• 한국식품과학회지
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• 제34권6호
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• pp.1134-1139
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• 2002

Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter는 분류학적으로 동일한 rRNA superfamily Ⅵ로 식중독 이외에도 위궤양, 위암, 유산 및 신경 장애를 유발한다. Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter를 오염된 식품 등에서 선택적으로 검출하기 위해 PCR, multiplex-PCR, RFLP(restriction fragment length polymorphism)의 기법을 이용하였다. Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter의 16S rRNA를 target으로 하는 CHA primer를 사용하여 동일한 PCR product의 검출할 수 있었다. C. jejuni와 C.coli를 A. butzleri와 H. pylori로부터 선택적으로 검출하기 위해 fla A gene을 target으로 하는 pg3, p50을 사용하였으며, A. butzleri는 23S rRNA를 target으로 하는 Arco2, Butz를 이용했다. 또한 H. pyloyi는 isocitrate dehydrogenase gene을 target으로 하는 icd1, icd2를 사용하였고, C. jejuni는 ceuE gene을 target으로 하는 JEJ1, JEJ2를 이용하여 효과적으로 분리검출이 이루어졌다. 또한 제한효소 Dde I 을 사용하여 PCR-RFLP를 통해 C. jejuni, C. coli를 A. butzleri, H. pylori로부터 분리할 수가 있었다. 따라서 이러한 primer를 이용하여 C. jejuni, C. coli, A. butzleri, H. pylori가 함께 오염되었을 때 각각 균주의 선택적인 검출이 가능할 것이다.

• 미생물학회지
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• 제32권1호
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• pp.7-11
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• 1994

미산소성 세균으로 알려진 질소고정균 Arcobacter nitrofigilis는 brucella 액체배지에서 호기적 생장의 특성을 나타내었다. 일반대기의 산소조건(21% $O_2$)하에서 최대생장의 특성을 보여주었다. 2% 이하의 산소조건하에서 산소 이외의 다른 최종산소수용체를 첨가하지 않은 액체배지에서 이 세균은 적은 정도의 생장을 나타내었다. 이 세균은 전자전달계 구성성분인 세포막에 함유되어 있는 cytochrome b 및 c, 그리고 용해성 cytochrome c를 가지고 있었다. 일반대기의 산소조건에서의 최대생장, 낮은 산소 농도하에서의 적은 정도의 생장 및 cytochrome c의 존재로 볼 때 이 세균은 미산소성 세균이나 통성혐기성 세균이 아니고, 호기성 세균임을 나타내주며, 또한 이 세균은 산소를 이용한 호픕에 의해 에너지를 얻음을 나타내준다.

• 한국식품과학회지
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• 제35권6호
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• pp.1169-1173
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• 2003

새롭게 출현한 식중독 세균으로 국내 유통 계육 등에 많이 오염이 되어 있는 Arcobacter butzleri를 제어하기 위해 여러 위생제 처리에 따른 생육영향을 평가하였다. 이들 균체에 1%농도의 유기산과 trisodium phosphate를 5, 10분간 처리한 결과 대부분이 10분 이내에 사멸한 것을 확인할 수 있었으며, 젖산의 경우는 5분 이내에 모든 균주가 사멸하였다. 배양할 때의 유기산의 농도별 생육영향은 1%의 농도로는 1시간 이내에, 0.1%의 농도에서 72시간 이내에 A. butzleri가 사멸한 것을 볼 수 있었으며, trisodium phosphate의 경우 2% 농도에서는 1 시간이내에 사멸하였다. 유기산 중에는 젖산의 생육저해효과가 가장 우수하게 나타났으며 hydrogen peroxide, sodium hypochlorite와 ethanol에 대한 사멸효과를 보았으나, 이 처리제는 효과가 나쁘거나 풍미에 영향을 주어 좋은 처리제라 할 수 없었다. 그리고 마늘과 양파즙에 대한 항미생물 작용에서 마늘에만 생육저해작용을 확인할 수 있었으며, 젖산균이 생산하는 유기산에 의한 낮은 pH에 의한 저해효과를 확인할 수 있었다. 따라서 계육 등의 육가공 및 취급 시에 유기산 및 TSP 등을 이용하여 주요 Arcobacter에 의한 식중독저해가 가능할 것으로 사료되었다.

• 한국축산식품학회지
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• 제32권2호
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• pp.204-211
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• 2012

본 연구에서는 Arcobacter spp. 중 사람에게 위장염을 가장 빈번하게 일으키며 전 세계적으로 식육에 가장 많이 오염되어 있는 A. butzleri에 대해 자외선과 에탄올의 살균 효과를 확인하고자 하였다. $3{\times}3cm^2$ 크기의 스테인리스스틸 표면과 돈육 샘플에 각각 8 ${\log}_{10}CFU$/mL의 A. butzleri를 $200{\mu}L$씩 접종한 후 254 nm 선량으로 108-648 mWs/$cm^2$의 자외선을 조사하였다. 또한 10, 35, 70%의 에탄올에 broth 상태의 A. butzleri와 A. butzleri를 접종한 돈육을 10-30분 간 침지시키거나 에어로졸 상태로 분무 시켰다. 스테인리스스틸 표면의 A. butzleri에 자외선 조사 시 A. butzleri는 모든 자외선 선량에서 유의적으로 감소하였으나 돈육에 오염된 A. butzleri는 유의적 차이가 없거나 감소율이 매우 적은 것으로 나타났다(최고 감소량 $0.92{\pm}0.62-1.29{\pm}0.34\;{\log}_{10}CFU$/mL). 또한 broth 상태의 A. butzleri에 에탄올을 처리했을 경우 모든 농도의 에탄올에서 A. butzleri가 유의적으로 감소하였으나 식육에 오염 된 A. butzleri는 유의적인 차이가 없거나 감소율이 매우 낮은 것으로 나타났다(10% 에탄올의 최고 감소량은 $0.16{\pm}0.42-0.77{\pm}0.65\;{\log}_{10}CFU$/mL, 35% 에탄올은 $0.59{\pm}0.38-1.52{\pm}0.60\;{\log}_{10}CFU$/mL, 70% 에탄올은 $1.33{\pm}0.43-2.83{\pm}0.52\;{\log}_{10}CFU$/mL).

• 한국환경과학회지
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• 제28권10호
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• pp.899-905
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• 2019

Recently, an innovative method for wastewater treatment and nutrient removal was developed by combining the sequence batch reactor and membrane bioreactor to overcome pollution caused by shipboard sewage. This system is a modified form of the activated sludge process and involves repeated cycles of mixing and aeration. In the present study, the bacterial diversity and dominant microbial community in this wastewater treatment system were studied using the MACROGEN next generation sequencing technique. A high diversity of bacteria was observed in anaerobic and aerobic bioreactors, with approximately 486 species. Microbial diversity and the presence of beneficial species are crucial for an effective biological shipboard wastewater treatment system. The Arcobacter genus was dominant in the anaerobic tank, which mainly contained Arcobacter lanthieri (8.24%), followed by Acinetobacter jahnsonii (5.81%). However, the dominant bacterial species in the aerobic bioreactor were Terrimonas lutea (7.24%) and Rubrivivax gelatinosus (4.95%).

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제26권1호
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• pp.31-35
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• 2011

본 연구에서는 최근 새롭게 출현한 식중독 세균인 Arcobacter butzleri 국내 분리 균주를 고온과 냉장 및 냉동 조건에 노출시킨 후 생존성을 조사하였다. 열처리를 한 경우 $50^{\circ}C$ 5분 이후부터 유의적으로 감소하였으며, $60^{\circ}C$와 $70^{\circ}C$ 열처리 조건에서는 생존성이 급격히 감소하였다. $4^{\circ}C$와 $-70^{\circ}C$ 온도에 저장할 경우 유의적인 생존성 감소가 없었으나, $-20^{\circ}C$ 냉동조건에서는 A. butzleri의 생존성이 유의적으로 감소하였다. 특히 장내용물에서 분리된 A. butzleri는 계육에서 분리된 균주보다 열처리에 저항하는 특정이 있었다. 따라서 고온처리 및 냉동 저장 등은 A. butzleri를 효과적으로 제어할 수 있는 기술개발에 활용할 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국축산식품학회지
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• 제36권4호
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• pp.463-468
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• 2016

Contamination by foodborne pathogens and mycotoxins was examined in 475 eggs and 20 feed samples collected from three egg layer farms, three egg-processing units, and five retail markets in Korea. Microbial contamination with Salmonella species, Escherichia coli, and Arcobacter species was examined by bacterial culture and multiplex polymerase chain reaction (PCR). The contamination levels of aflatoxins, ochratoxins, and zearalenone in eggs and chicken feeds were simultaneously analyzed with high-performance liquid chromatography coupled with fluorescence detection after the post-derivatization. While E. coli was isolated from 9.1% of eggs, Salmonella species were not isolated. Arcobacter species were detected in 0.8% of eggs collected from egg layers by PCR only. While aflatoxins, ochratoxins, and zearalenone were found in 100%, 100%, and 85% of chicken feeds, their contamination levels were below the maximum acceptable levels (1.86, 2.24, and 147.53 μg/kg, respectively). However, no eggs were contaminated with aflatoxins, ochratoxins, or zearalenone. Therefore, the risk of contamination by mycotoxins and microbes in eggs and chicken feeds is considered negligible and unlikely to pose a threat to human health.

• 환경생물
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• 제38권2호
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• pp.289-298
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• 2020

As part of the research program "2018 Rapid screening and identification of freshwater microorganisms using MALDI-TOF/MS library" freshwater samples were collected from a branch of the Nakdong River. Almost 300 antibiotic-resistant bacterial strains were isolated from freshwater samples and subsequently identified by 16S rRNA gene sequencing. Seventeen strains among the isolates shared high 16S rRNA gene sequence similarity (>99.0%) with known species that were not previously recorded in Korea, and each of the isolates also formed a robust phylogenetic clade with the closest species. These species were phylogenetically diverse, belonging to four phyla, seven classes, 10 orders, and 13 genera. At the genus and class level, the previously unrecorded species belonged to Rhodovarius, Xanthobacter, and Shinella of the class Alphaproteobacteria; Ottowia, Simplicispira, and Zoogloea of Betaproteobacteria; Pseudomonas, Acinetobacter, and Shewanella of Gammaproteobacteria; Arcobacter of Epsilonproteobacteria; Sphingobacterium of Sphingobacteriia; Trichococcus of Bacilli; and Leucobacter of Actinobacteria. The previously unrecorded species were further characterized by examining their gram-staining, colony and cell morphology, biochemical properties, and phylogenetic position.

• Journal of Species Research
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• 제7권3호
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• pp.193-201
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• 2018

Culturable bacterial diversity was investigated using freshwater and sediment samples collected from the North Han River basin in 2017, as a part of the research program 'Survey of freshwater organisms and specimen collection'. Over a thousand bacterial strains were isolated from the samples and identified based on 16S rRNA gene sequences. Among the bacterial isolates, 22 strains showing higher than 98.7% sequence similarity with validly published bacterial species, but not reported in Korea, were classified as unrecorded species in Korea. The 22 bacterial strains were phylogenetically diverse and assigned to 6 classes, 11 orders, 15 families, and 21 different genera. At the generic level, the unreported species were affiliated with Flavobacterium of the class Flavobacteria, Flexibacter of the class Cytophagia, Blastomonas, Brevundimonas, Elstera, Rhizobium, Roseomonas, Sphingomonas, and Xanthobacter of the class Alphaproteobacteria, Albidiferax, Cupriavidus, Curvibacter, Ferribacterium, Hydrogenophaga, Iodobacter, Limnohabitans, Polaromonas, Undibacterium, and Variovorax of the class Betaproteobacteria, Pseudomonas of the class Gammaproteobacteria, and Arcobacter of the class Epsilonproteobacteria. The unreported bacterial species were further characterized by examining Gram reaction, colonial and cellular morphology, and biochemical properties. The detailed descriptions of 22 strains of the unreported bacterial species are also provided.

• Journal of Species Research
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• 제6권1호
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• pp.15-24
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• 2017

During the extensive survey of the prokaryotic species diversity in Korea, bacterial strains belonging to Betaproteobacteria and Epsilonproteobacteria were isolated from various sources including freshwater, sediment, soil and fish. A total of 23 isolates were obtained, among which 22 strains were assigned to the class Betaproteobacteria and one strain to the class Epsilonproteobacteria. The 22 betaproteobacterial strains were further assigned to Comamonadaceae (11 strains), Burkholderiaceae (6 strains), Oxalobacteraceae (2 strains), Neisseriaceae (1 strain) and unclassified family groups (2 strains). For the strains of Burkholderiaceae, 3 strains were identified as 3 species of Burkholderia, and 2 strains were as 2 species of Cupriavidus. For the strains of Comamonadaceae, 4 strains were identified as 2 species of the genus Hydrogenophaga, 2 strains as 2 species of Acidovorax, 2 strains as 2 species of Limnohabitans, and each of the remaining strains as single species of Comamonas, Curvibacter and Rhodoferax, respectively. For the strains of Oxalobacteraceae, 1 strain was identified as a species of Undibacterium, and the other strain as a species of Herbaspirillum. The strain belonging to Neisseriaceae was identified as a species of Iodobacter. The remaining strains of Betaproteobacteria were identified as species of Sphaerotilus and Methylibium respectively (family unassigned). The epsilonproteobacterial strain was identified as a species of Arcobacter of the family Camplyobacteraceae. The detailed description of each unrecorded species is provided.