• Title/Summary/Keyword: Aspartic Enzymes

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Aspartic proteases of Plasmodium vivax are highly conserved in wild isolates

  • Na, Byoung-Kuk;Lee, Eung-Goo;Lee, Hyeong-Woo;Cho, Shin-Hyeong;Bae, Young-An;Kong, Yoon;Lee, Jong-Koo;Kim, Tong-Soo
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제42권2호
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    • pp.61-66
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    • 2004
  • The plasmepsins are the aspartic proteases of malaria parasites. Treatment of aspartic protease inhibitor inhibits hemoglobin hydrolysis and blocks the parasite development in vitro suggesting that these proteases might be exploited their potentials as antimalarial drug targets. In this study, we determined the genetic variations of the aspartic proteases of Plasmodium vivax (PvPMs) of wild isolates. Two plasmepsins (PvPM4 and PvPM5) were cloned and sequenced from 20 P. vivax Korean isolates and two imported isolates. The sequences of the enzymes were highly conserved except a small number of amino acid substitutions did not modify key residues for the function or the structure of the enzymes. The high sequence conservations between the plasmepsins from the isolates support the notion that the enzymes could be reliable targets for new antimalarial chemotherapeutics.

Type I 신호펩디드 가수분해효소에 존재하는 D99 아미노산 잔기의 구조적 역할 가능성 (D99 Type I Signal Peptidase Implicated Stabilizing the Protein Structure)

  • Sung, Meesook;Eunyoung Han;Lee, Hoyoung
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.140-144
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    • 2003
  • 신호펩디드 가수분해는 모든 생물에 필수적인 단백질로 N-말단에 신호서열을 가진 단백질들의 신호서열을 잘라내는 효소로 serine과 lysine을 활성부위로 하는 특이한 dyad serine 효소류로 알려져있다. 최근에 신호펩디드 가수분해효소의 특성으로 새로운 항생제 이용 가능성 때문에 그 활성 메카니즘의 연구가 중요시되고 있다. 본 연구는 E. coli 신호펩디드 효소가 serine/lysine/aspartic acid로 하는 전형적인 triad serine 효소류의 메카니즘을 갖는다는 가정하에 Type Ⅰ 신호펩디드류의 하나인 E. coli에서 aspartic acid 99을 alanine으로 치환하여 효소의 enzymatic activity를 조사하였다. 그 결과 D99잔기는 E. coli Type Ⅰ 신호펩디드 효소의 활성메카니즘에 직접적으로 관여한다기보다는 그 효소를 구조적으로 안정화하는데 중요한 역할을 할 가능성이 있는 것으로 암시되어진다.

Purification and characterization of a trypsin inhibitor from egg of skipjack tuna, Katsuwonus pelamis

  • Kim, Se-Kwon;Park, Joung-Ho;Je, Jae-Young
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.148-149
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    • 2001
  • Protein inhibitors are proteins or peptides capable of inhibiting catalytic activities of proteolytic enzymes. They are grouped primarily as either serine, cysteine, aspartic or metallto-proteinase inhibitors. Pretense inhibitors have been hewn since the end of the last century in nematodes and human blood serum, and their ubiquitous distribution in microorganisms, animals and plants has been widely documented. (omitted)

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Nicotinic acid 결핍이 메추리 혈청의 여러 대사물질 수준에 미치는 효과 (Effects of Nicotinic Acid Deficiency on the Levels of Various Metabolites in the Serum of Quail)

  • 이재혁;박인국
    • 한국동물학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.203-208
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    • 1991
  • Nicotinic acid 결핍시 메추리는 심각한 체중의 감소를 보였으며, 심장 및 간의 무게도 약간 감소하였다. 포도당의 농도는 현저하게 증가하였으나 콜레스테롤, 알부민 그리고 총 단백질 양의 변화는 없었다. Glutamic oxaloacetate iransaminase 와 glutamic pyruvate transaminase의 활성은 증가하였으나 alkaline phosphatase와 LDH의 활성은 변화가 없었다. 혈청속의 아미노산중 tryptophan, tyrosine, aspartic acid, glutamic acid 등의 농도는 감소하였으나, arginine, histidine, lysine 등은 변화가 없었다.

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5-아미노살리실산의 결장표적성 프로드럭 : 5-아미노살리실-L-글루타민산과 5-아미노살리실-L-아스파틸산의 합성 및 성상 (Synthesis and Properties of 5-Aminosalicyl-L-Aspartic Acid and 5-Aminosalicyl-L-glutamic Acid as Colon-Specific Prodrugs of 5-Aminosalicylic Acid)

  • 정연진;이정수;김학현;김영미;김대덕;한석규
    • 약학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.5-11
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    • 1998
  • 5-Aminosalicyl-L-aspartic acid (5-ASA-Asp) and 5-aminosalicyl-L-glutamic acid (5-ASA-Glu) were synthesized as new colon-specific prodrugs of 5-aminosalicylic acid (5-ASA), their apparent partition coefficients, and the extent of conversion in the homogenates of tissue and contents of various G.I. Tract segments of rats were evaluated. These prodrugs were stable in the homogenate of tissue and contents of stomach, proximal small intestine (PSI) or distal small intestine (DSI). Release of 5-ASA from 5-ASA-Asp after incubation with the cecal and colonic contents for 8hrs at $37^{\circ}C$ was 18%, and 8%, respectively. No significant conversion of prodrug was observed in the cecal and colonic contents of rats pretreated with kanamycin sulfate, which indicated that microbial enzymes were responsible for the cleavage of these prodrugs.

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Purification and Characterization of Trypsins Affecting on the Autolysis of Shrimp, Penaeus japonicus

  • KIM Hyeung-Rak;KIM Doo-Sang;AHN Chang-Bum;PYEUN Jae-Hyeung
    • 한국수산과학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.797-804
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    • 1996
  • Two trypsins were purified from shrimp hepatopancreas through ammonium sulfate fractionation, Q-Sepharose ionic exchange, benzamidine Sepharose-6B affinity, and Sephacryl S-300 gel chromatography. Both enzymes had a single polypeptide chain with a molecular weight (M.W.) of 32 kDa by sodium dodecylsulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SOS-PAGE), although trypsin A and B were estimated to be a molecular weight of 27.2 and 22.8 kDa, respectively, using Sephacryl S-300 gel filtration. Both trypsins had similar amino acid compositions and rich in glycine, valine, alanine, aspartic acid, and glutamic acid, but low in methionine and basic amino acids. Both enzymes were completely inactivated by soybean trypsin inhibitor (SBTI), phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), tosyl-L-lysine chloromethyl ketone (TLCK), benzamidine, leupeptin, however, not affected by tosyl-L-phenylalanine chloromethyl ketone (TPCK) and pepstatin.

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Krill solube의 가공 및 아미노산 조성 (PROCESSING OF DRILL SOLUBLE AND ITS AMINO ACID COMPOSITION)

  • 이응호;김세권;조덕재;한봉호
    • 한국수산과학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.235-240
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    • 1979
  • krill을 식용화하기 위한 한 방법으로서 paste상 및 분말상의 krill soluble을 가공하고 제품의 구성아미노산 및 유리아미노 리의 조성을 검토하였다. 생동결 krill, 자가소화 및 $0.2\%$의 pronase-p의 첨가후의 가수분해에 의한 paste상과 분말상의 krill solube의 구성아미노산 중에는 glutamic acid, lysinge 및 aspartic acid가 가장 많았으며, cystine과 histidine이 가장 적었다. 생동결 krill의 유리아미노산중에는 lysine, arginine, proline, glycine, alanine 및 leucine이 가장 많았으며, cystine과 histidine 그리고 구성아미노산에서 그 함량이 많던 glutamic acid와 aspartic acid가 가장 적었다. 자가소화에 의한 paste상의 krill soluble의 유리아미노산에서는 생동결 krill에서 보다 glutamin acid, serine threonine, isoleucine, aspartic acid, valine 등의 량이 많아졌으며, 특히 glutamic acid는 거의 40배정도로 증가하였다. 전체적으로는 lysine, leucine, threonine 및 alanine 등이 많았으며 cystine, aspartic acid 및 histidine의 량이 적었다. $0.2\%$의 pronase-p를 첨가하여 가수분해한 paste상의 krill soluble 유리아미노산에는 aspartic acid와 glutamic acid이 량이 자가소화시보다 월등히 큰 증가폭을 보였으며 전체적으로는 lysine, leucine, arginine, alanine 및 proline이 많았으며 cystine, histidine, serine 등의 량이 적었다. 생동결 krill 및 drill soluble의 필수아미노산은 함량면에서 달걀과 비교하여 손색이 없었다.

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혈합육어(멸치, 고등어, 황다랭이 및 날개다랭이)의 Trypsin 1. 정제와 반응조건 (Trypsins from the Dark Fleshed Fish(Anchovy, Mackerel, Yellowfin Tuna and Albacore) 1. Purification and Optimal Reaction Conditions)

  • 변재형;조득문;허민수
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.448-457
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    • 1993
  • 혈합육어 중 연근해 온대산 멸치의 내장과 고등어의 유문수, 그리고 원양 열대산 황다랭이 및 날개다랭이의 유문수를 각각 시료로 하여 trypsin을 분리 정제하였으며, 그 분자량과 아미노산 조성 및 효소의 반응 최적조건에 관하여 비교 분석하였다. 실험결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 멸치의 내장과 고등어, 황다랭이 및 날개다랭이의 유문수에서 각각 황산암모늄염석, benzamidine-Sepharose 6B 친화성 크로마토그래피, DEAE-Sephadex A-50 크로마토그래피, Sephadex G-75 겔 여과 크로마토그래피 등의 방법을 혼용하여 고등어로부터는 2종의 trypsin (고등어 trypsin A와 고등어 trypsin B로 명명함)을, 그리고 다른 어류로부터는 각각 1종의 trypsin을 분리 정제하였다. 2. 멸치 trypsin과 고등어 trypsin B는 고등어 trypsin A와 황다랭이 trypsin 및 날개다랭이 trypsin에 비하여 그 고유활성이 월등히 높았다. 3. 이들 혈합육어 trypsin의 분자량은 22kDa-26kDa 범위였다. 4. 이들 trypsin은 공통적으로 glycine, serine, aspartic acid를 많이 함유하고 있었으며, tryptophan, methionine, lysine, tyrosine의 함유량은 적었다. 5. BA-$\rho$-NA기질에 대한 반응 최적조건은 멸치 trypsin은 pH 8.0에서 45$^{\circ}C$, 고등어 trypsin A와 B는 pH 8.0에서 5$0^{\circ}C$, 그리고 황다랭이 trypsin은 PH 9.0에서 55$^{\circ}C$, 날개다랭이 trypsin은 pH 9.0에서 5$0^{\circ}C$였다. 6. 위에 든 실험 결과들은 혈합육 어류의 서식온도가 이들 어류의 trypsin의 반응 최적 온도와는 어느 정도 관계가 있을 것으로 추측되었다.

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Partial Characterization of Two Cathepsin D Family Aspartic Peptidases of Clonorchis sinensis

  • Kang, Jung-Mi;Yoo, Won-Gi;Le, Huong Giang;Thai, Thi Lam;Hong, Sung-Jong;Sohn, Woon-Mok;Na, Byoung-Kuk
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제57권6호
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    • pp.671-680
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    • 2019
  • Cathepsin D (CatD, EC 3.4.23.5) is a member belonging to the subfamily of aspartic endopeptidases, which are classified into the MEROPS clan AA, family A1. Helminth parasites express a large set of different peptidases that play pivotal roles in parasite biology and pathophysiology. However, CatD is less well known than the other classes of peptidases in terms of biochemical properties and biological functions. In this study, we identified 2 novel CatDs (CsCatD1 and CsCatD2) of Clonorchis sinensis and partially characterized their properties. Both CsCatDs represent typical enzymes sharing amino acid residues and motifs that are tightly conserved in the CatD superfamily of proteins. Both CsCatDs showed similar patterns of expression in different developmental stages of C. sinensis, but CsCatD2 was also expressed in metacercariae. CsCatD2 was mainly expressed in the intestines and eggs of C. sinensis. Sera obtained from rats experimentally infected with C. sinensis reacted with recombinant CsCatD2 beginning 2 weeks after infection and the antibody titers were gradually increased by maturation of the parasite. Structural analysis of CsCatD2 revealed a bilobed enzyme structure consisting of 2 antiparallel β-sheet domains packed against each other forming a homodimeric structure. These results suggested a plausible biological role of CsCatD2 in the nutrition and reproduction of parasite and its potential utility as a serodiagnostic antigen in clonorchiasis.