NIR(근적외) 분광분석법이 참기름의 원산국 판별에 이용 가능 한지를 알아보기 위하여 32종의 시료에 대하여 NIR 분석을 실시한 후, 그 분광 데이터에 대하여 principal component analysis(주성분 분석)와 canonical variate analysis(정준판별분석)을 실시하였다. 10개의 주성분과 400-2500nm에서 second derivative log(1/R) 데이터를 이용할 경우, 제1 및 제2 정준판별함수는 3개 참기름 그룹(한국산 참깨로 제조한 13종의 참기름 그룹, 외국산 참깨로 제조한 10종의 국산 참기름 그룹 및 미지의 참깨로 제조한 9종의 참기름 그룹)을 판별하는데 가장 효과적이었다. 사용된 canonical variate analysis는 참기름 시료를 100%의 정확도로 그 지리적 출처를 분류하였다. 한편 second derivative log(1/R) spectra상의 파장범위 498-500, 668, 1698-1724, 2242-2256, 2302-2306, 2328 및 2348~2352nm에서 3개 그룹간에 현저한 차이가 발견되었다.
Cho, Kang-Hee;Rho, Il Rae;Cho, Yong Seop;Park, Pue-Hee
Korean Journal of Breeding Science
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v.40
no.4
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pp.401-407
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2008
This study was conducted to develop the DNA markers for identification of the strawberry cultivars in Korea and Japan. We developed fifteen cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) markers based on the Fragaria gene sequences. Among them six CAPS markers showed polymorphism exclusively in one cultivar. Five CAPS markers (ANR-MspI, ANR-BamHI, ACO-HinfI, DFR-AseI, FGT-MspI) provided enough polymorphism to identify eight Korean strawberry cultivars except for 'Maehyang' and 'Sunhong'. To complement the fifteen CAPS markers, we selected another fifteen sequence-related amplified polymorphism (SRAP) and one of them, me1/em5_460bp marker, made it possible to discriminate between 'Maehyang' and 'Sunhong'. Therefore, application of the five CAPS markers and one SRAP marker were sufficient to identify the nineteen Korean and Japanese strawberry cultivars. These markers could be used practically for cultivar identification of Korean and Japanese strawberry.
Lee, Ki-Won;Song, Yowook;Kim, Ji Hye;Rahman, Md Atikur;Oh, Mirae;Park, Hyung Soo
Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
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v.40
no.4
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pp.259-264
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2020
The aim of this study was to investigate the feasibility of discrimination 12 different cultivar of sorghum × sudangrass hybrid (Sorghum genus) seed through near infrared spectroscopy (NIRS). The amount of samples for develop to the best discriminant equation was 360. Whole samples were applied different three spectra range (visible, NIR and full range) within 680-2500 nm wavelength and the spectrastar 2500 Near near infrared was used to measure spectra. The calibration equation for discriminant analysis was developed partial least square (PLS) regression and discrimination equation (DE) analysis. The PLS discriminant analysis model for three spectra range developed with mathematic pretreatment 1,8,8,1 successfully discriminated 12 different sorghum genus. External validation indicated that all samples were discriminated correctly. The whole discriminant accuracy shown 82 ~ 100 % in NIR full range spectra. The results demonstrated the usefulness of NIRS combined with chemometrics as a rapid method for discrimination of sorghum × sudangrass hybrid cultivar through seed.
NIR(근적외) 분광분석법이 녹차의 원산국을 판별하는데 이용할 수 있는지를 알아보기 위하여 분쇄한 47종의 한국산 및 일본산 녹차에 대하여 NIR 분석을 실시한 후, 그 분광 데이터에 대하여 principal component analysis(주성분 분석 )와 canonical variate analysis(정준판별분석)을 실시하였다. 15개의 주성분과 1100~2500nm에서의 first derivative log(1/R) 데이터를 이용할 경우, 제1 및 제2 정준판별함수는 한국산 녹차 및 일본산 녹차를 판별하는데 가장 효과적이었다. 사용된 canonical variate analysis는 녹차 시료를 97.87%의 정확도로 그 지리적 출처를 판별하였다. 한편 first derivative log(1/R) spectra상의 파장범위 1674~1686, 1950~1992, 2014~2030및 2118~2158 nm에서 일본산 녹차와 3종의 한국산 녹차 그룹간에 현저한 차이가 발견되었다. 이 차이는 polyphenols, caffeine 및 amino acids와 같은 녹차의 주요성분과 관련되어 있지 않으며 주로 지리적 출처상의 차이에 기인한 것으로 판단되었다.
Dried Rehmannia Radix Preparat, produced in different geographic origins of Korea and China, were investigated for the trace element contents using X-ray fluorescence spectrometry. When the estimated data for 35 kind of elements including K, P, S, Cl, Si, Al, Fe, Sn, etc on 143 samples were analyzed by canonical discrimination technique, the average classification correct rate was 92.3% and the significance was less than 0.0001. In case of reducing the number of elements for statistic analysis from 35 to 8 and to 3, the correct rates were also reduced to 88.1% and to 84.6%. The correct rate for Chinese samples ranged from 94.6-96.0%, while those for Korean ranged from 72.5-89.9%.
The kinds of kochujang were discriminated by using their organic acid compositions, GC peak areas of volatile concentrates and flavor intensity determined by sensory evaluation. Tested kochujang were 51 kinds of traditional kochujang and 10 kinds of industry-produced kochujang in the market. The traditional kochujang included 20 kinds of Sunchang kochujang prepared with glutinous rice, 11 kinds of Boeun kochujang prepared with barley and 20 kinds of Sachun kochujang prepared with wheat. Boeun kochujang was distinguished from other kinds of traditional and industry-produced kochujang by using canonical discriminant analysis for the compositions of organic acids. Among organic acids, lactic acid was the most contributing variable for the discrimination of various kochujang. Traditional and industry-produced kochujang could be classified into 4 groups by using discriminant analysis for GC peak areas. The peak number 2, 4, 8 and 11 were found to be highly contributing variables for the discrimination of kochujang by using stepwise discriminant analysis. Industry-produced kochujang was discriminated from traditional kochujang by using canonical discriminant analysis for the intensity of 8 kinds of flavor property. The taste 'umami' was found to be the most contributing variable for the discrimination of kochujang.
Proceedings of the Korean Society for Agricultural Machinery Conference
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2017.04a
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pp.147-147
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2017
우리나라에서는 수입 개방화 추세에 따라 공정한 유통질서 확립하고 국내 생산자와 소비자를 보호하기 위하여 원산지 표시제가 시행되고 있다. 그러나 수입 농산물과 국산 농산물의 큰 가격차이로 인하여 원산지를 허위 표시하는 경우가 증가하고 있다. 특히 쌀 관세화 전환 의무에 따른 수입산 쌀 증가하고 있으며 단립종과 중립종 수입산 쌀은 국내산 쌀과 외관이 유사하여 육안식별이 어려워 국내산 쌀로 둔갑할 우려가 있다. 이에 신속하고 비파괴적으로 쌀의 원산지를 판별할 수 있는 기술 개발이 요구되고 있다. 따라서 본 연구에서는 국내산 쌀과 중국산 쌀의 원산지를 신속하게 판별가능한 영상 처리기술을 개발하였다. 쌀은 국내에서 생산된 중립종 50점과 중국에서 생산된 단립종 및 중립종 51점이 수집되어 사용되었다. 쌀의 분광 영상은 초분광 가시광 및 근적외선 영상 시스템을 이용하여 측정하였다. 이 시스템은 할로겐-텅스텐 라인광, 시료 이송부, 초분광 영상 획득부로 구성되어 있다. 텅스텐-할로겐 라인광은 $15^{\circ}$ 각도로 대칭으로 시료에 조사되고 400 ~ 1000 nm 파장 영역의 반사광 영상 스펙트럼이 측정되었다. 초분광 영상 데이터는 광에 노출되지 않은 암실에서의 파장별 영상과 반사율이 99% 이상인 기준판의 파장별 영상을 이용하여 교정되었다. 부분최소제곱회귀법을 이용하여 쌀 원산지 판별모델 식을 개발하였고, 이 판별 모델식을 교정된 초분광 영상에 적용하여 영상처리 판별 모델을 개발하였다. 그 결과, 원산지 판별정확도가 97.4% 이상으로 나타났으며, 국내산과 중국산 쌀의 원산지 판별이 가능하였다.
Chung, In Young;Seo, Yong Bae;Yang, Ji-Young;Kim, Gun-Do
Journal of Life Science
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v.27
no.11
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pp.1331-1339
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2017
DNA barcoding is the identification of a species based on the DNA sequence of a fragment of the cytochrome C oxidase subunit I (COI) gene in the mitochondrial genome. It is widely applied to assist with the sustainable development of fishery-product resources and the protection of fish biodiversity. This study attempted to verify horse-head fish (Branchiostegus japonicus) and fake horse-head fish (Branchiostegus albus) species, which are commonly consumed in Korea. For the validation of the two species, a real-time PCR method was developed based on the species' mitochondrial DNA genome. Inter-species variations in mitochondrial DNA were observed in a bioinformatics analysis of the mitochondrial genomic DNA sequences of the two species. Some highly conserved regions and a few other regions were identified in the mitochondrial COI of the species. In order to test whether variations in the sequences were definitive, primers that targeted the varied regions of COI were designed and applied to amplify the DNA using the real-time PCR system. Threshold-cycle (Ct) range results confirmed that the Ct ranges of the real-time PCR were identical to the expected species of origin. Efficiency, specificity and cross-reactivity assays showed statistically significant differences between the average Ct of B. japonicus DNA ($21.85{\pm}3.599$) and the average Ct of B. albus DNA ($33.49{\pm}1.183$) for confirming B. japonicus. The assays also showed statistically significant differences between the average Ct of B. albus DNA ($22.49{\pm}0.908$) and the average Ct of B. japonicus DNA ($33.93{\pm}0.479$) for confirming B. albus. The methodology was validated by using ten commercial samples. The genomic DNA-based molecular technique that used the real-time PCR was a reliable method for the taxonomic classification of animal tissues.
Thistle is a perennial plant that is widely used for medicinal purposes. Information on the genetic diversity of thistle populations are great important for their conservation and germ plasmic utilization. Although thistle is an important medicinal plant species registered in South Korea, no molecular markers are currently available to distinguish them from other similar species from different countries. In this study, we developed single nucleotide polymorphism (SNP) markers derived from the nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) regions of genomic sequences to identify distinct Korean-specific thistle species via an amplification refractory mutation system (ARMS)-PCR and high resolution melting (HRM) curve analyses. We performed molecular authentication of four different kinds of thistle species from different regions using DNA sequences in the ITS intergenic region. We also developed a quantitative PCR assay using species-specific ITS primers, which allowed us to estimate the ratio of Korean-specific thistle species using varying ratios of mixed genomic DNA templates from the two species. The SNP markers developed in this study are useful for rapidly identifying specific thistle species from different countries.
This study was conducted for the identification of pure Landrace, Large White and Duroc breeds which are mainly maintained in Korea using DNA markers. We used known KIT and MC1R mutations, which were related coat color in pigs, and pig mitochondrial DNA variations. The KIT mutation was used to distinguish white and colored animals. Duroc breed could be discriminated from other colored breeds using the MC1R mutation N121D. Discriminating Landrace and Large White was possible using the l l-bp duplication of D-Ioop region and alternative initiation codon of ND2. In conclusion, identification of Landrace, Large White and Duroc breeds was might be possible using the procedure designed in this study.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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