Kim, Sang Hoon;Oh, Ju Kyoung;Kim, Yong Ho;Kang, Dae-Kyung
Journal of Animal Science and Technology
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제62권5호
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pp.761-763
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2020
Here we report the complete genome sequence of Bacillus amyloliquefaciens ATC6, which produces acidic cellulase, isolated from pig feces. The genome is 4,062,817 bp in length and has a guanine-cytosine (GC) content of 46.27%. Among the predicted 3,913 protein-coding genes, two glucanase genes, which are involved in lichenan and cellulose degradation, were found. This genome analysis helps clarify the mechanism involved in cellulose biodegradation and support its application for efficient use of livestock feeds.
사료곡물을 효율적으로 이용하기 위해, 산성 cellulase를 분비하는 ATC6 균주를 선발하였다. 선발된 ATC6 균주의 형태, 당 이용성 및 16S rDNA 서열분석 등을 통해 동정한 결과 Bacillus amyloliquefaciens에 속하는 것으로 나타났으므로, B. amyloliquefaciens ATC6로 명명하였다. B. amyloliquefaciens ATC6가 분비하는 cellulase 효소의 활성은 대수생장기 중반부터 급격히 증가하였고, 균의 생장이 정체기에 이르면 효소의 활성도 더 이상 증가하지 않는 것으로 나타났다. 효소의 최적 pH를 조사한 결과, pH 4.5에서 최대의 효소 활성을 나타내었으며, pH 4.0에서도 최고 활성의 80% 이상을 유지하였다. 또한 pH 4.0~pH 8.0까지 상대적으로 넓은 범위에서 최대 활성의 60% 이상을 유지하였다. Cellulase 활성의 최적 온도는 $55^{\circ}C$ 이었으며, $75^{\circ}C$의 고온에서도 최대 활성의 50% 정도의 활성을 나타내었다. 효소의 열 안정성을 조사한 결과, $45^{\circ}C$ 및 $55^{\circ}C$에서는 2시간 후에도 효소의 활성이 안정하게 유지되었으나, $65^{\circ}C$에서는 시간의 경과와 함께 효소 활성이 급격히 감소하는 것으로 나타났다.
홍삼에 70% 알콜로 추출하고 남은 홍삼알코올박과 물로 추출하고 남은 홍삼물박은 거의 이용되지 않는데 이 홍삼박에는 다량의 산성다당체가 존재하므로 홍삼박으로부터 산성다당체를 효과적으로 추출할 수 있는 산업적으로 이용할 대량 생산제조공정에 대해서 조사하였다. 홍삼알코올박 및 홍삼물박 모두 건조전보다 건조후 산성다당체의 추출효율이 높았으며, 추출시간과 추출회수가 증가함에 따라 추출되는 산성다당체의 양이 증가하는 것으로 조사되었다. 따라서 생산제조공정으로서 홍삼박을 건조시킨 후 입자를 3.35 mm 이하로 분쇄하고, 추출온도는 8$0^{\circ}C$에서 1~2시간 추출하면서 추출회수는 2~3회가 최적인 것으로 사료된다. 또한 산성다당체의 추출 효율을 높이기 위해서는 홍삼박에 $\alpha$-amlyase 및 cellulase 효소를 처리했을 때 추출효율이 20~50%까지 높은 것으로 나타났다.
섬유소 분해균인 P. verrculosum의 배양 여액으로부터 endo형 cellulase 인 CMCase IV를 정제하였다. CMCase IV는 13%의 탄수화물과 4.0의 pl값을 가진 산성, 당단백질이었다. CMCase IV의 SDSPAGE 상에서 분자량은 52 KDa이었으며, 효소 활성을 위한 최적 pH 및 온도는 5.0과 $50^{\circ}C$ 였다. CMCase IV를 CMC에 반응시 대부분 glucose와 cellobiose가 생산되었으며, 또한 동시에 transglycosylation 작용을 함께 갖는 것으로 사료되었다. Cellulase 활성 염색법(zymogram)을 통해서 P. verruculosum의 cellulase component가 배지 내에서 aggregation 되어있지 않음을 알 수 있었다. P. verruculosum mRNA의 in vitro 번역을 통하여 CMCase IV를 coding하는 번역산물이 동정 되었다.
A strain that produces a high level of carboxymethyl cellulase was isolated from rotten leaves. The isolated strain was revealed to be gram-negative, oxidase-positive, and catalase-negative. From the electron microscopic features, it was identified as a rod-shaped bacterium with peritrichous flagella and did not form spores. Morphological and biochemical characteristics of the strain were found to be similar to the Pseudomonas species. However, carbon utilization test showed different results. Based on the results, this new strain was identified as Pseudomonas sp. CMC-50. CMCase produced by this strain showed a strong activity in neutral and weak acidic conditions and maximum activity at $50^{\circ}C$.
Background: Red ginseng polysaccharides (RGPs) have been acknowledged for their outstanding immunomodulation and anti-tumor activities. However, their studies are still limited by the complexity of their structural features, the absence of purification and enrichment methods, and the rarity of the analytical instruments that apply to the analysis of such macromolecules. Thus, this study is an attempt to establish a new mass spectrometry (MS)-based analysis procedure for RGPs. Methods: Saponin pre-excluded powder of RG (RG-SPEP, 10 mg) was treated with 200 µL of distilled water and centrifuged for 5 h at 1000 rpm and 85 ℃. Ethanol-based precipitation and centrifugation were applied to obtain RGPs from the heated extracts. Further, endo-carbohydrase treatments were performed to produce specific saccharide fragments. Solid-phase extraction (SPE) processes were implemented to purify and enrich the enzyme-treated RGPs, while matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight/time-of-flight (MALDI-TOF/TOF) MS was employed for the partial structural analysis of the obtained RGPs. Results: Utilizing cellulase, porous graphitized carbon (PGC), hydrophilic interaction chromatography (HILIC), and MALDI-TOF/TOF MS, the neutral and acidic RGPs were qualitatively analyzed. Hexn and Hexn-18 (cellulose analogs) were determined to be novel neutral RGPs. Additionally, the [Unknown + Hexn] species were also determined as new acidic RGPs. Furthermore, HexAn (H) was determined as another form of the acidic RGPs. Conclusion: Compared to the previous methods of analysis, these unprecedented applications of HILIC-SPE and MALDI-TOF/TOF MS to analyze RGPs proved to be fairly effective for fractionating and detecting neutral and acidic components. This new procedure exhibits great potential as a specific tool for searching and determining various polysaccharides in many herbal medicines.
S. rugosoannulata의 배양액으로부터 4단계를 거쳐 분자량이 54 kDa인 CMCase를 분리 정제하였다. 이 효소는 pH 4.0에서 최대의 활성을 보여주는 acidic CMCase로 $40^{\circ}C$에서 최대활성을 나타냈다. EDTA에 의해 활성이 저해되는 것으로 보아 metalloenzyme으로 추정되며 1,10-phenanthroline과 KCN 및 L-cystein 등의 저해제에 효소활성이 크게 감소하였으며, $AgNO_{3},\;MgSO_{4},\;KCl$등의 금속염에서는 효소활성이 증가되었으나, $ZnSO_{4},\;BaCl_{2},\;CaCl_{2}$ 등에서는 효소활성이 저해되었다.
Bacillus licheniformis B1의 ${\beta}$-1,4-glucanase 유전자는 Escherichia coli BL21에서 발현되어, 이로부터 수용성의 50 kDa 단백질이 과량생산되었다. 반면에 B. licheniformis에서는 37 kDa의 형태가 분비되었다. E. coli에서 발현된 ${\beta}$-1,4-glucanase는 leader peptide가 제거되지 않고 포함되어 있고 Bacillus에서는 효소의 carboxy 말단에서 processing이 일어난 것으로 보인다. E. coli에서 생산된 ${\beta}$-1,4-glucanase의 최적온도는 $40^{\circ}C$이었지만, $60^{\circ}C$에서도 최대치의 76% 활성을 유지하였다. 효소의 최적 pH는 7이었고, 효소의 활성은 전체적으로 보면 약산성, 중성 및 약알칼리 영역에 널리 걸쳐 있었다. Cellulase는 식품, 세제, 펄프, 제지, 섬유산업 등 다양한 분야에서 주로 산성의 곰팡이계 효소가 이용되고 있으나, 중성 및 알칼리성 cellulase 연구 및 개발은 미흡한 편이다. 본 연구에서 개발된 중성 cellulase가 바이오 연료 개발 등의 분야에서 활용되기를 기대해 본다.
1. Cheatomium globosum의 밀기울 배양기에서 조효소를 추출하고 황산암모니움 염석 부분을 cellulose 분말 column으로 2개의 cellulase활성 부분(C-1, C-2)을 분리 하였다. 그 하나는 환원당 증가 활성이 강하며 (C-1) 다른 하나는 곁도 감소 활성이 강하였다. (C-2) 그러나 단백질 량은 C-1부분이 많았고 C-2 부분은 적었다. 2. 환원당 증가 활성이 강한부분 (C-1)을 DEAE-Sephadex A-25 column에서 분리할 결과 다시 2개의 성분 (C-1-1 및 C-1-2)으로 나누어 졌다. 그리고 C-1-2는 column에 강하게 흡착되었고 2M-NaCl의 용액으로 용출되었다. 이는 착색 된 것으로 봐서 C-1-1과는 아주 다른 단백질로 생각이 된다. 3. Cellulase C-1-1을 다시 Amberlite XE-64 column으로 분별하여 단일의 peak를 얻었다. 4. Cellulase C-1-1 부분의 초원심 침강계 면은 단일의 peak로 나타나고 또 자외선 홍수 spectrum도 전형적인 단백질의 흡수 spectrum을 나타 내었다. 5. Cellulase C-1-1의 최적 pH는 환원당 증가활성법으로나 점도 감소 활성법으로 다 같이 pH 4.0이였다. 6. 그리고 그의 최적 온도는 $40^{\circ}C$였다. 7. Cellulase C-1-1의 pH 안정성은 $40^{\circ}C$에서 pH 5.0 내지 pH 8.0의 범위 내였다. 8. 그리고 열안정성은 pH 4.0에서 $50^{\circ}C$ 이하였다
섬유소분해효소(CMCase)를 산업적으로 이용하기 위한 기초자료를 제공하고자 섬유소분해능이 우수한 L. japonicus로부터 CMCase를 분리 정제하였다. L. japonicus의 배양액으로부터 4단계를 거쳐 분자량이 42 kDa인 CMCase를 분리 정제하였다. 이 효소는 pH 6.0에서 최적의 활성을 보여주는 acidic CMCase로서 $30^{\circ}C$에서 최대 활성을 나타냈다. EDTA에 의해 활성이 저해되는 것으로 보아 metalloenzyme으로 추정되며, SDS에 의해 저해되는 것으로 보아 S-S기를 갖고 있는 효소로 판단된다. $Al_{2}(SO_{4})_{3}$와 $BaCl_{2}$에서는 효소 활성이 높았으나 그 이외의 금속염에서는 효소 활성이 낮았다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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