• 제목/요약/키워드: 타입정보

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품질정보의 사용유무에 따른 하플로타입 페이징의 결과 차이 (Difference in Haplotype Phasing According to the Use of Quality Information)

  • 이종찬;나중채
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2017년도 춘계학술발표대회
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    • pp.13-16
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    • 2017
  • 인간 유전자의 SNP 서열 정보를 통해 하플로타입을 추정하는 하플로타입 페이징은 생명공학분야에서 중요한 연구분야이다. 최근에는 SNP 데이터가 많아짐에 따라 많은 하플로타입 페이징 알고리즘들이 제시되었다. 본 논문에서는 SNP 데이터의 오류로 인한 하플로타입 페이징의 한계점과 이를 해결하기 위한 품질정보의 사용에 관한 문제점을 언급한 후 이와 관련된 실험을 통해 품질정보가 하플로타입 페이징의 결과에 미치는 영향을 알아본다. 실험은 기존의 하플로타입 페이징 알고리즘을 사용하여 품질정보의 사용 유무에 따라 하플로타입 페이징 결과를 비교하는 과정으로 진행되었다. 실험 결과 하플로타입 페이징에 과정에서 품질정보를 사용하는 것은 품질정보를 사용하지 않았을 때 보다 좋은 결과를 보여주었다.

다형적 객체 타입 기술을 위한 메커니즘 (A Mechanism for the Expression of Polymorphic Object Type)

  • 이민규;한동수
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 1999년도 가을 학술발표논문집 Vol.26 No.2 (1)
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    • pp.436-438
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    • 1999
  • 객체지향 프로그래밍에서 다형성이란 객체가 하나 이상의 객체 타입을 가질 수 있다는 것을 말한다. 이처럼 객체가 하나 이상의 타입을 가지게 되면 다양한 문맥에서 객체를 사용할 수 있게 되어 재사용성을 달성 할 수 있게 된다. 그러나 이러한 객체의 다형성은 정적인 타입 검사를 어렵게 하여 실행시 타입 오류를 유발할 가능성을 높이는 원인으로 작용한다. 본 논문에서는 객체 타입을 기술하기 위한 문맥에서 당일 타입만을 기술했던 것이 제약에서 벗어나 여러 타입의 조합으로 다형적 타입을 기술할 수 있게 함으로써 문맥에 맞는 객체 타입을 기술할 수 있도록 하는 메커니즘을 제안한다. 그리고 이 메커니즘이 어떻게 사용될 수 있는가에 대한 예제들도 함께 소개한다.

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m-유형 공간객체를 위한 $R^m$-tree기반의 mk-최근접질의 처리기법 (mkNN Query Processing Method based on $R^m$-tree for Spatial Objects with m-types)

  • 장동주;안수연;정성원
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2011년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.38 No.1(C)
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    • pp.45-48
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    • 2011
  • 본 논문에서는 다양한 타입의 위치기반 데이터들을 하나의 R-tree로 통합합 $R^m$-tree의 구조와 이 $R^m$-tree를 이용하여 질의 포인트로부터 각 타입에서 k개의 가까운 위치기반 데이터를 찾는 mkNN(multi-type k nearest neighbor) 질의 처리기법을 제안하였다. 특히, 다양한 타입의 위치기반 데이터들을 각 타입별로 독립된 R-tree로 유지하지 않고, 하나의 $R^m$-tree로 통합하여 관리함으로써 mkNN 질의 처리시 같은 레벨의 공간의 반복탐색을 줄일 수 있도록 고안하였다. 그리고 각 타입 t에 대한 위치데이터를 관리하는 부가적인 타입정보 자료구조로서 위치정보를 담은 TMBR, 데이터 개수정보를 담은 $I_t$-entry를 새로이 고안하여 mkNN질의 처리시 효율적인 휠터링(filtering)과 검색과정이 이루어지도록 하였다.

논리 프로그램의 타입 및 모드 분석의 계층 구조 (A Hierarchical Structure of Type and Mode Analyses of Logic Programs)

  • 창병모
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제26권3호
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    • pp.335-342
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    • 1999
  • 논리 프로그램의 타입 및 모드 분석은 실행 시간에 변수가 갖는 텀의 집합에 대한근사값을 구하는데 보통 요약 해석을 기반으로 하여 설계되고 개발되어 왔다. 이 논문에서는 타입 및 모드 분석을 위해서 설계된 다양한 요약 도메인을 고려하여 그들간의 계층 관계를 Galois insertion을 기준으로 밝힌다. 이 논문에서는 요약 도메인으로써 타입 그래프, 깊이-k 타입 , 깊이-k 모드, 순환모드, 그리고 모드를 고려할 것이다. 특히 깊이-k 모드는 타입 및 모드 분석을 통합하기 위한 도메인으로써 깊이-k 타입을 확장하여 제안하였다.

CTOC에서 3-주소 코드를 위한 정적 타입 추론 (Inference of Static Types for 3-Address Codes in CTOC)

  • 김기태;유원희
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2004년도 추계학술발표논문집(상)
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    • pp.437-440
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    • 2004
  • 자바 바이트 로드 명령어는 타입에 관한 정보를 포함하고 있다. 그러나 기본적으로 스택 기반으로 동작이 수행되기 때문에 지역 변수를 위한 명시적인 타입을 가지지 않는다. 하지만 프로그램의 최적화나 역컴파일을 위해서는 지역 변수의 타입을 아는 것이 중요하다. 본 논문은 스택을 사용하지 않는 3-주소 코드에서 지역 변수를 위한 정적 타입 추론을 구현한다. 이를 위해 본 논문에서는 SSA와 방향성 그래프를 적용한다.

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내장형 XML 데이타베이스를 위한 타입 처리기의 설계 및 구현 (Design and Implementation of the Type Processor in the Embedded XML Database System)

  • 임우규;권준호;이석호
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2003년도 가을 학술발표논문집 Vol.30 No.2 (2)
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    • pp.31-33
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    • 2003
  • 문서를 표현하는 여러 가지 기법 중에서 XML(eXtensible Markup Language)은 확장성과 범용성 때문에 데이타의 교환과 표현에 대한 표준으로 자리잡고 있다. 이에 XML로 데이타를 저장하기 위한 다양한 방법들이 제시되고 있다. 본 논문에서는 관계형 데이타베이스에 XML 데이타를 저장하기 위해 XML 데이터의 타입을 관계형 데이타베이스의 타입으로 매칭해 주는 서브시스템인 타입 처리기를 구현한다. 타입 처리기에서는 eXDM이 내장형 시스템이라는 제한사항을 고려하고, XQuery 형태의 질의문을 지원하기 위해 XML-스키마를 변형한 형태의 XML 타입 정의 문서를 이용한다.

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유전자 알고리즘을 이용한 하플로타입 추론 (Haplotype Inference Using a Genetic Algorithm)

  • 이시영;한현구;김희철
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제33권6호
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    • pp.316-325
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    • 2006
  • 인간과 같은 2배체의 각 염색체는 부모로부터 물려받은 2벌의 복제로 이루어져 있다. 이들 각 복제에서 SNP(single nucleotide polymorphism) 서열 정보를 하플로타입이라 부른다. 인간의 하플로타입 지도를 완전히 찾는 것은 인간 지놈의 중요한 작업 중의 하나인데, 실험적인 방법으로 하플로타입을 직접 얻는 것은 시간이 많이 걸리고 비용이 많이 든다. 따라서 두 하플로타입 정보가 혼합된 지노타입의 샘플들로부터 하플로타입을 추론하는 것에 대하여 연구되어왔다. 이 논문에서는 지노타입들을 설명하는 최소 개수의 하플로타입들을 찾는 모델(최소 하플로타입 추론문제)에 근거하여, 유전자 알고리즘을 사용하여 하플로타입을 추론하는 새로운 접근 방법을 제시한다. 좋은 결과를 주는 것으로 알려진 HAPAR[1]와 이 논문에 제시한 알고리즘을 컴퓨터 실험에 의한 비교를 통하여, 입력이 클 때 이 논문의 알고리즘이 수행시간은 적게 걸리면서 정확성이 비슷함을 보인다. 또한 이 실험 결과를 최근에 제시된 방법인 PTG[2]와 비교한다.

기존에 제안된 휘처 관계 타입 분석 및 비교 연구 (Feature Relationships in Software Product Lines: Survey)

  • 이혜선;강교철
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2012년도 추계학술발표대회
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    • pp.1547-1550
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    • 2012
  • 소프트웨어 제품라인의 핵심 자산을 개발할 때 제품라인에 포함된 휘처 사이의 관계를 고려하여 핵심 자산을 개발하지 않으면, 한 휘처의 변화가 핵심 자산의 많은 부분에 영향을 미칠 수가 있고, 미처 고려하지 못한 휘처 관계에 의해 제품이 동작중에 의도치 않은 문제가 발생할 수 있다. 휘처 사이의 존재할 수 휘처 관계 타입을 미리 알고 있다면, 실제 휘처 관계를 분석할 때 도움이 되고, 각 타입별로 어떻게 핵심 자산을 개발해야 하는지 가이드라인을 제시할 수 있다. 기존에 많은 연구자들이 휘처 관계 타입을 제시하였지만 아직까지 제안된 휘처 관계 타입들을 비교하고 분석하는 연구가 이루어지지 않았다. 이에 본 논문에서는 지금까지 제안된 휘처 관계 타입들을 살펴보고, 제안된 관계 타입들을 비교 및 논의하고자 한다. 또한 기존에 제안된 휘처 관계 타입 중 위쳐 사이의 관계로 보기 어렵거나 중복이 되는 타입을 제외하여 휘처 관계 타입 리스트를 정리 및 제안하였다.

유전자 알고리즘을 이용한 하플로타입 추론 (Haplotype Inference Using Genetic Algorithm)

  • 이시영;김희철
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2004년도 춘계학술발표대회
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    • pp.993-996
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    • 2004
  • 사람들 사이에는 DNA 서열의 변이로 인한 유전적 차이가 있으며, 가끔 이러한 차이가 유전 질병의 원인이 되기도 한다. 일반적으로 DNA에서 가장 잘 알려진 변이가 바로 SNP(Single Nucleotide Polymorphism : 스닙)이다. SNP는 보통 블록단위로 유전되어지며 한쪽 부모로부터 유전되어진 SNP 블록을 SNP 하플로타입이라고 부른다. 생물학 실험을 통하여 추출되어진 결과물은 부모로부터 유전되어진 대립 유전자가 혼합되어진 지노타입(genotype)의 정보이다. 지노타입은 직관적으로 정확한 SNP 하플로타입을 추정하기가 힘들고, 생물학 실험을 통하여 하플로타입(haplotype)을 분석하는데 많은 비용이 들기때문에, 이를 컴퓨터 계산을 통하여 추론하는 연구가 Clark[1]에 의해서 제안되어진 이후 활발하게 진행되고 있다. 본 논문에서는 하플로타입을 효과적으로 추론하기 위해 유전자 알고리즘을 이용한 새로운 방법을 설명하고, 실험 결과를 기존의 연구 결과와 비교 분석한다.

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가상 프로토타입핑을 위한 Statechart 도구 (The Statechart Tool for Virtual Prototyping)

  • 김남규;박홍진
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2000년도 가을 학술발표논문집 Vol.27 No.2 (3)
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    • pp.12-14
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    • 2000
  • 실제품과 동일한 물리적 특성과 기능적 특성을 갖는 디지털 모델을 만드는 가상 프로토타입핑 기술은 내장형 시스템이 복잡해질수록 더욱 중요시되는 기술이다. 가상 프로토타입핑 요소기술중 정형 명세언어인 Statechart는 제품의 기능적 특성을 나타낸다. 그러나 기존 가상 프로토타입핑에서 사용되고 있는 Statechart에서의 재사용은 단지 복사하여 붙이는 방법만 있어서 재사용시 시스템 설계자의 세밀한 분석이 요구된다. 본 논문에서 구현한 가상 프로토타입핑을 위한 Statechart 도구는 제품의 생명주기를 줄이고, 제품의 시장적기진입을 위해 컴포넌트 기법을 이용하여 보다 빠른 시스템의 설계를 지원한다.

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