• The Korean Journal of Malacology
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• v.9 no.1
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• pp.39-45
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• 1993

한국산 부산입술대고둥의 지역 집단간에 있어 유전적 변이, 종내 유연관계를 밝히기 위하여 애월, 세화, 삼척, 통도사, 거문도 및 여수 지역에서 채집한 총 180개체를 대상으로 전기영동을 실시하였고 여기서 나타난 16개의 유전자를 분석하였다. 각 집단의 유전전 변이 정도를 조사한 결과 전 집단의 평균 대립인자 수 (A)는 1.528이고, 평균 다형형의 빈도(P)는 45.5%이며, 평균이형접합자(H$_{D}$)는 0.205로 나타났다. 이중 삼척집단의 대립인자 수는 1.46으로 가장 낮고, 애월집단의 다형형의 빈도는 28.58%, 통도사의집단은 57.14%로 가장 낮은 빈도를 나타냈다. 각 집단간 유전적 유연관계를 분석한 결과 6개 집단간의 평균 유전적 근연치는 S=0.716이었고, 애월과 삼척집단은 0.903으로 가장 가까운 유전적 유연관계를 4보여주고 있다. 여수집단과 삼척집단의 유전적 유연관계는 0.562로 가장 낮은 값을 나타냈다. Nei의 공식에 따라 각 집단의 유전적 차이치(D)를 계산한 결과 평균D값은 0.267이며, 이중 애월과 삼척집단이 0.067로 가장 가깝게 나타났고 이는 Roger에 의한 유전적 근연관계와 유사한 양상을 보였다.

• Korean Journal of Plant Resources
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• v.26 no.4
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• pp.491-502
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• 2013

Persimmon (Diospyros kaki Thunb) fruit is one of the most important fruit and have been cultivated from ancient times in Korea. In this study, we found 16 EST-SSR markers that contained one or more EST-SSR sites from 246 cDNA sequences. The developing of EST-SSR marker analysis from 42 persimmon cultivars was compared by genetic relationships and morphological relationships using 6 qualitative traits (fruit related 6 traits) and 19 quantitative traits (flower related 19 traits). In this study, 25 primer sets were tested to identify PCR polymorphism and 14 potential EST-SSR primer pairs were selected. The result of morphological relationship EST-SSR marker analysis showed that the coefficient 0.02 was difficult to categorize in several groups. And then, coefficient 0.77 of genetic relationship showed that the group was classified as four groups. The result of correlation distance between genetic relationship and morphological relationship were investigated was low significance (-0.03). Our results also provided an optimized method for improvement of breeding efficiency and introduce of superior character at persimmon cultivars using EST-SSR markers which was useful for further investigation.

• The Korean Journal of Zoology
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• v.34 no.4
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• pp.571-584
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• 1991

잉어과(Gyprinidae)의 Zocco속 어류 4종과 Candidia속 어류 1종에 대한 종간 유연관계와 종분화 연대측정 및 이들의 지질학적 분포경로를 밝히기 위하여 한국, 일본 및 대만에서 채집된 개체를 대상으로 전기영동법에 의한 유전자 분석을 하였다. 각 종의 지역별(한국, 일본, 대만) 집단간 유전적 유연관계를 분석한 결과 평균 유전적 근연치는 90% 이상이었다. Z. temmincki의 경우 일본집 단들은 한국의 A-type 집단과는 유연관계가 가까왔으나 한국의 B-type과는 유전적 차이가 현저하러다. Z. PlaD여5의 경우 한국집단과 일본집단사이의 유연관계는 S = 0.852였고, 한국집단과 대만집단 사이는 5 = 0.672, 일본집단과 대만집단 사이는 S = 0.751로서 지리적으로 현저한 차이를 업였다. Z. pochycephalus 3개 집단간의 유전적 근인치는 S = 0.963이었고 Candidia borbota 2개 집단간은 S = 0.946이었다. 종간의 유전적 근연환계를 비교한 결과 Candidia borbota와 Z. temmincki사이는 S = 0.608, Z. pluDpus와 1. pachycephalus사이는 S = 0.612였으나, Z. temmincki와 Z. platypus사이는 S = 0.441, Z. temmincki 와 Z. pochycepholus 사이는 S = 0.350이었고, Z. plotpus와 Condfda barbata사이는 S = 0.328로서 이들 사이에는 현저한 유전적 차이가 있었다. 각 종간의 롱분화 연대를 추산한 결과 이들은 약 480만년 전인 Pliocene 초기에 공통 조상종에서 분화하여 Z. temmincki, Candidia borbato group과 Z. plotypus, Z. pochycepholus group으로 분리되었고 약 260만년 전인 Pliocene 후기에 Z. temminc소와 Candidia borbota로 분화되었다고 추산되며 약 80만년 전인 Pleistocene시기에 남 temmincki B-type에서 h-type이 분화되었다짙 여겨진다. 한편 또 다른 한 단opP은 약 230만년 전인 열iocene후기에 대만 지역의 Z. plotypas에서 Z. pochvcepholus가 분화된 후 현재에 이르렀다고 추정된다. Z. platypus는 약150만년 이전인 초기 Pleistocene시기에 대만지역에서 한국 및 일본집단으로 분리되었다고 보며 이들 한국집단과 일본집단은 약 50만년 전 Pleistocene의 Middle기에 고황하 수계를 거쳐 현재의 분포 상황에 이르렀다고 여겨진다. 한편 대. temmin체과의 B-type에서 저온 적응으로 분화되었다고 추측되는 A-type은 약 20만년 전인 Pleistocene의 Riss기에 역시 고황하 수계를 통하여 한국과 일본으로 분포하여 현재에 이르렀다고 사료된다.

• Korean Journal Plant Pathology
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• v.12 no.4
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• pp.389-394
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• 1996

도열병균, Magnaporthe grisea, 균주간의 유전적 유연관계를 분석하고 그들의 유전에 관한 '기본 정보를 얻고자 DNA polymorphism 분석을 실시하였다. 기주가 다른 도열병 균주들이 공시되었고 cloning에 의해 벼 도열병균 KJ201레이스 균주로부터 생성된 임의 선발 genomic clone들이 공시균주들간의 polymorphism을 밝히기 위해 사용되었던 바 그중 repectitive sequence를 보유한 repeated copy clone 하나가 선발되었다. Clone pMJ6에 의해 밝혀진 repetitive sequence는 Southern hybridization시 벼 분리균주에는 약 30개, 다른 기주 분리균에도 20∼33개의 밴드를 형성하였다. 반면 피 분리균주에는 단지 두 개의 밴드만을 나타내 분리기주가 다른 균주간에 뚜렷한 polymorphism이 존재하였으며 parsimony 분석에서도 역시 아주 먼 cluster를 형성하여 피 분리균은 다른 기주 분리균과 유전적으로 상당히 먼 것으로 추정되었다. 공시균의 genomic DNA를 HindIII로 처리했을 때 pMJ6에 의한 밴드양상은 공시균을 EcoRI으로 처리했을 때의 MGR probe의 밴드 양상과 유사하여 이 repeated copy clone이 도열병균주간의 유전적 유연관계를 분석하는데 MGR 못지않게 유용할 것으로 보인다.

• FLOWER RESEARCH JOURNAL
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• v.19 no.4
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• pp.225-230
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• 2011

This research was performed for making data-base of cross-breeding between Cymbidium goeringii cultivars. Morphological characteristics were investigated and then genetic relationship was analyzed. Collected 20 Cymbidium goeringii cultivars were clustered into 2 groups. Seven cultivars were clustered into group I, and thirteen cultivars were clustered into group II. Group I doesn't have leaf pattern. Group have leaf pattern. The genetic relationship among collected 20 Cymbidium goeringii cultivars was anaylzed using RAPD with ten 10-mers random primer. Eighty-nine bands were generated by RAPD. Among the rest, three bands were monomorphic and eight-six bands were polymorphic. Overall similarity degree ranged from 0.521 to 0.862. The result of RAPD analysis was clustered into 2 groups, too. Sixteen cultivars were clustered into GroupX, and four cultivars were clustered into GroupY. Result of classification with morphological characteristics and RAPD showed different pattern, but 4 cultivars of GroupY by RAPD analysis were included in groupby morphological characteristics. Crossbreeding combination among low related coltivars in RAPD analysis may get more efficient result.

• Journal of Aquaculture
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• v.21 no.4
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• pp.346-350
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• 2008

RAPD analysis was examined to estimate the availability as a genetic marker. The availability was evaluated in terms of genetic divergence and relationships among Haliotis discus hannai, H. rufescens, H. rubra and H. midae in both hemispheres of the world. In results, RAPD analysis showed a clear genetic divergence between every pair of species. However, genetic relationships among the four species estimated by RAPD analysis unreflected to geographical distribution and morphological characteristics. In conclusion, RAPD is suitable genetic markers for estimates of genetic divergence and differences among abalone species.

• The Korean Journal of Malacology
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• v.12 no.1
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• pp.19-31
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• 1996

국내 11개 지역(경기도 옹진군 덕적도, 경기도 의정부시 소요산, 강원도 춘천시, 충청남도 태안군 안홍, 경상북도 울릉군 울릉도, 전라북도 부안군 변산, 전라남도 신안군 홍도, 흑산도 비금도, 진도, 제주도)에서 채집된 달팽이 (A. despecta sieboleiana)를 대상으로 외부형태 분석과 동위효소를 검출하여 각 지역 집단간의 형태적, 유전적 유연관계와 변이 정도를 연구한 결과는 다음과 같다. 외부형태에 의한 집단간 유연관계는 안홍과 덕적도집단(average taxonomic distance, D=0.358)이 형태적으로 가장 유사한 집단으로 나타났다. Polyacrylamide gel을 사용하여 11가지의 동위효소를 검출한 결과 AKP, ACP, AO, EST, GPD, HBDH, LDH, SDH, XDH의 동위효소에서 유전적 다형현상이 나타났다. 전 집단의 평균 다형형의 빈도는 59.19%이며 이형접합자 빈도는 0.263이고 각 집단의 유전적 차이치는 춘천과 울릉도 집단이 0.066(genetic distance)으로 가장 높은 유사성을 보였다. 지리적 분포에 따른 외부형태 변이와 유전적 변이와의 관계는 유의성이 없었다.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.36 no.4
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• pp.293-308
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• 2006

Genetic and morphological studies using morphological and isozymic data from 20 populations of 6 Korea Hylotelephium were conducted to resolve the species relationships and the origin of polyploid species. The results of morphological studies suggest that triploid H. viviparum is closely related to H. verticillatum, and the high frequency alleles of two species were very similar each other in isozyme analyses. Unique fixation of $PGI-1^b$ in two species supports that H. verticillatum should be the diploid ancestor of H. viviparum. However, a unique $ALD-1^c$ allele is present in H. viviparum, and the lack of the common alleles of H. erythrostictum and H. spectabile in this species eliminated them from the candidates of another tetraploid ancestor of H. viviparum. Based on the high morphological and genetic similarities, our results supported that the Korea endemic H. viridescens might be originated from the H. erythrostictum or share a common ancestor with it. Besides, H. ussuriense is closely related with H. erythrostictum and H. viridescens.

• Korean Journal of Plant Resources
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• v.22 no.2
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• pp.152-158
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• 2009

We performed RAPD analysis to investigate the inter-/intraspecific relationships and regional variations of Phragmites japonica and P. communis according to the environmental change. One hundred and fourty nine genetic effective polymorphic bands between 300 bp and 1,900 bp were marked from RAPD PCR with nine oligoprimers. From the RAPD analysis by Nei-Li's genetic distance, the dissimilarity indices among the populations of Phragmites japonica were relatively low from 0.012 to 0.061, and Phragmites communis were also low from 0.033 to 0.095. It showed the close genetic relationships among the same species populations, and both species were distinctly independent with relatively high level of dissimilarity indices (0.043 - 0.132). The obvious genetic markers to distinguish two species were confirmed and those profiles were suggested. From the UPGMA phenogram by RAPD analysis, both species showed the water environment related cluster patterns by distributional regions. RAPD analysis was useful to delimit two species taxonomically and to investigate the genetic relationships among inter-/intraspecific populations.

• Journal of Aquaculture
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• v.18 no.4
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• pp.252-259
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• 2005

Isozyme and AFLP analyses were examined to estimate the utilities of them as a genetic marker. The utilities were evaluated by genetic divergence and relationships among the four distinct abalone species; Haliotis discus hannai collected from northeast coast of Japan and Yellow-Sea coast of China, H. rufescens collected from west coast of USA, H rubra collected from southeast coast of Australia and H midae collected from Cape Town of South Africa. Isozyme and AFLP analyses showed a clear genetic divergence between every pair of species. Genetic relationships among the low species estimated by isozyme and AFLP analyses reflected to geographical distribution and morphological characteristics. In conclusion, Isozyme and AFLP analyses are suitable genetic markers far estimates of genetic divergence and relationship among abalone species.