• 제목/요약/키워드: 2D Marker

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UHPLC를 이용한 새로운 한약제제 HPL-1의 품질관리법 개발 (Development of Quality Control Method for a Novel Herbal Medicine, HPL-1 using UHPLC)

  • 김세건;라마칸타라미차네;이경희;정현주
    • 대한본초학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.19-24
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    • 2015
  • Objectives : HPL-1, a novel herbal medicine which is composed of five herbs such as Kalopanacis Cortex, Chaenomelis Fructus, Raphani Semen, Atractylodis Rhizoma and Pulvis Aconiti Tuberis Purificatum, was developed for treatment of osteoarthritis. This study is aimed to develop analytical method for consistent quality control of HPL-1 and validate chromatographic method. Methods : Chromatographic analysis was performed using ultra-high performance liquid chromatography - diode array detector (UHPLC-DAD) equipped with RP-amide column, column oven, and auto sampler. Marker compounds [protocatechuic acid, chlorogenic acid, liriodendrin, 3,5-dicaffeoylquinic acid, ${\beta}$-D-(3-O-sinapoyl)-fructofuranosyl-$\alpha$-D-(6-O-sinapoyl)glucopyranoside and benzoylmesaconine] were separated by step gradient elution of acetonitrile and 0.1% phosphoric acid/water. The method validation was evaluated by quantitative validation parameters of linearity, accuracy, precision, limit of detection (LOD) and limit of quantification (LOQ) according to KFDA guideline.Results : An optimized method for six marker compounds in HPL-1 was established by UHPLC-DAD. The correlation coefficient (R2) with each calibration curve was greater than 0.99. The LOD and LOQ were within the range of 0.008-0.090 and $0.023-0.274{\mu}g/mL$, respectively. The relative standard deviation (RSD) of intra- and inter-day variability were less than 4.0%. The result of recovery test was range from 93.3-106.3% with RSD < 4.0%.Conclusions : These results suggest that the quantitative UHPLC method is precise, accurate, effective for quality evaluation of HPL-1. The method may also contribute to improve quality of crude drug preparations used for treatment of various diseases.

The serum level of 25-hydroxyvitamin D for maximal suppression of parathyroid hormone in children: the relationship between 25-hydroxyvitamin D and parathyroid hormone

  • Kang, Jung In;Lee, Yoon Suk;Han, Ye Jin;Kong, Kyoung Ae;Kim, Hae Soon
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제60권2호
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    • pp.45-49
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    • 2017
  • Purpose: Serum level of 25-hydroxyvitamin D (25-OHD) is considered as the most appropriate marker of vitamin D status. However, only a few studies have investigated the relationship between 25-OHD and parathyroid hormone (PTH) in children. To this end, this study was aimed at evaluating the lowest 25-OHD level that suppresses the production of parathyroid hormone in children. Methods: A retrospective record review was performed for children aged 0.2 to 18 years (n=193; 106 boys and 87 girls) who underwent simultaneous measurements of serum 25-OHD and PTH levels between January 2010 and June 2014. Results: The inflection point of serum 25-OHD level for maximal suppression of PTH was at 18.0 ng/mL (95% confidence interval, 14.3-21.7 ng/mL). The median PTH level of the children with 25-OHD levels of <18.0 ng/mL was higher than that of children with 25-OHD levels ${\geq}$ 18.0 ng/mL (P<0.0001). The median calcium level of children with 25-OHD levels<18.0 ng/mL was lower than that of children with 25-OHD levels${\geq}18.0ng/mL$ (P=0.0001). The frequency of hyperparathyroidism was higher in the children with 25-OHD levels<18.0 ng/mL than in the children with 25-OHD levels${\geq}18.0ng/mL$ (P<0.0001). Hypocalcemia was more prevalent in the children with 25-OHD levels<18.0 ng/mL than in the children with 25-OHD levels${\geq}18.0ng/mL$ (P<0.0001). Conclusion: These data suggest that a vitamin D level of 18.0 ng/mL could be the criterion for 25-OHD deficiency in children at the inflection point of the maximal suppression of PTH.

월악산북측(月岳山北側) 고운리층(古雲里層) 방해석(方解石) 쌍정(雙晶)을 이용(利用)한 추정차응력(推定差應力) 분석(分析) (Inferred Differential Stress from Twinning in Calcite of Gounri Formation in the Northern Area of Worak-san, Korea)

  • 임명혁;김영엄;장태우
    • 자원환경지질
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    • 제24권2호
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    • pp.177-186
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    • 1991
  • Ogchon Supergroup directly contacts with Choseon Supergroup in the northern area of Worak-san, where evidences indicating thrust-fault formed during $D_2$-deformation are observed. On footwall of thrust fault, calcite veins in Gounri Formation belonging to Choson Supergroup may be deformed during thrust faulting($D_2$). Calcite veins are parallel to axial plane cleavage($S_2$) of $F_2$ fold and truncate slaty cleavage($S_1$). Therefore, we can use deformation twins in calcite grains of the veins as a marker for inferred differential stress operated upon thrust faulting. The inferred differential stresses are estimated at 190 Mpa from K, sample. The stress from K, sample close to the contact between Ogchon Supergroup and Choseon Supergroup shows a higher value than $K_2$-$K_6$ samples, probably having an important influence upon thrust faulting. The differential stress reveal again high value at $K_7$ sample, which may suggest the presence of another thrust fault.

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Petunia hybrida와 Nicotiana sanderae의 원형질체융합에 의한 잠정적 체세포잡종 식물체 생산 (Production of Putative Somatic Hybrid of Petunia hybrida and. Nicotiana sanderae by Protoplast Fusion)

  • 정재동;노영희;최수옥;지선옥
    • 식물조직배양학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.105-110
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    • 1995
  • Petunia hybrida와 Nicotiana sanderae의 원형질체를 융합하여 체세포잡종식물을 얻고자 융합산물의 배양에 의해 얻은 개체들에 대해 유전분석을 하였다. 재분화 개체중 융합된 것으로 인정되는 개체의 peroxidase pattern은 두 모본의 band를 모두 가진 개체(A-D patterns)에서 나타난 band중 p. hybrida에서 나타난 band 이외에 최상부에 1개의 band가 추가되었는데 이는 융합을 판별할 수 이는 중요한 marker 로서 가능성이 있으며, aspartate aminotransferase isoenzyme pattern은 두 모본의 양상이 모두 나타나거나 N. sanderae의 상부 band가 소실된 개체도 있었다. 염색체 검경에서 P.hybrida는 2n=14, M sanderae는 2n=18개로 나타났으며, 동위효소검정에서 체세포 잡종일 것으로 추정되는 개체들은 2n=32-36으로 나타났다. 표현형 관찰에서 체세포잡종으로 인정되는 개체의 형태적 특징은 두 모본의 중간형태를 나타내었다.

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고추의 역병 저항성과 연관된 분자표지의 효용성 검정 (Validity Test for Molecular Markers Associated with Resistance to Phytophthora Root Rot in Chili Pepper (Capsicum annuum L.))

  • 이원필;이준대;한정헌;강병철;윤재복
    • 원예과학기술지
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    • 제30권1호
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    • pp.64-72
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    • 2012
  • 고추 역병은 그 동안 우리나라 고추 생산에 있어서 심각한 수량감소의 피해를 주어 왔으며, 2004년 처음으로 고추 역병 저항성 품종이 보급되기 시작하면서, 국내 건고추 육종에 있어서 역병 저항성의 도입은 필수불가결한 것으로 되었다. 그러므로 저항성 식물체 선발의 정확성 제고 및 육종의 효율 향상을 위하여 역병 저항성과 연관된 분자표지의 개발이 요구된다. 지금까지 고추 역병 저항성 주동 유전자에 연관된 분자표지가 일부 개발되어 있지만, 부분적으로 밖에 사용할 수 없다는 문제점이 있다. 따라서 본 연구에서는 역병 저항성 소재에 상관없이 저항성을 구별해 낼 수 있는 분자표지를 개발하고자 하였다. 이를 위해 '수비초' ${\times}$ 'CM334' 조합의 $F_2$ 분리집단($SF_2$)과 역병 저항성 시판 $F_1$품종('독야청청')을 자가수정한 $F_2$ 분리집단($DCF_2$)을 만들었다. BSA-AFLP 방법으로 총 1,024 프라이머 조합을 사용하여 역병 저항성과 연관된 세 개의 AFLP 분자표지(AFLP1, AFLP2 및 AFLP3)를 선발하였으며, 이를 CAPS 분자표지(M1-CAPS, M2-CAPS 및 M3-CAPS)로 전환하였다. 이 중 M3-CAPS 분자표지를 10개의 역병 저항성 계통, 14개의 이병성 계통, 'CM334'를 화분친으로 사용한 5개의 $F_1$ 조합, 그리고 53개의 시판 $F_1$ 품종에 적용해 본 결과, 역병 저항성 표현형과 M3-CAPS 분자표지의 마커형이 잘 일치하였고, P5-SNAP과 Phyto5.2-SCAR 분자표지보다 높은 실용성을 보이는 결과를 얻었다. 따라서, M3-CAPS 분자표지는 역병 저항성 고추 계통 육성에 많은 도움을 줄 수 있을 것으로 생각한다.

Taxonomic revision of the genus Herposiphonia (Rhodomelaceae, Rhodophyta) from Korea, with the description of three new species

  • Koh, Young Ho;Kim, Myung Sook
    • ALGAE
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    • 제33권1호
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    • pp.69-84
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    • 2018
  • We examined the species diversity of Herposiphonia on Korean coasts, based on a combination of morphology and molecular analyses of the mitochondrial COI-5P DNA barcode marker and plastid rbcL gene. We report the presence of eight species including three novel species: H. donghaensis sp. nov., H. jejuinsula sp. nov., H. sparsa sp. nov., H. caespitosa, H. fissidentoides, H. insidiosa, H. parca, and H. subdisticha. Specimens were separated into eight clades in both the COI-5P and rbcL gene analyses, with 1.3-19.6 and 6.6-15% interspecific sequence divergence, respectively. These eight species are also distinguishable by several morphological characteristics such as: branching pattern (d/i pattern in H. donghaensis sp. nov. and H. sparsa sp. nov.; d/d/d/i pattern in others), shape of determinate branch (ligulate in H. fissidentoides; terete in others), number of vegetative trichoblasts (1-2 in H. insidiosa and H. sparsa sp. nov.; 3-4 in H. caespitosa; absent in others), and number of segments and pericentral cells in determinate branches. About three novel species revealed by our analyses, H. donghaensis sp. nov. is newly discovered, and H. jejuinsula sp. nov. and H. sparsa sp. nov. were previously reported in Korea as H. nuda and H. secunda, respectively. Our results show that DNA barcoding and rbcL analyses are useful for delimiting species boundaries and discovering cryptic species diversity in the genus Herposiphonia.

Effects of D-Fructose on the Uptake of Iron by the Intestinal Brush-Border Membrane Vesicles from Rats.

  • Kim, Ok-Seon;Lee, Yong-Bok;Oh, In-Joon;Koh, Ik-Bae;Lee, Yeong-Woo
    • Journal of Pharmaceutical Investigation
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    • 제24권3호spc1호
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    • pp.11-18
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    • 1994
  • We have studied the iron uptake by the purified brush-border membrane vesicles (BBMVs) to determine the effect of fructose on the absorption of iron. BBMVs were prepared by the modified calcium precipitation method, The degree of purification was routinely assessed by the marker enzyme, alkaline phosphatase, and the functional integrity was tested by $D-[1-^3H]glucose$ uptake. The appearance of membrane vesicles was shown by transmission electron microscopy (TEM). The uptakes of complexes of labeled iron $[^{59}Fe]$ with fructose and ascorbate were measured with a rapid filtration technique, The uptake rate and pattern of the two iron-complexes, Fe(III)-fructose and Fe(III)-ascorbate, were also observed. A typical overshooting uptake of D-glucose was observed with peak value of $2{\sim}3$ times higher concentration than that at equilibrium. This result was similar to other studies with BBMVs. TEM showed that the size of BBMVs was uniform and we can hardly find any contaminants, Fe(III)-fructose has the higher value of $V_{max}$ and the lower value of Km than those of Fe(III)-ascorbate, respectively. It may be concluded that D-fructose is more effective in promoting the iron absorption than ascorbate.

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The complete chloroplast genome of Diarthron linifolium (Thymelaeaceae), a species found on a limestone outcrop in eastern Asia

  • KIM, Sang-Tae;OH, Sang-Hun;PARK, Jongsun
    • 식물분류학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.345-352
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    • 2021
  • Diarthron linifolium Turcz. is an annual herb usually found in sandy soil or limestone areas. Plants in the genus Diarthron are known to have toxic chemicals that may, however, be potentially useful as an anticancer treatment. Diarthron linifolium is a unique species among the species of the genus distributed in Korea. Here, we determine the genetic variation of D. linifolium collected in Korea with a full chloroplast genome and investigate its evolutionary status by means of a phylogenetic analysis. The chloroplast genome of Korean D. linifolium has a total length of 172,644 bp with four subregions; 86,158 bp of large single copy and 2,858 bp of small single copy (SSC) regions are separated by 41,814 bp of inverted repeat (IR) regions. We found that the SSC region of D. linifolium is considerably short but that IRs are relatively long in comparison with other chloroplast genomes. Various simple sequence repeats were identified, and our nucleotide diversity analysis suggested potential marker regions near ndhF. The phylogenetic analysis indicated that D. linifolium from Korea is a sister to the group of Daphne species.

소 성장호르몬 유전자의 Exon 5번에서의 새로운 다형성 연구 (A Missense Mutation in Exon 5 of the Bovine Growth Hormone Gene)

  • 윤두학;김태헌;이경희;박응우;이학교;정일정;홍기창
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권1호
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    • pp.13-22
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    • 2003
  • 성장호르몬 유전자는 하나의 작은 공통 선조 유전자로부터 아주 오랜 기간동안 유전자 중복에 의해 진화되어 온 그룹들 중의 하나이다. 이들에 속하는 유전자들은 동물 종간에 구조적인 상동성과 기능적 공통성 등 유사성이 비교적 높게 나타난다. 이런 연구결과들을 근거로 하여 소 성장호르몬 유전자에서 아미노산을 암호화하는 영역으로부터 새로운 아미노산의 변이(missense mutation)를 검출하였고, 이 변이의 대립유전자 빈도는 소(cattle)의 종(species) 및 품종의 지리적 분포에 따라 일정한 경향 치를 보여 주었다. 한편 변경되어진 아미노산은 Tryptophan으로 이는 생물체에 존재하는 많은 단백질들을 구성하는 아미노산중에서도 그 출현빈도가 가장 낮은 것이다. 또한 검출된 변이는 성장호르몬이 그의 수용체와 강하게 결합하는 부위로서, 성장호르몬의 구조적 변이를 초래하여 수용체와의 결합이 비정상적으로 이루어져, 이후 성장호르몬이 표적세포로의 신호전달과 같은 역할을 제대로 수행치 못하게 되고, 이로 인하여 가축의 표현되어지는 경제형질에 영향을 미칠 것으로 추정된다. 그러므로 이러한 대립유전자를 보유하는 개체는 집단에서 제거하는 방법에 의한 개량이 가능할 것으로 사료된다.

멜론 유전자원의 생육 평가와 과육색 유전형 분석 (Characterization of Phenotypic Traits and Application of Fruit Flesh Color Marker in Melon (Cucumis melo L.) Accessions)

  • 배익현;강한솔;정우진;유재황;이오흠;정희
    • 한국자원식물학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.478-490
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    • 2021
  • 멜론은 세계 각지에서 재배되는 경제적으로 중요한 작물중의 하나이다. 본 연구는 농업유전자원센터에서 수집 보관중인 멜론 유전자원을 대상으로 다양한 생육 특성을 특성을 조사하고, 멜론의 중요한 육종 형질중의 하나인 과육색의 유전형과 표현형을 조사하여 멜론 육종에 필요한 육종 재료 확보를 위한 기초 자료를 마련하고자 수행되었다. 총 219개의 멜론 유전자원을 대상으로 19개의 생육 특성과 PCA분석을 수행하고, 멜론의 중요한 육종 형질중의 하나인 과육색의 유전형을 조사하여 표현형과 비교하였다. 과육색은 오렌지색, 백색, 녹색, 유백색, 황색의 5가지로 분류하였으며, 이중 오렌지색이 87개로 가장 많았으며, 그 다음으로 백색이 75개였다. 그리고, 오렌지색과 녹색 과육 구별용 마커를 적용한 결과, 녹색 과육 21개의 경우는 표현형과 유전형 일치율이 100%였으며, 오렌지색의 경우는 98%, 백색은 97%, 유백색의 경우는 80%의 일치율을 보였다. 표현형과 유전형이 일치하는 않는 총 8개 유전자원의 염기서열을 분석한 결과, 3곳의 위치에서 단일염기다형성(SNP; single nucleotide polymorphism)이 있었다. 이러한 결과는 멜론의 과육색을 결정하는 아직 알려지지 않은 유전기작이 존재한다는 것을 제시하였으며, 본 연구에서 얻어진 다양한 유전자원의 생육조사 결과는 멜론 육종에 유용하게 쓰일 것으로 생각된다.