• Title/Summary/Keyword: 신약 재창출

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Analysis of Research Trends Related to drug Repositioning Based on Machine Learning (머신러닝 기반의 신약 재창출 관련 연구 동향 분석)

  • So Yeon Yoo;Gyoo Gun Lim
    • Information Systems Review
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    • v.24 no.1
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    • pp.21-37
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    • 2022
  • Drug repositioning, one of the methods of developing new drugs, is a useful way to discover new indications by allowing drugs that have already been approved for use in people to be used for other purposes. Recently, with the development of machine learning technology, the case of analyzing vast amounts of biological information and using it to develop new drugs is increasing. The use of machine learning technology to drug repositioning will help quickly find effective treatments. Currently, the world is having a difficult time due to a new disease caused by coronavirus (COVID-19), a severe acute respiratory syndrome. Drug repositioning that repurposes drugsthat have already been clinically approved could be an alternative to therapeutics to treat COVID-19 patients. This study intends to examine research trends in the field of drug repositioning using machine learning techniques. In Pub Med, a total of 4,821 papers were collected with the keyword 'Drug Repositioning'using the web scraping technique. After data preprocessing, frequency analysis, LDA-based topic modeling, random forest classification analysis, and prediction performance evaluation were performed on 4,419 papers. Associated words were analyzed based on the Word2vec model, and after reducing the PCA dimension, K-Means clustered to generate labels, and then the structured organization of the literature was visualized using the t-SNE algorithm. Hierarchical clustering was applied to the LDA results and visualized as a heat map. This study identified the research topics related to drug repositioning, and presented a method to derive and visualize meaningful topics from a large amount of literature using a machine learning algorithm. It is expected that it will help to be used as basic data for establishing research or development strategies in the field of drug repositioning in the future.

Development of a System to Detect the Risk Factors of Trade based on Network Search Technology (네트워크 탐색 기술을 기반으로 한 무역 거래 위험 요소 적발 시스템 개발)

  • Seo, Dongmin;Kim, Jaesoo;Song, Jeong a;Park, Moon il
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2018.05a
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    • pp.11-12
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    • 2018
  • 빅데이터 분석에 활용되는 원천 데이터는 네트워크 형태이며, 최근 소셜 네트워크 분석을 통한 효과적인 상품 광고, 핵심 유전자 발굴, 신약 재창출 등 다양한 영역에서 네트워크 분석 기술이 사회와 인류에게 가치 있는 정보를 제공할 수 있는 가능성을 제시하면서 네트워크 분석 기술의 중요성이 부각되고 있다. 또한, 세계화와 정보통신기술의 급격한 발전으로 빠르게 변화하는 무역 환경 속에서 신속하고 정확한 무역 거래에 대한 안전 관리의 요구가 점차 증가하고 있다. 그래서 본 논문에서는 네트워크 탐색 기술을 기반으로 한 무역 거래 위험 요소 적발 기술을 제시했다.

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Development of Web Crawler and Network Analysis Technology for Occurrence and Prediction of Flooding (수난 발생 및 규모 예측을 위한 웹 크롤러 및 네트워크 분석기술 개발)

  • Seo, Dongmin;Kim, Hoyong;Lee, Jeongha;Hwang, Seokhwan
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2019.05a
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    • pp.5-6
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    • 2019
  • 빅데이터 분석을 위해 활용되는 데이터로는 뉴스, 블로그, SNS, 논문, 특허 그리고 센서로부터 수집된 데이터 등 매우 다양한 유형의 데이터가 있다. 특히, 신뢰성 있는 데이터를 실시간 제공하는 웹 데이터의 활용이 점차 확산되고 있다. 그리고 빅데이터의 활용이 다양한 분야로 점차 확산되고 웹 데이터가 매년 기하급수적으로 증가하면서, 최근 웹 데이터는 재난대응 미디어로써 매우 중요한 역할을 하고 있다. 또한, 빅데이터 분석에 활용되는 원천 데이터는 네트워크 형태이며, 최근 소셜 네트워크 분석을 통한 효과적인 상품 광고, 핵심 유전자 발굴, 신약 재창출 등 다양한 영역에서 네트워크 분석 기술이 사회와 인류에게 가치 있는 정보를 제공할 수 있는 가능성을 제시하면서 네트워크 분석 기술의 중요성이 부각되고 있다. 본 논문에서는 웹에서 제공하는 뉴스와 SNS 데이터를 이용해 수난 발생 및 규모 예측을 지원하는 웹 크롤러 및 네트워크 분석기술을 제안한다.

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Co-occurrence Based Drug-disease Relationship Inference with Genes as Mediators (유전자를 중간 매개로 고려한 동시발생 기반의 약물-질병 관계 추론)

  • Shin, Sangwon;Sin, Yeeun;Jang, Giup;Yoo, Youngmi
    • The Journal of Korean Institute of Information Technology
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    • v.16 no.11
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    • pp.1-9
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    • 2018
  • Drug repositioning is to discover new uses of drugs. Text mining derives knowledge from unstructured text. We propose a method to predict new drug-disease relationships by taking into account the rate of frequency of genes simultaneously measured in disease-gene and gene-drug. Co-occurrence of drug-gene and gene-disease in the biological literature is counted and calculate the rate of the gene for each drug and disease. Weights of drug-disease relationships are calculated using the average of the rates of genes that are measured and used to measure the accuracy for each disease. In measuring drug-disease relationships, a more accurate identification of relationships was shown by measuring the frequency on a sentence and considering multiple relationships than existing method.