• 제목/요약/키워드: 5' UTR

검색결과 136건 처리시간 0.024초

Transcriptional Activity of Plasmodium Subtilisin-like Protease 2 (Pf-Sub2)5' Untranslated Regions and Its Interaction with Hepatocyte Growth Factor

  • Liao, Shunyao;Liu, Yunqiang;Jung, Suk-Yul;Cho, Pyo-Yun;Zheng, Bing;Park, Hyun
    • Parasites, Hosts and Diseases
    • /
    • 제48권4호
    • /
    • pp.291-295
    • /
    • 2010
  • The onset, severity, and ultimate outcome of malaria infection are influenced by parasite-expressed virulence factors and individual host responses to these determinants, In both humans and mice, liver injury is involved after parasite entry, which persists until the erythrocyte stage after infection with the fatal strain Plasmodium falciparum (Pf), Hepatocyte growth factor (HGF) has strong anti-apoptotic effects in various kinds of cells, and also has diverse metabolic functions. In this work, Pf-subtilisin-like protease 2 (Pf-Sub2) 5' untranslated region (UTR) was analyzed and its transcriptional activity was estimated by luciferase expression. Fourteen TATA boxes were observed but only one Oct-1 and c-Myb were done. In addition, host HGF interaction with Pf-Sub2 was evaluated by co-transfection of HGF- and Pf-Sub2-cloned vector. Interestingly, -1,422/+12 UTR exhibited the strongest luciferase activity but -329 to + 12 UTR did not exhibit luciferase activity. Moreover, as compared with the control of unexpressed HGF, the HGF protein suppressed luciferase expression driven by the 5' untranslated region of the Pf-Sub2 promoter. Taken together, it is suggested that HGF controls and interacts with the promoter region of the Pf-Sub2 gene.

수온변화에 따른 붉바리(Epinephelus akaara)의 heat shock protein (Hsp) 70 mRNA 발현 (Molecular Cloning and Expression Analysis of Red-spotted Grouper, Epinephelus akaara Hsp70)

  • 민병화;허준욱;박형준
    • 생명과학회지
    • /
    • 제28권6호
    • /
    • pp.639-647
    • /
    • 2018
  • 한국의 고급 양식대상 어종인 붉바리(Epinephelus akaara)로부터 새로운 heat shock protein (Hsp) 70을 동정하였다. 붉바리 Hsp70 (RgHsp70)의 cDNA는 RACE (rapid amplification of cDNA ends)법을 사용하였고, RgHsp70 cDNA의 전장은 2,152 bp이고, 5'-terminal untranslated region (UTR)은 105 bp, 3'-terminal UTR은 274 bp, 590개의 아미노산을 암호화하는 open reading frame (ORF)는 1,773 bp였으며, 분자무게(molecular weight)는 64.9 kDa 및 등전위값(isoelectric point, pI)은 5.2였다. 추정되는 아미노산 비교 및 계통발생학적 분석 결과, 다른 어종과 마찬가지로 Hsp70 고유의 signature를 포함하는 것을 비롯하여 높은 유사성을 나타내었으므로 RgHsp70이 Hsp70 family임을 확인할 수 있었다 RgHsp70 mRNA는 간과 두신 조직에서 높은 발현을 보였으며, 48시간 동안 수온별(21, 18, 15 및 $12^{\circ}C$) 노출 후 간 조직에서 대조구인 $21^{\circ}C$보다 $12^{\circ}C$에서 발현이 증가함을 확인하였다. 본 연구에서는, 수온이 하강함에 따라 RgHsp70 mRNA 발현에 주요한 영향을 미치는 것으로 보아, 수온변화에 따른 스트레스로 인해 발현의 변화를 나타내는 주요 스트레스성 단백질임을 확인할 수 있었다.

Expression and Secretion of Human Serum Albumin in the Yeast Saccharomyces cerevisae

  • Kang, Hyun-Ah;Jung, Moon-Soo;Hong, Won-Kyoung;Sohn, Jung-Hoon;Choi, Eui-Sung;Rhee, Sang-Ki
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제8권1호
    • /
    • pp.42-48
    • /
    • 1998
  • In order to maximize the secretory expression of human serum albumin (HSA) in the yeast Saccharomyces cerevisiae, a series of HSA expression vectors were constructed with a combination of different promoters, 5' untranslated regions (5'UTR), and secretion signal sequences. The expression vector composed of the galactose-inducible promoter GALl0, the natural 5'UTR, and the natural signal sequence of HSA directed the most efficient expression and secretion of HSA among the constructed vectors when introduced into several S. cerevisiae strains. Although the major form of HSA expressed and secreted in the yeast transformants was the mature form of 66 kDa, the truncated form of 45 kDa was also detected both in the cell extract and in the culture supernatant. The level of the intact HSA protein in the culture supernatant reached up to 30 mg/l at 24 h of cultivation in a shake-flask culture but began to decrease afterwards, indicating that the secreted HSA protein was unstable in a prolonged culture of yeast.

  • PDF

사람의 세포질 Superoxide Dismutase 유전자의 클로닝과 대장균내에서의 대량발현에 관한 연구 (Molecular Cloning and High-Level Expression of Human Cytoplasmic Superoxide Dismutase Gene in Escherichia coli)

  • 이우길;김영호;양중익;노현모
    • 미생물학회지
    • /
    • 제28권2호
    • /
    • pp.91-97
    • /
    • 1990
  • 생체내의 유해산소를 제거하는 superoxide dismutase (superoxide : superoxide oxidoreductase E.C.1.15.1.1) 중 세포질내에서 그 활성을 지니는 인체의 세포질 superoxide dismuta~ie (SODl) 유전자를 사람의 간 cDNA library로부터 동위원소로 표지된 oligonucleotide probe를 이용, in situ plaque hybridization 방법으로 선별 분리하여 내장균 벡터로 클로닝하였다. 이 클론은 SOD1 유전자의 5"L"TR과 3’UTR을 포함한 1.6 kb 정도의 cDNA였다 SOD1 구조유전자만을 선택적으로 분리하기 위해서 ATG를 포함하는 sense strand primer와 3’UTR 부위의 antisense strand primer를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction) 방법을 써서 SOD1 구조유전자 부위만을 선택적으로 증폭시켰다. Taq DNA polymerase에 의해 증폭된 DNA를 벡터 pUCl9의 multiple cloning site (MCS) 내의 Hinc II 위치에 넣였으며 이 insert DNA를 M13 mp19으로 옮겨 dideoxy chain termination 방법으로 sequenase를 사용하여 염기서열을 결정하였다. 클론닝된 cDNA는 153개의 아미노산을 포함하고 있는 하나의 open reading frame (ORF)을 가셨다. 중합효소연쇄반응에 의해 이때 증폭된 SOD1 구조유전자를 $\lambda P_{L}$ 프로모터를 포함하고 있는 발현 벡터 pUPL에 옮긴 후 대장균에서 대량으로 발현시켰다. 이때 발현된 단백질 SOD1은 고유의 효소활성을 가지고 있었다.

  • PDF

미꾸라지(Misgurnus mizolepis) Apolipoprotein A-I cDNA의 구조, 분자계통 및 발현 특징 분석 (Characterization of Mud Loach (Misgurnus mizolepis) Apolipoprotein A-I: cDNA Cloning, Molecular Phylogeny and Expression Analysis)

  • 이윤호;노재구;김근용;조영선;남윤권;김동수
    • 한국양식학회지
    • /
    • 제20권1호
    • /
    • pp.65-72
    • /
    • 2007
  • 우리나라 주요 담수어종인 미꾸라지(Misgurnus mizolepis)로 부터 apolipoprotein A-I (apoA-I) cDNA를 분리하고 그 구조, 분자 계통 및 발현 특징을 분석하였다. 미꾸라지 apoA-I cDNA는 254개의 아미노산을 암호화하고 있는 762 bp의 ORF를 포함하고 있었으며 아울러 24 bp의 5'UTR 및 293 bp의 3'UTR(종결 코돈 및 poly A tail 제외)를 갖고 있었다. 미꾸라지 apoA-I은 여타 척추동물 apoA-I과의 다중배열 시 염기서열에서는 많은 차이를 나타내었지만 단백질의 구조적 특징은 높은 상동성을 보였고, 또한 척추동물의 apoA-I들과의 분자계통을 분석한 결과, 종래 알려진 분류학적 위치와 비교적 잘 일치하였다. 미꾸라지 apoA-I mRNA는 RT-PCR 분석을 통해 간 및 뇌 조직에서 분석한 다른 조직보다 유의적으로 높게 발현하는 것으로 나타났고, 특히 간에서 가장 높은 발현을 보였다. 수정시부터 부화 후 14일까지 초기 발생 및 치어에서의 apoA-I mRNA 발현을 조사한 결과 수정 8시간째부터 급격한 발현의 증가가 시작되어 이후 지속적으로 높은 발현 수준을 유지하였다.

GBSSI 유전자 3'UTR 영역의 발현 억제 dsRNAi 벡터를 이용한 아밀로스함량 조절 벼 개발 (Variation of Amylose Content Using dsRNAi Vector by Targeting 3'-UTR Region of GBSSI Gene in Rice)

  • 박향미;최만수;천아름;이정희;김명기;김연규;신동범;이장용;김율호
    • 한국육종학회지
    • /
    • 제42권5호
    • /
    • pp.515-524
    • /
    • 2010
  • 본 연구에서는 RNAi 기작을 이용하여 식미에 중요한 영향을 미치는 아밀로스 함량을 다양화하기 위해 GBSSI 유전자의 3'-UTR 부위를 targeting하여 dsRNA를 생성시킬 수 있는 운반체를 제작하고, 벼에 형질전환 하였다. 작성된 형질전환체들을 대상으로 $I_2$-KI 용액 반응과 아밀로스 함량을 분석한 결과, $I_2$-KI 용액에 대한 반응은 waxy 타입으로 나타났으나 아밀로스 함량은 찰벼와 저아밀로스 벼 사이에 해당되는 범위를 보였다. 원품종과 형질전환체 간의 아밀로펙틴 사슬 분포의 차이를 비교한 결과, 단쇄에 해당되는 A1과 B1 사슬의 분포는 감소한 반면, 중쇄에 해당되는 B2와 장쇄인 B3 사슬의 분포는 다소 증가하였으며, B3 사슬의 분포비율은 사용된 품종에 따라 약간의 차이를 보였다. 배유 단면의 전자현미경적 구조를 비교한 결과, 원품종에 비해 형질전환체의 전분립 크기가 작아지고 쪼개짐의 형태가 완만한 굴곡을 보였다. 이러한 결과를 바탕으로, RNAi 기술을 이용하여 다양한 아밀로스 함량이 조절된 형질전환 벼를 개발하기 위해서는 targeting 부위를 결정하는 것이 하나의 중요한 전략이 될 수 있음을 확인하였다.

경북지방에서 사육되고 있는 한우에서 소 바이러스성 설사 바이러스의 유전적 특징 (Genetic Characterization of Bovine Viral Diarrhea Virus from Korean Indigenous Calves in Gyeongbuk Province)

  • 송무찬;최경성
    • 한국임상수의학회지
    • /
    • 제27권3호
    • /
    • pp.220-224
    • /
    • 2010
  • 소 바이러스성 설사 바이러스는 전세계 축산업에서 중요한 질병이다. 대한민국의 최대 소 사육지역인 경북지방에서 유행하고 있는 소 바이러스 설사 바이러스를 조사하기 위해, 소 바이러스성 설사 바이러스의 임상증상을 보이는 한우 송아지로부터 365개의 분변을 채취하였다. 가검물을 채취한 365 마리 송아지 가운데 50 마리가 소 바이러스성 설사 바이러스에 양성반응을 보였다. 5'-UTR을 이용한 계통발생 분석에서 48두 송아지가 BDVD-2a에 속했고, 2두에서만 각각 BVDV-1a와 BVDV-1b로 분류되었다. 이들 결과는 BVDV-2a가 경북지역의 한우 송아지에서 유행하고 있음을 제시하고 있다.