• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2012.06c
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• pp.113-115
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• 2012

전사체(transcriptome) 분석이란 주어진 조건 하에서 현재 세포 내에 발현된 모든 트랜스크립트의 종류와 양을 밝히는 것을 의미하며, 분석 결과는 질병 관련성/유전적 요인 규명 등의 연구에 직접 활용한다. 우리는 선행 연구에서 RNA-Seq 데이터를 이용하여 선택 스플라이싱 과정에 의하여 생성되는 모든 트랜스크립트의 유형을 분류/추출하는 새로운 방법론을 제안한 바 있다. 그 후속 연구로서 본 연구에서는 시간/공간 효율적인 알고리즘 구현을 위한 최적화 방법론을 제안하고, 실용화를 위한 전사체 분석 도구 개발에 대하여 논한다. 개발된 전사체 분석 도구에서는 기존의 분석 도구와 달리 RNA-Seq 데이터의 단계적 분석 결과를 시각적 뷰어를 통하여 검색 가능하며, 이들 기능은 복잡한 전사체 분석 결과의 이해와 타당성 검증에 활용한다.

• Ocean and Polar Research
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• v.25 no.4
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• pp.469-481
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• 2003

This study is to suggest strategies for the aquaculture of marine fishes in Korea through the analysis of current domestic states and case studies of the advanced countries to enhance the competitiveness of the industry. To reveal the current state, a questionnaire study to the producers was carried out, and cases in Norway, China, Japan, USA were analysed in terms of national development strategies. From those analyses, 3 strategies for the improvement of the competitive edge in the industry were induced as followings. First, it is necessary to implement restructuring such as upsizing through consolidation of small units, networking, etc. Second, it is required to introduce the state-of-the-art technology with the newly-designed equipments to save energy and cost in the operation. Third, it is also required to implement programs to select the national strategic species and concentrate R&D resources on the selected ones.

• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2002.06a
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• pp.89-104
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• 2002

유전체연구사업단은 국내에서 발병 및 사망빈도가 가장 높은 위암과 간암의 퇴치를 목적으로 국가적 특목전략사업으로 연구를 추진하고 있다. 이와 별도로 보건복지부에서는 22개의 중요 질병별 유전체 연구센터를 전국적으로 추진하고 있다. 따라서, 연구가 성공적으로 진행되면 각 연구소에서 독자적으로 개발하여 제공하는 생명정보의 양은 거의 무한에 이를 것이다. 그러나 생명정보는 환자진료에 도움을 주기 위해서는 궁극적으로 임상정보와 함께 유기적으로 통합되어야 한다. 임상정보와의 통합을 위해서는 의료기관의 진료정보와 연구소의 생명정보가 연계되어 엄밀한 임상실험이 추가적으로 실시되어야 한다. 뿐만 아니라 생명정보학의 발전을 위해서는 연구대상의 임상정보가 공유되어야 한다. 유전체정보를 이용하는 생명정보학(Bioinformatics)은 각 국가마다 전략사업으로 간주하여 막대한 투자가 이루어지는 새로운 분야이다. 현재 선진국에서 개발 사용 중인 시스템의 연간 사용료가 고가이므로 국내 도입은 거의 불가능하거나 또는 매우 비효율적이다. 유전체 또는 생명정보의 임상활용 및 생명정보연구를 위한 임상정보 공유를 위해서는 우선 다음의 사항이 개발되어야 한다. 1) 다음과 같은 개별환자의 정보를 각 의료기관에서 제공 받아 저장 활용한다. - 진찰 및 임상소견, 수술기록, 경과기록, 검사결과 (임상병리, 해부병리, 방사선 등), - 영상정보 (X-ray, CT, MRI, 초음파, 전자현미경, 그래픽 등), - 환자개인기록(병력, 과거력, 가족력, 알러지 등), - 예방접종 기록 2) 각 연구소에서 첨단기술을 이용하여 개발되는 생명정보를 임상에 활용하기 위해서는 유전체연구센타와 병원간에 임상정보와 유전체 분석정보의 공유가 필수적으로 발생하게 됨으로, 유전체 정보와 임상정보의 통합은 미래 의료환경에 필수기능이 될 것이다. 3) 각 생명공학 연구소에서 사용하는 첨단 분석 장비와 생명공학 정보시스템의 자동 연계가 필요하다. 현재 국내에는 전국적인 초고속정보망이 가동되어 웹을 기반으로 하는 생명정보의 공유는 기술적으로 문제가 될 수 없으나 임상정보의 유전체연구에 그리고 유전체연구정보의 임상활용은 다양한 문제를 내포하고 있다. 이에 영상을 포함한 환자정보의 유전체연구센터와 병원정보시스템과의 효율적인 연계통합 운영을 위해 국내에서는 초기 도입단계에 있는 국제적인 보건의료정보의 표준인 Health Level 7 (textural information 공유), DICOM (image 및 wave 공유), 관련 ISO표준, WHO의 ICD9/10 (질병분류), LOINC (검사 및 관련용어), SNOMED International (의학용어) 등을 활용하여야 한다.

• Proceedings of the Microbiological Society of Korea Conference
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• 2001.11a
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• pp.77-81
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• 2001

Microsporidia in humans emerged with the AIDS epidemic. Enterocytozoon bieneusi is the most significant species' and causes chronic diarrhea, wasting, papillary stenosis, acaculous cholecystitis, bile duct dilatation and sclerosing cholangitis and is responsible for $30-50\%$ of all cases of in people with AIDS. Microsporidiosis has been reported in immunosuppressed, and in immunologically normal individuals. Variety of study has revealed the mode of transmission and possible reservoir of E. bieneusi. Its sites of infection suggest that transmission occurs by ingestion. Transmission has been speculated to occur via infected animals to human, person to person. There is evidence that E. bieneusi occurs in pigs, monkeys, and possibly other animals such as cattle, dogs, cats, llamas and rabbits. E. bieneusi from infected humans has been transmitted experimentally to macaques and to pigs. These observations reflect indirectly the zoonotic nature of E. bieneusi and indicate that cross species transmission is a real possibility. Meanwhile, In recent report, thirty-two percent of the pigs were found to be positive with rates higher over the summer months in US.

• Feed Journal
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• v.4 no.7 s.35
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• pp.108-115
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• 2006

우리나라는 사계절이 뚜렷한 기후적 환경으로 여름철 한낮의 외부온도가 35℃ 이상이 되는 날이 계속되고, 야간에도 25℃ 이상인 열대야가 지속되는 날이 많다. 이러한 조건하에서 양돈 생산성 향상을 위해서는 돼지의 사육환경과 성장단계별 적절한 사양기술을 투입하여야만 한다. 돼지는 생리적으로 추위에 의한 영향보다는 여름철 더위에 의한 영향을 쉬게 받으며, 이로 인해 자돈의 쇠약, 압사,수태율 저하, 번식장애 등으로 생산성 저하의 원인이 되며, 사육기간 중에 일시적인 고온스트레스가 돼지가 생존하는 동안 능력의 저하를 초래하게 된다. 특히 하절기 양돈장은 우기와 무더위로 인한 돈사내 온도의 급상승과 더불어 습도의 불균형에 의한 환경적 스트레스로 번식능력과 생산성에 크게 영향을 미칠 수 있으며,돼지에 일시적인 고온 스트레스 피해는 장기간 계속되며, 생존하는 동안 능력저하를 초래하기 때문에 농장별 사육여건에 따른 성장저해 요인을 제거하는 안목이 필요한 계절이다. 즉,5~9월 모돈에 고온스트레스가 가해지면 11~12월, 다음해 1월 모돈의 분만율은 최저가 되고 , 이 시기에 생산된 자돈은 추운겨울을 이겨내야 함으로 육성률도 낮아지며, 이로 인해 4~7월의 출하성적은 최저가 되는 것이다. 따라서 모돈 관리는 5~9월이 집중관리가 필요한 시기이기도 하다. 고온 다습한 환경 하에서 어미돼지는 영양불균형과 생체리듬의 파괴로 인하여 신생자돈의 폐사가 증가할 수도 있고,이유 후 1주일 이내 발정 재귀율이 약 30%정도 감소하고 무발정돈이 많이 발생되며, 수태가 되어도 조기 배아사멸 및 흡수로 인하여 수태율이 25%까지 감소될 수 있다. 현재 국내 양돈농가에는 예년과 같이 돼지 조모성질환의 발생이 늘어나고 있고, 어려움을 겪고 있는 농장이 많은 것으로 조사 보고되어지고 있는데, 이는 농장에 사육되는 돈군이 외부환경에 대한 적응능력과 질병에 저항력이 부족하여 쉽게 질병에 노출되어 발생함으로 농장에는 돼지가 스트레스를 받지 않게 외부 환경과 사양관리 측면에 심혈을 기울려 강건한 축군을 유지하려는 노력이 무엇보다 우선되어져야 한다고 생각된다. 따라서 본고에서는 여름철에 돼지 스트레스를 줄이고 생산성을 향상시키기 위해 돼지의 생리변화와 돈사 급수설비와 사료관리 및 사육관리에 대해 알아보고자 한다.

• The Journal of the Korea institute of electronic communication sciences
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• v.16 no.4
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• pp.661-674
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• 2021

Edwardsiellosis is difficult to treat in cultured olive flounder, Paralichthys olivaceus. It is present in the fish for a long period during all growth stages, and it often leads to mass mortalites. In this paper, the clinical patterns of Edwardsiellosis were analyzed by dividing the data into the whole-water temperature, low-water temperature, low-high water temperature, high-water temperature, and high-low water temperature groups based on various clinical signs of diseased cultured olive flounder using a decision tree technique. In the clinical sign patterns in the decision trees analyzed in the experiment, clinical signs in the liver, such as liver nodules, liver hemorrhages, and liver degeneration, were selected as the criteria for determining Edwardsiellosis. The selected clinical signs were known as the major clinical signs of Edwardsiellosis, and through consultation with fishery disease experts, the analysis confirmed that the clinical signs of Edwardsiellosis were successfully found in this study.

• Proceedings of the Korean Society for Information Management Conference
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• 2017.08a
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• pp.104-104
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• 2017

연구 데이터란 과학적 연구에서 사용된 일차 자료와 연구자에 의해 직접 작성된 연구의 결과로서 수치, 문자, 이미지, 음성 등의 사실적 기록을 의미한다. 이 연구의 주제 분야인 의학은 잠재적 가치와 활용 가능성이 높고 공익적 성격을 가지고 있는 학문 분야로 의학 연구 데이터의 종류와 관리의 필요성을 통해서 그 가치와 공유 의미를 찾아보고자 한다. 또한 연구 데이터의 대표적인 임상 시험 기록과 연구 논문의 발표와 공유 현황에 대해서도 살펴보고 그 안에서 도서관의 역할이 어떤 것인가를 짚어보고자 한다. 의학 연구 데이터는 환자 진료기록, 건강 검진 기록, 임상 기록, 사망 기록, 임상 시험 기록, 유전체 정보, 연구 논문 등 그 종류와 형태가 다양하며 대용량인 경우가 많다. 의학 연구는 개인 정보보호와 윤리적인 문제 등 연구 수행 과정에서 어려운 점이 많은 성격을 가지고 있으나 질병 치료나 예방 나아가 인류의 건강과 직접적으로 관련된 학문 분야로 의학 연구 데이터의 보존과 공개, 공유를 위한 관리는 큰 의미가 있다. 의학 연구 데이터관리는 새로운 연구의 밑받침이 될 뿐만 아니라 중 저개발 국가의 연구자들에게도 큰 기회를 부여하여 세계적인 의학 발전에 기여할 수 있다. 또한 임상 시험 결과에 대한 은폐와 거짓 연구 방지에도 의미가 있어 미국뿐만 아니라 전세계적으로 학술 연구 논문 발표에 사용된 데이터는 등록하도록 규정하고 있다. 임상 시험 등록으로 공인된 사이트는 NIH의 ClinicalTrials.gov, ICTRP의 Primary Registry 등이 있으며, 우리나라에도 질병관리본부 국립보건연구원에서 관리하는 CRIS 등이 있다. 의학 연구자들은 연구의 시작부터 연구 데이터를 수집, 사용, 보존, 공유의 문제를 고려해야 하나 시간적 물리적인 문제 등으로 어려움을 겪고 있으며, 이를 지원하는 서비스는 도서관에서도 관심이 높아지고 있는 분야로 Virginia Commonwealth 대학 도서관과 Emory 대학 도서관 등에서 시도되고 있다. 이 서비스는 연구 과정에서 사서의 지원이 가능한 새로운 기회로 연구자의 데이터관리를 위한 단계별 스토리를 조직하고 DMP 작성 지원 및 교육 등을 통해서 학술 커뮤니케이션에서 새로운 역할자로 자리잡을 수 있을 것이다.

• Journal of the Korea Society of Computer and Information
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• v.25 no.12
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• pp.101-107
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• 2020

This paper aims to compare and analyze the major keywords according to the political orientation of progressive and conservative newspapers by utilizing the big data of the four major domestic daily newspapers related to COVID-19, which has entered a long-term war. To this end, 93,917 news reports from Jan. 20 to Sept. 15, 2020 were divided into four stages and the major keywords of the four newspapers were implemented and analyzed in WordCloud. According to the analysis, the conservative newspaper focused on the government's response, criticism, and China's responsibility by mentioning the keywords "government," "president," "state of affairs" and "mask" more than the progressive newspaper, while the progressive newspaper uses keywords that emphasize the seriousness of the disease and the occurrence of a dangerous situation. The Chosun Ilbo found that the use of various keywords during the massive outbreak of collective infections (2.18-5.15), and that the JoongAng Ilbo used keywords criticizing government policies in relation to reports of infectious diseases such as COVID-19, but also used keywords that emphasize the seriousness of diseases used by progressive newspapers and the occurrence of dangerous situations.

• Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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• v.24 no.6
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• pp.795-801
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• 2020

In the event of a fatal infectious disease in the country, it is very important that the government respond quickly and prevent the secondary infection of the people to prevent the subsequent spread of damage. However, in order to detect infectious diseases in existing medical institutions, and to reach the KCDCP(Korea Centers for Disease Control and Prevention) a total of four steps must be taken. In this paper, we simplifies the existing reporting process using the open blockchain. In addition, not only infectious disease related organizations share infectious disease information on the blockchain, but also grant access to the blockchain to ordinary citizens. By sharing information quickly and transparently revealing the process, we can add credibility to the response to the outbreak and official announcements. The public can also build efficient next-generation defense systems by checking information on the blockchain to prevent secondary infections.

• Journal of Preventive Medicine and Public Health
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• v.22 no.1 s.25
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• pp.29-44
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• 1989

A household survey was conducted to determine the utilization rate of medical facilities and to identify the factors related with the utilization in the South District of Taegu from July 3 to July 15, 1988. Study population included 1,723 family members of 431 households which were selected by one-stage simple cluster random sampling. Well trained medical college students interviewed mainly housewives with a structurized questionnaire. Morbidity rate of acute illness during the 2-week period was 101 per 1,000 persons and it was highest in the age group of 9 years below. The rate for chronic illness was 77 per 1,000 persons, increasing with age, low income and medicaid benefit. During the 2-week period, 689 of 1,000 persons utilized the medical facilities. Of the facilities, most number, 294, used hospital and clinic, and the order ran as pharmacy, health center, and herb medical clinic. The utilization rate was higher in the female, 70-year and older group, medicaid group, the lowest income class and self-employed group than other groups. The average number of visits among users of medical facilities during the 2-week period was 3.25. those who visited medical facilities most frequently were females, the 70-year and older group, the lowest income class and blue collar worker group. During one-year period, admission rate of 1,000 persons was 27.6 and that of female was 38.9, higher than that of male. the eldest group had the highest admission rate. Admission rate of medical insurance beneficiaries was twice or higher than non-beneficiaries. The higher the family monthly income, the more frequently they admitted. During one-year period, average admission days of the persons hospitalized were 22.5 days and males were hospitalized longer than females. The groups which were hospitalized longest were those between the ages of 40 and 49, medical insurance beneficiaries, the lowest income group and unemployed group. During one-year period, average admission days of 1,000 persons were 560 days and those of female were 661 days, more than those of male. The guoups which had the longest admission days were those above 70 years of age, the lowest income and unemployed groups. The medical insurance beneficiaries were three times or longer than non-beneficiaries. In logistic regression analysis of utilization of physician significant independent variables were the 9-year and younger group(+), the 70-year and older group(+), acute illness episode(+), chronic illness episode(+), medical insurance beneficiary(+) and white collar workers(-). Acute and chronic illness episode(+), and medical insurance for government employees and private school teacher(-) were significant variables in analysis of utilization of pharmacy. In multiple regression analysis of the number of physician visits, siginificant variables were acute illnes episode(+), chronic illness episode(+), industrial, occupational and regional medical insurance beneficiary(+), white collar workers(-). Acute and chronic illness episode(+), and medical insurance beneficiary(-) were significant variables in analysis of the number of pharmacy visits. In logistic regression analysis of admission event, significant independent variables were the 9-year and younger group(+), the 70-year and older group(+) , chronic illness episode(+), and medical insurance beneficiary(+).