Park, Sang Beom;Roh, Seok Beom;Oh, Sung Kwun;Park, Eun Kyu;Choi, Woo Zin
Resources Recycling
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v.26
no.2
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pp.46-55
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2017
In this study, the design methodology of Radial Basis Function Neural Networks is developed with the aid of Laser Induced Breakdown Spectroscopy and also applied to the practical plastics sorting system. To identify black plastics such as ABS, PP, and PS, RBFNNs classifier as a kind of intelligent algorithms is designed. The dimensionality of the obtained input variables are reduced by using PCA and divided into several groups by using K-means clustering which is a kind of clustering techniques. The entire data is split into training data and test data according to the ratio of 4:1. The 5-fold cross validation method is used to evaluate the performance as well as reliability of the proposed classifier. In case of input variables and clusters equal to 5 respectively, the classification performance of the proposed classifier is obtained as 96.78%. Also, the proposed classifier showed superiority in the viewpoint of classification performance where compared to other classifiers.
Recently, we sequenced the entire genome of a freshwater agar-degrading bacterium Cellvibrio sp. KY-GH-1 (KCTC13629BP) to explore genetic information encoding agarases that hydrolyze agarose into monomers 3,6-anhydro-L-galactose (L-AHG) and D-galactose. The KY-GH-1 strain appeared to possess nine β-agarase genes and two α-neoagarobiose hydrolase (α-NABH) genes in a 77-kb agarase gene cluster. Based on these genetic information, the KY-GH-1 strain-caused agarose degradation into L-AHG and D-galactose was predicted to be initiated by both endolytic GH16 and GH86 β-agarases to generate NAOS (NA4/NA6/NA8), and further processed by exolytic GH50 β-agarases to generate NA2, and then terminated by GH117 α-NABHs which degrade NA2 into L-AHG and D-galactose. More recently, by employing E. coli expression system with pET-30a vector we obtained three recombinant His-tagged GH50 family β-agarases (GH50A, GH50B, and GH50C) derived from Cellvibrio sp. KY-GH-1 to compare their enzymatic properties. GH50A β-agarase turned out to have the highest exolytic β-agarase activity among the three GH50 isozymes, catalyzing efficient NA2 production from the substrate (agarose, NAOS or AOS). Additionally, we determined that GH117A α-NABH, but not GH117B α-NABH, could potently degrade NA2 into L-AHG and D-galactose. Sequentially, we examined the enzymatic characteristics of GH50A β-agarase and GH117A α-NABH, and assessed their efficiency for NA2 production from agarose and for production of L-AHG and D-galactose from NA2, respectively. In this review, we describe the benefits of recombinant GH50A β-agarase and GH117A α-NABH originated from Cellvibrio sp. KY-GH-1, which may be useful for the enzymatic hydrolysis of agarose for mass production of L-AHG and D-galactose.
Park, Kwang-Lai;Suga, Yuko;Hong, Seung-Gil;Lee, Chorong;Ahn, Minsil;Kim, Seok-Cheol;Hashimoto, Tomoyoshi
Journal of the Korea Organic Resources Recycling Association
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v.24
no.4
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pp.77-83
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2016
The objectives of this study was to investigate the difference between organic-farming and conventional-farming soils relatives to soil chemical properties and microbial flora. Fifteen soil sampling sites were chosen from the certified organic upland farm, considered with its location, crop and application of organic compost types. Soil chemical properties were analyzed by standard methods established by National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration. For the soil chemical properties, the values of pH were ranged from 4.5 to 7.3. The values of electrical conductivity (EC) in the sampling sites were below 2 dS/m of convention cultivation soil. For analyzing the microbial flora, the bacillus(16S rDNA) and cladothricosis(18S rDNA) were analyzed by using PCR-DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) in the soil of 15 sampling sites. Cluster analysis of biodiversity index was performed by using pattern of DGGE. DGGE patterns and clustering analysis of bacterial DNA from soil extracts revealed that the bacterial community was differentiated between less than 5 years and more than 5 years depending on the cultivation history. But there was no consistent tendency between cultivation history and regional trend in the case of molds. Therefore, it would be very effective to analyze bacterial clusters of organically cultivated soils in long - term cultivated soil for more than 5 years.
Kim, Hojun;Jayapala, HPS;Jo, Won Hee;Nam, Hyung Sik;Lim, Sun Young
Journal of Life Science
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v.31
no.6
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pp.559-567
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2021
This study compared the nutritional characteristics and antioxidant effects of sea mustards sourced from five different areas (Barammaegi, Gultongmeori, Chanmulgae, Johongtaek, and Goraedeung) in Taejongdae, Youngdo, Busan. The contents of total flavonoids and phenols and fatty acid composition were measured. To evaluate their antioxidant effects, 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) and 2,2'-azino-bis (3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS) assays were used. Acetone/methylene chloride (A+M) extracts from all the sea mustards contained higher amounts of total flavonoids and phenols than methanol (MeOH) extracts. Among the sea mustards obtained from the different areas, the total flavonoid and total phenolic content of the A+M extract of the sea mustard from Gultongmeori was 1.44±0.04 mg/g and 1.72±0.06 mg/g, respectively. In terms of the fatty acid composition, the Gultongmeori sea mustard had higher percentages of total n-6, total n-3, eicosapentaenoic acid (EPA, 20:5n-3), and docosahexaenoic acid (DHA, 22:6n-3) than the sea mustards from the other areas. The A+M extract of the sea mustard from Gultongmeori was more effective in terms of scavenging free radicals as compared with that of the other sea mustards, as assessed by the DPPH and ABTS assays (p<0.05). In a 120-minute reactive oxygen species (ROS) production assay, all the extracts tested decreased cellular ROS production induced by H2O2 compared to that produced by exposure to an extract-free control (p<0.05). The extracts from Barammaegi and Gultongmeori had a greater inhibitory effect on cellular ROS production. These results indicated that the antioxidant effects of sea mustards might be associated with a higher amount of flavonoids and phenols. This study suggests that food-processed products from sea mustard can be developed as functional foods for promoting health in the local population.
An experiment was performed for zone refined Re-filament and normal (nonzone refined) Re-filament to reduce the background effect on the measurement of low level uranium samples. From both filaments, the signals which seemed to come from a cluster of light alkali elements, $(^{39}K_6)^+$, $(^{39}K_5+^{41}K)^+$ and $PbO_2$ were identified as the isobaric effect of the uranium isotopes. The isobaric effect signal was completely disappeared by heating the filament about $2000^{\circ}C$ at < $10^{-7}$ torr of vacuum for more than 1.5 hour in zone refined Refilaments, while that from the normal Re-filaments was not disappeared completely and was still remained as 3 pg. of uranium as the impurities after the degassing treatment was performed for more than 5 hours at the same condition of zone refined filaments. A threshold condition eliminating impurities were proved to be at 5 A and 30 minutes of degassing time. The uranium content as an impurity in rhenium filament was checked with a filament degassing treatment using the U-233 spike by isotope dilution mass spectrometry. A 0.31 ng of U was detected in rhenium filament without degassing, while only 3 pg of U was detected with baking treatment at a current of 5.5 A for 1 hr. Using normal Re-filaments for the ultra trace of uranium sample analysis had something problem because uranium remains to be 3 pg on the filament even though degassed for long hours. If the 1 ng uranium were measured, 0.3% error occurred basically. It was also conformed that ionization filament current was recommended not to be increased over 5.5 A to reduce the background. Finally, the contents of uranium isotopes in uranium standard materials (KRISS standard material and NIST standard materials, U-005 and U-030) were measured and compared with certified values. The differences between them showed 0.04% for U-235, 2% for U-234 and 2% for U-236, respectively.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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