• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권11호
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• pp.3565-3570
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• 2012

Until now, few groups reported the antifreeze activity of cyclic glycopeptides; however, the tedious synthetic procedure is not amenable to study the intensive structure activity relationship. A series of N-linked cyclic glycopeptoids and glycopeptide have been prepared to evaluate antifreeze activity as a function of peptide backbone cyclization and methyl stereochemical effect on the rigid Thr position. This study has combined the cyclization protocol with solid phase peptide synthesis and obtained significant quantities of homogeneous cyclic glycopeptide and glycopeptoids. Analysis of antifreeze activity revealed that our cyclic peptide demonstrated RI activity while cyclic glycopeptoids showed no RI activity. These results suggest that the subtle changes in conformation and Thr orientation dramatically influence RI activity of N-linked glycopeptoids.

• KSBB Journal
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• 제28권5호
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• pp.310-314
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• 2013

Antifreeze peptide from Myoxocephalus octodecemspinosus was overexpressed and purified in Escherichia coli. Green fluorescence protein-AFP chimera was constructed by integrating gfp and afp genes. Produced GFP-AFP chimera protein was purified using polyhistidine tag which was inserted at C-terminus. By addition of GFP-AFP chimera protein, freezing point of elution buffer was decreased from $-13^{\circ}C$ to $-20^{\circ}C$. This result suggested that GFP-AFP chimera can be considered as a potential candidate of novel inhibitor for gas hydrates.

• 생명과학회지
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• 제27권5호
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• pp.584-590
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• 2017

결빙방지 단백질(Antifreeze protein, AFP)은 얼음 결정에 결합하여 결정의 성장을 억제한다. AFP는 영하의 환경에서 서식하는 생물체의 생존에 필수적이다. 겨울 넙치에서 분리된 type I AFP (AFP37)는 37 개의 잔기를 가진 ${\alpha}$-나선 구조의 펩타이드이다. 본 연구에서는 활성과 수용성이 높은 짧은 AFP 조각을 개발하고자 시도하였다. 아미노-말단 15, 21 잔기의 AFP15와 21를 설계 및 합성하였다. 이들 펩타이드의 아미노-말단에 CGG를 도입한 AFP15N and 21N을 합성하고 이황화 결합을 유도함으로써 이량체 펩타이드인dAFP15N과dAFP21N을 합성하였다. 이들의 나선 함량과 결빙방지 활성을 circular dichroism (CD) 분광법과 나노리터 삼투압계로 각각 측정하였다. 합성된 펩타이드 AFP15 AFP21, AFP15N, AFP21N, dAFP15N, dAFP21N의 나선 구조 함량은 대조구인 AFP37의 49, 41, 23.8, 28, 47.9, 51.7% 수준을 보였다. 이들의 결빙방지 활성은 AFP37의 13, 7, 0.05, 5.6, 13, 11%로 나타났다. 예상과는 달리 이량체화된 펩타이드는 단량체와 비슷한 결빙방지 활성을 보였다. 이는 이량체 펩타이드가 하나의 펩타이드로 얼음과 결합하기 보다 두 개의 개별적 펩타이드로 작용함으로써 단량체와 같은 활성을 보인 것으로 생각된다. 또한 펩타이드들에 의한 별 모양의 얼음 결정 형성은 펩타이드와 얼음의 약한 결합을 시사한다.