As whole genome sequences of many organisms have been revealed by small-scale genome projects, the intensive research on individual genes and their functions has been performed. However on-memory algorithms are inefficient to analysis of whole genome sequences, since the size of individual whole genome is from several million base pairs to hundreds billion base pairs. In order to effectively manipulate the huge sequence data, it is necessary to use the indexed data structure for external memory. In this paper, we introduce a workbench system for analysis and visualization of whole genome sequence using string B-tree that is suitable for analysis of huge data. This system consists of two parts : analysis query part and visualization part. Query system supports various transactions such as sequence search, k-occurrence, and k-mer analysis. Visualization system helps biological scientist to easily understand whole structure and specificity by many kinds of visualization such as whole genome sequence, annotation, CGR (Chaos Game Representation), k-mer, and RWP (Random Walk Plot). One can find the relations among organisms, predict the genes in a genome, and research on the function of junk DNA using our workbench.
Kim, Chanyoung;Kwon, Dosoon;Lee, Jaebeom;Kim, Jinhwa
Information Systems Review
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v.14
no.2
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pp.1-19
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2012
Recently due to the enhancement of education and lifestyle, the trend of healthcare services are changed to a more active and differentiated service in which a continuous self health care is possible. The Smart-Telemedicine system offers medical services by merging Blue-tooth and telecommunication modules to former blood pressure, blood sugar, heartbeat and temperature measuring devices. Moreover, it could analyze one's health pattern which would be helpful for the patient to prevent potential future illness. In addition, the easier accesses to various remote controllable medical check-up programs are offered to public as a number of available smart phone are rapidly escalating. The Smart-Telemedicine system provides the most ideal interactive medical service via accessible smart phones and mobile medical check-up devices at anywhere and anytime. It is very beneficial since it can save patients' time and money because people can reach to the service right at their home and be allowed to take charge of their health care process via longitudinal health data. Therefore, not only social costs that occur in elderly community would be saved, but also business in various forms of medical service field transactions could be possible. This paper will suggest the Smart-Telemedicine System for preventive medicine, its design and analysis of business models and the evaluation of those model.
A 3-year-old, intact male Pungsan dog was presented for a 2-week history of a non-weight-bearing lameness of left hindlimb with anorexia. The dog had no history of trauma, and never been routinely vaccinated or treated with heartworm preventatives. The complete blood count showed severe leukocytosis and neutrophilia with left shift. Serum biochemistry showed hypoalbuminemia, azotemia, and increased hepatobilliary enzyme activity. A canine heartworm antigen test was positive. Thoracic radiographs were consistent with heartworm disease as evidences by main pulmonary artery enlargement, right-sided cardiomegaly, and interstitial lung pattern. Echocardiography revealed pulmonary valvular regurgitation and pulmonary hypertension. Selective femoral arterial angiogram was performed, and bilateral femoral arterial occlusion was identified. The dog died after angiogram, and necropsy was performed. At necropsy, adult heartworm and a large blood clot were found within the lumen of left and right femoral artery. This case report describes an unusual migration of heartworm to femoral artery that caused hindlimb lameness.
Forest fire has a number of variables and since the effects of wind fields are bigger than any other variables, it is essential to know wind direction and velocity for the forest fire extinguishing techniques and the prediction of fire spread. With regards to the local area that has a high chance of forest fire, the data from meteorological observatory in the area is used for the estimation of wind velocity. It is relatively easy to obtain automatic weather station (AWS) data which are available for the whole nation. There is a chance that the data from the weather station may be different with the actual data at the mountain areas. In this study simply shaped hills (Sae-byeol hill of Jeju Island and port Ma-geum in An-myeon Island in the sea side) were selected as the experimental locations to minimize the distortion of the wind field by the adjacent geographic features. Spot measurements and analysis of computational fluid dynamics (CFD) for the given geographic features were conducted to examine and compare their consistency. As a conclusion It is possible to predict wind patterns in these simple locations.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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v.15
no.8
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pp.4831-4843
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2014
Magazines on specific genres have been operating collaborative, co-working and collective production systems for value maximization using an adaptation strategy on the dynamic, complex and uncertain value network of the magazine industry. The study used a case study method, and data collection was performed by observational research, depth interviews and survey research. The subjects of the study were 'magazine industry', 'magazine firm and community', and 'collaboration system within creative users'. According to the research results, the ecosystem of magazines on a specific genre has been evolving into an innovative value network system, which is combined with the magazine firm, community users and magazine platform. Second, the rapid introduction of smart device environment changes the way of the collaborating system, in which an action and interaction came out within the community, creative users and magazine firms. Third, the production agency shows strong action and interaction, which fits the magazine platform within the ecosystem of a magazine on a specific genre well. This model has a similar fractal structure to the game, publishing, drama, movie, comic, and animation contents industry, converging to an innovative technology-based-creative-industry.
Journal of the Korean Society for Library and Information Science
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v.45
no.2
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pp.209-228
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2011
Web search behavior has evolved. People now search using many diverse information devices in various situations. To monitor these scattered and shifting search patterns, an improved way of learning and analysis are needed. Traditional web search studies relied on the server transaction logs and single query instance analysis. Since people use multiple smart devices and their searching occurs intermittently through a day, a bundled query research could look at the whole context as well as penetrating search needs. To observe and analyze bundled queries, we developed a proprietary research software set including a log catcher, query bundling tool, and bundle monitoring tool. In this system, users' daily search logs are sent to our analytic server, every night the users need to log on our bundling tool to package his/her queries, a built in web survey collects additional data, and our researcher performs deep interviews on a weekly basis. Out of 90 participants in the study, it was found that a normal user generates on average 4.75 query bundles a day, and each bundle contains 2.75 queries. Query bundles were categorized by; Query refinement vs. Topic refinement and 9 different sub-categories.
As part of a policy to address climate change and pollution problem, the government introduced a green credit card scheme in order to motivate pro-environmental behaviors in July 2011. It is important to present the specific ways to facilitate pro-environmental behaviors using the consumer behavior pattern data. This study was a result of data from total fifty seven thousands customer purchasing history data of green credit card to be created for the 3 months from January to March 2015. As the analysis process is put in to operation the analysis of the purchasing customer's profile firstly, and the second come into association analysis to consider the buying associations for green products purchasing networks, the third estimate the useful parameters to affect the customer's pro-environmental behavior and customer characteristics. It shows that royal customers are from 30 to 40 years old and their incomes are from 30 million won to 40 million won. Especially, they live in Daegu, Gyeonggi, and Seoul.
The purpose of this study is to assess the relationship between glomerular filtration rate (GFR) and age by using dynamic computed tomography (CT) and Patlak plot analysis in dogs. Fifteen dogs were used in this study. CT-GFR study was performed under general anesthesia using propofol and isoflurane. 1 ml/kg dosage of 300 mgI/ml iohexol was administered at a rate of 3 ml/s during GFR measurement. CT-GFR was determined with a single-slice dynamic acquisition and Patlak plot analysis. The individual and global GFR values were calculated to plasma clearance per body weight (ml/min/kg). Bodyweight ($mean{\pm}SD$) ranged from 2.0 to 5.7 kg ($3.31{\pm}1.13$ kg). Age ranged from 3 years to 13 years old ($7.14{\pm}3.30$). $Mean{\pm}SD$ creatinine ($0.53{\pm}0.34 $mg/dl), phosphorus ($4.1{\pm}1.2$ mg/dL), and albumin ($3.3{\pm}0.3$ mg/dL) concentrations and urine protein-to-creatinine ratios (all ratios were < 0.5) were within reference ranges. Abdominal ultrasonography revealed small-sized renal calculi, mineralization, or renal cyst at eight dogs. The global CT-GFR ranges shown in this study was 2.57 to 6.60 ml/min/kg. In this study, there was no trend toward weight-adjusted CT-GFR with increasing age. We found no relationships between age-related kidney dysfunction in fifteen dogs. Small-sized renal calculi or cysts did not affect renal function in this study. However, it is thought that a large sample size may have been required to document an age effect.
Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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2002.05a
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pp.315-322
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2002
최근에 경험적 지식을 체계화하는 방법으로 사례기반추론(CBR: Case Based Reasoning) 및 규칙기반추론(RBR: Rule Based Reasoning)이 여러 분야에서 이용되고 있다. CBR과 RBR이 각각 활용되기도 하지만 문제 해결의 정확성을 높이기 위해 복합된 형태로 사용되기도 하고, 흑은 효과적으로 문제를 해결하기 위해 문제 해결 단계별로 각각 사용되기도 한다 또한 데이터에서 지식을 추출하기 위한 세부 알고리즘으로는 인공지능과 통계적 분석기법 등이 활발하게 연구 및 적용되고 있다. 본 연구는 모니터의 핵심 부품인 섀도우마스크(Shadow Mask)를 개발하는데 있어 도면 협의부터 설계가지의 과정에 CBR과 RBR을 활용하고 발생되는 데이터를 이용하여 진화(Evolution)하는 지식기반시스템(Knowledge Based System)으로 구축하는 것을 목적으로 하고 있다. 특히 도면 협의시 인터넷상에 웹서버 시스템을 통하여 규격 (User Spec.)을 생성하고 이를 이용하여 자동으로 도면이 설계되도록 하고 저장된 사례들을 공유할 수 있도록 하여 도면 검토 시간이 단축되고 검토의 정확성을 기할 수 있어 실패비용을 감소시켰다. 그리고 실제 설계시 CBR과 RBR을 활용하여 자동설계를 할 수 있게 하였고 현장에서 발생되는 데이터를 지식화하여 유사사례 설계가 가능하도록 하였다. 지식기반시스템은 신속한 도면 검토가 가능하므로 인원 활용이 극대화되고, 섀도우 마스크 설계자와 마스터 패턴 설계자 사이의 원활한 의사소통을 통해 고객과의 신뢰성 확보와 신인도 향상을 기대할 수 있는 효과가 있다. 그리고 고급설계자에게만 의지되어온 것을 어느 정도 해결할 수 있고, 신입설계자에게는 훌륭한 교육시스템이 될 수 있다.한 도구임을 입증하였다는 점에서 큰 의의를 갖는다고 하겠다.운 선용품 판매 및 관련 정보 제공 등 해운 거래를 위한 종합적인 서비스가 제공되어야 한다. 이를 위해, 본문에서는 e-Marketplace의 효율적인 연계 방안에 대해 해운 관련 업종별로 제시하고 있다. 리스트 제공형, 중개형, 협력형, 보완형, 정보 연계형 등이 있는데, 이는 해운 분야에서 사이버 해운 거래가 가지는 문제점들을 보완하고 업종간 협업체제를 이루어 원활한 거래를 유도할 것이다. 그리하여 우리나라가 동북아 지역뿐만 아니라 세계적인 해운 국가 및 물류 ·정보 중심지로 성장할 수 있는 여건을 구축하는데 기여할 것이다. 나타내었다.약 1주일간의 포르말린 고정이 끝난 소장 및 대장을 부위별, 별 종양개수 및 분포를 자동영상분석기(Kontron Co. Ltd., Germany)로 분석하였다. 체의 변화, 장기무게, 사료소비량 및 마리당 종양의 개수에 대한 통계학적 유의성 검증을 위하여 Duncan's t-test로 통계처리 하였고, 종양 발생빈도에 대하여는 Likelihood ration Chi-square test로 유의성을 검증하였다. C57BL/6J-Apc$^{min/+}$계 수컷 이형접합체 형질전환 마우스에 AIN-76A 정제사료만을 투여한 대조군의 대장선종의 발생률은 84%(Group 3; 21/25례)로써 I3C 100ppm 및 300ppm을 투여한 경우에 있어서는 각군 모두 60%(Group 1; 12/20 례, Group 2; 15/25 례)로 감소하는 경향을 나타내었다. 대장선종의 마리당 발생개수에 있어서는 C57BL/6J-Apc$^{min/+}$계 수컷 이형접합체 형질전환 마우스에 AIN-76A 정제사료만을 투여한
Park, Hyo-Min;Kim, Wan-Seok;Kang, So-Jeong;Shin, Sang Uk
Journal of Digital Convergence
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v.15
no.4
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pp.285-293
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2017
They are rapidly evolving malicious attacks on smart devices, and to timely protect the smart devices from these attacks has become a very important issue. In particular, smishing attack has emerged as one of the most important threats on the smartphone. In this paper, we propose the cloud service that can fundamentally protect the user from the risk of smishing attack. The proposed scheme provides cloud messaging service that can filter text messages including URLs in the user's smart device, view and manage them through a virtual machine provided by a cloud server. The existing techniques for preventing smshing attacks protect only malicious code of a known pattern and there is the possibility of error such as FP(False Positive) or FN(False Negative). However, since the proposed method automatically filters all text messages including URLs, storing, viewing, and managing them in their own storage space on the cloud server, it can completely block the installation of malwares(malicious codes) on the user's smart device through smishing attacks.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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