전분 분해능력을 갖는 알콜생산용 효모를 만들기 위해 Saccharomyces cerevisiae에 glucoamylase 유전자인 STA를 도입하였다. 도입된 형질의 발현증대를 위해 STA 유전자의 promoter 부위를 alcohol dehydrogenase isoenzyme I 유전자의 promoter 부위와 치환 시켜준 재조합 플라스미드를 재조하였으며 안정성을 증진시키기 위해 centrometer 부위를 치환시킨 결과 glucoamylase의 발현이 증가하였으며, STA 유전자와 centromere를 갖고 있는 재조합 플라스미드는 여러세대가 거듭되어도 비교적 안정하게 유지되었으나 낮은 copy 수로 인해 형질전환체의 효소 역가와 형질전환 빈도는 낮아졌다. STA 유전자가 도입되어 형질전환된 다배체 산업용 효모는 액화 과정만을 거친 주정생산 배지(액화액)에서 원래의 알콜 생산용 효모에 비해 훨씬 많은 양의 알콜을 생산해 내었다. 그러나 centromere를 보유하는 플라스미드에의한 산업용 효모의 형질전환에는 실패하였다.
원유 분해세균에 의한 원유 분해능을 조사한 결과, Xanthomonas camperstris M12, Xanthomonas sp. M28, Acintobacter lwoffi G1, Klebsiella pneumoniae L25, 그리고 Pseudomonas maltophilia N246 등의 순서로 나타났다. Xanthomonas maltophilia M12, Xanthomonas sp. M28, 그리고 Pseudomonas maltophilia N246 균주 모두 pctane 분해시의 온도는 $30^{\circ}C$에서 최적이었으며, 최적 pH는 X.camperstris M12와 Xanthomonas sp. M28이 7.0-7.5 이었고, P.maltophilia N246이 7.5-9.0이었다. N246 균주의 최적 NaCl농도는 3.0-3.5 이었다. P.maltophilia N246와 X.campestris M12는 모두 플라스미드를 갖고 있음을 확인하였고, N246 균주로 부터 플라스미드를 제거하였을 경우 octane 분해능이 소실되었으므로 이 플라스미드 위에 octane 분해 유전자가 있음이 확인되었다. 이 균주이 OTC 플라스미드의 크기는 118kb이었다. 또한, N246 균주는 ampicillin 항생제에 내성을 나타내었다.
청주시 무심천의 하천수에서 항생물질에 내성을 나타내는 Gram 음성 세균을 분리하여 수질환경에서 일어나는 R 플라스미드의 전이를 연구하였다. 분리된 균주사이에서 접합에 의한 R 플라스미드의 전이는 실험실 환경에서 1.1$\times$$10^{-6}$-1.2$\times$$10^{-7}$, 하천의 수질환경에서 1.2$\times$$10^{-7}$-1.0$\times$$10^{-9}$으로 나타나, 자연의 수질환경에서도 R 플라스미드의 전이가 일어남을 확인하였다. 또 T-44 균주의 Ap$^{r}$Cm$^{r}$Tc$^{r}$ 플라스미드는 형질전환에 의하여 E. coli HB 101에 1.7$\times$$10^{-6}$의 비율로 전이되었다. 분자의 크기가 약 9.01kb로 측정된 Ap$^{r}$Cm$^{r}$Tc$^{r}$플라스미드 DNA를 제한효소로 처리한 결과 이 플라스비드에는 EcoRI과 BamHI의 절단부위가 각각 하나씩 존재하고 P-stI의 절단부위는 3개가 있었다.
국내에서 분리된 Agrobacterium tumefaciens KU12 는 많은 식물체에서 종양을 유발하여 octopine 을 유일한 탄소원과 질소원으로 이용할 수 있다. A. tumefaciens KU12 내에는 크기가 각각 45.5 kb, 240 kb 및 240 kb 이상인 3종류의 플라스미드가 존재하는 것으로 확인되었다. KU12내에 존재하는 octopine type Ti plasmid 를 확인하기 위하여 플라스미드를 가지고 있지 않은 A. tumefaciens A136 을 direct transformation 방법에 따라 KU12 에서 분리한 플라스미드 시료로 형질전환시킨후 질소원으로 octopine 만을 가지로 있는 AB 최소배지를 이용하여 Ti plasmid 에 의해 형질전환된 형질정환체를 선별하였다. 선별된 형질전환체를 A. tumefaciens KU911 이라고 명명하였으며 KU911 내에는 240 kb 크기의 플라스미드만이 존재하였다. 종양형성능 및 Southern hybridization 을 이용하여 octopine type Ti plasmid 인 pTiKU12 로 명명된 240 kb 크기의 플라스미드가 Ti plasmid 임을 확인되었다.
분리한 살리실산 자화세균 중 플라스미드블 갖는 세 균주를 션별하였다. 세 균주, KU801(pKUs, pKUS) , KUS03(pKU6 pKU9), KUS06(pKU7, pKU10)는 각각 두 개씩의 플라스미드플 가지고 있음이 전기갱동에 의해 밝혀졌고, Pseudomoηas putida로 동정되었다. 세 문주들은 모두 암피실린, 터l트라사이클린, 클로람페니콜등의 항생제에 대하여 내성을 지니며, 조사 된 방화족과 지방족 탄화수소들 중 삼리실산과 그의 중간 대사물인 카터1콜만을 이용하있다. 큰 분자량의 플라스비드(pKUS, p pKU6, pKU7)는 마이로마이신 C로 처리하였을때 큐어되며 그 빈도는 각각 0.40%, l,67%, 0.7S% 이었다. 큐어된 균주는 상리실산을 분해하지 못하였으나, 여전히 야생균주와 동일한 항생제 내성을 가지고 있었다. 살리실산 분해에 관여하는 유전자가 그들 플라스미드에 있는 것으로 판명되었다. pKU5와 pKU6의 분자량은 103, SMd, pKU7의 분자량은 101Md으로 측정되었다. SAL 플라스미드인 pKU5, pKU6, pKU7은 접합에 의해 P.putida와 P.aeruginosa로는 전달되었으나, E. coli에서는 발현되지 아니하였다.
남자 대학생의 피부에서 분리한 Moraxella osloensis NP7는 베타-락탐과 아미노글리코사이드 항생제에 대해 내성을 보였다. 본 연구에서는 NP7 균주 유전체의 완전한 염기서열과 유전자 주석을 보고하고자 한다. NP7 균주는 원형 염색체와 7개의 플라스미드를 갖고 있다. 염색체는 43.9%의 G + C 함량을 갖는 2,389,582개의 염기쌍을 갖고 있으며, 단백질을 암호하는 2,065개의 유전자를 보유하고 있다. 전체 플라스미드는 평균적으로 40.5%의 G + C 함량을 갖는 654,202개의 염기쌍을 갖고 있으며, 단백질을 암호하는 667개의 유전자를 보유하고 있다. 염색체는 4개의 리보좀 RNA 오페론, 1개의 transfermessenger RNA 유전자, 47개의 tRNA 유전자, 3개의 핵산스위치 유전자 그리고 3개의CRISPR array를 포함하고 있으며, 1개의 CRISPR은 pNP7-1 플라스미드에 존재한다. 베타-락탐과 아미노글리코사이드 항생제에 내성을 부여하는 유전자는 pNP7-1 플라스미드에 존재하고 있다.
접합에 의한 P.putida mt-2의 TOL를 CAM 함유 P.putida PpG1으로 이동시켜 형성된 접합주 P.Putida CST3A는 작아진 TOL(TOL$\Delta$)를 가지고 있었지만, m-toiuate를 분해할 수 있었다. 접합에 의한 이동실험은 CAM에 결합되어 CAM:TO* 플라스미드를 형성하고 있었다. 불화합성 Inc P9군에 속하는 NAH를 CAM:TOL* 과 TOL$\Delta$을 가지는 P.putida CST3A로 이동시키면 TOL$\Delta$의 방출이 관찰되었으나 m-toluate 대사에는 아무런 영향을 미치지 않았다.
임상 검체에서 분리 동정한 E.faecalis 균주에 대하여 gentamicin및 타 항균제에 대한 감수성을 조사했고, R-플라스미드 DNA패턴 및 제한효소에 의한 DNA단편분석,filter-mating에 의한 gentamicin 플라스미드 DNA 전이, R-플라스미드 DNA 제거, tetracycline 내성 유전자확인, 항원분석을 실시하였다. 분리된 40주 E. faecalis 모두가 gentamicin에는 내성이었고, 25주는 요 검체에서 분리되었으며, 이 40균주들 중 95%가 입원환자에서 분리되어 중요한 원내감염균임을 알 수 있었다. Gentamicin 고도내성 E. faecalis는 24주(60%)이었고, 최소억제농도의 범위는 ampicillin이 1~64$\mu$g/ml, Chroramphenicol 이 8~128$\mu$g/ml 과 erythromycin 128 $\mu$g/ml, vancomycinol 1~2 $\mu$g이었다. 분리한 Gentamicin 고도내성 E. faecalis HL-1은 4가지 항균제에 모두 내성이었고, 7종류의 플라스미드가 있었다. HL-2와 HL-3은 모두 6종류, HL-4는 7종류, HL-5는 4종류 그리고 HL-6은 5종류의 플라스미드가 있었다. E. faecalis HL-1 과 HL-6의 내성전달 빈도는 6.3$\times10^{-4}$ 과 3.7$\times10^{-5}$이 었으며, E faecalis HL-1의 내성전달 빈도가 높았다 접합에 의해 E.faecalir HL-1과 HL-6의 플라스미드 중 51.7 Kb크기의 전이된 DNA가 확인되어 gentamicin 내성이 플라스미드 전이에 의한 것임을 알 수 있었다. Tetracycline 유전자는 E.faecalis transconjugants R-1의 2.15 Kb 플라스미드에 있었다. 공여균주 및 transconjugants균주의 항원성을 Immunoblotting으로 분석한 결과 E. faecalis HL-1과 E. faecalis transconjugants R-1균주는 97.8, 46.8 Kd의 분자량을 갖는 단백질과 공통적으로 반응하였고, E. faecalis HL-6와 E. faecalis transconjugants R-6균주는 46.8 Kd의 분자량을 갖는 단백질과 공통적으로 반응하였다. 그 반응의 강도는 85.8, 97.8, 46.8, 33.7, 63.5 와 74.8 Kd 순이었다. 공여균주 E. faecalis HL-6에서는 반응하지 않았던 97.8, 95.8, 74.8와 63.5 Kd의 단백질이 E. faecalis transconjugants R-6균 주에서 반응하였다. 이들 종 특이성 단백질을 Invitro에서는 배양되지 않는 E. faecalis에 대한 혈청학적 진단의 항원으로 이용한다면 유용할 것이다.
Pseudomonas nitroreducens TX1는 대만의 벼를 재배하는 논의 배수구에서 분리된 세균이다. 이 균주는 알킬페놀 폴리에톡실레이트와 같은 비이온성 계면활성제를 고농도에서도 탄소원으로 이용할 수 있다. 본 연구에서는 TX1 균주에서 분리된 새로운 플라스미드 pTX1의 특성을 조사하였다. 크기는 2,286 bp, GC 함량은 63.3%, 암호된 유전자로는 $Rep_{pTX1}$과 기능이 밝혀지지 않은 ORF1과 ORF2가 동정되었다. $Rep_{pTX1}$은 롤링-서클 기작에 의해 복제되는 그람 양성 세균에서 주로 발견되는 pC194/pUB110 플라스미드 계열에 속하는 DNA 복제 효소임을 알 수 있었다. 또한 세포마다 약 150개의 플라스미드가 존재함을 규명하였다. 플라스미드에 존재하는 유전자 지문과 유사 플라스미드와의 핵산과 아미노산 서열비교를 통해 pTX1은 슈도모나스 세균에서는 흔히 발견되지 않는 롤링-서클 기작에 의해 복제된다는 것을 확인할 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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