• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제32권12호
• /
• pp.4427-4430
• /
• 2011

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제14권6호
• /
• pp.3955-3961
• /
• 2013

Background: Defects of manganese superoxide dismutase (MnSOD) have long been implicated in generation of oxidative stress and risk susceptibility to various cancers. Two functional polymorphisms within the MnSOD gene, including the Val-9Ala of the mitochondrial targeting sequence (MTS) and the Ile58Thr of the exon-3, have been proposed to reduce its enzyme activity and antioxidant potential. Materials and Methods: A high-throughput multiplex SNaPshot$^{(R)}$ system was developed herein for simultaneous analyses of Val-9Ala and Ile58Thr in a single reaction. Genomic DNA extracted from each whole blood sample of 248 patients including 107 with cervical cancer and 141 with breast cancer and from 136 healthy women as controls was analyzed by the multiplex SNaPshot$^{(R)}$ system. Results: The Val/Val, Val/Ala genotypes and the Val allele of the MTS were predominant in patients with cervical or breast cancer as well as healthy women in Thailand. The Ile/Ile genotype and the Ile allele of the exon-3 were found in all of them whereas none of the Ile/Thr, the Thr/Thr genotypes and the Thr allele was detected. Genotypic association of both Val-9Ala and Ile58Thr polymorphisms with cervical cancer and breast cancer of these patients comparing to healthy women was not statistically significant (p<0.05). Conclusions: The Val/Val, Val/Ala genotypes and the Val allele of the MTS were found predominantly but the Ile/Ile genotype and the Ile allele of the exon-3 were detected in patients with cervical cancer, breast cancer and healthy women in Thailand. These two functional polymorphisms (Val-9Ala and Ile58Thr) in MnSOD gene did not associate with susceptibility risk of these cancer patients in Thailand.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
• /
• 제61권2호
• /
• pp.258-266
• /
• 2018

Objective : The diagnosis of insufficiency fractures of the sacrum in an elder population increases annually. Fractures show very different morphology. We aimed to classify sacral insufficiency fractures according to the position of cortical break and possible need for intervention. Methods : Between January 1, 2008 and December 31, 2014, all patients with a proven fracture of the sacrum following a low-energy or an even unnoticed trauma were prospectively registered : 117 females and 13 males. All patients had a computer tomography of the pelvic ring, two patients had a magnetic resonance imaging additionally : localization and involvement of the fracture lines into the sacroiliac joint, neural foramina or the spinal canal were identified. Results : Patients were aged between 46 and 98 years (mean, 79.8 years). Seventy-seven patients had an unilateral fracture of the sacral ala, 41 bilateral ala fractures and 12 patients showed a fracture of the sacral corpus : a total of 171 fractures were analyzed. The first group A included fractures of the sacral ala which were assessed to have no or less mechanical importance (n=53) : fractures with no cortical disruption ("bone bruise") (A1; n=2), cortical deformation of the anterior cortical bone (A2; n=4), and fracture of the anterolateral rim of ala (A3; n=47). Complete fractures of the sacral ala (B; n=106) : parallel to the sacroiliac joint (B1; n=63), into the sacroiliac joint (B2; n=19), and involvement of the sacral foramina respectively the spinal canal (B3; n=24). Central fractures involving the sacral corpus (C; n=12) : fracture limited to the corpus or finishing into one ala (C1; n=3), unidirectional including the neural foramina or the spinal canal or both (C2; n=2), and horizontal fractures of the corpus with bilateral sagittal completion (C3; n=8). Sixty-eight fractures proceeded into the sacroiliac joint, 34 fractures showed an injury of foramina or canal. Conclusion : The new classification allowes the differentiation of fractures of less mechanical importance and a risk assessment for possible polymethyl methacrylate leaks during sacroplasty in the direction of the neurological structures. In addition, identification of instable fractures in need for laminectomy and surgical stabilization is possible.

• 한국식품영양학회지
• /
• 제19권4호
• /
• pp.496-501
• /
• 2006

본 연구는 대한민국 서해안 갯벌로부터 알칼리성 단백질 분해 효소를 생산하는 세균을 분리하고 분리된 세균으로부터 생산되는 단백질 분해 효소의 생화학적 특징을 조사하는 것이다. 분리 균주는 16S rRNA의 염기 서열, 그람 염색과 전자 현미경사진을 통해 Celidibacter sp. HK-1으로 명명하였다. 분리 균주의 증식과 pretense 생산을 위한 최적 온도는 $25^{\circ}C$이었다. 분리 균주의 증식은 접종 10시간후에 stationary phase에 도달하였다. 효소 생산은 14시간 후 최대 값을 보였다. 효소 활성의 최적 온도와 pH는 각각 $45^{\circ}C$와 pH 9이었다. Pretense의 분자량은 약 50KD이었고 pretense의 부분적인 아미노산 서열은 Ala-Try-Ala-Leu-Asn-Thr-Ser-Val-Thr-Glu-Thr-Phe-Ala-Lys이었다. Protease의 부분적인 아미노산 서열은 Streptomyces avemitilis의 pretense와 높은 상동성을 보였다.

• KSBB Journal
• /
• 제19권1호
• /
• pp.27-32
• /
• 2004

본 연구에서는 2차원 형광 센서를 이용하여 ALA 생산 공정을 실시간 모니터링하고 오프라인 분석 데이터와 비교, 고찰하였다. 배양액의 pH나 균체의 성장 특성 등 생물공정내의 환경 변화에 따라 형광 특성에 차이를 보였으며 최소배지인 MS8 배지에 IPTG, LA 및 기질 (포도당, 숙신산) 등을 첨가한 후 형광 특성의 변화를 살펴본 결과 균체의 성장이나 세포내 대사현상의 변화를 형광 차이로부터 확인할 수 있었다 2차원 형광센서에 의해 실시간 모니터링 된 형광 스펙트럼데이터는 기질 및 생산물 그리고 세포내 효소 활성 등의 각종 공정 변수와 좋은 상관성을 보였다. 따라서 본 연구에서 사용한 2차원 형광센서는 ALA 대량 생산을 위해 주요한 공정변수를 실시간 모니터링 하는데 매우 효과적이라 할 수 있으며 향후 공정의 제어 및 최적화에도 이용될 수 있다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제13권10호
• /
• pp.4923-4926
• /
• 2012

Aim: To investigate whether XRCC1 and ADPRT polymorphisms might be associated with outcomes of breast cancer. Methods: A prospective study was conducted with a total of 335 breast cancer patients undergoing chemotherapy consecutively collected from Jan. 2005 to Jan. 2008. Genotyping of XRCC1 and ADPRT polymorphisms was conducted by PCR-RFLP assay. Results: All 335 patients were followed up until death or the end of Jan. 2012, with a median follow-up period of 38.8 (2-64) months. It was shown that the variant genotype of XRCC1 399Gln/Gln was strongly significantly associated with a decreased risk of death from breast cancer, with an HR (95% CI) of 0.52 (0.28-0.91). Similarly, individuals carrying the ADPRT 762Ala/Ala demonstrated longer survival compared to ADPRT 762 Val/Val, with an HR (95% CI) of 0.58 (0.31-0.97). Individuals with combination genotypes of XRCC1 399Gln allele and ADPRT 762Ala/Ala presented with a longer survival, the HR (95% CI) being 0.56 (0.32-0.97). Conclusion: We found a significant association between XRCC1399Gln/Gln and ADPRT 762Ala/Ala polymorphisms and clinical outcomes. These two genotypes could be used as a surrogate markers of clinical outcome in glioma cases receiving chemotherapy.

• 한국균학회지
• /
• 제36권2호
• /
• pp.183-188
• /
• 2008

3단계를 거처 식용 가능한 다발구멍장이버섯으로부터 분리한 혈전용해효소의 비활성은 30.49 U/mg이었으며, MALDI-TOF/MS로부터 분자량이 30086.41 Da이었다. 일차 아미노산 구조는 Glu-Thr-Val-Thr-Glu-Thr-Thr-Ala-Pro-Trp-Gly-Leu-Ser-Arg-Ile으로 밝혀졌으며, pH 8.0에서 pH 10.0의 넓은 범위에서 큰 활성을 나타내는 alkaline protease로, 최적온도는 $50^{\circ}C$이며, $30^{\circ}C$까지는 대체로 열에 안정한 효소였다. 이 효소는 합성 기질 N-Suc-Ala-Ala-Pro-Phe pNA을 강하게 분해하였으며, $Hg^{2+}$ 금속이온의 첨가로 효소 활성이 완전히 사라졌다. 효소저해제인 PMSF의 첨가로 혈전용해활성이 사라지는 결과로부터 serine 분해효소임을 알 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제28권10호
• /
• pp.1589-1603
• /
• 2018

Twenty analogs of $[Orn^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ were synthesized and assayed for their biological activities: seven analogs of $[Orn^6,X^9]{\alpha}-factor$, seven analogs of $[X^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$, five analogs of $[X^5,X^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$, and native ${\alpha}-factor$ (X = amino acids). Their biological activities (halo, gene induction, and affinity) were measured using S. cerevisiae Y7925 and LM102 and compared with those of native ${\alpha}-factor$ (100%). G protein-coupled receptor was expressed in strain LM102 containing pESC-LEU-STE2 vector. $[Dap^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ with weak halo activity (10%) showed the highest receptor affinity (> 230%) and the highest gene induction activity (167%). $[Arg^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ showed the highest halo activity (2,000%). The number of active binding sites per cell (about 20,000 for strain LM102) was determined using a newly-designed fluorescence-based detector, $[Arg^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor-Edan$, with high sensitivity (12,500-fold higher than the absorption-based detector $[Orn^6]{\alpha}-factor-[Cys]_3$).

• 디지털융복합연구
• /
• 제12권5호
• /
• pp.1-12
• /
• 2014

최근 인터넷 뱅킹, 전자결제, 전자상거래, 홈쇼핑, 증권 거래, 민원 업무 등 미션 크리티컬한 비즈니스가 증가함에 따라 무정지 서비스에 대한 요구가 높아지면서, 기존의 단일 데이터베이스에서 클러스터링, 이중화 기법 등에 관한 고가용성 기법에 관한 연구가 증가하고 있다. ALTIBASE$^{TM}$ Log Analyzer(이하 ALA)는 이중화 기법과는 별개로 Active Log를 기반으로 API를 제공하여, 이기종 또는 동일 기종간의 통신 및 확장성을 제공한다. 본 논문에서는 ALA를 사용하여 고가용성과 고확장성, 실시간 동기화 기능을 모두 만족시킬 수 있는 데이터베이스 시스템의 설계를 제시하고 ALA에 대한 성능평가를 하였다.

• 생명과학회지
• /
• 제24권2호
• /
• pp.128-136
• /
• 2014

알긴산은 ${\alpha}$-L-guluronic acid와 ${\beta}$-D-mannuronic acid가 (1-4) 결합한 선형 산성다당류이다. 알긴산은 다양한 알긴산 분해효소들에 의하여 분해되는데 ${\beta}$-제거반응으로 비환원 말단에 이중결합이 있는 불포화 우론산 올리고머가 생산된다. 본 연구실에서는 이전에 Stenotrophomonas maltophilia KJ-2로부터 새로운 구조를 가진 polyMG lyase를 재조합하였다. KJ-2 polyMG lyase의 단백질구조를 예측하기 위하여 상동성 모델링을 한 결과 Azotobacter vinelandii가 생산하는 세 종류의 polyMG lyase들이 모두 PL7 family에 속하는 반면 KJ-2 polyMG lyase는 PL6 family에 속하였다. 또한 $^1H$-NMR spectra를 분석한 결과 polyMG lyase는 M-${\beta}$(1-4)-G 당쇄결합을 분해하고 G-${\alpha}$(1-4)-M 결합은 거의 분해하지 못하는 것으로 나타났다. 예측된 polyMG lyase 모델을 기초로 하여 14군데 아미노산 잔기를 선택하였으며 17개의 돌연변이체를 만들어 알긴산 분해효소의 활성을 측정하였다. Lys220Ala, Arg241Ala, Arg241Lys및 Arg265Ala 돌연변이체들은 완전히 알긴산 분해효소의 활성을 잃었으며 Arg155Ala, Gly303Glu 및 Tyr304Phe 돌연변이체들의 분해활성은 19.1-39.3%까지 감소하였다. 이러한 결과들로부터 Arg155, Lys220, Arg241, Arg265, Gly303 및 Tyr304 들은 알긴산 분해효소의 촉매활성과 기질결합에 중요한 잔기들임을 알 수 있다.