• 미생물학회지
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• 제45권4호
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• pp.339-345
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• 2009

김치로부터 오르니틴을 생산하는 능력이 있는 2개의 젖산균주(OK1-4, OK1-6)를 분리하여 그 특성을 조사하였다. 분리된 균주는 그람 양성, 단간균이었으며, 혐기적 조건에서 이산화탄소를 생성하였다. MRS 배지에서 $25\sim37^{\circ}C$ 범위와 pH 6.0~7.0 범위에서 잘 자랐으며, 성장을 위한 최적 온도와 pH는 각각 $30^{\circ}C$와 pH 6.5이었다. 분리된 젖산균주는 L-아라비노스, 자일로스, 리보오스, 글루코오스 등의 당을 분해하여 산을 생성하였고, cellobiose, galactose, raffinose, trehalsoe는 분해하지 못하였다. 16S rDNA 염기서열분석을 통해 분리된 균주는 유전자은행에 등재되어 있는 Weissella koreensis S5623(AY035891)의 염기서열과 각각 99.6%와 99.7%의 서열 동질성이 있음을 확인하였다. 이와같은 생화학적 특성과 염기서열 분석결과를 토대로 분리된 균주를 Weissella koreensis OK1-4와 Weissella koreensis OK1-6로 각각 명명하였다. 이들 균주의 오르니틴 생성능력은 1% 아르기닌이 첨가된 MRS 배지에서 각각 27.01와 31.41 mg/L/h 이었다. 이와같은 결과는 우리김치로부터 분리된 Weissella 속 균주의 오르니틴 생성에 관한 최초의 보고이다.

• 대한수의학회지
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• 제31권3호
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• pp.329-335
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• 1991

The filter elution technique was used to assay $^{60}Co$ $\gamma$ ray-induced DNA strand breaks(SB) in EL4 mouse leukemia cell and mouse spleen lymphocyte. The lymphocytes were stimulated with lipopolysaccharide (LPS, $20{\mu}g/ml$) to label $[^3H]$ thymidine. EL4 cells and lymphocytes in suspension were exposed at $0^{\circ}C$ to 0Gy, 1Gy, 5Gy, 10Gy or l5Gy for DNA single strand breaks(SSB) assay and 0Gy, 25Gy, 50Gy, 75Gy or 100Gy for DNA double strand breaks(DSB) assay of $^{60}Co$ radiation and elution procedure was performed at pH12.1 and 9.6. The number of DNA strand breaks increased with increasing doses of r rays. The strand scission factor(SSF) was estimated in each experiment (eluted volume 21ml). The slope of SSB EL4 cells was $0.01301{\pm}0.00096Gy^{-1}$ (n=5), the slope of SSB for lymphocytes was $0.01097{\pm}0.00091Gy^{-1}$ (n=5) and the slope of DSB for lymphocytes was $0.001707{\pm}0.0000573Gy^{-1}$ (n=5). Thus EL4 cells were more sensitive to induction of DNA SSB by ionizing radiation than lymphocytes (p<0.005). The ratio of slope of dose-response relationship (SSF versus dose) of lymphocytes DNA SSB as compared with the slope of DNA DSB was 6.4.

• 대한소아치과학회지
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• 제34권2호
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• pp.247-254
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• 2007

본 연구는 125명의 6-11세 혼합치열기 아동을 대상으로 연령에 따라 초기 혼합치열기 A군(6-8세; 62명)과 후기 혼합치열기 B군(9-11세; 63명)으로 분류하고 유치의 dfs, 영구치의 DFS를 기록한 후 자극성 타액을 채취하여 TYCSB 배지에 배양해서 S. mutans와 S. sobrinus를 구분하였으며 PCR을 시행하여 확인하였다. S. mutans와 S. sobrinus의 분포도와 치아우식증과의 상관관계를 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. S. mutans와 S. sobrinus의 상관계수는 A군 0.70, B군 0.50로 두 군 모두에서 높은 상관관계를 보였다. 2. S. mutans와 치아우식증과의 관계는 A군(r=0.25)과 B군(r=0.34) 모두에서 약간의 관련성이 나타났다. 3. A군에서 S. sobrinus와 치아우식증간에 상관관계가 없는 것으로 나타났으며, B군(r=0.21)에서는 미약한 상관관계가 성립되었다. 4. S. mutans와 나이의 상관관계는 A군과 B군 모두에서 관련성이 없는 것으로 나타났다. 5. S. sobrinus와 나이의 상관관계는 A군(r=0.32)에서는 약간의 관련성이 나타났고, B군에서는 관련성이 없는 것으로 나타났다.

• 한국유기농업학회지
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• 제20권3호
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• pp.327-343
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• 2012

In order to develop a high cellulolytic direct-fed microorganism (DFM) for ruminant productivity improvement, this study isolated cellulolytic bacteria from the rumen of Holstein dairy cows, and compared their cellulolytic abilities via DM degradability, gas production and cellulolytic enzyme activities. Twenty six bacteria were isolated from colonies grown in Dehority's artificial (DA) medium with 2% agar and cultured in DA medium containing filter paper at $39^{\circ}C$ for 24h. 16s rDNA gene sequencing of four strains from isolated bacteria showed that H8, H20 and H25 strains identified as Ruminococcus flavefaciens, and H23 strain identified as Fibrobacter succinogenes. H20 strain had higher degradability of filter paper compared with others during the incubation. H8 (R. flavefaciens), H20 (R. flavefaciens), H23 (F. succinogenes), H25 (R. flavefaciens) and RF (R. flavefaciens sijpesteijn, ATCC 19208) were cultured in DA medium with filter paper as a single carbon source for 0, 1, 2, 3, 4 and 6 days without shaking at $39^{\circ}C$, respectively. Dry matter degradability rates of H20, H23 and H25 were relatively higher than those of H8 and RF since 2 d incubation. The cumulative gas production of isolated cellulolytic bacteria increased with incubation time. At every incubation time, the gas production was highest in H20 strain. The activities of carboxymethylcellulase (CMCase) and Avicelase in the culture supernatant were significantly higher in H20 strain compared with others at every incubation time (p<0.05). Therefore, although further researches are required, the present results suggest that H20 strain could be a candidate of DFM in animal feed due to high cellulolytic ability.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제34권2호
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• pp.153-167
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• 2009

본 연구는 편백 피톤치드에 의해 사멸되지 않는 구강상주균을 분리하고, 이 분리된 세균이 구강 병인균에 대하여 어떠한 영향을 미치는지를 관찰함으로써 편백 피톤치드에 구강 내 세균에 대한 지속적인 이차적 효과를 구명한 실험적 연구이다. 이에 정상인 타액 내의 구강상주균에 1%의 편백 피톤치드를 첨가하여 사멸되지 않고 생존한 200개의 잔존 세균을 뷴리하고 이들이 치주질환과 구취의 중요한 원인균인 Pr. intermedia에 대한 억제효과를 관찰하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 선택된 200개의 잔존 세균 중, 148개(74.0%)가 Pr. intermedia를 억제하였다. 2. 선택한 200개의 잔존 세균은 Streptococcus salivarius가 109개(54.5%)로 가장 많이 나타났고, Streptococcus sanguinis가 25개(12.5%), Streptococcus mitis가 15개(7.5%)로 나타났다. 3. Pr. intermedia를 억제하는 148개의 잔존 세균 중, Streptococcus salivarius가 85.3%(93/109), Streptococcus sanguinis가 64.0%.(16/25), Streptococcus mitis가 54.3%(8/15), Streptococcus parasanguinis가 66.7%(6/9), Streptococcus alactolyticus가 100%(8/8)로 나타났다. 따라서 타액 내에서 편백 피톤치드에 저항하는 구강 상주균은 Streptococcus salivarius, Streptococcus sanguinis, Streptococcus mitis 등으로 나타났으며, 이는 치주질환을 일으키고 구취를 발생시키는 대표적 균주인 Pr. intermedia 에 대하여 세균 억제효과를 가지고 있었다. 따라서 피톤치드는 구강 내 유해균을 억제할 수 있고, 잔존하는 구강 상주균과 함께 구강 내 유해균을 억제함으로써 지속적이고 이차적인 효과를 나타냄으로써 치주질환과 구취발생을 예방할 수 있어, 구강 환경 개선을 위한 임상적 근거가 마련될 수 있을 것으로 생각된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제8권6호
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• pp.650-655
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• 1998

The chromosomal DNA fragment from Phaffia rhodozyma CBS 6938 which is able to autonomously replicate in the yeast Saccharomyces cerevisiae was cloned on an integrative URA3 plasmid. Its minimal fragment exhibiting autonomously replicating activiy in the S. cerevisiae gave a higher frequency transformation efficiency than that found for centromere-based plasmid, and enabled extrachromosoma1ly stable transmission of the plasmids in one copy per yeast cell under non-selective culture condition. The 836-bp DNA element lacked an ORF and did not contain any acceptable match to an ARS core consensus. Sequence analysis, however, displayed a cluster of three hairpin-Ioop-sequences with individual $\triangle {G_{25}}^{\circ}C$ free energy value of -10.0, -17.5, and -17.0 kcal. $mor^{-l}$as well as a 9-bp sequence with two base pair mismatches to the S. cerevisiae/E. coli gyrase-binding site. This 836-bp sequence also included one 7-bp sequence analogous to the core consensus of centromeric DNA element III (CDEIII) of S. cerevisiae, but CDEIII-like 7 bp sequence alone did not give a replicative function in this yeast.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제36권2호
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• pp.165-172
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• 2008

본 연구에서는 분리균주 LH2를 이용하여 각각의 중금속 (Cr, Cu, Ni, Pb, Zn)에 대한 최적성장조건을 도출하였으며, pH, 온도 및 중금속 농도 변화에 따른 중금속 제거효율을 관찰하였다. 분리균주는 18S rDNA 분석에 의거하여 종 유사성이 100%로서 Exophiala sp.로 동정되었다. 분리균주의 경우 $25^{\circ}C$, pH 7인 진탕배양 조건에서 가장 높은 제거효율을 보였다. 첨가되는 중금속의 농도가 200 ppm이하일 경우 중 금속의 비제거속도를 구한 결과 pH 7인 조건에서 중금속의 종류와 무관하게 10 ppm에서 200 ppm으로 중금속의 농도가 증가함에 따라 0.01에서 4.43 mg-metal $L^{-1}{\cdot}d^{-1}{\cdot}mg^{-1}{\cdot}DCW^{-1}$으로 증가하였다. pH 7로 설정된 배양액에 약 200ppm의 중금속이 첨가될 경우 중금속의 제거효율은 Cr, Cu, Ni, Pb, 및 Zn 이 각각 99.28%, 97.67%, 91.94%, 99.77%, 99.61%로 관찰되었다.

• 한국어병학회지
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• 제17권2호
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• pp.83-90
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• 2004

제주도에서 양식되는 돌돔에서 저수온기에 체표에 출혈성 패혈증 혹은 진무름 및 안구백탁이 수반되며 폐사하는 증상이 지속적으로 발견되었다. 이러한 증상의 원인균으로 추정되는 세균을 병어의 체표 및 장기에서 순수분리하였고 형태학적, 배양적 생화학적 조사 및 16S rDNA sequencing 분석 결과 Pseudomonas anguilliseptica로 동정되었다. 본 균주의 병원성 유무를 확인하기 위하여 인위 감염시험을 실시하였고, 그 결과 시험구에서 21일만에 실험어 20마리 모두가 자연감염된 병어와 유사한 증상으로 폐사하였다. 분리균주의 생육 최적 온도는 $\25^circ{C}$였고 생육 최적 pH는 7-8사이로 좁은 범위를 보였다. 낮은 염분농도에서 생육능이 우수하였으며 3%의 염분이 첨가된 배지에서도 생육능이 양호하였다. 약제내성 검사에서는 doxycycline, chloramphenicol, ciprofloxacin, erythromycin, flumequine, nalidixic acid, norfloxacin, ofloxacin에 감수성이 높게 나타났으나 페니실린계의 항생제에 높은 내성을 나타내었다.

• 한국식품조리과학회지
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• 제24권1호
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• pp.11-15
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• 2008

발효차로부터 분리 동정한 JY-1 효모는 18S rDNA 유전자 분석에서는 Rhodosporidium azoricum과의 유의성 99%, 생화학적 분석 VITEK system에서는 Rhodotorula glutinis/Rhodotorula mucilaginosa와 93%의 유의성을 나타내였다. 배양조건에서 최적의 온도는 $25-30^{\circ}C$, pH는 5.0이었으며 염의 농도는 2%, 최적의 에탄올 농도는 4%이었다. 일반적인 실험결과에서도 Rhodosporidium 속의 특이성과 비교하여 보았을 때 형태적, 생리적, 생화학적 유사성을 나타내었다. 이상의 결과에서 앞으로의 연구과제는 많이 음용되고 있는 발효차와 관련한 또 다른 미생물군을 분리 동정하여 우수한 균주를 확보하는데 있으며 이를 이용한 발효차 음료산업 개발에 목적을 두고 있다.

• Molecules and Cells
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• 제25권2호
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• pp.205-210
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• 2008

To develop molecular markers linked to the $L^4$ locus conferring resistance to tobamovirus pathotypes in pepper plants, we performed AFLP with 512 primer combinations for susceptible (S pool) and resistant (R pool) DNA bulks against pathotype 1.2 of pepper mild mottle virus. Each bulk was made by pooling the DNA of five homozygous individuals from a T10 population, which was a near-isogenic $BC_4F_2$ generation for the $L^4$ locus. A total of 19 primer pairs produced scorable bands in the R pool. Further screening with these primer pairs was done on DNA bulks from T102, a $BC_{10}F_2$ derived from T10 by back crossing. Three AFLP markers were finally selected and designated L4-a, L4-b and L4-c. L4-a and L4-c each underwent one recombination event, whereas no recombination for L4-b was seen in 20 individuals of each DNA bulk. Linkage analysis of these markers in 112 $F_2$ T102 individuals showed that they were each within 2.5 cM of the $L^4$ locus. L4-b was successfully converted into a simple 340-bp SCAR marker, designated L4SC340, which mapped 1.8 cM from the $L^4$ locus in T102 and 0.9 cM in another $BC_{10}F_2$ population, T101. We believe that this newly characterized marker will improve selection of tobamovirus resistance in pepper plants by reducing breeding cost and time.