Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2006.06a
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pp.85-87
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2006
압타머칩은 (주)제노프라에서 개발한 새로운 개념의 바이오칩으로서, 압타머(aptamer)를 이용하여 혈액중의 특정 단백질군의 상대적인 양의 변화를 측정할 수 있으며, 질병 진단에 바로 응용할 수 있는 도구이다. 본 논문에서는 압타머칩 데이터 분석을 통해 심혈관 질환 환자의 질병 진행 단계를 예측할 수 있음을 보인다. 정상, 안정/불안정성 협심증, 심근경색의 네 단계로 표지된 환자의 혈액 샘플로부터 제작한 (주)제노프라의 3K 압타머칩 데이터를, 일반 DNA 마이크로어레이 분석과 동일한 과정을 거쳐 분류한 결과, 각 단계별 환자샘플이 확연히 구분되는 것을 확인하였다. 분산분석 결과 P-Value를 이용하여 자질 선택을 수행하고, 분류 알고리즘으로는 신경망, 결정트리, SVM, 베이지안망을 적용한 결과. 각 알고리즘별로 50대 남성환자 31개의 샘플에 대하여 $77{\sim}100%$의 정확도로 심혈관 질환의 단계를 구분해내었다.
Studies on assessment tools for predicting cardiovascular disease risk (CDR), along with the studies to prevent CDR have been consistently reported. The validity of the Framingham risk score (FRS), a commonly known tool, has been verified through the precedent studies. In this study, we examined the differences of FRS according to the application of categories of LDL cholesterol (LDL-C) or Total cholesterol (TC), and attempted to evaluate the agreement of 10 yr CHD risk judgment based on the above-mentioned application. Excluding those diagnosed as cardiovascular diseases, data on subjects (755 men and 775 women) from the 2011 Korean National Health and Nutrition Examination Survey were used. We found differences of FRS and 10 yr CHD risk depending on the application of categories of LDL cholesterol (LDL-C) or Total cholesterol (TC). FRS of TC points were higher than those of LDL-C in both men and women. In classification of low risk (<10%), intermediate risk (10~19%), and high risk (${\geq}20%$), there were disagreements for 106 men and 26 women. Women showed almost perfect agreement from Coefficient of Cohen's Kappa (0.718 in men, and 0.884 in women). In assessment of 10 yr CHD risk, R-squared value from regression including TC was higher than that of LDC-C in both men and women (0.972 vs 0.885). From this result, we can draw a conclusion that correlation coefficients of FRS and CHD risk including TC were higher than those of LDC-C, and women showed a greater degree of agreement than men.
This study have researched on feasibility of bioelectrical impedance analysis (BIA, which is simple useful evaluation tool for predictive factor of cardiovascular disease) to patients who have to travel along the sea for a long-period time and have difficulty in visiting medical institutions. We studied on the basis of total cholesterol value, which is nowadays widely used tool for predictive factor of cardiovascular disease, and also studied its association with BIA value via statistical analysis. Our result showed correlation with fat thickness of individual sites, and especially, fat thickness of left thigh showed high relation with total cholesterol value. This result shows that people who are in travel of long-period of time at sea are feasible of using BIA to evaluate changes of left thigh fat thickness as predictive factor for cardiovascular disease. Due to lack of advanced researches further studies should be done. And based on special circumstances in sea, more studies should be done to validity concerning this circumstances and accuracy of this evaluation tool.
Objectives : The distressed personality (type-D) pattern, consisting of negative affectivity and social inhibition, has been shown by Denollet et al. For measuring the Type D characteristics, Denollet has devised the 14 item Type D scale (DS14). In the present study, this instrument was translated into Korean. The reliability and validity of the Korean DS14 was pilot tested. Methods : Preliminary version of the total 17-item DS14 scale was translated into Korean. 372 controls that did not have any coronary heart diseases (CHD) were randomly sampled in Seoul and Gyeonggi province. Preliminary Korean version was applied to controls and 14 items were finally selected to maximize reliability of the scale. We compared the distribution of type-D personality among the normal controls, hypertensive patients, and the CHD patients. Results : 7 of 10 items in social inhibition were selected and final 14-item version was made. The internal consistency of negative affectivity (0.817) and social inhibition (0.797) were high. In addition, the prevalence of type-D personality in the CHD patients group was significantly higher than normal controls. Conclusion : These findings suggest that Korean version of DS14 is a valid tool for measuring the type D characteristics. Type-D characteristics can be suggested to predict adverse prognosis in patients with CHD.
The primary goal of this study was to ascertain the primary factors to the affect for the carotid artery intima-media thickness (IMT), the prevalence of metabolic syndrome and other risks can possibly influence the carotid artery IMT. All patients data (total specimens: 289, male: 197, female: 92) including the carotid artery ultrasonography examination. The all data were analyzed by the use of SPSS software, version 21.0 (SPSS, Chicago, IL USA), with the descriptive statistics method. The Results of this study was found to be highly increased in the males than the females. The prevalence of metabolic syndrome in all of the participants was 30.5 percentages. The carotid artery IMT in the subjects with metabolic syndrome was significantly high in both genders, compared to the rest, who were without metabolic syndrome. The Pearson's correlation coefficient of metabolic syndrome and CIMT was 0.378(p<0.01). In conclusions, the present study also supports the association between the carotid artery IMT and the metabolic syndromes with cardiovascular risk factors. Usage of B-mode ultrasonography to measure the carotid artery IMT was found to be highly effective in the current analysis.
GRAS probiotics can be used to modulate intestinal microbiota and to alleviate various gastrointestinal disorders. In several recent studies, researchers have explored the potential expansion and usability of probiotics to reduce the risk factors associated with diseases, including obesity, hypercholesterolemia, arterial hypertension, hyperhomocysteinemia, and oxidative stress. In this review, our aim was to clarify the mechanism underlying interactions between hosts (animal or human) and probiotics and the beneficial effects of probiotics on human health.
Objectives: The analysis of heart rate variability (HRV) is a useful non-invasive tool to investigate the autonomic nerve function. Previous studies on the relationship between HRV and depression have been reported controversial results. Similarly, the correlation between the serum lipids and depression is debatable. The purpose of this study is to examine the relationship between heart rate variability, lipid profile and depression. Methods: A total of 42 patients with major depressive disorder (MDD) and 32 age and sex-matched normal subjects who had no previous history of major medical and mental illnesses were recruited for this study. A structured-interview was used to assess the general characteristics and psychiatric illness. HRV measures were assessed by time-domain and frequency-domain analyses. Psychological symptoms were measured using the Hamilton rating scale for anxiety (HAM-A), Hamilton rating scale for depression (HAM-D). In addition, the evaluation for lipid profile was performed by blood test. Results: In serum lipid profile test, MDD group showed higher cholesterol ($197.68{\pm}42.94$ mg/dL vs. $176.85{\pm}34.68$ mg/dL, p=0.044), TG ($139.45{\pm}92.54$ mg/dL vs. $91.4{\pm}65.68$ mg/dL, p=0.018), LDL ($130.03{\pm}33.18$ vs. $106.62{\pm}27.08$, p=0.004) level than normal control group. In HRV time domain analyses, the standard deviation of the NN interval (SDNN) was decreased in MDD group than normal control group, but was not significant ($32.82{\pm}14.33$ ms vs. $40.36{\pm}21.40$ms, p=0.078). ApEn (Approximate Entrophy) was significantly increased in MDD group than normal control group ($1.13{\pm}0.11$ vs. $0.91{\pm}0.18$, p<0.001). ApEn was correlated with LDL level (r=0.277, p=0.028), HAM-D scores (r=0.534, p<0.001) and HAM-A scores (r=0.470, p<0.001). Conclusions: MDD patients showed increased ApEn, one of the HRV measurement. And this ApEn was correlated with LDL, HAM-D and HAM-A scores. In this study, the analysis of ApEn would be a useful test of MDD.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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v.17
no.11
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pp.94-103
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2016
This study was conducted to investigate the association of serum alanine aminotransferase (ALT) and aspartate aminotransferase (AST) with all-cause mortality among populations. The data used were from a Korean Genome and Epidemiology Study (KoGES) based on health examinations and questionnaires. The subjects consisted of 10,110 persons aged 40 and over. Hazard ratio was analyzed using Cox's proportional hazard model. The hazard ratio of AST (${\geq}50.0\;IU/L$) was 2.198 (95% CI: 1.217-3.971) after being adjusted for age, sex, education, regular exercise, smoking, drinking, WHR, and TG. In conclusion, AST was an independent significant risk factor of all-cause mortality, and ALT showed a tendency to increase. Overall, these findings indicate that AST and ALT may be useful tools for predicting mortality.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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