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Bacillus subtilis KL-57로부터 생산되는 생체계면활성제 합성 유전자 클로닝 (Cloning of Biosurfactant-Producing Gene from Bacillus subtilis KL-57)

  • 강상모;이병옥;이철수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제22권6호
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    • pp.593-598
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    • 1994
  • A bacterium KL-57 which exhibited biosurfactant activity was isolated. This bacterium was identified as Bacillus subtilis. The biosurfactant-producing gene of B. subtilis KL-57 was cloned into R subtilis MI113 by using plasmid pTB523. The plasmid DNA from the clone was found to carry a 18 kb PstI insert. The biosurfactant-producing gene was cleaved into 4 fragments by SmaI, 3 fragments by PvulI or EcoRl, 4 fragments by PvulI and EcoRI double digestion, 5 fragments by AccI, and 2 fragments by KpnI, HindIII or BamHI. By subcloning the 18 kb Pstl insert, a 2.3 kb EcoRl fragment conferred the biosurfactant producing activity on B. subtilis cells. The 2.3 kb had one HindIII cleave site. But Two fragments, which corresponds HindIII/EcoRl termini, exhibited no biosurfactant activity.

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ErmSF의 N-Terminal End Region에 존재하는 $^{60}RR^{61}$의 23S rRNA Methylation에서의 역할 (Functional Role of $^{60}RR^{61}$ in 23S rRNA Methylation, Which is in N-Terminal End Region of ErmSF)

  • 진형종
    • 미생물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.193-198
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    • 2008
  • ErmSF는, 235 rRNA의 A2058에 methylation 시켜서 macrolide-lincosamide-streptogramin B ($MLS_B$)계 항생제의 부착을 저해함으로써 항생제의 활성을 억제하는 내성인자 단백질인 ERM 단백질의 하나로, 다른 ERM 단백질과는 달리 긴 N-terminal end region을 가지고 있고 이 부위의 25%를 arginine이 차지하고 있다. 특히 $^{58}RARR^{61}$ 부위에 arginine이 모여 있어서 여기에 존재하는 R의 역할을 알아보기 위해 1-57, 1-59 그리고 1-60과 1-61이 제거된 결손 변이 단백질을 대장균에 발현하고 그 활성을 성장곡선을 작성하여 알아보았다. 그 결과 R60과 R6l이 활성에 중요한 것으로 관찰되었다. 1-59의 아미노산이 결손 된 유전자를 사용하여 R60A, R61A와RR60, 61AA의 위치선정 치환 변이 단배질의 세포내 활성을 측정하여 본 결과 R60의 역할이 R6l보다 큰 것으로 관찰되었으며 이들의 활성에서의 역할은 상호보완적인 것으로 나타났다. 그리고 이 아미노산들이 2차 구조인 $\alpha$-helix의 일부일 것으로 추정되었다.

Segmented TMA T-loop spring에 의한 견치 후방이동시의 응력분포에 관한 광탄성법적 분석 (A photoelastic study of the stress distribution on canine retraction by segmented TMA T-loop spring)

  • 윤영주;김광원;유필식
    • 대한치과교정학회지
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    • 제31권2호통권85호
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    • pp.199-207
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    • 2001
  • 본 연구는 교정치료를 시행함에 있어 전치부 crowding을 해결하기 위한 견치의 단독견인 방법중 새로운 segmented TMA T-loop spring으로 견치 후방견인시 치근단과 그 주위 치조골에서의 응력상태를 알아보기 위해 시행되었다. PL-3 epoxy resin으로 광탄성 모형을 제작하여 B/L ratio가 0.25, 0.5, 0.75인 위치로 T-loop을 위치시키고 각 위치에서 5mm, 3mm, 1mm activation하였다. 이후 광탄성 응력 해석장치를 이용하여 견치견인시 치근단과 그 주위 치조골에서의 초기 응력 상태를 광탄성법으로 분석한 바, 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. T-looP 위치에 상관없이 activation량이 감소할수록 상악 1소구치 발치부위에 응력이 감소하였고 상악 1대구치의 함입응력은 증가하였다. 2. 5mm activation시 T-loop위치가 구치부쪽으로 이동할수록 상악 1소구치 발치부위에 응력이 증가하였다. 3. 3mm activation시 T-loop위치가 구치부쪽으로 이동할수록 상악 1소구치 발치부위와 상악 1대구치 협측 근심치근 근심면하방 1/2부위에 응력이 증가하였다. 4. 1mm activation시 T-loop위치가 견치쪽으로 이동할수록 상악 견치의 근심치근면 상방과 치근첨 하방의 응력이 증가하였다. 5. B/L ratio가 0.25이고 3mm activation시 상악견치의 치체이동이 나타났다. 이상의 결과를 종합해볼 때 segmented T-loop spring의 근, 원심 위치 와 activation량을 조절하여 원하는 치아이동과 고정원 조절이 가능하다고 사료된다.

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살충성(殺蟲性) O,O-Diethylphenylphosphate유도체(誘導體)들에 의(依)한 Acetylcholinesterase의 Phosphorylation에 미치는 자유(自由)에너지 관계(關係) (Linear Free Energy Relationship on the Phosphorylation of Acetylcholinesterase by Insecticidal O,O-Diethylphenylphosphate Derivatives)

  • 성낙도
    • 농업과학연구
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    • 제11권1호
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    • pp.176-181
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    • 1984
  • 살충성 O,O-diethylphenylphosphate (A)와 3,5-dimethylphenyl-O,O-diethylphosphate 유도체 (B)에 의한 acetylcholinesterase(Ach E)의 phosphorylation 반응에 미치는 정량적인 자유에너지 관계(LFER)를 알아보기 위하여 Ach E의 두 작용점인 esteratic-anionic site에 대응하는 (A) 및 (B)의 P원자 및 meta 위치간의 공간직선 거리 및 알짜전하를 확장 H$\ddot{u}$ckel이론(EHT)에 의한 MO 계산 방법으로 계산하고 여러 가지 치환기상수와 $pI_{50}$ 상수를 Hammett 및 Okamoto-Brown식, Taft와 Swaln-Lupton의 DSP식에 적용한 회귀분석 결과로부터 살충작용에 미치는 정량적인 자유에너지 관계, %R과 %F를 계산하여 검토하였다. 즉, (A) 및 (B)의 살충효과는 서로 비슷하였으며 blending coefficient (${\lambda}$)는 모두 ${\lambda}$<1의 값을 나타내었다. (A) 및 (B)의 resonance effect (%R)와 field effect (%F)는 각각 %R=33.5, %F=66.5 그리고 %R=2, %F=98로 각각 계산되었는데(B)와 같이 phenyl group에 bulky한 소수성의 methyl group이 결합될수록 resonance effect($R_{\pi}$)보다는 direct through space field effect ($F_D$)가 아닌 through space field effect가 더 크게 영향을 미치게 된다는 사실을 알 수 있었다.

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공공도서관의 진단적 평가와 대안모색 - 대구광역시를 중심으로 - (Diagnostic Evaluation and Alternative Plans of Public Libraries in Taegu Metropolitan City)

  • 윤희윤
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.47-67
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    • 2000
  • 본 연구는 대구광역시 공공도서관을 대상으로 로그-회귀분석에 의한 경영성과를 평가하고 대안을 모색하였다. 투입예산에 대한 산출효과(생산성)를 분석한 결과, 기울기(b)의 누적값(${\Sigma}b_n$)은 약 3.732이므로 지역주민에 대한 정보봉사력은 매우 낮은 것으로 밝혀졌다. 이에 대한 대안으로 도서관 정체성의 재정립, 최적의 입지선정과 증설, 예산배정 및 장서구성의 개선, 적정 인력의 확보와 조직개편, 웹환경의 최적화, 이용자봉사의 강화를 제시하였다.

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위성자료를 이용한 산화지의 입목 손실량 평가 (Evaluation of Damaged Stand Volume in Burned Area of Mt. Weol-A using Remotely Sensed Data)

  • 마호섭;정영관;정수영;최동욱
    • 한국지리정보학회지
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    • 제2권2호
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    • pp.79-86
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    • 1999
  • 본 연구는 1995년 4월 5일 진주시 월아산지역에서 발생한 산화지를 1995년 5월에 관측된 Landsat TM화상 데이터로부터 산림내 피해지를 분류하고 그 입목손실량을 추정하기 위해서 실시되었다. 화상 데이터에서 11개의 GCP를 선정하여 Affine좌표변환식에 의해 TM지도좌표체계에 일치되도록 화상을 기하보정 처리한 후 공1차내삽법(bilinear interpolation)에 의해 재배열하였다. 재배열된 화상 데이타를 감독분류 중 최대우도법에 의해 토지이용구분을 실시하였다. 산화지로 분류된 지역과 비산화지로 분류된 인접지역 중 임상(Pinus thunbergii)과 지형이 동일한 지역을 GIS기법에 의해 추출하고 이 지역을 표준지로 선정하였다. 선정된 표준지를 중심으로 표준목의 재적과 수령을 Criterion laser estimator와 WinDENDRO$^{tm}$(v. 6.3b)시스템에 의해 분석하였다. 표준목의 흉고직경은 20.9cm, 수고는 9.7m, 재적은 $0.1396m^3$으로서 표준지의 임분재적은 $2.9316m^3$/0.04ha로 나타났으며, 산화지 218.4ha에서의 총 입목손실량은 $16,007m^3$로 평가되었다.

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Ecological Attributes by Forest Types in the Natural Forest of Mt. Odae

  • Choi, Yeong Hwa;Kim, Ji Hong;Chung, Sang Hoon
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제33권1호
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    • pp.66-73
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    • 2017
  • This study was conducted to evaluate the ecological attributes of forest types which were classified by cluster analysis in the natural forest of Mt. Odae on the basis of the vegetation data (232 sampling points) from the point-quarter sampling methods. For the classified types, the species composition was expressed by importance value to describe the stand structure and the species diversity was quantified using the Shannon's diversity index. Recognized forest types were 1) Quercus mongolica-Pinus densiflora-Betula ermanii forest type, 2) Mixed mesophytic forest type, 3) Q. mongolica forest type, 4) B. ermanii forest type. Species diversity indices of total and overstory were highest in the Mixed mesophytic forest type (3.465 and 2.942), and lowest in the B. ermanii forest type (0.118 and 0.832). In addition to that, Q. mongolica-P. densiflora-B. ermanii forest type was calculated as 3.226 and 2.565, and Q. mongolica forest type was calculated as 2.776 and 1.218 in total and overstory, respectively. It was considered that after the P. densiflora and B. ermanii first invaded and site condition became good, Q. mongolica-P. densiflora-B. ermanii forest type was dominated by Q. mongolica. Mixed mesophytic forest type showed the most stable stand structure with various species distributed uniformly. Q. mongolica forest type would preserve the present stand status for a while, and the B. ermanii in B. ermanii forest type would be pressed by other species over time.

신생아에 있어 TcB[transcutaneous bilirubinometry]를 이용한 고빌리루빈혈증의 사정 (Assessment of Neonatal Hyperbilirubinemia Using a Transcutas Bilirubinometry)

  • 안영미;김미란;이상미;전용훈
    • 대한간호학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.51-59
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    • 2003
  • Purpose: The purpose of the study is to investigate the relationship between total serum bilirubin(TSB) and transcutaneous bilirubinometry(TcB) in neonates with jaundice. Method: TcB from various sites(forehead, sternum, abdomen, buttock, hand, dorsalis-pedia) was measured using a JM-102 in a total of 102 neonate, 42 female and 60 male, with the mean 37.5 gestational week and the mean 2,903 gram of birth weight, as well as TSB from capillary punctures. Result: The mean bilirubin was 11.73 in serum, 20.55 on the forehead, 17.23 on the sternum, 16.19 on the abdomen, 18.22 on the buttock, 15.83 on the hand and 15.49 on the dorsalis-pedia. The relationship between TSB and TcBs were formulated by simple regression with 0.406 < r < 0.668(p < .000). A higher relationship was revealed between TSB and TCB at the forehead in infants of full-term, ABO incompatibility, and Hb greater than 16 mg/dl(r =0.725, 0.790, and 0.717, retrospectively). Phototherapy altered the measurement of TcB per site. Conclusion: TcB on the forehead is a reliable, noninvasive and convenient measurement of TSB in normal infants(Institutions need to establish quantitative equations representing the specific relationship between TSB and TCB according to the hemodynamic problems of infants such as ABO incompatibility, or low Hb).

Cloning and Characterization of Cellulase Gene (cel5B) from Cow Rumen Metagenome

  • Kang, Tae-Ho;Kim, Min-Keun;Barman, Dhirendra Nath;Kim, Jung-Ho;Kim, Hoon;Yun, Han-Dae
    • 농업생명과학연구
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    • 제46권2호
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    • pp.129-137
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    • 2012
  • A carboxymethyl cellulase gene, cel5B, was cloned, sequenced, and expressed in Escherichia coli. pRCS20 in E. coli was identified from metagenomic cosmid library of cow rumen for cellulase activity on a carboxymethyl cellulose agar plates. Cosmid clone (RCS20) was partially digested with Sau3AI, ligated into BamHI site of pBluescript II SK+ vector, and transformed into E. coli $DH5{\alpha}$. The insert DNA of 1.3 kb was obtained, designated cel5B, which has the activity of hydrolyzation of CMC. The cel5B gene had an open reading frame (ORF) of 1,059 bp encoding 352 amino acids with a signal peptide of 48 amino acids and the conserved region, VIYEIYNEPL, belongs to the glycosyl hydrolase family 5. The molecular mass of Cel5B protein expressed from E. coli $DH5{\alpha}$ exhibited to be about 34 kDa by CMC-SDS-PAGE. The optimal pH was 8.0, and the optimal temperature was about $50^{\circ}C$ for its enzymatic activity.

Investigation of the Binding Site of CCR2 using 4-Azetidinyl-1-aryl-cyclohexane Derivatives: A Membrane Modeling and Molecular Dynamics Study

  • Kothandan, Gugan;Gadhe, Changdev G.;Cho, Seung Joo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권11호
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    • pp.3429-3443
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    • 2013
  • Chemokine receptor (CCR2) is a G protein-coupled receptor that contains seven transmembrane helices. Recent pharmaceutical research has focused on the antagonism of CCR2 and candidate drugs are currently undergoing clinical studies for the treatment of diseases like arthritis, multiple sclerosis, and type 2 diabetes. In this study, we analyzed the time dependent behavior of CCR2 docked with a potent 4-azetidinyl-1-aryl-cyclohexane (4AAC) derivative using molecular dynamics simulations (MDS) for 20 nanoseconds (ns). Homology modeling of CCR2 was performed and the 4AAC derivative was docked into this binding site. The docked model of selected conformations was then utilized to study the dynamic behavior of the 4AAC enzyme complexes inside lipid membrane. MDS of CCR2-16b of 4AAC complexes allowed us to refine the system since binding of an inhibitor to a receptor is a dynamic process and identify stable structures and better binding modes. Structure activity relationships (SAR) for 4AAC derivatives were investigated and reasons for the activities were determined. Probable binding pose for some CCR2 antagonists were determined from the perspectives of binding site. Initial modeling showed that Tyr49, Trp98, Ser101, Glu291, and additional residues are crucial for 4AAC binding, but MDS analysis showed that Ser101 may not be vital. 4AAC moved away from Ser101 and the hydrogen bonding between 4AAC and Ser101 vanished. The results of this study provide useful information regarding the structure-based drug design of CCR2 antagonists and additionally suggest key residues for further study by mutagenesis.