), Actinomyces viscosus (7.2%), Micoroccus diversus(6.8%), Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis(5.2%), Streptococcus equi subsp. zooepidemicus (3.2%), Other non-beta hemolytic Streptococcus spp. (2.0%) and many others from vaginal mucosa and clitorial fossa in Thoroughbred mares. No significant bacteria (Taylorella equigenitalis and Klebsiella pneumonia) were isolated from the mare genital tract. In antimicrobial agents susceptibility test, it shows a high sensibility in the antibiotics of the most which excepts the streptomycin and neomycinm, kanamycin, spectinomycin, compound sulfonamides. Especially, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus spp. and Streptococcus spp. were visible a high sensibility in the all antibiotics. However, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Proteus spp. and E. coli were showed a high antibiotic resistance patterns. These results may provide the basic information to establish strategies for the treatment and prevention of reproductive disease in Thoroughbred mares in Korea.

• 미생물학회지
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• 제36권3호
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• pp.209-215
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• 2000

이연구는 물리화학적 환경요인에 따른 TNT 분해 세균에 의한 s-triazine 계열의 atrazine과 simazine의 분해를 조사하기 위하여 실시되었다. TNT 분해세균은 atrazine과 simazine에 대해서도 높은 분해능을 나타내었다. Atrazine(<50 mg/l)과 simazine(<15 mg/l) 은 각각 30시간과 4일의 배양기간중에 완전히 분해되었다. 배양내에서 atrazine과 simazine 의 농도가 증가함에 따라 이들의 분해는 지연되었다. 부가 탄소원은 atrazine과 simazine의 분해를 위하여 필수적이었으며 부가 탄소원이 없는 상태에서는 분해되지 않았다. Atrazine 과 simazine의 분해에서 부가 질소원의 효과에 대하여 조사하였다. Atrazine이나 simazine을 포함하는 생장배지에 부가 질소원이 첨가된 뱅야에서 배양기간동안 이들 제초제는 일부만 문해되었다. 그러나 부가 질소원이 첨가되지 않은 배양에서 atrazine과 simazine은 완전히 분해되지 않았다. 이 연구에서 효모추출물의 첨가는 atrazine과 simazine의 분해를 억제하였 다. TNT 분해세균은 작은 그람 음성의 간균이었다. BIOLOG system을 이용한 생리학적 분 석으로 이 균주는 Stenotrophomonas maltophilia로 동정되었다.

• 생명과학회지
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• 제13권4호
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• pp.535-540
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• 2003

최근 발효식품의 건강학적 활용면에 관한 연구는 활발히 진행되고 있다. 또한 발효식품 중에 가장 중요한 간장 발효미생물의 건강제품의 활용에 대해서 많은 연구가 진행되었다. 재래식 간장에 관한 연구결과로 항암작용, 노화지연, 호르몬 분비 촉진 등이 보고되고 있으나, 구강질환 원인균에 대한 방제효과가 있는가에 관한 연구는 거의 이루어지지 않고 있는 실정이다. 본 연구는 치아우식 등 구강질환 원인균인 Streptococcus sanguis, S. salivarius, S. mutans들의 성장을 억제하는 방제균을 선발하고 이들을 동정하기 위해 시행되었다. 우선 25종의 간장발효 균주를 분리하였고, 그 중 구강질환 방제력이 높은 2 균주(NG 06, NG 16)를 선별하였다. Bergey's manual of systematic bacteriology의 세균분류동정표에 의해 각종 동정에 필요한 배양학적, 형태학적, 생화학적 특성을 시험한 결과와 $Biolog^{(R)}$사의 세균동정시스템(MicroLogTM 3)을 이용하여 검정 실험한 결과 NG 06은 Bacillus racemilacticus로 NG 16은 Bacillus amyloliquefaciens으로 최종 확인, 동정되었다(Table 3). 앞으로 이 균들이 생산해내는 항균물질의 길항 기작에 관한 연구와 그 효능을 검증하고자 하며 그 항균물질 효과생산 최적조건에 대한 연구를 수행할 계획이다. 나아가 세치제 및 구강위생용품으로 활용면에 관한 연구를 확대하고자 한다.

• Journal of Microbiology
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• 제40권1호
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• pp.38-42
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• 2002

The strain KKI isolated from soil contaminated with polycyclic aromatic hydrocarbons was identified as Pseundomonas sp. based on analyses by MIDI and Biolog Identification System. Cellular and physiological responses of strain KKI to two-ring polycyclic aromatic hydrocarbon, naphthalene were evaluated using radiorespirometry, PLFAs and sequence analysis of Rieske-type iron sulfur center of dioxygenase. KKI was found to be able to rapidly mineralize naphthalene. Notably, KKI cells pregrown on phenanthrene were able to mineralize naphthalene much more rapidly than naphthalenepregrown cells. The total cellular fatty acids of KKI were comprised of eleven C-even and two C-odd fatty acids (fatty acids < 0.2% in abundance were not considered in this calculation). Lipids 12:0 2OH, 12:03 OH, 16:0, 18:1 6c, 18:0 increased for naphthalene-exposed cells, while lipids 18:1 7c1/15:0 ism 2OH, 17:0 cyclo, 18:1 7c, 19:0 cyclo decreased. Data from Northern hybridization using a naphthalene dixoygenase gene fragment cloned out from KKI as a probe provided the information that naphthalene dioxygenase gene was more highly expressed in cells grown on phenanthrene than naphthalene.

• 환경생물
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• 제18권4호
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• pp.441-446
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• 2000

Trichoderma harzianum is an aggressive causal agent of green mold disease on mushroom cultivation. Some bacterial strains isolated, from oyster mushroom compost in Wonju, were found to have in vitro antifungal activity against Trichoderma harzianum ATCC 6385, 6504, and our isolates Trichoderma spp. Y and G. Further in vitro antifungal studies on several strains of phytopathogenic fungi showed that all of 12 phytopathogenic fungal strains were significantly inhibited by the isolated antifungal bacteria in Petri dishes. Of these, KATB 99121 showed the broadest inhibiting effect and displayed as negative coagulase, negative sulfide production and rod shape. KATB 99121 was resistant to ampicillin, chlorampenicol, and kanamycin. Identification of isolates was determined by Biolog GN system, and KATB 99121 was identified as Photobacterium logei because of 96 probability, 0.65 similarity, and 4.97 disturbance. With electron microscopy, thin section of KATB 99121 strain revealed typical rod-like shaped cell (0.6-0.8${\mu}{\textrm}{m}$$\times$1.5-2.0${\mu}{\textrm}{m}$) with prokaryotic structure and organization.