• 제목/요약/키워드: Agarose gel

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Serratia marcescens Purine Nucleoside Phosphorylase의 정제 및 특성 (Purification and Properties of Serratia marcescens Purine Nucleoside Phosphorylase.)

  • 방성권;신종란;최병범
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.251-257
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    • 2000
  • Serratia marcescens purine nucleoside phosphorylase (PNP) was purfied to homogeneity by streptomycin sulfate treatment, Sephacry HR S-200 gel filtration chromatography and AMP-agarose affinity chromatography. The specific activity of the enzyme was increased 49-fold during purification with an overall yield of 7.0%. The molecular weight was 168kD as estimated by Sephadex G-150 gel filtration chromatography. The S. marcescens enzyme was composed of six identical subunits with subunit molecular weight of 28kD, as estimated by SDS-PAGE. The Km values of S. marcescens enzyme for inosine and deoxyinsoine were 0.38 and 1.20 mM, respectively. The ph optimum was near 8.0, and the enzyme was relatively heat-stable protein. The enzyme was inactivated com-pletely by 0.5 mM of $Cu^{ 2+}$.

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STUDIES ON ANTITUMOR AGENTS PRODUCED BY STREPTOMYCES spp. ISOLATED IN KOREA

  • Ryeom, Kon;Kwon, Hyuk-Ku;Hong, Bum-Soo;Shin, Y.H.;Chang, S.J.
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1995년도 춘계학술대회
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    • pp.61-61
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    • 1995
  • 1993년 국내토양으로부터 분리동정된 Streptomyces속 균주중 항종양성이 우수한 균주 3주(DKM104, DKM117, DKM409)를 선정하고 이들을 대량 배양하여 종양억제인자를 분리하고 시험관내 종양세포 독성능 및 생체내 항암활성능과 이들 물질생산과 PLASMID DNA와의 관련성, $LD_{50}$등을 시험하여 새로운 항종양물질의 개발을 목적으로 하였다. 분리선별균주의 배양조건을 확립하였으며 배양여액을 국성이 적은 유기용매로부터 큰쪽으로 단계적으로 유효성분을 추출하여 Gel Chromatography를 이용하여 유효성분을 분획하였다. 시험관내 항종양능 시험은 MTT colorimetric검정법을 이용하여 $IC_{50}$값을 산정하였으며 생체내 항종양능은 마국의 NIC에서 권장하는 tumor panel system에 따랐다. 선정된 균주의 plasmid 분리는 alkalin lysis법을 채택하였으며 agarose gel electrophoresis로 plasmid profile을 시험하였다. Novobiocin등을 이용하여 Curing test를 시행하였고 독성실험은 $LD_{50}$량을 구해 항암효과 측정시에 Maximum dost로 투여하였고 최고용량을 기준으로 일정한 공비를 적응하여 3단계의 투여량을 설정하였다.(중략)

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Comparison of electrophoretic karyotypes in fusarium

  • Min, Byung-Re
    • Journal of Microbiology
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    • 제33권4호
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    • pp.334-338
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    • 1995
  • The electrophoretic karyotypes of 6 species in different Fusarium sections were examined by using contour-clamped homogeneous electric field (CHEF) gel electrophoresis. Intact chromosomal DNA was prepared from protoplasts and up to 9 distinct bands were separated on 0.7% or 0.8% agarose gel under several different conditions. Putative chromosome numbers varied from 6 to 9 amd polymorphic karyotypes were observed in different Fusarium sections. Using Schizosaccharomyces pombe and Saccharomyces cerevisiae chromosomes as standards, the sizes of the Fusarium spp. chromosomes were estimated. The electrophoretic karyotypes of F. moniliforme and F. subglutinans (section Liseola) were similar. Unidentified filamentour fungi, F. beomiforme was much closer to F. axysporum (section Elecgans) in karyotype and the karyotypes of F. napiforme were more similar to those of section Liseola than any other sections. F. graminearum (section Discolor) had a distinctive electrophoretic karyotype.

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돼지 농장으로부터 수집한 혈청가검물에서 돼지생식기 호흡기증 바이러스의 분리 및 동정 (Isolation and identification of porcine reproductive and respiratory syndrome virus from serum samples collected from swine farms)

  • Kim, Hyun-Soo;Kong, Sin-Koog
    • 한국동물위생학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.363-370
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    • 1999
  • 돼지 호흡기 생식기증 바이러스(porcine reproductive and respiratory syndrome virus: PRRSV) 감염이 의심되는 농장으로부터 수집된 혈청가검물 646개로부터 MARC-145 cell을 이용하여 PRRSV 분리를 시도한 바 MARC-145 세포단층상에 세포변성효과(cytopathic effects : CPE)를 나타내는 바이러스 36주를 분리하였다. 분리된 36주가 PRRSV인지 여부를 확인하기 위하여 PRRSV를 실험적으로 접종한 혈청을 이용하여 간접형광항체시험과 혈청중화시험을 실시한 결과 36주 모두가 PRRSV로 동정되었다. 혈청학적인 동정법과 더불어 reverse-transcription polymerase chain reaction을 이용하여 PRRSV open reading frame 5(ORF5)의 유전자를 증폭한 결과 선발된 6주 모두에서 80bp의 flanking sequencing를 포함하여 약 680bp의 ORF5의 유전자를 증폭할 수 있었다.

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랫드에서 cyclophosphamide에 의해 유발된 흉선세포의 apoptosis (Thymocyte Apoptosis Induced by Cyclophosphamide in Rats)

  • 구현옥;권창희;조준형;정상희;박신자;김윤배;양재만;이영순
    • Toxicological Research
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    • 제13권1_2호
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    • pp.39-48
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    • 1997
  • Cyclophosphamide(25, 50 or 100 mg/kg), orally administered to male Sprague-Dawley rats, caused a time- and dose-dependent thymic atrophy. In the light microscopic examination of the atrophic thymus, thymocytes with condensed or fragmented nucleus were multifocally observed in the cortical region, started to increase 8 hr after CPA treatment and reached to the maximal level at 16 hr, although such cells were not seen after 48 hr when the severe depletion of thymocytes were marked. In agarose gel electrophoresis to analyze the DNA changes, DNA extracted from atrophic thymus showed a oligonucleosomal laddering at the corresponding time to morphological changes. In an additional supportive experiment, thymocytes showing morphological changes, nuclear condensation or apoptotic body, exhibited a positive reaction to immunoperoxidase staining using in situ apoptosis detection kit. Separately, agarose gel electrophoresis of DNA from bone .marrow cells was performed to investigate the involvement of bone marrow cells in the process of thymocyte apoptosis. Although DNA laddering was slightly increased 2 and 4 hr after treatment, no clear correlation was inferred. Taken togather, it is concluded that thymocytes showing morphological changes in thymic atrophy induced by cyclophosphamide administration represent an apoptosis having biochemical nature of programmed cell death.

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점안액 보존제 성분 Benzalkonium Chloride에 의해 유도된 각막상피세포의 세포고사 유도 (Effects of Benzalkonium Chloride on the growth and survival of Human corneal epithelial cells)

  • 김재민;이석주;서은선
    • 한국안광학회지
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    • 제7권2호
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    • pp.189-195
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    • 2002
  • 점안액 보존제 성분으로 이용되는 Benzalkonium Chloride(BAC)가 배양 각막 상피세포에 미치는 영향을 조사하기 위해 본 연구를 시행하였다. BAC를 세포에 0.0001%~0.01%로 15분 동안 처리하여 24시간 후 회복 효과를 조사하였다. MTT assay를 이용하여 세포 생존율을 산정하고 Hoechst 33342로 염색질 응축을 조사하였다. Fas 발현 여부를 조사하기 위해 western blot과 immunocytochemistry를 이용하였으며 DNA fragmentation은 agarose gel을 이용한 전기영동을 시행하였다. BAC를 0.005% 이상 처리하면 세포괴사가 일어나는 반면에 저농도의 BAC는 세포고사를 유도하는 것으로 나타났으며 BAC로 Fas 발현이 유도될 수 있다는 것을 보여주고 있다. 본 연구를 통해 점안액의 대표적인 보존제인 BAC의 부작용에 대한 각막세포 차원의 연구가 필요하며 세포독성이 없는 새로운 보존제의 개발이 필요한 것으로 나타났다.

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In Vitro Antioxidant and Antiproliferative Activities of Novel Orange Peel Extract and It's Fractions on Leukemia HL-60 Cells

  • Diab, Kawthar AE;Shafik, Reham Ezzat;Yasuda, Shin
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권16호
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    • pp.7053-7060
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    • 2015
  • In the present work, novel orange peel was extracted with 100%EtOH (ethanol) and fractionated into four fractions namely F1, F2, F3, F4 which were eluted from paper chromatographs using 100%EtOH, 80%EtOH, 50%EtOH and pure water respectively. The crude extract and its four fractions were evaluated for their total polyphenol content (TPC), total flavonoid content (TFC) and radical scavenging activity using DPPH (1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl) assay. Their cytotoxic activity using WST assay and DNA damage by agarose gel electrophoresis were also evaluated in a human leukemia HL-60 cell line. The findings revealed that F4 had the highest TPC followed by crude extract, F2, F3 and F1. However, the crude extract had the highest TFC followed by F4, F3, F2, and F1. Depending on the values of $EC_{50}$ and trolox equivalent antioxidant capacity, F4 possessed the strongest antioxidant activity while F1 and F2 displayed weak antioxidant activity. Further, incubation HL-60 cells with extract/fractions for 24h caused an inhibition of cell viability in a concentration-dependent manner. F3 and F4 exhibited a high antiproliferative activity with a narrow range of $IC_{50}$ values ($45.9-48.9{\mu}g/ml$). Crude extract exhibited the weakest antiproliferative activity with an $IC_{50}$ value of $314.89{\mu}g/ml$. Analysis of DNA fragmentation displayed DNA degradation in the form of a smear-type pattern upon agarose gel after incubation of HL-60 cells with F3 and F4 for 6 h. Overall, F3 and F4 appear to be good sources of phytochemicals with antioxidant and potential anticancer activities.

돼지 간 유래의 methenyltetrahydrofolate synthetase 반응메커니즘 (Kinetic and Chemical Mechanism of Pig Liver Methenyltetrahydrofolate Synthetase)

  • 조용권
    • 생명과학회지
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    • 제18권8호
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    • pp.1036-1041
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    • 2008
  • $30{\sim}70%$ 황산암모늄 분획, Fast Q 음이온 교환수지 및 Phenyl Agarose 수지를 통해 돼지간유래의 methenyltetrahydrofolate synthetase를 정제하였으며 정제도는 119이었다. SDS-PAGE 및 HPLC를 이용한 gel permeation column chromatography에 의해 이 효소는 분자량이 23 kDa인 단량체로 확인되었다. 최적 온도와 최적 pH는 각각 $35^{\circ}C$ 와 6.5이었다. 이 효소는 tetranitromethane 및 1-ethyl-3-(3-dimethyl aminopropyl)-carbodiimide (EDC)에 의해서만 활성이 감소되었는데, 이는 티로신과 카르복실산이 효소의 활성부위에 존재한다는 것을 나타낸다. 활성부위의 pH 실험으로부터 2개의 티로신이 기질의 결합에 관여하며 하나의 카르복실기가 촉매반응에 관여한다는 사실이 관찰되었다. 따라서 이 효소는 2개의 티로신이 ATP와 5-formylTHF과 결합하며 하나의 카르복실기가 일반염기로서 촉매한다는 것을 알 수 있다.

건강잠 및 핵다각체 이병잠의 체액단백질의 전기영동상 (Electrophoretic Patterns of Hemolymph Protein of Healthy and Nuclear-Polyhedrosis Virus Infected Silkworm, Bombyx mori.)

  • 김낙정;강석권;김정일
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.141-143
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    • 1971
  • 누에의 성장에 따른 단백질분획의 변화 및 핵다각체 이병잠의 체액의 단백질분획의 변화를 agarose gel을 지지체로 한 전기영동에 의하여 조사하였던 바 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 4령기에는 4개의 단백질 분획이 나타났으며 령기가 진전됨에 따라서 염색의 농도가 짙어졌다. 2. 5령 1일에는 5개의 분획이, 5영 4일에는 5개의 분획이 나타났다. 3. 5영 5일 이후의 건강잠의 체액중에는 양극쪽으로 이동하는 7개의 단백질 분획과 음극쪽으로 이동하는 1개의 분획이 분리되었다. 4. 핵다각체 Virus를 첨식시킨 이병잠의 체액단백질 중에서 5령 6일 7일에는 D,E,F 분획이 증가되는 경향이 있고 5령 8일에는 A,B,D,E 분획은 소실되고 F분획은 감소되는 경향이 있다.

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YEp 13 vector를 이용한 Bacillus amyloliquefaciens amylase gene의 cloning I. Escherichia coli에서의 발현 (Cloning of Bacillus amyloliquefaciens amylase gene using YEp13 as a vector I. Expression of cloned amylase gene in Escherichia coli)

  • 이창후;서정훈
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.155-160
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    • 1986
  • E. coli-Yeast shuttle vector YEp 13에 B. amyloliquefaciens의 $\alpha$-amylase gene을 cloning하여 얻은 hybrid plasnidlasmid를 E. coli를 숙주세포로 하여 형질을 발현시켰다. 형질전환주의 $\alpha$-amylase 활성 측정 결과, B. amyloliquefaciens에 대해 20-30%의 상대 활성도를 나타내었다. 형질전환주의 경우 생성된 $\alpha$-amylase의 60-65%가 periplasm에 축적되었으며 세포 외부로의 분비는 없었다. Hybrid DNA를 agarose-gel 전기영동으로 조사한 결과 그 크기가 다른 다수의 hybrid DNA가 확인되었으며 pHA28의 plasmid (a)(Fig.3)에서만 $\alpha$-amylase 활성을 나타내는 것으로 밝혀졌다 pHA28의 plasmid(a)의 크기가 YEp 13 plasmid DNA보다 작은 것은 YEp13 plasmid에서 yeast gene부분이 deletion된 결과로 추측되었다.

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