Backcross breeding is the method most commonly used to introgress new traits into elite lines. Conventional backcross breeding requires at least 4-5 generations to recover the genomic background of the recurrent parent. Marker-assisted backcrossing (MABC) represents a new breeding approach that can substantially reduce breeding time and cost. For successful MABC, highly polymorphic markers with known positions in each chromosome are essential. Single nucleotide polymorphism (SNP) markers have many advantages over other marker systems for MABC due to their high abundance and amenability to genotyping automation. To facilitate MABC in hot pepper (Capsicum annuum), we utilized expressed sequence tags (ESTs) to develop SNP markers in this study. For SNP identification, we used Bukang $F_1$-hybrid pepper ESTs to prepare a reference sequence through de novo assembly. We performed large-scale transcriptome sequencing of eight accessions using the Illumina Genome Analyzer (IGA) IIx platform by Solexa, which generated small sequence fragments of about 90-100 bp. By aligning each contig to the reference sequence, 58,151 SNPs were identified. After filtering for polymorphism, segregation ratio, and lack of proximity to other SNPS or exon/intron boundaries, a total of 1,910 putative SNPs were chosen and positioned to a pepper linkage map. We further selected 412 SNPs evenly distributed on each chromosome and primers were designed for high throughput SNP assays and tested using a genetic diversity panel of 27 Capsicum accessions. The SNP markers clearly distinguished each accession. These results suggest that the SNP marker set developed in this study will be valuable for MABC, genetic mapping, and comparative genome analysis.
Proceedings of the Korean Institute of Building Construction Conference
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2016.05a
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pp.87-88
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2016
In order to assess the design value of engineering work from the point of view of LCC (Life Cycle Cost) in Korea, it is mandatory for all construction works that the total construction costs are over 10 billion won. The LCC includes initial construction costs, maintenance & operation costs, energy costs, end-of-life costs, and so on. Among these, the portion for maintenance & operation costs for a building is sizeable, as compared to the initial construction costs. Furthermore, the paradigm for construction industry has rapidly shifted from 2D to BIM, which includes design planning and data management. However, the study of BIM-based LCC analysis is not adequate today, even though all domestic construction projects ordered by the Public Procurement Service have to adopt BIM. Therefore, this study suggests a methodology of BIM-based LCC analysis that is particularly focused on repair and replacement (R&R) cost. For this purpose, we defined requirements of calculating R&R cost and extracted X from the relevant IFC data. Thereafter, we input them to the ontology of calculating the initial construction costs to obtain an objective output. Finally, in order to automatically calculate R&R cost, mapping with R&R criteria was performed. We expect that our methodology will contribute to more efficiently calculate R&R cost and, furthermore, that this methodology will be applicable to all range of total LCC. Thus, the proposed process of automatic BIM-based LCC analysis will contribute to making LCC analysis more fast and accurate than it is at present.
This study evaluated a novel method of defining the automatic flight path of unmanned aerial vehicles (UAVs) for search and rescue missions in a VR environment. The developed VR content reserves miniature digital twins of a building in the fire and a steep mountain terrain site. The users drow the UAV's scanning path using hand gestures on the surface of digital twins, and then the UAV make an automatic flight along the defined path. According to human-in-the-loop simulation tests comparing the novel method with a conventional manual flight task with 19 participants, the novel method did not improve the mission performance but participants felt a lower mental workload. The designer may need to consider the automation support on the vulnerable points of the SAR mission environment while maintaining experts' mapping capability.
International conference on construction engineering and project management
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2024.07a
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pp.1294-1294
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2024
Flood risk maps are used in urban flooding to understand the spatial extent and depth of inundation damage. To construct these maps, hydrodynamic modeling capable of simulating flood waves is necessary. Flood waves are typically fast, and inundation patterns can significantly vary depending on the terrain, making it essential to accurately represent the terrain of the flood source in flood wave analysis. Recently, methods using UAVs for terrain data construction through Structure-from-Motion or LiDAR have been utilized. These methods are crucial for UAV operations, and thus, still require a lot of time and manpower, and are limited when UAV operations are not possible. Therefore, for efficient nationwide monitoring, this study developed a model that can automatically generate terrain data by estimating depth information from a single image using c-GAN (Conditional Generative Adversarial Networks) and BBDM (Brownian Bridge Diffusion Model). The training, utilization, and validation datasets employed images from the ISPRS (2018) and directly aerial photographed image sets from five locations in the territory of the Republic of Korea. Compared to the ground truth of the test data set, it is considered sufficiently usable as terrain data for flood wave analysis, capable of generating highly accurate and precise terrain data with high reproducibility.
Due to the transformation to the intelligent information society, the rapid change of our life and environment is expected. The Ministry of Science and ICT (MSIT) and the National Research Council of Science and Technology (NST) introduced a five-year government supported research institution's planning and evaluation based on the mid-to long-term perspective. This study collects international benchmarking information including industry, academia, and research fields by collecting mid- and long-term strategy reports from public research institutes, surveys by experts from abroad universities and research institutes, and analyzing overseas market information reports. The British Geological Survey (BGS), the U.S. Geological Survey (USGS) and the japanese geological survey related institutes (AIST-GSJ) plans for three-dimensional national geological information, predictions of geological environmental disasters, and development of important metals and material in the low carbon economic transformation and in the era of the Fourth Industrial Revolution. The mid- and long-term program emphasizes basic and public research on geological information through abroad experts survey such as the IPGP-CNRS etc. The market analysis of the mining automation and digital map sectors has been able to derive the fields in which the role of public research institutes by the market is expected such as data collection on land and in the air, mobile or three-dimensional information production, smooth/fast/real-time maps, custom map design, mapping support to various platforms, geological environmental risk assessment and disaster management information and maps.
Journal of the Korean Society for information Management
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v.27
no.4
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pp.33-47
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2010
The growth of IT technology and the popularity of network based information sharing increase the number of digital contents in military area. Thus, there arise issues of finding suitable public information with the growing number of long-term preservation of digital public information. According to the source of raw data and the time of compilation may be variable and there can be existed in many correlations about digital contents. The business service ontology makes knowledge explicit and allows for knowledge sharing among information provider and information consumer for public digital archive engaged in improving the searching ability of digital public information. The business service ontology is at the interface as a bridge between information provider and information consumer. However, according to the difficulty of semantic knowledge extraction for the business process analysis, it is hard to realize the automation of constructing business service ontology for mapping from unformed activities to a unit of business service. To solve the problem, we propose a new business service auto-acquisition method for the first step of constructing a business service ontology based on Enterprise Architecture.
After introducing the industry 4.0 policy, Korean government announced 'Digital New Deal' and 'Green New Deal' as 'Korean New Deal' in 2020. We analyzed Korea Institute of Geoscience and Mineral Resources (KIGAM)'s research projects related to that policy and conducted markets analysis focused on Digital Twin and environmental monitoring technologies. Regarding 'Data Dam' policy, we suggested the digital geo-contents with Augmented Reality (AR) & Virtual Reality (VR) and the public geo-data collection & sharing system. It is necessary to expand and support the smart mining and digital oil fields research for '5th generation mobile communication (5G) and artificial intelligence (AI) convergence into all industries' policy. Korean government is suggesting downtown 3D maps for 'Digital Twin' policy. KIGAM can provide 3D geological maps and Internet of Things (IoT) systems for social overhead capital (SOC) management. 'Green New Deal' proposed developing technologies for green industries including resource circulation, Carbon Capture Utilization and Storage (CCUS), and electric & hydrogen vehicles. KIGAM has carried out related research projects and currently conducts research on domestic energy storage minerals. Oil and gas industries are presented as representative applications of digital twin. Many progress is made in mining automation and digital mapping and Digital Twin Earth (DTE) is a emerging research subject. The emerging research subjects are deeply related to data analysis, simulation, AI, and the IoT, therefore KIGAM should collaborate with sensors and computing software & system companies.
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