Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2005.05a
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pp.1045-1048
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2005
유전자 칩의 정확성은 각 유전자들의 식별자로 활용되는 probe들에 의해 결정된다. 일반적으로 칩을 구성하는 probe들은 반응 오류를 예측하기 위해 이중구조와 녹는점과 같은 요소들을 고려한다. 또한 다른 유전자들과의 교차반응을 최소화하기 위해 각 probe들의 specificity도 고려되어야 한다. probe가 specificity를 보장하는지 검증하는 것은 전체 유전자들을 탐색해야 하므로 대규모 인간염색체에 대해서는 많은 시간이 소요된다. 본 논문에서는 specificity를 만족하는 probe들을 선택하는 효율적인 알고리즘을 제시한다. 제시한 알고리즘은 해시 테이블을 활용하여 probe가 specificity를 만족하지 못하게 하는 유전자 시퀀스들만을 탐색하여 비교한다. 제시한 알고리즘이 기존 알고리즘보다 효율적임을 실험결과를 통해 보인다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2004.04b
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pp.283-285
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2004
마이크로 어레이 기술로 인해서 유전자의 발현 데이터를 대량으로 얻을 수 있게 되었다. 따라서 실험조건에 따른 유전자 발현 양상을 한눈에 볼 수 있게 되었고. 이를 기반으로 유전자간의 조절 관계를 예측할 수 있게 되었다. 또한 실험 이미지와 분석 파일들이 많아짐에 따라서 이러한 데이터를 효율적으로 관리하고, 저장하는 시스템이 필요하게 되었다. 이 두 가지 시스템을 통합함으로써 유전자 조절 네트워크 분석에 필요한 발현 데이터를 체계적으로 관리하고 손쉽게 얻을 수 있을 뿐만 아니라 분석 결과 또한 효율적으로 관리할 수 있다. 본 논문에서는 유전자 네트워크 분석 시스템과 마이크로 이미지 및 분석 데이터 관리 시스템을 통합한 시스템을 소개하고 각 시스템에서 제공하는 기능과 통합 시스템의 특징에 대해서 소개한다.
Hyo Seo Kang;Tae Hee Nam;Woo Ju Lee;Joon Sang Lee;Sangsu Shin
Korean Journal of Poultry Science
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v.50
no.4
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pp.261-266
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2023
The skeletal muscles of livestock play a crucial role as protein sources for humans, and the consumption of poultry meat is steadily increasing worldwide. Numerous genes, including myogenic regulatory factors, are involved in myogenesis, and precise regulation of them is essential. In this study, genes specifically expressed in muscles were selected, and their promoters were cloned and analyzed. The analysis of gene expression in various tissues of animals revealed that many genes exhibited specific expression patterns in skeletal muscles, with TNNT3, TNNC2, and MYF6 genes showing similar patterns in poultry. The promoter regions of three genes were amplified by polymerase chain reaction to sizes of 1.2 kb, 1.03 kb, and 1.43 kb, respectively. These fragments were then inserted at the front of the enhanced green fluorescent protein gene in vectors. It was confirmed that the sequences of three promoters closely matched the chicken genome sequences. Upon introducing vectors with each promoter into QM7 quail muscle cells, all three promoters successfully induced the expression of the green fluorescent protein. The brightness of the green fluorescence in each promoter was approximately seven times dimmer compared to the control, CMV-IE promoter. It is predicted that more than 230 transcription factors can bind to each promoter, especially various transcription factors expressed in muscles, including myogenic regulatory factors such as MYF5, MYOD, and MYOG. These promoters can be valuable for studying gene expression in poultry muscle cells, and further research is needed to precisely investigate the regulatory region of gene expression in promoters.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2003.04c
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pp.49-51
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2003
성공적인 소프트웨어 개발을 위해서는 프로젝트 계획 수립단계에서 정확한 예측 모델을 연구하는 것이 중요하다. 소프트웨어 개발의 중요성이 대두됨에 따라 현재에는 많은 기존의 프로젝트 데이터를 보관하게 되었다. 기존의 예측모델에서는 개발환경에 따라 서로 다른 형태의 모델을 만들어 개발비용을 예측하였다. 모델의 형태에 따른 신뢰도 또한 주요 이슈로 작용하였다. 이 논문에서는 이러한 많은 프로젝트 데이터와 현재 개발하고자 하는 프로젝트에 대하여 과거의 데이터 중 가장 유사한 최적의 프로젝트를 찾아내기 위해 FP(Function Point)를 이용하는 많은 프로젝트 데이터에 유전자 알고리즘을 적용하여 최적의 유사 모델을 찾아내는 방법에 대하여 제안하고자 한다.
Korean Journal of Construction Engineering and Management
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v.21
no.1
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pp.50-60
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2020
Estimates of project costs in the early stages of a construction project have a significant impact on the operator's decision-making in important matters, such as the site's decision or the construction period. However, it is difficult to carry out the initial stage with confidence because information such as design books and specifications is not available. In previous studies, case-based reasoning was used to predict initial construction costs, and genetic algorithms were used to calculate the weight of the inquiry phase among them. However, some say that it is difficult to perform better than the current year because existing genetic algorithms are calculated in random numbers. To overcome these limitations, correlation numbers using correlation analysis rather than random numbers are reflected in the genetic algorithm by method of local search, and weights are calculated using a hybrid genetic algorithm that combines local search and genetic algorithms. A case-based reasoning model was developed using the weights calculated and validated with the data. As a result, it was found that the hybrid GA-CBR applied with local search performed better than the existing GA-CBR.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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