Pseudomonas sp. strain SY5 is a PCB-degrading bacterium [24] that includes two different enzymes (BphC1 and BphC2) encoding 2,3-dihdroxybiphenyl 1,2-dioxygenase and BphD encoding 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase. The bphC1 and bphC2 genes were found to consist of 897 based encoding 299 amino acids and 882 bases encoding 294 amino acids, respectively, whereas the bphD gene consisted of 861 bases encoding 287 amino acids. According to a homology search, a 50% and 39% similarity between the bphC1 and bphC2 genes at the nucleotide and amino acid level was shown, respectively. The bphC1 gene showed a 38% and 45% similarity at the amino acid level to Alcaligenes eutrophus A5 and Rhodococcus rhodochrous, respectively, whereas, bphC2 showed a 95% and 43% similarity, respectively. A comparison of the deduced amino acid sequence of the bphD product of Pseudomonas sp. SY5 with that of A. eutrophus A5, Pseudomons sp. KKS102, and LB400 showed a sequence identity of 92, 92, and 79%, respectively. Strain SY5 was originally isolated from municipal sewage containing recalcitrant organic compounds an found to have a high degradability of various aromatic compounds [23]. The current study found that strain SY5 had two extradiol-type dioxygenases, which did not hybridize with each other as they had a low similarity, yet a similar structure of evolutionarily conserved amino acids residues for catalytic activity between BphC1 and BphC2 was observed.
키조개 부산물로 부터 향미제로 응용하기 위하여 제조한 가수분해물의 유리아미노산 및 휘발성 향기성분을 분석한 결과, 유리아미노산의 경우 가수분해물이 생시료에 비해 3배 이상 증가하였으며 taurine의 함량이 가장 많았다. 그리고 생시료와 가수분해물의 휘발성 향기성분을 분석한 결과 총 109종의 화합물이 동정되었는데 이중에서 생시료는 88종, 가수분해물은 65종이 검출되었다. 그리고 이들은 주로 알데히드류(16종), 케톤류(17종), 알콜류(31종), 함질소화합물류(16종), 방향족화합물류(8종), 에스테르류(3종) 및 기타 화합물류(17종)으로 구성되어 있었다. 특히 생시료에서의 산화취 성분인 알데히드류 및 방향족화합물은 가수분해물에서 상당량 감소되었으며 반면에 고소한 향기성분인 heterocyclic 화합물이 상당량 검출되었다.
아미노산이 김치유산균에 미치는 영향을 검토하였다. 발효온도 $15^{\circ}C$에서 형태가 다른 집락을 73개 분리하였다. 이 중에서 69.9%가 덱스트란 생성균주이었으며, Leuconostoc 속이 4.1%, Lactobacillus 속이 65.8%를 차지하였다. Tyrosine 500 ppm이 되도록 첨가한 배지에서 분리균주의 생장은 완전히 억제되었다. 그러나 실제로 이 아미노산을 첨가하여 만든 김치에서 분리된 총 집락수는 58개 이었고, 이 중에서 덱스트란 생성균주가 70.7%로 큰 변동이 없었으나 대신에 Leuconostoc 속이 41.4%로 증가하였고, Lactobacillus 속은 29.3%로 감소하였다. 각 속에서 우점종은 Leu. mesenteroides와 Lac. minor이었다. 따라서 실제 김치에서 tyrosine은 Lactobacillus 속의 생장을 억제하는 효과가 있었다.
원유의 고갈, 반복되는 에너지 위기 및 지구온난화 문제에 기인하여 석유 대신 재생가능한 바이오매스를 사용하여 방향족 화학원료를 개발하는 연구가 광범위하게 진행되고 있다. 특히, 바이오테크놀로지를 이용한 포도당으로부터 방향족아미노산 생합성경로 중간대사체 및 그 유도체 합성기술은 벤젠유래 화합물을 포함한 많은 방향족 석유화학원료를 대체할 가능성이 있는 기술들이 개발되고 있다. 본 고는 미생물 대사공학, 생물전환, 화학공정 기술을 이용하여 hydroquinone, catechol, adipic acid, shikimic acid, gallic acid, pyrogallol, vanillin, p-hydroxycinnamic acid, p-hydroxystyrene, p-hydroxybenzoic acid, indigo, indole 3-acetic acid와 같은 방향족화합물을 어떻게 개발하고 있는지를 논하였다. 또한, 경쟁력있는 화이트바이오텍기반 방향족화합물 생산기술을 개발하기 위한 문제점 및 해결방안등을 논했다.
Luminol-$H_2O_2$-Cu(II) 시스템을 이용한 화학발광법을 사용하여 방향족 아미노산인 트립토판, 타이로신 및 페닐알라닌의 정량분석을 하였다. 세 종류의 방향족 아미노산(트립토판, 타이로신, 페닐알라닌)을 luminol-$H_2O_2$-Cu(II) 시스템에 첨가하였을 때 아미노산이 존재하지 않을 때보다 화학발광세기가 더욱 증가하는 현상을 관찰하였으며, 이러한 현상을 이용하여 각 방향족 아미노산을 정량분석 하였다. 방향족 아미노산의 최적분석 조건을 조사하기 위하여, Cu(II) 이온 촉매에 의한 루미놀과 과산화수소의 화학발광반응에 미치는 아미노산의 반응속도론적 영향을 조사하였고 과산화수소와 Cu(II) 이온의 농도 그리고 pH와 완충용액의 영향을 조사하였다. 루미놀 화학발광 시스템의 최적 분석조건 하에서 수용액 중의 방향족 아미노산 정량분석을 위해 얻은 검정곡선에서 직선성이 성립하는 농도 범위는 각각 트립토판은 $1.0{\times}10^{-6}{\sim}2.0{\times}10^{-5}\;M$, 타이로신은 $1.0{\times}10^{-6}{\sim}2.0{\times}10^{-5}\;M$ 그리고 페닐알라닌은 $2.0{\times}10^{-6}{\sim}2.0{\times}10^{-5}\;M$이었으며, 이 구간에서 각 아미노산에 대한 상대표준편차(n = 4)는 순차적으로 3.21%, 2.64% 그리고 2.48%이었다. 그리고 각 아미노산의 검출한계($3{\sigma}/s$)는 트립토판 $6.8{\times}10^{-7}\;M$, 타이로신 $5.7{\times}10^{-7}\;M$, 페닐알라닌 $9.6{\times}10^{-7}\;M$이었다.
We investigated the comparative physicochemical attributes, oxidative stability, and microbial characteristics of 28 days dry-aged meat in between boneless sirloin (gluteus medius) and bone-in T-bone steaks (infraspinatus) muscles from Korean Native Hanwoo Steer (KNHS). Results reveal that regardless of the muscles, dry-aging increased protein content and water-holding capacity (WHC) (p < 0.05). Meat from infraspinatus-aged muscle led to darker meat with higher pH values than un-aged meat (p < 0.05). However, fat content, CIE a*, and CIE b* remained unchanged in both muscles at aging. At aged meat, thiobarbituric acid reactive substances (TBARS) values from bone-in infraspinatus muscle was 2.5-fold higher than boneless gluteus medius muscle (p < 0.05). Dry-aging led to an increase in the contents of total unsaturated fatty acids (UFAs), monounsaturated fatty acids (MUFAs), and UFA/saturated fatty acids (SFA) in both muscles (p < 0.05). Furthermore, gluteus medius aged muscle concentrated with olic acid (C18:1) compared to infraspinatus aged muscle. Irrespective of the muscles, dry-aging enhanced the total free amino acids (FAAs) as well as tasty, and bitter amino acid contents whereas decreased the tasty/bitter amino acids (p < 0.05). Aromatic amino acid, tryptophan that converted to serotonin was 2-fold higher in boneless gluteus medius muscle than bone-in infraspinatus muscle at pre and post aging processes (p < 0.05). Aged Infraspinatus muscle increased total bacteria (p < 0.05) while no salmonella spp. was detected in both muscles. Taken together, our study confirms that 28 days dry-aging profiling the quality characteristics of boneless sirloin (gluteus medius) and bone-in T-bone steaks (infraspinatus) distinctly while gluteus medius aged steak performs better owing to oxidative stability and functional compounds than infraspinatus aged steak.
한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
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pp.29-30
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2006
The synthesis of dendritic dipeptides $(4-3,4-3,5)12G2-CH_{2}-Boc-_{L}-Tyr-X-OMe\;where\;X\;=\;Gly,\;_{L}-Val,\;_{L}-Leu,\;_{L}-Ile,\;_{L}-Phe$, and L-Pro will be discussed. Their self-assembly in bulk and in solution and the structural and retrostructural analysis of their periodic assemblies will be compared to that of the previously reported and currently reinvestigated dendritic dipeptide with $X=_{L}-Ala$. All dendritic dipeptides containing as X nonpolar ${\alpha}-amino$ acids self-assemble into helical porous columns. The principles via which the aliphatic and aromatic substituents of X program the structure of the helical pores indicate synthetic pathways to helical pores with bioinspired functions based on artificial nonpolar ${\alpha}-amino$ acids will be discussed.
Kim, Hye Ryun;Kim, Jae-Ho;Ahn, Byung Hak;Bai, Dong-Hoon
Mycobiology
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제42권4호
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pp.353-360
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2014
Makgeolli is a traditional Korean alcoholic beverage. The flavor of makgeolli is primarily determined by metabolic products such as free sugars, amino acids, organic acids, and aromatic compounds, which are produced during the fermentation of raw materials by molds and yeasts present in nuruk, a Korean fermentation starter. In this study, makgeolli was brewed using the wild yeast strain Saccharomyces cerevisiae Y98-5, and temporal changes in the metabolites during fermentation were analyzed by ultra-high-performance liquid chromatography-quadrupole-time-of-flight mass spectrometry. The resultant data were analyzed by partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA). Various metabolites, including amino acids, organic acids, sugar alcohols, small peptides, and nucleosides, were obviously altered by increasing the fermentation period. Changes in these metabolites allowed us to distinguish among makgeolli samples with different fermentation periods (1, 2, 3, 6, 7, and 8 days) on a PLS-DA score plot. In the makgeolli brewed in this study, the amounts of tyrosine ($463.13{\mu}g/mL$) and leucine ($362.77{\mu}g/mL$) were high. Therefore, our results indicate that monitoring the changes in metabolites during makgeolli fermentation might be important for brewing makgeolli with good nutritional quality.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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