• Journal of Species Research
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• 제12권4호
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• pp.313-320
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• 2023

Diatoms are unicellular eukaryotic microalgae, and they are highly diversified in aquatic environments. We describe an unrecorded diatom species Fragilaria saxoplanctonica Lange-Bertalot & Ulrich (Bacillariophyceae) collected from Paldang Reservoir, Korea, on 4 April 2022. The valve was needle shaped and narrowly rectangular, its ends were rounded, and no spines were found on the outline of their valves. The valve was 67.2-70.2㎛ in length and 1.4-2.9㎛ in width. The ratio of width-to-length was 1 : 23.2-50.1. The pattern of striation was alternate or opposite, and the number of striae in 10㎛ was 24-26. Molecular comparisons of the 18S rDNA and rbcL sequences showed that it belonged to the genus Fragilaria. These morphological and phylogenetic results confirmed that our species was F. saxoplanctonica, and it was the first record in Korea.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제46권1호
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• pp.68-76
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• 2018

Actinobacterial strains isolated from Cow feces were studied for their antifungal attributes against phytopathogens and industrially important enzymes. A total of 30 Actinobacterial strains were obtained from 10 samples of cow feces. All the strains were belonging to the genera Streptomyces on the basis of morphological and chemotaxonomic analysis. During preliminary screening, out of 30 strains, 15 strains (50%) showed antifungal activity against five fungal phytopathogens including Aspergillus niger, Fusarium solani, Fusarium oxysporum, Macrophomina phaseolina and Rhizoctonia solani. While, isolate GBTCF-26 was found to be most active against R. solani with 62.2% inhibition of fungal mycelium, GBTCF-09 was prominent against F. solani and F. oxysporum with percent inhibition of 61.1% and 58.8%, respectively. Out of 30 strains, 19 (63.3%), 16 (53.3%), 11 (36.7%), 10 (33.3%), 4 (13.3%) and 8 (26.7%) strains were producing amylase, caseinase, gelatinase, lipase, chitinase and cellulose, respectively. The selected strains, GBTCF-09, GBTCF-21 and GBTCF-26, were identified as Streptomyces sp. on the basis of their 16S rDNA sequence. The study supports the idea that the Actinobacteria from unique niches (Cow feces) possess the production potential of industrially important enzymes including bioactive molecules.

• 한국균학회지
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• 제42권1호
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• pp.28-33
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• 2014

경상북도 울릉도와 경상남도 욕지도의 야생화들에 분포하고 있는 효모 종 다양특성을 알아보고자 이들로부터 효모를 분리하고 분자생물학적인 26S rDNA의 D1/D2 영역 염기서열을 확인, 비교하여 동정하였다. 울릉도 야생화들에서는 22종 48균주, 욕지도에서 야생화들로부터는 25종 60균주 효모들을 분리, 동정하였다. 두 섬에서 분리한 효모들 중 Cryptococcus albidus, Cryptococcus laurentii, Metschnikowia reukafii, Pichia scolyti, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula graminis and Rhodotorula mucilaginosa 등 7종이 공통으로 분리되었고 나머지 33종이 두 섬에서 특이적으로 분리되었다.

• 한국균학회지
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• 제40권3호
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• pp.141-144
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• 2012

자연환경에서 분포하고 있는 효모의 mycoflora를 확인하고 궁극적으로 이들을 고부가가치의 산업에 응용하기 위한 연구의 일환으로 대전과 인근 충남지역 일부의 야생화들을 채집하여 효모들을 분리, 동정하였다. 대전지역 야생화 42점에서 32종의 효모들을 54균주 분리하였고 이들 중 Cryptococcus 속균과 Phodotonula 속균 등이 우점균이었으며 Metschnikowia 속균과 같이 희귀 효모들을 20여종 분리하였다. 대전 인근의 충남 금산군과 논산군 일부지역의 야생화 28점에서 모두 18종의 효모들을 26균주 분리하였다. 이들 균 중에서 Candida 속균과 Pseudozyma 속균 등이 우점균으로 분리되었다.

• 한국균학회지
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• 제51권4호
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• pp.349-359
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• 2023

본 연구는 국내 담수환경으로부터 야생효모를 분리하여 특성을 분석하였다. 분리된 효모의 26S rDNA의 D1/D2부위 염기서열을 이용하여 동정을 하였다. 결과적으로 C. viswanathii (NNIBRFG39781), C. cygneicollum (NNIBRFG49003), O. silvestris (NNIBRFG39803), V. foliicola (NNIBRFG6120) 등 4종의 국내 미기록 야생효모들을 동정하였다. 이들 미기록 효모는 모두 출아에 의하여 영양생식을 하였고 PD, YM, YV 배지에서 잘 자랐다. C. viswanathii (NNIBRFG39781) 균주는 의균사를 형성하였으며 고온에서도 생육하였다. 또한 C. viswanathii (NNIBRFG39781), O. silvestris (NNIBRFG39803), V. foliicola (NNIBRFG6120) 균주는 20% glucose를 함유한 YPD 배지에서 생육하는 내당성을 보였으며 C. cygneicollum (NNIBRFG49003)와 O. silvestris (NNIBRFG39803) 균주는 NaCl을 함유한 배지에서는 생육하지 못하였다. 담수환경은 효모를 포함한 균류의 다양성이 높은 환경으로 지속적 연구가 필요하다. 본 연구는 향후 담수환경의 생물다양성 연구에 기초자료로 활용될 것이다.

• 미생물학회지
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• 제38권4호
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• pp.235-240
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• 2002

식품폐수처리장의 활성슬러지와 논, 밭의 토양에서 우수한 protease 생성 균주을 분리 선별하였다. 이 중 효소활성이 우수한 PB16은 그람 음성, 간균이며 protease activity는 6.49 U/ml이었다. 생리, 생화학적 특성 및 16S rRNA 염기서열분석을 실시한 결과, Aeromonas hydrophila (99.0%) 인 것으로 확인 되었다. Bioscreen C를 사용한 최적 성장조건 평가는 합성폐수에 vitamin과mineral을 첨가한 배지의 중식속도(0.26 $h^{-1}$)가 무 첨가배지(0.21 $h^{-1}$)보다 높았으며, 분리균주의 합성폐수 유기물 제거능 실험에서는 초기 soluble-CODcr 2,472 mg/l인 고농도 합성폐수를 1일, 3일 반응 후 각각 59, 87%의 제거율을 나타내었다.

• 생명과학회지
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• 제32권9호
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• pp.721-728
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• 2022

본 논문은 제주연안에서 채집한 소라(Turbo cornutus)의 장내세균을 분리하고 군집의 다양성을 조사하였다. 표준배지를 사용하여 순수 정체 배양 결과 MA agar에서 가장 많은 군집을 나타났다. 일반 배양 CFU값은 평균 1.8×10⁵, 혐기 배양 CFU값은 평균 0.4×10으로 보다 적게 나타났다. 기존 표준균주와 16S rDNA sequence 유사도 비교 분석 결과 크게 4문 12과 26속 67종으로 분류되었다. 표준균주와의 상동성 범위는 93-100%로 나타났다. 소라장내세균 군집은 크게 Proteobacteria 39% (α-proteobacteria; Phyllobacteriaceae (1), Rhodobacteraceae (8) / γ-proteobacteria; Alteromonadaecae (1), Shewanellaceae (4), Vibrionaceae(12))로 가장 우점하였고, Firmicutes 34% (Bacillaceae (21), Paenibacillaceae (2)), Actinobacteria 21% (Cellulomonadaceae (1), Mycobacteriaceae (6), Nocardiaceae (4), Streptomycetacea (3)), Bacteroidetes 6% (Flavobacteriaceae (4))로 각각 나타났다. Bacillus sp., Vibrio sp.이 가장 우점 하였으며, 그 외 대부분의 분리 균주는 해양 유래 관련 균주로 나타났다. 이전 보고된 제주 연안에 서식하는 해양동물 장내세균군과 비슷한 양상을 보였다. 분리된 일부 균주가 단당류(Cellulose), 다당류(alginate, agar)분해능을 갖고 있는 것으로 나타났는데, 대부분이 해조류 유래 세균으로 소라의 섭이가 장내세균군과 관련됨을 알 수 있었다. 동시에 probiotics 기능을 갖고 있는 일부 균주도 분리되었다.

• 대한의생명과학회지
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• 제6권1호
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• pp.1-9
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• 2000

Zoogloea ramigera 115SLR로부터 다당류 생합성에 관여하는 유전자를 분리하기 위해서 균주의 genomic DNA로부터 제조된 gene bank로부터 plasmid pLEX3이 얻어졌다. 이로부터 재조합된 5.0 kb DNA fragment를 포함하는 plasmid pLEX10은 다당류의 형태를 변환시키는 유전자를 포함하고 있으며, 이중에서 upstream 영역에 해당하는 1.7 kb DNA fragment가 분리되었다. 1.7 kb DNA 염기서열의 결과로부터 단백질을 인지 할 수 있는 2개의 ORF가 존재하였으며, 50 kDa 단백질을 인지 할 수 있는 ORF3은 X. campestris의 다당류 생합성 유전자들인 gumC와 R. meliloti의 exoP와 아미노산의 동질성을 나타내었다. ORF4는 N-terminal 영역이 결여된 단백질을 인지하며, Thermotoga maritime의 다당류 export에 관여하는 단백질과 동질성을 보였다. Z. ramigera 115SLR and Z. ramigera 115SLR/pLEX10은 각각 slime또는 capsule 형태의 다당류를 생합성하며 이들로부터 생합성된 다당류양은 각각 0.26% (w/v) and 0.16% (w/v)였다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제16권1호
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• pp.133-137
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• 2007

The Strain TFM-7, Which has an antitumor effect, was isolated from Kefir and identified based on analysis using the API 50 CHL kit and 265 rDNA sequencing. Strain TFM-7 was confirmed to belong to the genus Kluyveromyces. Analysis of the 265 rDNA nucleotide sequences found strain TFM-7 to be related to Kluyveromyces marxianus. NRRL Y-828IT. K. marxianus. TFM-7 was cultured with potato dektrose broth medium at $27^{\circ}C$ for 72 hr, and its inhibition effects on the proliferation of seven tumor cell lines and a normal cell line were assessed using the MTT assay. The antitumor effects and growth characteristics of K. marxianus TFM-7 were investigated during a culture period of 7 days. By the $3^{rd}\;day$, K. marxianus TFM-7 showed a dry cell weight 2.39 g/L, a pH of 4.39, an ethanol content of 0.89%, and an inhibition effect on the proliferation of seven tumor cell lines above 50%, except for A-549 tumor cell line. K. marxianus TFM-7 was the most effective at inhibiting the growth of Hep-2 cell line among all tumor cell lines tested. Growth inhibition of a normal cell line, NIH/3T3, was less than 35%, suggesting a decreased level of cytotoxicity toward normal cells. These results indicate that K. marxianus TFM-7 may have used as a yeast strain with antitumor activity.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권10호
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• pp.1386-1392
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• 2010

A bacterial strain designated GR5$^T$, previously isolated from a freshwater culture pond in Taiwan while screening for bacteria for antimicrobial compounds, was characterized using a polyphasic taxonomic approach. Strain GR5$^T$ was found to be Gram-negative, aerobic, greenish-yellow colored, rod-shaped, and motile by means of a single polar flagellum. Growth occurred at $10-40^{\circ}C$ (optimum, $35^{\circ}C$), pH 7.0-8.0 (optimum pH 8.0), and with 0-2.0% NaCl (optimum, 0.5-1.0%). The major fatty acids were $C_{16:1}{\omega}7c$(36.3%), $C_{16:0}$(16.6%), $C_{12:0}$ 3-OH (12.5%), and $C_{18:1}{\omega}7c$(9.1%). The major respiratory quinone was Q-8, and the DNA G+C content of the genomic DNA was 51.9 mol%. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences showed that strain GR5$^T$ belongs to the genus Rheinheimera, where its most closely related neighbors are Rheinheimera texasensis A62-14B$^T$ and Rheinheimera tangshanensis JA3-B52$^T$ with sequence similarities of 98.1% and 97.5%, respectively, and the sequence similarities to any other recognized species within Gammaproteobacteria are less than 96.5%. The mean level of DNA-DNA relatedness between strain GR5$^T$ and R. texasensis A62-14B$^T$, the strain most closely related to the isolate, was $26.5{\pm}7.6%$. Therefore, based on the phylogenetic and phenotypic data, strain GR5$^T$ should be classified as a novel species, for which the name Rheinheimera aquatica sp. nov. is proposed. The type strain is GR5$^T$ (=BCRC 80081$^T$=LMG 25379$^T$).