Park, Sung-Jin;Lee, Na-Young;Kim, Wha-Jung;Ghim, Sa-Youl
Microbiology and Biotechnology Letters
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v.38
no.2
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pp.216-221
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2010
This study shows an application of microbiologically induced carbonate precipitate for strength improvement and crack remediation of cement-sand mortar. Seven calcium carbonate-forming bacteria (CFB) were isolated from Dok-do and partially identified by DNA sequence analysis of the 16s rRNA gene. Crystal aggregates were apparent around the bacterial colonies grown on an agar medium. These strains showed strain specific $CaCO_3$ precipitation on urea-$CaCl_2$ medium. Among 7 isolates, Arthrobacter nicotinovorans KNUC601, Microbacterium resistens KNUC602, Agrobacterium tumefaciens KNUC603, Exiguobacterium acetylicum KNUC604, and Bacillus thuringiensis KNUC606 showed a repairing of artificial forced cracks in cement-sand mortar. Compressive strength of cement-sand mortar consolidated with Stenotrophomonas maltophilia KNUC605 was increased around 14.07% compared with that of negative control.
Oh, Hong Rock;Aizono, Yasuo;Shimoda, Tadahisa;Masaru, Funatsu
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.12
no.4
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pp.387-394
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1983
The factor, which was capable of accelerating the yeast cell wall lysis of the zymolyase(${\beta}-1$, 3-glucanase), was purified to a homogeneous state from the protease fraction of the crude zymolyase by Sephadex G-75 gel filtration and preparative polyacrylamide gel disc electrophoresis. The molecular weight of the purified factor was estimated to be 40,500 by SDS-polylacrylamide gel disc electrophoresis and it's iso-electric point was pH 9.6. The factor was found to be a basic protease consisted of single polypeptide chain with 395 amino acid residues and it showed the $E_{280,cm}^{1%}$ of 11.9 and the molecular extinction coefficient of $4.83{\times}10^4$, respectively.
For the effective production of functional oligosaccharides(DP 3-5) from inulin in chicory extracts, the acid hydrolysis and enzymatic endo-inulinase reaction were compared. Acid hydrolysis was unfavorable ; the content of oligosacharides in total sugar increased to 26.0% for 12 min at $55^{\circ}C$ and 24.6% at 6 min at $65^{\circ}C$ and showed little change for 30 min. The content of high DP(DP 6) decreased from 83.5 to 49.5% and 23.0% for 30 min, repectively. Glucose, fructose and sucrose increased to 24.6% and 50.3%, respectively. Hydrolysis of chicory extracts with purified endo-inulinase from Arthrobacter sp. S37 was carried out at $40^{\circ}C$ and pH 7.5 for 44 hrs. The content of high DP($DP{\geq}6$) in total sugar decreased from 83.5 to 23.0% and that of inulobiose(F2) and DP 3-5 increased to 66.1%. Glucose, fructose and sucrose were not produced. The hydrolysis of chicory extracts without DP 1 and DP 2 with crude or with purified enzyme were also carried out. In contrast to the hydrolysate of crude enzyme, that of purified endo-inulinase did not contain glucose, fructose, sucrose, F2 and 1-kestose(GF2). The content of oligosaccharides in the hydrolysate of the purified endo-inulinase were 79.2%, composed mainly of inulotriose(F3), inulotetraose(F4) and inulopentaose(F5), which shows that the enzymatic hydrolysis using purified endo-inulinase from Arthrobacter sp. S37 is the best method for oligosaccharides production from inulin in chicory extracts.
Park, Kap-Joo;Lee, Byeong-Chol;Lee, Jae-Seok;Park, Chan-Sun;Cho, Myung-Hwan
Korean Journal of Environmental Biology
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v.29
no.1
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pp.52-60
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2011
Today, the weather is changing continually, due to the progress of global warming. As the weather changes, the habitats of different organisms will change as well. It cannot be predicted whether or not the weather will change with each passing day. In particular, the biological distribution of the areas climate change affects constitutes a major factor in determining the natural state of indigenous plants; additionally, plants are constantly exposed to rhizospheric microorganisms, which are bound to be sensitive to these changes. Interest has grown in the relationship between plants and rhizopheric microorganisms. As a result of this interest we elected to research and experiment further. We researched the dominant changes that occur between plants and rhizospheric organisms due to global warming. First, we used temperature as a variable. We employed four different temperatures and four different sites: room temperature ($27^{\circ}C$), $+2^{\circ}C$, $+4^{\circ}C$, and $+6^{\circ}C$. The four different sites we used were populated by the following species: Pinus deniflora, Pinus koraiensis, Quercus acutissima, and Alnus japonica. We counted colonies of these plants and divided them. Then, using 16S rRNA analysis we identified the microorganisms. In conclusion, we identified the following genera, which were as follows: 10 species of Bacillus, 2 Enterobacter species, 4 Pseudomonas species, 1 Arthrobacter species, 1 Chryseobacterium species, and 1 Rhodococcus species. Among these genera, the dominant species in Pinus deniflora was discovered in the same genus, but a different species dominated at $33^{\circ}C$. Additionally, that of Pinus koraiensis changed in both genus and species which changed into the Chryseobacrterium genus from the Bacilus genus at $33^{\circ}C$.
To detect proper lytic assay conditions of the crude zumolyase from Arthrobacter luteus, effets of the various factors involved in the lytic system of Sacchromyces sake cultured with shaking in the malt extracts medium were investigated. The results are summarized as follows : 1. The susceptibilities of viable cells of S. sake from logarithmic growth phase to the lytic enzmye were much greater than those of the cells in lag and stationary phases. The cells cultured for 18 hr were the most susceptible to the enzyme. 2. Lytic activity of the enzyme toward the viable cells of S. sake was very low. It was, however, enhanced 4 folds of more by the pretreatment of the cells with 0.05 M sodium sulfite. 3. Lytic activity of the enzyme toward commercial baker's yeast cells was negligible, and the effect of sodium sulfite on the lysis of the cells also was nothing but a little. 4. The lyophilized cells of the baker's yeast showed more susceptibility to the lytic enzyme than viable cells of the yeast. No definite effect of sodium sulfite on the lysis of the lyophilized cells, however, was observed either baker's yeast of S. sake. 5. It appeared that the relationship between the reaction rate and the enzyme concentration on the lysis of the yeast cell walls followed enzyme kinetic theory, but one between the reaction rate and concentration of the yeast cells as substrates showed different pattern from that in enzyme kinetic theory. 6. After the preparation of crude zymolyase was kept at $7^[\circ}C$ for 10 days in the 0.05 M phosphate buffer, pH 7.5, the remainning lytic activity was about 80 %.
A microbial product composed of three antagonistic fungal isolates (Aspergillus sp., Penicillium sp. and Trichoderma sp.) and three bacterial isolates (Arthrobacter sp., Bacillus sp., and Pseudomonas sp.) was tested for the control of Pythium blight caused by Pythium sp., brown patch by Rhizoctonia solani (anastomosis group(AG) 1-1) and large patch by R. solani (AG 2-2) of turfgrasses. Cultures of the antagonistic fungi and bacteria varied in the effectiveness in reducing disease severity of Pytium blight and brown patch on bentgrass. The antagonistic fungal and bacterial isolates were mixed and cultured at 20-$25^{\circ}C$ for 3 days in a growth medium, and the diluted solution of the microbial culture was applied under the field conditions after inoculation of the above turfgrass pathogens. The treated turfgrass was incubated at 28$^{\circ}C$ in a growth chamber. In this experiment, Pythium blight was almost completely controlled and brown patch was slightly decreased by the microbial product, while no control was observed in large patch of zoysiagrass. In zoysiagrass treated with the microbial culture, thatch accumulation was notably reduced.
Streptomyces cattleya is a producer of carbapenem antibiotics, thienamycin and N-acetylthienamycin, which have potent and broad-spectrum antibacterial activities. We stud ied on strain improvement for antibiotic productivity of S. cattleya by transformation technique which employed S.cattleya protoplasts and chromosomal DNAs of glutamic acid producers: Corynebacterium glutamicum and Arthrobacter simplex. 150 Transformant strains were cultured and bioassayed using Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus as test organisms. 8.7% of transformants tested showed 1.4~2.6 fold higher productivities than wild type which produced $1.61{\pm}0.67{\mu}g/ml$. The best transformant produced $8.36{\pm}2.84{\mu}g/ml$ carbapenems.
Several soil bacteria were found to degrade N-Acylhomoserine lactones (NAHLs), thereby interfering with the bacterial quorum sensing system. In this research, fifteen strains of NAHL degrading rhizobacteria were isolated from potato rhizosphere. Based on phenotypic characteristics and 16S rDNA sequence analyses, the strains were identified as members of genera Bacillus, Streptomyces, Arthrobacter, Pseudomonas and Mesorhizobium. All tested isolates were capable to degrade both synthetic and natural NAHL produced by Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc) strain EMPCC. In quorum quenching experiments selected isolates, especially Mesorhizobium sp., were markedly reduced the pathogenicity of Pcc strain EMPCC in potato tubers and totally suppressed tissue maceration on potato tubers. These led to consider the latter as a useful biocontrol agent against Pectobacterium spp.
Two isolated strains, Comamonas testosteroni CPW301 and Arthrobacter ureafaciens CPR706, were able to use 4-chlorophenol (4-CP) as a sole carbon and energy source. CPW301 was found to degrade 4-CP via a meta-cleavage pathway in which the chloro-substituent was eliminated even when 4-chlorocatechol was cleaved by the catechol 2, 3-dioxygenase. In contrast, CPR706 removed chloride from 4-CP prior to the ring-fission reaction, producing hydroquinone as a transient intermediate during 4-CP degradation. CPR706 exhibited much higher tolerance for 4-CP than CPW301, which was indicated by the maximum degradable concentration and degradation rate.
A bacterial consortium capable of utilizing a variety of polycyclic aromatic hydrocarbons has been isolated from a former manufactured gas plant site. The consortium consisted of four members including Arthrobacter sp., Burkholderia sp., Ochrobacterium sp., and Alcaligenes sp., which were identified and characterized by the patterns of fatty acid methyl esters (FAME analysis) and carbon source utilization (BIOLOG system). With the individual members, the biodegradation characteristics of aromatic hydrocarbons depending on different growth substrates were determined. FAME analyses demonstrated that microbial fatty acid profiles changed to significant extents in response to different carbon sources, and hence, such shift profiles may be informative to characterize the biodegradation potential of a bacterium or microbial community.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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