• 제목/요약/키워드: Adenovirus-41

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Construction of Improved PCR Primer Set for the Detection of Human Enteric Adenovirus 41

  • Cho, Kyu-Bong
    • 대한의생명과학회지
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    • 제24권3호
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    • pp.230-238
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    • 2018
  • Human enteric Adenovirus-41 (HuEAdV-41) causes gastroenteritis, which detected by the polymerase chain reaction (PCR) base diagnostic system for clinical, food, environmental, fish and shellfish samples. We developed improved PCR and nested PCR primer set which had high specificity, sensitivity and reduced times. In this study, we compared seventeen conditions reported in the previous study that was using the PCR based HuEAdV-41 detection system, and non-enteric Adenovirus were detected in nine conditions. The most sensitive detection condition was up to 25 copies however it took 184 minutes of PCR reaction time. In this study, the PCR primer set developed had same level of sensitivity, it reduced the time of detection for clinical, food and seafood samples to 112 minutes. Developed nested PCR primer set needed 112 minutes but detected up to approximately 1 copy. In addition, developed PCR and nested PCR primer set was validated with twenty samples of underground water at random, of which ten samples showed specific band without non-specific reaction. We expect this study will be used to diagnose HuEAdV-41 from various samples.

Detection of Adenovirus from Respiratory and Alimentary Tract in Pusan, 1999

  • Cho, Kyung-Soon;Kim, Young-Hee
    • Journal of Life Science
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    • 제10권2호
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    • pp.17-20
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    • 2000
  • Adenovirus which is an important infectious viral agent in respiratory and alimentary tract was investigated in Pusan, 1999. Fifteen cases of adenovirus were detected from stools and throat swabs of suspected patients. Two cases of enteric adenovirus were detected from a 5 years old boy and a 6-month-old boy. Thirteen cases of respiratory adenoviruses were detected from children aged under 10 years old and one adult. From respiratory specimens, 1 case of adenovirus type 2, 1 case of type 5, and 11 cases of type 3 were found. Enterotype 41 was detected from fecal preparations. Adenoviruses appeared mostly during winter months, January, February and December. Adenovirus showed a slowly progressive cytopathic effect on HEp-2 cells, Vero cells and BGM cells at 37$^{\circ}C$, in a 5-7% $CO_{2}$ incubation. An electron microscopic observation exhibited non-enveloped icosahedron with a diameter of 70nm. No significant differences on cytopathic effect and morphological features have been found from specimens of either alimentary tract or respiratory secretions.

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Development of a diagnostic method for human enteric Adenovirus-41 with rapid, specific and high sensitivity using the loop-mediated isothermal amplification assay

  • Lee, Jin-Young;Rho, Jae Young
    • 농업과학연구
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    • 제47권3호
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    • pp.673-681
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    • 2020
  • Human enteric Adenovirus 41 (HueAdV-41) is a major waterborne virus that causes human gastroenteritis and is classified as a viral group I double-strand DNA virus, Adenoviridae. HueAdV-41 has been detected with the polymerase chain reaction (PCR) in various samples such as ground water. However, the PCR-based diagnostic method has problems such as reaction time, sensitivity, and specificity. Thus, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay has emerged as an excellent method for field applications. In this study, we developed a LAMP system that can rapidly detect HueAdV-41 with high specificity and sensitivity. HueAdV-41 specific LAMP primer sets were tested through a specific, non-specific selection and sensitivity test for three prepared LAMP primer sets, of which only one primer set and optimum reaction temperature were selected. The developed LAMP primer set condition was confirmed as 63℃, and the sensitivity was 1 copy. In addition, to confirm the system, a LAMP positive reaction was developed with the restriction enzyme Taq I (T/GCC). The developed method in this study was more specific, rapid (typically within 2 - 3 hours), and highly sensitive than that of the conventional PCR method. To evaluate and verify the developed LAMP assay, an artificial infection test was done with five cDNAs from groundwater samples, and the results were compared to those of the conventional PCR method. We expect the developed LAMP primer set will be used to diagnose HueAdV-41 from various samples.

Rotavirus 및 Adenovirus에 의한 급성 장염에 관한 비교 연구 (Distribution of Rotavirus and Adenovirus Type 40 and 41 in Chungju Area form 1998 to 1999)

  • 권재봉;심재건
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제7권1호
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    • pp.108-112
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    • 2000
  • 목 적 : Rotavirus와 adenovirus는 영유아에서 급성장염을 유발하는 주요 원인인데 한국에서 adenovirus에 관한 연구 논문이 적어 저자들은 최근에 발생한 adenovirus와 rotavirus 장염의 분포를 조사하여 향후 질병 예방 및 발생 정보에 도움을 얻고자 연구 분석하였다. 방 법 : 1998년 3월에서 1999년 6월까지 대상으로 건국의대 부속병원에 급성 위장관염으로 입원 또는 통원 치료를 한 143명을 대상으로 하였다. 결 과 : 전체 환아 143명중 rotavirus 양성은 53명으로 37%의 양성률을 보였으며 1999년 1월에서 3월 사이의 초봄에 가장 많이 발생하였으며 2세 이하에서 가장 많이 발생함을 보였고 2~4세 사이에서도 16%의 양성률을 보였으며 9월에 전체 24례중 6례로 가장 많이 검출되었고 2개월에서 2세 사이에 많은 발생을 보였다. Adenovirus와 rotavirus에 동시 검출된 경우는 7명(5%)이였다. 결 론 : Rotavirus 장염은 1월부터 3월에 가장 많은 발생 빈도를 보여서 겨울 및 초봄에 유행시기를 보였으며 adenovirus는 9월에 가장 많이 검출 되었다. Rotavirus와 adenovirus의 발생의 중간 나이 분포는 각각 1세 4개월, 1세 3개월의 분포를 보였다.

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1998-2000년 부산지역 소화기계 바이러스의 탐색 (Detection of Alimentary Tract Viruses in Busan: 1998-2000)

  • 조경순;김영희
    • 미생물학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.289-293
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    • 2001
  • 감염성 바이러스의 발생은 세계적인 현상으로 어린이는 물론 성인의 건강을 위협하고 있는 설정이다. 1998년-2000년 사이에 부산지역 바이러스성 전염병 유행예측사업의 과정에서 소화기계 바이러스가 탐색되었다. 의심되는 환자의 대변 및 뇌척수액, 인후가검물에서 세포배양, Latex 응집반응, 간접면역형광항체법, 전자현미경 관찰 등을 행하여 바이러스를 확인하였다. 총 검체 중에서 바이러스의 확인 율은 12.5% 이었다. 이 과정을 통하여 3 사례의 장 adenovirus 및 , 23 사례의 echovirus, 31 사례의 coxsackievirus, 36 사례의 rotavirus, 45 사례의 small round structued virus (SRSV), 7 사례의 poliovirus가 확인되었다. 확인된 주요 혈청형으로는 장 adenovirus 41형 및 echovirus 6, 9, 11, 25, 30형, coxsackievirus B2, B3, B4, B6 형 등이 탐색되었다. 각 바이러스의 월별 발생별로는 SRSV는 12월에서는 다음해 4월 사이, echovirus와 coxsackievirus는 4월에서 10월 사이에, rotavirus는 1월에서 4월사이에 각각 분리 율이 높았다. 전자현미경 관찰에서는 30-80 nm의 작은 크기의 바이러스들이 확인되었다.

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Detection of Human Adenoviruses and Enteroviruses in Korean Oysters Using Cell Culture, Integrated Cell Culture-PCR, and Direct PCR

  • Choo Yoe-Jin;Kim Sang-Jong
    • Journal of Microbiology
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    • 제44권2호
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    • pp.162-170
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    • 2006
  • Oysters are known to be carriers of food-born diseases, but research on viruses in Korean oysters is scarce despite its importance for public health. We therefore tested oysters cultivated in Goheung, Seosan, Chungmu, and Tongyeong, for viral contamination using cell culture and integrated cell culture PCR (ICC-PCR) with Buffalo green monkey kidney (BGMK) and human lung epithelial (A549) cells. Additional screens via PCR, amplifying viral nucleic acids extracted from oysters supplemented our analysis. Our methods found 23.6 %, 50.9 %, and 89.1 % of all oysters to be positive for adenoviruses when cell culture, ICC-PCR, and direct PCR, respectively, was used to conduct the screen. The same methodology identified enteroviruses in 5.45%, 30.9%, and 10.9% of all cases. Most of the detected enteroviruses (81.3%) were similar to poliovirus type 1; the remainder resembled coxsackievirus type A1. A homology search with the adenoviral sequences revealed similarities to adenovirus subgenera C (type 2, 5, and 6), D (type 44), and F (enteric type 40 and 41). Adenovirus-positive samples were more abundant in A549 cells (47.3%) than in BGMK cells (18.2 %), while the reverse was true for enteroviruses (21.8 % vs. 14.5 %). Our data demonstrate that Korean oysters are heavily contaminated with enteric viruses, which is readily detectable via ICC-PCR using a combination of A549 and BGMK cells.

Functional Implications in Apoptosis by Interferon Inducible Gene Product 1-8D, the Binding Protein to Adenovirus Preterminal Protein

  • Joung, In-Sil;Angeletti, Peter C.;Engler, Jeffrey A.
    • Journal of Microbiology
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    • 제41권4호
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    • pp.295-299
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    • 2003
  • Adenovirus (Ad) precursor to the terminal protein (pTP) plays an essential roles in the viral DNA replication. Ad pTP serves as a primer for the synthesis of a new DNA strand during the initiation step of replication. In addition, Ad pTP forms organized spherical replication foci on the nuclear matrix (NM) and anchors the viral genome to the NM. Here we identified the interferon inducible gene product 1-8D (Inid) as a pTP binding protein by using a two-hybrid screen of a HeLa cDNA library. Of the clones obtained in this assay, nine were identical to the Inid, a 13-kDa polypeptide that shares homology with genes 1-8U and Leu-13/9-27, most of which have little known functions. The entire open reading frame (ORF) of Inid was cloned into the tetracycline inducible expression vector in order to determine the biological functions related with adenoviral infection. When Inid was introduced to the cells along with adenoviruses, fifty to sixty percent of Ad-infected cells expressing Inid had rounded morphology, which was suggestive of apoptosis. Results from the terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) and DNA fragmentation assays confirmed that Inid induces apoptosis in Ad-infected or in uninfected cells. The Inid binding to pTP may target the cell for apoptotic destruction as a host defense mechanism against the viral infection.

재조합 가금 아데노바이러스 Fiber 2 단백질을 이용한 특이 난황 항체 생산 (Production of Specific Egg Yolk Antibodies in Chicken against Recombinant Fowl Adenovirus Fiber 2 Protein)

  • 정경민;이성;김정우
    • 한국가금학회지
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    • 제41권1호
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    • pp.15-20
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    • 2014
  • 본 연구는 가금에서 호흡기 질환, 심낭수종, 봉입체 간염, 산란저하증 등을 유발하는 가금 아데노바이러스의 fiber 2 유전자에 대한 특이 난황 항체를 개발하고자 실험을 실시하였다. Fiber 2 유전자를 클로닝한 뒤, 대장균 발현 시스템을 이용하여 약 22 kDa의 재조합 fiber 2 단백질을 생산하였다. 이를 산란계에 3주 간격으로 총 4회 면역하여 혈청 및 난황 내 항체가를 측정한 결과, 면역 후 12주경에 항체가가 최고치에 달하였으며, 산란계로부터 획득한 난황 항체를 이용한 Western blot analysis 결과, 가금 아데노바이러스 내 fiber 2 단백과 특이적으로 반응한다는 것을 규명하였다. 결론적으로, 가금 아데노바이러스 fiber 2에 특이적인 난황 항체 생산에 성공하였으며, 이러한 특이적인 난황 항체는 가금 아데노바이러스로 인한 질병의 예방 및 치료에 활용 가능할 것으로 사료된다.

전북지역 조류아데노바이러스 및 닭전염성빈혈 감염률 조사 (Prevalence of fowl adenovirus and chicken anemia virus in Jeonbuk, Korea)

  • 정한솔;백귀정;고원석;이정원
    • 한국동물위생학회지
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    • 제41권1호
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    • pp.21-27
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    • 2018
  • Fowl adenovirus (FAdV) and chicken anemia virus (CAV) have gained much importance as an immunosuppressive and economically important emerging pathogen of poultry. This study was carried out to investigate the prevalence of FAdV and CAV infection in chickens. The groups were divided into Korean native chickens, broiler, layer hens and broiler breeder and set up groups according to age. As results, 12.5% of the native chicken, 2.5% of broiler and 6.7% of layer chicken were positive, respectively by PCR for FAdV. Serological test showed that 84.8%, 79.0%, 97.7% and 96.1% of chickens were positive for antibody to FAdV in native chickens, broiler, layer hens and broiler breeder. The prevalence of CAV infection were 20.0%, 7.5%, 16.7% and 10.0%, based on CAV gene detection by PCR. In serological test of CAV, 40.6%, 35.9%, 84.8% and 73.9% of chickens were positive in that groups.

소아의 Adenovirus 하기도 감염증에 관한 연구 - 유행 양상과 임상 양상에 대하여 - (Adenoviral Lower Respiratory Tract Infection of Children in Korea from 1990 Through 1998)

  • 홍정연;이환종
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제7권1호
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    • pp.94-107
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    • 2000
  • 목 적 : 우리나라 하기도 감염 소아에서 분리되는 아데노바이러스 각 혈청형의 유행 양상과 아데노바이러스에 의한 하기도 감염의 임상적 특징을 알아보고자 한다. 방 법 : 1990년 11월부터 1998년 2월까지 호흡기 감염증상을 주소로 서울대학교 어린이병원 소아과를 내원한 환아들을 대상으로 비흡인물을 채취하여 단일 클론항체를 이용한 면역 형광염색법 및 HEp-2 세포주를 이용한 바이러스 배양법으로 87례의 아데노바이러스에 의한 호흡기 감염증을 진단하고, 분리된 바이러스는 중화 항체 시험으로 혈청형을 결정하였다. 아데노바이러스 감염증이 확인되고 혈청형 결정 시험이 시행된 84명의 환아 중에서 혼합감염과 병록 고찰이 불가능한 환아들을 제외한 74명의 환아들의 병록 고찰을 하였다. 결 과 : 혈청형 검사가 시행된 84례 중에 7형이 36례로 가장 많았다. 그리고 나머지는 혈청형 1은 3례, 혈청형 2는 13례, 소아 혈청형군이 13례, 기타 혈청형군이 12례였다. 혈청형 7형은 95년 10월부터 97년 초까지 유행성으로 발병하였고 그 외의 다른 혈청형은 7형이 유행할 당시에는 거의 분리되지 않았다. 그 외의 기간 동안에는 98년을 제외하고는 7형은 분리되지 않았고 주로 2형과 3형이 연중 산발적으로 발생하였다. 환아의 평균 연령은 1년 11개월로 주로 6개월에서 5세 사이였고 6개월 이하의 영아도 14례 있었다. 아데노바이러스에 의한 폐렴의 흉부방사선 소견은 폐나 폐문 주위의 침윤, 과환기, 무기폐, 폐경화 등의 다양한 형태로 나타났으며, 정상소견도 있었다. 그러나 7형의 경우는 세균성 폐렴과 구별이 어려울 정도의 병변으로 폐경화와 늑막 삼출, 그리고 대엽성이나 소엽성 무기폐 등이 관찰되었고 양측 폐야를 동시에 침범한 경우도 7형에서 20례(55%)에서 있었다. 호흡곤란으로 인공호흡기 치료를 받는 경우는 혈청형 7의 36례 중의 14례(38.9%)였다. 사망한 환자는 총 9명(12%)이었고 그 중 호흡 부전으로 사망한 경우는 7명(9.4%)였다. 그 중 7례는 혈청형 7이 분리되었고 소아 혈청형군 1례와 2형이 1례씩 있었다. 결 론 : 아데노바이러스는 주로 6개월에서 5세사이의 소아에서 심한 호흡기 감염을 일으키며, 특히 혈청형 7형에 의한 심한 폐렴이나 선행질환으로 선선청 심질환이나 면역 기능이 저하된 경우 혹은 만성 폐질환을 앓는 경우에 사망과도 연관되는 것으로 생각된다. 과거 5년간 관찰되지 않던 7형에 의한 폐렴은 유행성으로 많은 정상 환아에서도 사망이나 심각한 후유증을 초래하였으므로 앞으로 이에 대한 진단과 치료 뿐만 아니라 예방에 대한 연구를 더욱 진행시켜야 할 것으로 생각된다.

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