• 제목/요약/키워드: AGU

검색결과 19건 처리시간 0.017초

Evaluation of the genetic structure of indigenous Okinawa Agu pigs using microsatellite markers

  • Touma, Shihei;Arakawa, Aisaku;Oikawa, Takuro
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
    • /
    • 제33권2호
    • /
    • pp.212-218
    • /
    • 2020
  • Objective: Agu pigs are indigenous to the Okinawa prefecture, which is the southernmost region of Japan. Agu pigs were exposed to a genetic bottleneck during the 20th century, due to the introduction of European pig breeds. The objective of this study was to elucidate the genetic structure of Agu pigs and to determine their relationships with those of five European breeds, two Chinese breeds and Ryukyu wild boar using microsatellite markers. Methods: A total of 203 DNA samples from 8 pig breeds were used in this study. Genotyping was performed using 21 microsatellite markers distributed across 17 chromosomes. Results: Numbers of effective alleles in Agu pigs were fewer than in European breeds and Ryukyu wild boar. Among domestic pigs, Agu pigs had the lowest heterozygosity (0.423) and highest inbreeding coefficient (FIS = 0.202), indicating a severe loss of heterozygosity in Agu pigs possibly due to inbreeding. Neighbor-joining tree analysis was performed based on Reynolds' genetic distances, which clustered Agu pigs with Duroc pigs. However, principal component analysis revealed a unique genetic position of the Agu pig, and the second principal component separated Agu pigs from all other breeds. Structure analysis with the optimal assumption of seven groups (K = 7) indicated that Agu pigs form an independent cluster from the other breeds. In addition, high and significant FST values (0.235 to 0.413) were identified between Agu pigs and the other breeds. Conclusion: This study revealed a substantial loss of genetic diversity among Agu pigs due to inbreeding. Our data also suggest that Agu pigs have a distinctive genetic structure, although gene flows from European breeds were observed.

Maternal lineage of Okinawa indigenous Agu pig inferred from mitochondrial DNA control region

  • Touma, Shihei;Shimabukuro, Hirotoshi;Arakawa, Aisaku;Oikawa, Takuro
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
    • /
    • 제32권4호
    • /
    • pp.501-507
    • /
    • 2019
  • Objective: The Agu is the only native pig breed in Japan, which is reared in Okinawa prefecture, the southernmost region in Japan. Its origins are considered to be of Asian lineage; however, the genetic background of the Agu is still unclear. The objective of this study was to elucidate the maternal lineage of the Okinawa indigenous Agu pig with the use of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region. Methods: The mtDNA control regions of Agu pigs were sequenced and the phylogenetic relationship among Agu, East Asian and European pigs was investigated with the use of 78 Agu individuals. Results: Twenty-seven polymorphic sites and five different haplotypes (type 1 to type 5) were identified within the Agu population. Phylogenetic analysis indicated that types 1 and 2 were included in East Asian lineages; however, the remaining types 3, 4, and 5 were of European lineages, which showed a gene flow from European pigs in the 20th century. Sixty-seven out of 78 Agu individuals (85.9%) possessed mtDNA haplotypes 1 and 2 of the East Asian lineage, which were identical to two haplotypes of ancient mtDNA (7,200 to 1,700 years before the present) excavated at archaeological sites in Okinawa. Conclusion: This study confirmed that the East Asian lineage is dominant in the maternal genetic background of the Agu population, supporting the hypothesis that the ancestors of the Agu pig were introduced from the Asian continent.

TEMPO와 NaBr 의 농도 및 온도가 옥수수 전분의 선택적 산화반응에 미치는 영향 (The Effects of TEMPO, NaBr and Temperature on the Selective Oxidation of Primary Alcohol Groups in Corn Starch)

  • 서동순;장판식;김광옥
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제33권1호
    • /
    • pp.40-44
    • /
    • 2001
  • 이 연구에서는 TEMPO와 NaBr의 농도 및 온도가 옥수수 전분 내 1차 알코올기의 선택적 산화 반응에 미치는 영향을 조사하였다. TEMPO와 NaBr 및 온도의 수준이 증가함에 따라 반응 시간은 감소되는 경향을 나타내었다. TEMPO, NaBr 및 온도의 수준이 각각 1.7 mM/100 mM AGU, 100 mM/100 mM AGU 및 $14^{\circ}C$까지는 이들의 수준이 증가함에 따라 반응 시간이 급격히 단축되었으나, 이 이후의 수준부터는 단축정도가 적었다. 수율은 NaBr의 수준이 증가함에 따라 감소하였고, TEMPO와 온도는 수율에 큰 영향을 주지 않는 것으로 나타났다. 선택성은 NaBr의 농도와 온도가 각각 100 mM/100 mM AGU와 $6^{\circ}C$까지는 유의적인 차이를 보이지 않았으며, 이 이후의 수준부터 NaBr 및 온도가 증가함에 따라 유의적으로 감소하는 것으로 나타났다.

  • PDF

가교결합 감자 전분의 호화특성과 형태학적 변화 (Influence of Crosslinking on Gelatinization Behavior and Morphological Change of Potato Starch)

  • 김향숙;이영은
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제28권3호
    • /
    • pp.580-586
    • /
    • 1996
  • 감자 전분을 epichlorohydrin과 반응시적 제조한 가교결합 감자 전분(가교파도 2,300, 2,100, 1,900 AGU/CL)의 호화 특성과 호화 중 전분 입자의 형태학적 변화를 조사하였다. 천연 감자 전분은 한 단계의 급격한 팽윤 양상을 보이나, 동부 전분은 두 단계, 가교결합 전분은 가교화도에 따라 각각 다른 평윤 양상을 나타내었다. 가교화도가 증가할수록 팽윤력과 용해도는 입자의 팽윤이 억제되어 크게 감소하였다. 광투과도는 가교파도가 증가할수록 감소하였다. 가교결합 전분 입자의 팽윤이 동부 전분에 비해 억제되었음에도 불구하고 $55{\sim}95^{\circ}C$ 온도 법위와 2.5%까지 의 농도 범위에서는 동부 전분보다 더 투병하였다. 아밀로그래프에 의한 초기 호화온도는 가교화도가 증가할수록 입자의 팽윤이 지연되어 올라갔으며, 최고점도에 도달하는 시간이 매우 지인되었다 가교화도 2,300과 2,100 AGU/CL 가교 전분은 어느정도 팽윤이 억제되며 동시에 팽윤된 전분 입자가 내열성과 내전단성을 갖게되어 서서히 점도가 증가하여 천연 감자 전분보다 더 높은 최고 점도에 도달하는 반면에, 1.900AGU/CL 가교 번분은 너무 강하게 팽윤이 억제되어 최고 점도를 나타내지 못하였다. 또한 가교 결합 전분의 setback과 consistency 정도는 천연 감자 전분과는 달리 생각하면 젤 형성도 가능함을 시사하였다. 가교화도가 낮을 때는 사방으로의 접선방향의 팽윤이 가능하였으나, 가교화도가 증가함에 따라 밀전분과 같은 일차원적인 접선방향의 팽윤이 우세해졌다. 가열 중 전분입자의 형태학적인 미세구조의 변화는 가교화도에 따른 호화특성들의 차이를 잘 설명하여 주었다.

  • PDF

가교결합 감자 전분의 이화학적 특성 (Physicochemical Properties of Crosslinked Potato Starch)

  • 김향숙;이영은
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제28권3호
    • /
    • pp.573-579
    • /
    • 1996
  • Epichlorohydrin과 반응시켜 제조한 가교 결합 감자전분의 이화학적 성질을 조사하였다. 가교화 반응의 수율은 평균 85.2%, 가교화도는 epichlorohydrin 첨가량이 전분 건량의 0.005%일 때 2400 AGU/CL이고 0.01% 증가시 가교결합 1개 당 200개의 무수포도당 단위씩 감소하였다. 가교화에 의해 일반성분 중 평형 수분함량, 조단백, 회분함량이 감소하였다. 천연 및 가교결합 감자전분의 인 함량은 $0.07{\sim}0.09%$로 동부 전분 0.01%에 비해 높았다. 물결합능력은 가교화도가 증가함에 따라 증가하였으며 가교화도가 2100 AGU/CL일 때 85.2%로 동부 전분 86.3%와 비슷한 수준에 도달하였다. 전분의 요오드 흡착 특성은 천연감자 전분이 594nm, 동부 전분이 598 nm에서 최대흡수파장을 나타냈으며, 가교화에 의해 580 nm 근처로 이동하였다. 청가로부터 계산한 아밀로오스 함량은 감자 전분이 21.1%, 동부 전분이 27.7%이었으며, 가교결합 감자 전분은 알카리에 의한 완전 호화 팽윤이 억제되어 아밀로오스 함량 측정은 불가능하였다. 감자 전분 입자는 작은 것은 구형, 큰 것은 타원형이 많았으며, 크기는 $8{\sim}57{\mu}m$로 타원형의 동부 전분 $7{\sim}23{\mu}m$보다 컸으며, 가교화도가 증가함에 따라 크기 분포는 약간 큰 쪽으로 이동하였다. 천연 감자 전분의 표면은 매끄러웠으나, 가교반응에 의해 표면이 녹아내리듯 거칠어졌다. X-ray 회절양상은 가교화에 의해 변하지 않아 천연 감자 전분과 동일한 B형을 나타냈으며, 상대결정화도는 $34.0{\sim}36.1%$로 천연 감자 전분의 34.1%와 비슷한 수준을 유지하였다. 시차주사열량계로 측정한 호화온도(Tp)는 천연 감자 전분의 $43.1^{\circ}C$, 가교결합 감자 전분은 $62.9^{\circ}C{\sim}63.4^{\circ}C$로 거의 변화가 없었으며, 호화엔탈피($-{\Delta}H_G$)는 $10.63{\sim}11.32J/g$으로 천연 감자 전분과 비슷하였다. X-ray 회절도와 시차주사열량계 결과로부터 가교결합은 전분 입자의 비결정질 영역에서 이루어졌다고 결론지을 수 있다.

  • PDF

Virulence genes of Streptococcus mutans and dental caries

  • You, Yong-Ouk
    • International Journal of Oral Biology
    • /
    • 제44권2호
    • /
    • pp.31-36
    • /
    • 2019
  • Streptococcus mutans is one of the important bacteria that forms dental biofilm and cause dental caries. Virulence genes in S. mutans can be classified into the genes involved in bacterial adhesion, extracellular polysaccharide formation, biofilm formation, sugar uptake and metabolism, acid tolerance, and regulation. The genes involved in bacterial adhesion are gbps (gbpA, gbpB, and gbpC) and spaP. The gbp genes encode glucan-binding protein (GBP) A, GBP B, and GBP C. The spaP gene encodes cell surface antigen, SpaP. The genes involved in extracellular polysaccharide formation are gtfs (gtfB, gtfC, and gtfD) and ftf, which encode glycosyltransferase (GTF) B, GTF C, and GTF D and fructosyltransferase, respectively. The genes involved in biofilm formation are smu630, relA, and comDE. The smu630 gene is important for biofilm formation. The relA and comDE genes contribute to quorumsensing and biofilm formation. The genes involved in sugar uptake and metabolism are eno, ldh, and relA. The eno gene encodes bacterial enolase, which catalyzes the formation of phosphoenolpyruvate. The ldh gene encodes lactic acid dehydrogenase. The relA gene contributes to the regulation of the glucose phosphotransferase system. The genes related to acid tolerance are atpD, aguD, brpA, and relA. The atpD gene encodes $F_1F_0$-ATPase, a proton pump that discharges $H^+$ from within the bacterium to the outside. The aguD gene encodes agmatine deiminase system and produces alkali to overcome acid stress. The genes involved in regulation are vicR, brpA, and relA.

외란에 강인한 정밀공중물자수송시스템 연착륙 알고리즘 설계 (Design of a Robust Precision Aerial Delivery System Soft Landing Algorithm)

  • 김태욱
    • 항공우주시스템공학회지
    • /
    • 제16권4호
    • /
    • pp.77-87
    • /
    • 2022
  • PADS(Precision Aerial Delivery System)은 원형 낙하산을 이용한 공중 물자수송 시스템의 낮은 착륙 정확도를 개선해줄 수 있는 장비로 AGU(Airborne Guidance Unit)을 장착하여 원하는 목적지로 안전하게 물자를 수송할 수 있다. 현재 외국에서 개발된 PADS 성능은 착륙 정확도가 CEP50 100m 범위로 보고되고 있으나 실제 지형 및 기상환경에 따라 많은 차이를 보인다. 산악지역이 많은 국내 환경에서는 국부적인 지형변화에 따른 풍향, 풍속 변화가 심하고 이는 착륙 정밀도에 영향을 미친다. 본 연구에서는 이러한 문제점을 해결하기 위해 PADS의 6DOF 비선형 모델링을 기반으로 HILS(Hardware In the Loop Simulation)를 구축하여 바람 환경에서 Ram air parachute의 기동 특성을 분석하였다. 이러한 기동 특성을 고려하여 EM(Energy Management) 기동과 FA(Final Approach) 기동을 포함한 정밀 연착륙 알고리즘을 설계하였다. PADS 시뮬레이션 결과 CEP50 40m 이내로 정밀 연착륙이 가능하였으며, 향후 이러한 연구 결과를 바탕으로 실제 PADS 투하시험을 통하여 정밀 공중 물자수송 시스템에 적용될 수 있을 것이다.

Rotating Detonation Engine Study in AGU

  • Hayashi, A. Koichi;Uemura, Yuho;Yamada, Takayuki;Yamada, Eisuke
    • 한국추진공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국추진공학회 2011년도 제37회 추계학술대회논문집
    • /
    • pp.1-4
    • /
    • 2011
  • Detonation is useful phenomena to get an effective thrust for aerospace vehicle. Fast pressure rise of detonation provides a cycle close to the constant volume system to use energy efficiently. From this point detonation can be used as an aerospace engine system. There are several types of detonation engine; pulse detonation engine (PDE) which provides a thrust by detonation intermittently, and oblique detonation engine (ODE), spin detonation engine (SDE), and rotating detonation engine (RDE) which, on the other hand, provide a continuous thrust.

  • PDF

보현산천문대 고분산 편광 분광기 개념 설계 (CONCEPTUAL DESIGN STUDY OF THE BOES STOKESMETER)

  • 김강민;한인우;;;유계화
    • 천문학논총
    • /
    • 제20권1호
    • /
    • pp.117-124
    • /
    • 2005
  • We plan to install the polarimetric optics in the AGU(acqusition and guiding unit) of the 1.8 m telescope at the BOAO(Bohyunsan Optical Astronomy Observatory). With this, the spectropolarimetric observations with the resolution of 45,000 and 60,000 in 4,000 to $8,000{\AA}$ ange could be done by the BOES(BOao Echelle Spectrograph). If we use the precision radial velocity measurement capability of the BOES, the accuracy of the magnetic field intensity measurements with this new BOES stokesmeter will be much increased. We present here the design concept of the BOES stokesmeter. Some details on the optics, mechanical parts, fiber parts and the lab test procedures of this stokesmeter are explained.